MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-328

Total Repeats: 138

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020385	AAATTT	2	12	4813	4824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020385	CATCCC	2	12	5910	5921	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	452202397
3	NC_020385	GAAGGC	2	12	6946	6957	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	452202398
4	NC_020385	GTTAAA	2	12	8072	8083	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	452202400
5	NC_020385	CAAGAC	2	12	8756	8767	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	452202400
6	NC_020385	ACAGGT	2	12	12469	12480	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	452202403
7	NC_020385	AATGAA	2	12	12863	12874	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	452202403
8	NC_020385	CATTAG	2	12	14233	14244	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452202406
9	NC_020385	TAAACA	2	12	14817	14828	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	452202407
10	NC_020385	TAAAAA	2	12	15778	15789	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	452202409
11	NC_020385	ATTCAC	2	12	22069	22080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202417
12	NC_020385	ATATTT	2	12	23119	23130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020385	AAAACT	2	12	23442	23453	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_020385	TTAAAA	2	12	24211	24222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020385	ATTTTA	2	12	28965	28976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202422
16	NC_020385	AGATTC	2	12	29473	29484	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452202422
17	NC_020385	TAAAAA	2	12	36956	36967	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	452202432
18	NC_020385	TATTTT	2	12	40309	40320	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	452202434
19	NC_020385	AAATAT	2	12	41746	41757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202435
20	NC_020385	GTGAAT	2	12	43893	43904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202436
21	NC_020385	GCAAGT	2	12	47027	47038	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	452202437
22	NC_020385	ATTCTG	2	12	51221	51232	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	452202442
23	NC_020385	GATGTA	2	12	54389	54400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202445
24	NC_020385	TTAAAT	2	12	54826	54837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020385	ATAAAA	2	12	57639	57650	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	452202450
26	NC_020385	ATATAA	2	12	58166	58177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020385	AATTGC	2	12	62344	62355	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452202455
28	NC_020385	TACATT	2	12	63910	63921	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	452202456
29	NC_020385	ATCCTA	2	12	65223	65234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020385	GGACAT	2	12	66441	66452	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	452202458
31	NC_020385	TACGAT	2	12	66672	66683	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452202458
32	NC_020385	TGTATT	2	12	66901	66912	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020385	ACAGTT	2	12	69591	69602	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452202461
34	NC_020385	GGAACA	2	12	71054	71065	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	452202462
35	NC_020385	TAAAAA	2	12	73532	73543	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	452202464
36	NC_020385	TGAAAT	2	12	75139	75150	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	452202465
37	NC_020385	AGATGG	2	12	75431	75442	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	452202466
38	NC_020385	ATTTTT	2	12	75837	75848	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	452202466
39	NC_020385	TTCTTT	2	12	80141	80152	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	452202472
40	NC_020385	TTTATT	3	18	81229	81246	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	452202473
41	NC_020385	AGGATA	2	12	81460	81471	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	452202473
42	NC_020385	ACATAT	2	12	83247	83258	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_020385	AGTGAA	2	12	83410	83421	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	452202476
44	NC_020385	AATATC	2	12	85212	85223	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	452202478
45	NC_020385	TATATG	2	12	86984	86995	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020385	TAAAAA	2	12	88322	88333	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	452202479
47	NC_020385	ACAGGA	2	12	89254	89265	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	452202480
48	NC_020385	ATGAAT	2	12	89686	89697	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	452202481
49	NC_020385	TAACAC	2	12	90806	90817	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	452202483
50	NC_020385	AAAGAA	2	12	92056	92067	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	452202483
51	NC_020385	CATTTA	2	12	95008	95019	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_020385	TAATTA	2	12	95750	95761	50 %	50 %	0 %	0 %	452202486
53	NC_020385	TATATT	2	12	98867	98878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020385	TAAAAG	2	12	100970	100981	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	452202489
55	NC_020385	AATTTA	2	12	101270	101281	50 %	50 %	0 %	0 %	452202489
56	NC_020385	TAATTA	2	12	109749	109760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020385	TTGGTG	2	12	112659	112670	0 %	50 %	50 %	0 %	452202499
58	NC_020385	TGGTAT	2	12	117639	117650	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	452202503
59	NC_020385	GGCGAG	2	12	118259	118270	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	452202504
60	NC_020385	AAATGA	2	12	118719	118730	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	452202504
61	NC_020385	AAAGAA	2	12	121589	121600	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	452202507
62	NC_020385	ATAAAG	2	12	123590	123601	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	452202510
63	NC_020385	ACCATC	2	12	125247	125258	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	452202511
64	NC_020385	AATCCT	2	12	126498	126509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202513
65	NC_020385	GAAAAA	2	12	130728	130739	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	452202516
66	NC_020385	ATTTAT	2	12	131070	131081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020385	TAACAA	2	12	131145	131156	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_020385	CATATA	2	12	132747	132758	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	452202518
69	NC_020385	CTTTAT	2	12	133296	133307	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	452202518
70	NC_020385	CCATTT	2	12	140669	140680	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	452202524
71	NC_020385	AATATT	2	12	140876	140887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020385	ATTTAT	2	12	145896	145907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202528
73	NC_020385	TTTTTG	2	12	147524	147535	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020385	AAATAA	2	12	147706	147717	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020385	ATAAAG	2	12	148540	148551	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	452202531
76	NC_020385	TTTCTA	2	12	150592	150603	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_020385	TAAAAA	2	12	151769	151780	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020385	AATATA	2	12	158376	158387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020385	TTCTTT	2	12	163578	163589	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	452202548
80	NC_020385	TCCTGT	2	12	165848	165859	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	452202550
81	NC_020385	TTTTAA	2	12	167448	167459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202551
82	NC_020385	TATTAA	2	12	168994	169005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020385	ATTTTT	2	12	172706	172717	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020385	GGTGAT	2	12	173499	173510	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	452202556
85	NC_020385	TTTTAA	2	12	175380	175391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202557
86	NC_020385	GGTCTT	2	12	183513	183524	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	452202566
87	NC_020385	TTTAAC	2	12	184198	184209	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	452202566
88	NC_020385	CAATCA	2	12	188694	188705	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	452202572
89	NC_020385	TACTTA	2	12	190551	190562	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_020385	TTAAAA	2	12	193496	193507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202576
91	NC_020385	AATAGA	2	12	194267	194278	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020385	CCGGTA	2	12	195833	195844	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	452202578
93	NC_020385	TTAATA	2	12	199511	199522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020385	ATAGTT	2	12	204554	204565	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020385	TAAAAA	2	12	218934	218945	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020385	ACATTG	2	12	220759	220770	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452202599
97	NC_020385	ATACAA	2	12	223581	223592	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_020385	ATCTAA	2	12	225045	225056	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	452202603
99	NC_020385	TTTGTG	2	12	227371	227382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020385	TGCAGC	2	12	230345	230356	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	452202609
101	NC_020385	TTTTAA	2	12	232785	232796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202611
102	NC_020385	GATTCA	2	12	234760	234771	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452202613
103	NC_020385	CTTTAT	2	12	239778	239789	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	452202619
104	NC_020385	TTTAAT	2	12	248124	248135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202621
105	NC_020385	ATTAAA	2	12	249665	249676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202621
106	NC_020385	TAATCA	2	12	251115	251126	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	452202621
107	NC_020385	CTAAAC	2	12	251797	251808	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	452202621
108	NC_020385	AACATT	2	12	252170	252181	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	452202621
109	NC_020385	ATGCTA	2	12	253974	253985	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452202622
110	NC_020385	AGGTTC	2	12	255685	255696	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	452202622
111	NC_020385	AATTTA	2	12	258665	258676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020385	ATGTTA	2	12	263774	263785	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020385	TAAACA	2	12	264499	264510	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	452202630
114	NC_020385	TGTCAT	2	12	271655	271666	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	452202637
115	NC_020385	GCTGTA	2	12	272305	272316	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	452202639
116	NC_020385	AAATTT	2	12	272655	272666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020385	AAATAC	2	12	274679	274690	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_020385	GCAAGA	2	12	275781	275792	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	452202642
119	NC_020385	AATATT	2	12	278304	278315	50 %	50 %	0 %	0 %	452202644
120	NC_020385	TAAAAT	2	12	281614	281625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020385	TATTAA	2	12	285480	285491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020385	ACAATT	2	12	286279	286290	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	452202650
123	NC_020385	TGATGG	2	12	287419	287430	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020385	GCGAAA	2	12	288446	288457	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	452202653
125	NC_020385	TTTCTT	2	12	289322	289333	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_020385	TTTAAT	2	12	291821	291832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020385	ACGTAT	2	12	294436	294447	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452202658
128	NC_020385	TTTAAT	2	12	299516	299527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202661
129	NC_020385	AATACG	2	12	299812	299823	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	452202661
130	NC_020385	TCTGGT	2	12	300394	300405	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	452202662
131	NC_020385	GCAATT	2	12	301931	301942	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452202663
132	NC_020385	AATTTG	2	12	302762	302773	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	452202664
133	NC_020385	AATTGA	2	12	302873	302884	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	452202665
134	NC_020385	ATTTGA	2	12	317631	317642	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	452202680
135	NC_020385	AATAAA	2	12	317647	317658	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	452202680
136	NC_020385	TCTTTT	2	12	324298	324309	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	452202687
137	NC_020385	CTTTCA	2	12	325717	325728	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_020385	ATCAAT	3	18	326492	326509	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.