MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-39

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020381	ATTCA	2	10	959	968	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_020381	ATTTT	2	10	2253	2262	20 %	80 %	0 %	0 %	452202138
3	NC_020381	CTGTA	2	10	2497	2506	20 %	40 %	20 %	20 %	452202138
4	NC_020381	TAAGA	2	10	3061	3070	60 %	20 %	20 %	0 %	452202138
5	NC_020381	AAAAT	2	10	3660	3669	80 %	20 %	0 %	0 %	452202140
6	NC_020381	AATTT	2	10	5092	5101	40 %	60 %	0 %	0 %	452202142
7	NC_020381	TTCTT	2	10	7560	7569	0 %	80 %	0 %	20 %	452202147
8	NC_020381	AATGC	2	10	7665	7674	40 %	20 %	20 %	20 %	452202147
9	NC_020381	TCTTT	2	10	7880	7889	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_020381	TATGA	2	10	7905	7914	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020381	ATAAA	2	10	7942	7951	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020381	TAAAT	2	10	8155	8164	60 %	40 %	0 %	0 %	452202148
13	NC_020381	TTGGG	2	10	9631	9640	0 %	40 %	60 %	0 %	452202151
14	NC_020381	ATTTA	2	10	12590	12599	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020381	TCTTT	2	10	12723	12732	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_020381	TATAA	2	10	12907	12916	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020381	AGAGA	2	10	13434	13443	60 %	0 %	40 %	0 %	452202158
18	NC_020381	TTACA	2	10	14955	14964	40 %	40 %	0 %	20 %	452202160
19	NC_020381	AGGGG	2	10	16411	16420	20 %	0 %	80 %	0 %	452202163
20	NC_020381	TAATA	2	10	16698	16707	60 %	40 %	0 %	0 %	452202163
21	NC_020381	ATTAT	2	10	16758	16767	40 %	60 %	0 %	0 %	452202163
22	NC_020381	CTTTT	2	10	18617	18626	0 %	80 %	0 %	20 %	452202167
23	NC_020381	TTTTC	2	10	20039	20048	0 %	80 %	0 %	20 %	452202169
24	NC_020381	ATTCG	2	10	21155	21164	20 %	40 %	20 %	20 %	452202170
25	NC_020381	ATCAA	2	10	21564	21573	60 %	20 %	0 %	20 %	452202170
26	NC_020381	TTTCG	2	10	22346	22355	0 %	60 %	20 %	20 %	452202171
27	NC_020381	ATATT	2	10	22737	22746	40 %	60 %	0 %	0 %	452202172
28	NC_020381	GAACC	2	10	25560	25569	40 %	0 %	20 %	40 %	452202174
29	NC_020381	CAAAT	2	10	27493	27502	60 %	20 %	0 %	20 %	452202175
30	NC_020381	ATGAA	2	10	28656	28665	60 %	20 %	20 %	0 %	452202176
31	NC_020381	CAAAC	2	10	31962	31971	60 %	0 %	0 %	40 %	452202179
32	NC_020381	AAACT	2	10	33557	33566	60 %	20 %	0 %	20 %	452202181
33	NC_020381	AATTA	2	10	34225	34234	60 %	40 %	0 %	0 %	452202181
34	NC_020381	GTATT	2	10	34901	34910	20 %	60 %	20 %	0 %	452202182
35	NC_020381	CATTT	2	10	37403	37412	20 %	60 %	0 %	20 %	452202183

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.