MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-16

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020380	CAAA	2	8	248	255	75 %	0 %	0 %	25 %	452202119
2	NC_020380	AGCA	2	8	282	289	50 %	0 %	25 %	25 %	452202119
3	NC_020380	CAAT	2	8	1129	1136	50 %	25 %	0 %	25 %	452202119
4	NC_020380	TAAA	2	8	1968	1975	75 %	25 %	0 %	0 %	452202119
5	NC_020380	CAAT	2	8	1983	1990	50 %	25 %	0 %	25 %	452202119
6	NC_020380	TACT	2	8	2462	2469	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_020380	AGTA	2	8	3079	3086	50 %	25 %	25 %	0 %	452202121
8	NC_020380	TGCT	2	8	3162	3169	0 %	50 %	25 %	25 %	452202122
9	NC_020380	TATT	2	8	3477	3484	25 %	75 %	0 %	0 %	452202122
10	NC_020380	CATA	2	8	3528	3535	50 %	25 %	0 %	25 %	452202122
11	NC_020380	TTTG	2	8	4178	4185	0 %	75 %	25 %	0 %	452202122
12	NC_020380	TTAA	2	8	4880	4887	50 %	50 %	0 %	0 %	452202123
13	NC_020380	AGTT	2	8	5017	5024	25 %	50 %	25 %	0 %	452202123
14	NC_020380	AAAC	2	8	5849	5856	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020380	GTTT	2	8	5874	5881	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020380	AGAA	2	8	6202	6209	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020380	TGAA	2	8	6775	6782	50 %	25 %	25 %	0 %	452202125
18	NC_020380	AGAT	2	8	6959	6966	50 %	25 %	25 %	0 %	452202125
19	NC_020380	AGAA	2	8	7566	7573	75 %	0 %	25 %	0 %	452202126
20	NC_020380	AGGA	2	8	7609	7616	50 %	0 %	50 %	0 %	452202126
21	NC_020380	GATT	2	8	8061	8068	25 %	50 %	25 %	0 %	452202126
22	NC_020380	TTGC	2	8	8594	8601	0 %	50 %	25 %	25 %	452202126
23	NC_020380	AGTG	2	8	8629	8636	25 %	25 %	50 %	0 %	452202126
24	NC_020380	TCCA	2	8	8826	8833	25 %	25 %	0 %	50 %	452202126
25	NC_020380	ATTA	2	8	8936	8943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020380	AGAC	2	8	9484	9491	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_020380	GTCT	2	8	9779	9786	0 %	50 %	25 %	25 %	452202129
28	NC_020380	ACTT	2	8	9856	9863	25 %	50 %	0 %	25 %	452202129
29	NC_020380	CATC	2	8	9880	9887	25 %	25 %	0 %	50 %	452202129
30	NC_020380	TCTT	2	8	10904	10911	0 %	75 %	0 %	25 %	452202130
31	NC_020380	TTAA	2	8	10942	10949	50 %	50 %	0 %	0 %	452202130
32	NC_020380	TCAT	2	8	10978	10985	25 %	50 %	0 %	25 %	452202130
33	NC_020380	ATGA	2	8	11796	11803	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020380	ATAA	2	8	11905	11912	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020380	CTAA	2	8	12247	12254	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_020380	TATT	2	8	12451	12458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020380	AGAA	2	8	12507	12514	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020380	ATTG	2	8	12622	12629	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020380	TAGA	2	8	12661	12668	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020380	ATGG	2	8	13044	13051	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020380	ATTA	2	8	13204	13211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020380	TTTA	2	8	13212	13219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020380	AAAG	2	8	13605	13612	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020380	TAAT	2	8	13637	13644	50 %	50 %	0 %	0 %	452202133
45	NC_020380	TGAG	2	8	13703	13710	25 %	25 %	50 %	0 %	452202133
46	NC_020380	TAAA	2	8	13881	13888	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020380	CCAA	2	8	14122	14129	50 %	0 %	0 %	50 %	452202135
48	NC_020380	TCTT	2	8	14308	14315	0 %	75 %	0 %	25 %	452202135
49	NC_020380	ATAA	2	8	14620	14627	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020380	TATC	2	8	15120	15127	25 %	50 %	0 %	25 %	452202136
51	NC_020380	ATGA	2	8	15131	15138	50 %	25 %	25 %	0 %	452202136
52	NC_020380	ATCG	2	8	15245	15252	25 %	25 %	25 %	25 %	452202136
53	NC_020380	CTGG	2	8	15729	15736	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_020380	TATG	2	8	16021	16028	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.