MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-15

Total Repeats: 183

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020379	TAA	2	6	54	59	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202827
2	NC_020379	TAT	2	6	107	112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202827
3	NC_020379	CGA	2	6	191	196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202827
4	NC_020379	GGT	2	6	241	246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202827
5	NC_020379	AAT	2	6	334	339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202827
6	NC_020379	AGA	2	6	420	425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202827
7	NC_020379	CTA	2	6	453	458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202827
8	NC_020379	AAG	2	6	614	619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202827
9	NC_020379	TCA	2	6	891	896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202827
10	NC_020379	TTC	2	6	966	971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202827
11	NC_020379	GAT	2	6	1044	1049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202827
12	NC_020379	CCT	2	6	1131	1136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452202827
13	NC_020379	AGA	2	6	1139	1144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202827
14	NC_020379	GAA	2	6	1170	1175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202827
15	NC_020379	TCT	2	6	1572	1577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202828
16	NC_020379	TTC	2	6	1601	1606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202828
17	NC_020379	TAA	2	6	1651	1656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202828
18	NC_020379	TTA	2	6	1803	1808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202828
19	NC_020379	TTA	2	6	1981	1986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202828
20	NC_020379	TTC	2	6	2033	2038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202828
21	NC_020379	CCA	2	6	2040	2045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202828
22	NC_020379	GAG	2	6	2086	2091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452202828
23	NC_020379	CAA	2	6	2105	2110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202828
24	NC_020379	TTC	2	6	2162	2167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202828
25	NC_020379	ATG	2	6	2186	2191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202828
26	NC_020379	AAG	2	6	2192	2197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202828
27	NC_020379	GTA	2	6	2232	2237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202828
28	NC_020379	AGA	3	9	2369	2377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202828
29	NC_020379	GAT	2	6	2400	2405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202828
30	NC_020379	CAT	3	9	2458	2466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202828
31	NC_020379	GAA	2	6	2704	2709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202828
32	NC_020379	CTT	2	6	2728	2733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202828
33	NC_020379	TCA	2	6	2922	2927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202828
34	NC_020379	ATC	2	6	2942	2947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202828
35	NC_020379	ATG	2	6	2957	2962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202828
36	NC_020379	ATA	2	6	3032	3037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202828
37	NC_020379	TCA	3	9	3057	3065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202828
38	NC_020379	TCG	2	6	3190	3195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202828
39	NC_020379	TAA	2	6	3215	3220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202828
40	NC_020379	GTT	2	6	3298	3303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202828
41	NC_020379	CTT	2	6	3307	3312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202828
42	NC_020379	TAA	2	6	3412	3417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202828
43	NC_020379	TCT	2	6	3427	3432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202828
44	NC_020379	TCA	2	6	3499	3504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202828
45	NC_020379	GTA	2	6	3856	3861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202828
46	NC_020379	TTG	2	6	3884	3889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202828
47	NC_020379	GAA	2	6	3931	3936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202828
48	NC_020379	TAT	2	6	3988	3993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202828
49	NC_020379	TTG	2	6	4007	4012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202828
50	NC_020379	TAA	2	6	4025	4030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202828
51	NC_020379	AGA	2	6	4046	4051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202828
52	NC_020379	TTC	2	6	4133	4138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202828
53	NC_020379	AGT	2	6	4473	4478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202829
54	NC_020379	AGA	2	6	4555	4560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202829
55	NC_020379	TAA	2	6	4582	4587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202829
56	NC_020379	GAC	2	6	4616	4621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202829
57	NC_020379	TAA	2	6	4651	4656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202829
58	NC_020379	GTT	2	6	4753	4758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202829
59	NC_020379	CCT	2	6	4761	4766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452202829
60	NC_020379	AAT	2	6	4778	4783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202829
61	NC_020379	TTA	2	6	4890	4895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202829
62	NC_020379	CAA	2	6	4936	4941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202829
63	NC_020379	TTG	2	6	5006	5011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202829
64	NC_020379	CTA	2	6	5052	5057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202829
65	NC_020379	TCC	2	6	5282	5287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_020379	ACA	2	6	5382	5387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020379	TGT	2	6	5400	5405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020379	ATT	2	6	5406	5411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020379	AAT	2	6	5446	5451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020379	TAG	2	6	5525	5530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020379	TAA	2	6	5686	5691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020379	ATG	2	6	5699	5704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020379	AGG	2	6	5714	5719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020379	AAT	2	6	5838	5843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202830
75	NC_020379	CAA	2	6	5847	5852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202830
76	NC_020379	AAG	2	6	5929	5934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202830
77	NC_020379	ATC	2	6	5954	5959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202830
78	NC_020379	CAA	2	6	6114	6119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202830
79	NC_020379	CAA	3	9	6210	6218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202830
80	NC_020379	ATC	2	6	6219	6224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202830
81	NC_020379	CAA	2	6	6231	6236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202830
82	NC_020379	CAA	2	6	6384	6389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202830
83	NC_020379	TTC	2	6	6411	6416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202830
84	NC_020379	TTC	2	6	6423	6428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202830
85	NC_020379	CCT	2	6	6451	6456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_020379	CTC	2	6	6582	6587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452202831
87	NC_020379	TCA	2	6	6598	6603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202831
88	NC_020379	ATC	2	6	6627	6632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202831
89	NC_020379	TCA	2	6	6649	6654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202831
90	NC_020379	AAG	2	6	6738	6743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202831
91	NC_020379	GTT	2	6	7016	7021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202831
92	NC_020379	CTT	2	6	7088	7093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202831
93	NC_020379	CTA	2	6	7102	7107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202831
94	NC_020379	TTA	2	6	7135	7140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202831
95	NC_020379	GCT	2	6	7162	7167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202831
96	NC_020379	CCG	2	6	7175	7180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452202831
97	NC_020379	CTG	2	6	7205	7210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202831
98	NC_020379	GTG	2	6	7228	7233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202831
99	NC_020379	TAT	2	6	7373	7378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020379	ATT	2	6	7381	7386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020379	AGG	2	6	7421	7426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020379	ATT	2	6	7558	7563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020379	TAA	2	6	7669	7674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020379	TGT	2	6	7698	7703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020379	ACA	2	6	7800	7805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202832
106	NC_020379	TAC	2	6	8097	8102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_020379	ATA	2	6	8117	8122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020379	CCG	2	6	8172	8177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_020379	CGC	2	6	8225	8230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_020379	GAT	2	6	8340	8345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020379	AAT	2	6	8427	8432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020379	AAC	2	6	8536	8541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202833
113	NC_020379	ATT	2	6	8542	8547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202833
114	NC_020379	TTC	2	6	8730	8735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_020379	GAC	2	6	8981	8986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_020379	ACT	2	6	9007	9012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_020379	TAA	2	6	9122	9127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020379	CGC	2	6	9165	9170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_020379	ATC	2	6	9253	9258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_020379	ATT	2	6	9259	9264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020379	TAT	2	6	9509	9514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020379	TAA	2	6	9580	9585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020379	GGA	2	6	9844	9849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452202834
124	NC_020379	TAA	2	6	9995	10000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202835
125	NC_020379	CGC	2	6	10088	10093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452202835
126	NC_020379	CTT	2	6	10176	10181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202835
127	NC_020379	AAG	2	6	10390	10395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202835
128	NC_020379	CTT	2	6	10457	10462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202835
129	NC_020379	TTA	2	6	10513	10518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202835
130	NC_020379	TTA	2	6	10531	10536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202835
131	NC_020379	TTC	2	6	10617	10622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202835
132	NC_020379	TTC	2	6	10662	10667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202835
133	NC_020379	CTC	2	6	10947	10952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452202835
134	NC_020379	CAT	2	6	10965	10970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202835
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.