MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-6

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020390	TAA	2	6	227	232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020390	TGT	2	6	333	338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020390	TCT	2	6	355	360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020390	TTG	2	6	459	464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020390	TGT	2	6	514	519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020390	ACT	2	6	538	543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020390	TGT	2	6	700	705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020390	TCT	2	6	757	762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020390	GTG	2	6	791	796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020390	TAC	2	6	933	938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020390	CAA	2	6	1038	1043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020390	AAT	2	6	1067	1072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020390	ACT	2	6	1214	1219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020390	TTG	2	6	1313	1318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020390	CCA	2	6	1400	1405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_020390	CTT	2	6	1599	1604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202017
17	NC_020390	GTT	2	6	1626	1631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202017
18	NC_020390	TCT	2	6	1681	1686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202017
19	NC_020390	TCT	3	9	1715	1723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202017
20	NC_020390	TGT	2	6	1877	1882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202017
21	NC_020390	TCT	2	6	1976	1981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_020390	GAA	2	6	2190	2195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020390	AAT	2	6	2438	2443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202018
24	NC_020390	ATT	2	6	2575	2580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202018
25	NC_020390	TTA	2	6	2789	2794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202018
26	NC_020390	ATG	2	6	2956	2961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202018
27	NC_020390	TTA	2	6	3101	3106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020390	CTT	2	6	3171	3176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020390	GTT	2	6	3182	3187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020390	AAC	2	6	3192	3197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020390	TTA	2	6	3319	3324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020390	TAA	2	6	3426	3431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020390	ATA	2	6	3469	3474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020390	AGA	3	9	3633	3641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202019
35	NC_020390	CCA	2	6	3681	3686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202019
36	NC_020390	TCT	2	6	3762	3767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202019
37	NC_020390	TAT	2	6	3775	3780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202019
38	NC_020390	TAT	2	6	3901	3906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202019
39	NC_020390	CAA	2	6	3934	3939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202019
40	NC_020390	TAA	2	6	4023	4028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202019
41	NC_020390	GAA	2	6	4075	4080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202019
42	NC_020390	TAA	2	6	4329	4334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202019
43	NC_020390	GAA	2	6	4345	4350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202019
44	NC_020390	ATA	2	6	4417	4422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202019
45	NC_020390	ATA	2	6	4574	4579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202019
46	NC_020390	ATT	2	6	4623	4628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202020
47	NC_020390	TAT	2	6	4825	4830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202021
48	NC_020390	ATA	2	6	4923	4928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202021
49	NC_020390	TTA	2	6	5098	5103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202022
50	NC_020390	CTG	2	6	5216	5221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202022
51	NC_020390	GCT	2	6	5230	5235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202022
52	NC_020390	TAA	2	6	5253	5258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202022
53	NC_020390	ATT	2	6	5307	5312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202022
54	NC_020390	TTG	2	6	5319	5324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202022
55	NC_020390	CCA	2	6	5358	5363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202022
56	NC_020390	ATT	2	6	5418	5423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202022
57	NC_020390	TAT	2	6	5459	5464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202022
58	NC_020390	AAT	2	6	5637	5642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202022
59	NC_020390	TCT	2	6	5749	5754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202022
60	NC_020390	AAC	2	6	5763	5768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202022
61	NC_020390	ATA	2	6	5786	5791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202022
62	NC_020390	ATA	2	6	5833	5838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202022
63	NC_020390	AAT	2	6	5864	5869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202022
64	NC_020390	CAT	2	6	5915	5920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020390	AAT	2	6	5961	5966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020390	CAA	2	6	6065	6070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020390	ACT	2	6	6151	6156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_020390	ACC	2	6	6563	6568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_020390	GAC	2	6	6612	6617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_020390	CAC	2	6	6682	6687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_020390	ACA	2	6	6730	6735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020390	TAA	2	6	6843	6848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.