MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-39

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020381	TA	3	6	677	682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020381	AC	3	6	2722	2727	50 %	0 %	0 %	50 %	452202138
3	NC_020381	AT	3	6	3272	3277	50 %	50 %	0 %	0 %	452202139
4	NC_020381	AT	3	6	3376	3381	50 %	50 %	0 %	0 %	452202139
5	NC_020381	CT	3	6	3394	3399	0 %	50 %	0 %	50 %	452202139
6	NC_020381	TA	3	6	3502	3507	50 %	50 %	0 %	0 %	452202140
7	NC_020381	TA	3	6	4699	4704	50 %	50 %	0 %	0 %	452202142
8	NC_020381	TA	3	6	5058	5063	50 %	50 %	0 %	0 %	452202142
9	NC_020381	TC	3	6	5337	5342	0 %	50 %	0 %	50 %	452202142
10	NC_020381	TC	3	6	6700	6705	0 %	50 %	0 %	50 %	452202145
11	NC_020381	AG	3	6	7137	7142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020381	AC	3	6	7211	7216	50 %	0 %	0 %	50 %	452202147
13	NC_020381	AG	3	6	7338	7343	50 %	0 %	50 %	0 %	452202147
14	NC_020381	TC	3	6	8190	8195	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020381	CA	3	6	8257	8262	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020381	GA	3	6	9420	9425	50 %	0 %	50 %	0 %	452202151
17	NC_020381	AT	3	6	9935	9940	50 %	50 %	0 %	0 %	452202152
18	NC_020381	AC	3	6	10535	10540	50 %	0 %	0 %	50 %	452202152
19	NC_020381	TA	3	6	11066	11071	50 %	50 %	0 %	0 %	452202153
20	NC_020381	GA	3	6	11151	11156	50 %	0 %	50 %	0 %	452202153
21	NC_020381	AG	3	6	12140	12145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020381	TA	3	6	12154	12159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020381	TA	3	6	12756	12761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020381	AT	4	8	12897	12904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020381	AT	3	6	15541	15546	50 %	50 %	0 %	0 %	452202162
26	NC_020381	TA	3	6	16004	16009	50 %	50 %	0 %	0 %	452202163
27	NC_020381	TA	3	6	16397	16402	50 %	50 %	0 %	0 %	452202163
28	NC_020381	AG	3	6	16692	16697	50 %	0 %	50 %	0 %	452202163
29	NC_020381	TA	3	6	17071	17076	50 %	50 %	0 %	0 %	452202164
30	NC_020381	TA	3	6	18023	18028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020381	GA	3	6	18070	18075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020381	TA	3	6	18524	18529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020381	AG	3	6	18557	18562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020381	CT	3	6	18569	18574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020381	TA	3	6	18918	18923	50 %	50 %	0 %	0 %	452202168
36	NC_020381	AT	3	6	22822	22827	50 %	50 %	0 %	0 %	452202172
37	NC_020381	TA	3	6	23244	23249	50 %	50 %	0 %	0 %	452202172
38	NC_020381	TA	3	6	23557	23562	50 %	50 %	0 %	0 %	452202173
39	NC_020381	TA	3	6	23850	23855	50 %	50 %	0 %	0 %	452202173
40	NC_020381	AT	3	6	25383	25388	50 %	50 %	0 %	0 %	452202174
41	NC_020381	TC	3	6	25685	25690	0 %	50 %	0 %	50 %	452202174
42	NC_020381	TC	3	6	25893	25898	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_020381	CT	3	6	26028	26033	0 %	50 %	0 %	50 %	452202175
44	NC_020381	TC	3	6	26142	26147	0 %	50 %	0 %	50 %	452202175
45	NC_020381	TG	3	6	27142	27147	0 %	50 %	50 %	0 %	452202175
46	NC_020381	AT	3	6	27219	27224	50 %	50 %	0 %	0 %	452202175
47	NC_020381	AT	3	6	27624	27629	50 %	50 %	0 %	0 %	452202175
48	NC_020381	CT	3	6	27953	27958	0 %	50 %	0 %	50 %	452202175
49	NC_020381	TA	3	6	29139	29144	50 %	50 %	0 %	0 %	452202176
50	NC_020381	AT	3	6	30173	30178	50 %	50 %	0 %	0 %	452202176
51	NC_020381	TG	3	6	30719	30724	0 %	50 %	50 %	0 %	452202177
52	NC_020381	GA	3	6	32495	32500	50 %	0 %	50 %	0 %	452202180
53	NC_020381	TA	3	6	32672	32677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020381	TA	3	6	33949	33954	50 %	50 %	0 %	0 %	452202181
55	NC_020381	TC	3	6	34295	34300	0 %	50 %	0 %	50 %	452202181
56	NC_020381	TA	3	6	34662	34667	50 %	50 %	0 %	0 %	452202182
57	NC_020381	TC	3	6	34776	34781	0 %	50 %	0 %	50 %	452202182
58	NC_020381	TA	3	6	35665	35670	50 %	50 %	0 %	0 %	452202183
59	NC_020381	AT	3	6	39188	39193	50 %	50 %	0 %	0 %	452202186
60	NC_020381	CA	3	6	39203	39208	50 %	0 %	0 %	50 %	452202186
61	NC_020381	GT	3	6	39679	39684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.