MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens IT-45

Total Repeats: 84386

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_020272	ATGTTC	2	12	45586	45597	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451344809
1003	NC_020272	TGTA	2	8	45609	45616	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_020272	T	7	7	45619	45625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_020272	TCC	2	6	45643	45648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_020272	A	7	7	45678	45684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_020272	CAT	2	6	45791	45796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_020272	GAT	2	6	45845	45850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_020272	A	6	6	45860	45865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_020272	AT	3	6	45875	45880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_020272	A	6	6	45916	45921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_020272	CT	3	6	45923	45928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_020272	A	6	6	45929	45934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_020272	T	6	6	45944	45949	0 %	100 %	0 %	0 %	451344810
1015	NC_020272	GATA	2	8	45953	45960	50 %	25 %	25 %	0 %	451344810
1016	NC_020272	TGG	2	6	45970	45975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451344810
1017	NC_020272	A	6	6	46041	46046	100 %	0 %	0 %	0 %	451344810
1018	NC_020272	ATG	2	6	46149	46154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451344810
1019	NC_020272	GGGC	2	8	46208	46215	0 %	0 %	75 %	25 %	451344810
1020	NC_020272	CCG	2	6	46236	46241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451344810
1021	NC_020272	ACA	2	6	46260	46265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451344810
1022	NC_020272	CAG	2	6	46286	46291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451344810
1023	NC_020272	CGTG	2	8	46387	46394	0 %	25 %	50 %	25 %	451344810
1024	NC_020272	AATG	2	8	46400	46407	50 %	25 %	25 %	0 %	451344810
1025	NC_020272	AGC	2	6	46434	46439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451344810
1026	NC_020272	GAA	2	6	46510	46515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344810
1027	NC_020272	AAG	2	6	46598	46603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344810
1028	NC_020272	CTGTC	2	10	46611	46620	0 %	40 %	20 %	40 %	451344810
1029	NC_020272	C	6	6	46771	46776	0 %	0 %	0 %	100 %	451344810
1030	NC_020272	TGT	2	6	46811	46816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_020272	AAGA	2	8	46825	46832	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_020272	TGT	2	6	46871	46876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_020272	AAT	2	6	46890	46895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_020272	A	6	6	46899	46904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_020272	AT	3	6	46921	46926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_020272	TA	3	6	46927	46932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_020272	AAT	2	6	46954	46959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_020272	TGA	2	6	46990	46995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_020272	A	7	7	47004	47010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_020272	TTTC	2	8	47079	47086	0 %	75 %	0 %	25 %	451344811
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1046	NC_020272	TTC	2	6	47376	47381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451344811
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1048	NC_020272	AG	3	6	47518	47523	50 %	0 %	50 %	0 %	451344811
1049	NC_020272	TTTC	2	8	47558	47565	0 %	75 %	0 %	25 %	451344811
1050	NC_020272	GTA	2	6	47637	47642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451344811
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1053	NC_020272	CCA	2	6	47786	47791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451344811
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1055	NC_020272	T	6	6	47887	47892	0 %	100 %	0 %	0 %	451344811
1056	NC_020272	T	6	6	47960	47965	0 %	100 %	0 %	0 %	451344811
1057	NC_020272	ATA	2	6	47968	47973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451344811
1058	NC_020272	T	6	6	47985	47990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_020272	AAG	2	6	48070	48075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_020272	TTG	2	6	48081	48086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_020272	GAG	2	6	48093	48098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_020272	A	6	6	48150	48155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_020272	GGA	2	6	48164	48169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_020272	AT	3	6	48182	48187	50 %	50 %	0 %	0 %	451344812
1065	NC_020272	AAG	2	6	48195	48200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344812
1066	NC_020272	CGG	2	6	48232	48237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451344812
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1068	NC_020272	A	6	6	48277	48282	100 %	0 %	0 %	0 %	451344812
1069	NC_020272	CAG	2	6	48389	48394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451344812
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1072	NC_020272	AAG	2	6	48546	48551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344812
1073	NC_020272	TGC	2	6	48572	48577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_020272	T	8	8	48578	48585	0 %	100 %	0 %	0 %	451344813
1075	NC_020272	CAT	2	6	48619	48624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451344813
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1078	NC_020272	GCC	2	6	48812	48817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451344813
1079	NC_020272	GC	3	6	48837	48842	0 %	0 %	50 %	50 %	451344813
1080	NC_020272	TCT	2	6	48843	48848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451344813
1081	NC_020272	GAA	2	6	48881	48886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344813
1082	NC_020272	ATGG	2	8	48920	48927	25 %	25 %	50 %	0 %	451344813
1083	NC_020272	CATGC	2	10	49039	49048	20 %	20 %	20 %	40 %	451344813
1084	NC_020272	TGT	2	6	49127	49132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_020272	CTT	2	6	49223	49228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451344814
1086	NC_020272	CAG	2	6	49235	49240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451344814
1087	NC_020272	CT	3	6	49261	49266	0 %	50 %	0 %	50 %	451344814
1088	NC_020272	TTATCG	2	12	49270	49281	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451344814
1089	NC_020272	GAT	2	6	49338	49343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451344814
1090	NC_020272	AT	3	6	49465	49470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_020272	GCG	2	6	49521	49526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_020272	GTC	2	6	49538	49543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_020272	GCT	2	6	49547	49552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_020272	TTC	2	6	49696	49701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451344815
1095	NC_020272	CTTTG	2	10	49703	49712	0 %	60 %	20 %	20 %	451344815
1096	NC_020272	ATGG	2	8	49763	49770	25 %	25 %	50 %	0 %	451344815
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1100	NC_020272	TGTGC	2	10	49919	49928	0 %	40 %	40 %	20 %	451344815
1101	NC_020272	CGT	2	6	49931	49936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451344815
1102	NC_020272	T	8	8	49936	49943	0 %	100 %	0 %	0 %	451344815
1103	NC_020272	ACC	2	6	49983	49988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451344815
1104	NC_020272	AGC	2	6	50035	50040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451344815
1105	NC_020272	T	6	6	50143	50148	0 %	100 %	0 %	0 %	451344815
1106	NC_020272	AG	3	6	50223	50228	50 %	0 %	50 %	0 %	451344815
1107	NC_020272	T	7	7	50380	50386	0 %	100 %	0 %	0 %	451344815
1108	NC_020272	CAT	2	6	50486	50491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451344815
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1111	NC_020272	ATC	2	6	50628	50633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451344816
1112	NC_020272	TCA	2	6	50641	50646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451344816
1113	NC_020272	TGC	2	6	50686	50691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451344816
1114	NC_020272	AGAAA	2	10	50736	50745	80 %	0 %	20 %	0 %	451344816
1115	NC_020272	A	6	6	50781	50786	100 %	0 %	0 %	0 %	451344816
1116	NC_020272	TCG	2	6	50899	50904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451344816
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1118	NC_020272	AGG	2	6	50953	50958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451344816
1119	NC_020272	AGT	2	6	50999	51004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451344816
1120	NC_020272	ACAGA	2	10	51045	51054	60 %	0 %	20 %	20 %	451344816
1121	NC_020272	GA	3	6	51081	51086	50 %	0 %	50 %	0 %	451344816
1122	NC_020272	AT	3	6	51098	51103	50 %	50 %	0 %	0 %	451344816
1123	NC_020272	ATG	2	6	51118	51123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451344816
1124	NC_020272	CA	3	6	51128	51133	50 %	0 %	0 %	50 %	451344816
1125	NC_020272	ATT	2	6	51182	51187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451344816
1126	NC_020272	A	6	6	51319	51324	100 %	0 %	0 %	0 %	451344816
1127	NC_020272	TTC	2	6	51377	51382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451344816
1128	NC_020272	CGG	2	6	51488	51493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451344816
1129	NC_020272	GC	3	6	51527	51532	0 %	0 %	50 %	50 %	451344816
1130	NC_020272	AGC	2	6	51573	51578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451344816
1131	NC_020272	AAG	2	6	51667	51672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344816
1132	NC_020272	GAA	2	6	51726	51731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344816
1133	NC_020272	A	6	6	51735	51740	100 %	0 %	0 %	0 %	451344816
1134	NC_020272	TCA	2	6	51763	51768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451344816
1135	NC_020272	GAC	2	6	51798	51803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451344816
1136	NC_020272	GCT	2	6	51806	51811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451344816
1137	NC_020272	GTC	2	6	51813	51818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451344816
1138	NC_020272	ACC	3	9	51892	51900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451344816
1139	NC_020272	TTA	2	6	51916	51921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451344816
1140	NC_020272	GCT	2	6	51929	51934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451344816
1141	NC_020272	GCT	2	6	51983	51988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451344816
1142	NC_020272	CGC	2	6	52103	52108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451344816
1143	NC_020272	GGC	2	6	52292	52297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451344816
1144	NC_020272	ATT	2	6	52407	52412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451344816
1145	NC_020272	GAAG	2	8	52499	52506	50 %	0 %	50 %	0 %	451344816
1146	NC_020272	TGA	2	6	52511	52516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451344816
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1148	NC_020272	A	7	7	52579	52585	100 %	0 %	0 %	0 %	451344817
1149	NC_020272	A	6	6	52634	52639	100 %	0 %	0 %	0 %	451344817
1150	NC_020272	AGAA	2	8	52689	52696	75 %	0 %	25 %	0 %	451344817
1151	NC_020272	A	6	6	52703	52708	100 %	0 %	0 %	0 %	451344817
1152	NC_020272	GAAA	2	8	52744	52751	75 %	0 %	25 %	0 %	451344817
1153	NC_020272	GGC	2	6	52796	52801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451344817
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1155	NC_020272	A	6	6	52848	52853	100 %	0 %	0 %	0 %	451344817
1156	NC_020272	AGA	2	6	52978	52983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344817
1157	NC_020272	CCG	2	6	53006	53011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1158	NC_020272	CGG	2	6	53015	53020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1159	NC_020272	T	7	7	53022	53028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1160	NC_020272	GCA	2	6	53032	53037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1161	NC_020272	GCGCA	2	10	53042	53051	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1162	NC_020272	ATG	2	6	53057	53062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1163	NC_020272	ATATT	2	10	53096	53105	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1164	NC_020272	CAT	2	6	53107	53112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1165	NC_020272	T	7	7	53140	53146	0 %	100 %	0 %	0 %	451344818
1166	NC_020272	TAA	2	6	53160	53165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451344818
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1171	NC_020272	AGAAA	2	10	53407	53416	80 %	0 %	20 %	0 %	451344818
1172	NC_020272	CTG	2	6	53438	53443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451344818
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1174	NC_020272	T	7	7	53725	53731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1227	NC_020272	GGAG	2	8	55748	55755	25 %	0 %	75 %	0 %	451344820
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1229	NC_020272	TATCG	2	10	55873	55882	20 %	40 %	20 %	20 %	451344821
1230	NC_020272	GAA	2	6	55936	55941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344821
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1232	NC_020272	CTGA	2	8	55954	55961	25 %	25 %	25 %	25 %	451344821
1233	NC_020272	TGA	2	6	56007	56012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451344821
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1235	NC_020272	CT	3	6	56082	56087	0 %	50 %	0 %	50 %	451344821
1236	NC_020272	AAAGC	2	10	56108	56117	60 %	0 %	20 %	20 %	451344821
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1238	NC_020272	AAC	2	6	56170	56175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451344821
1239	NC_020272	GGCC	2	8	56235	56242	0 %	0 %	50 %	50 %	451344821
1240	NC_020272	A	7	7	56253	56259	100 %	0 %	0 %	0 %	451344821
1241	NC_020272	A	6	6	56266	56271	100 %	0 %	0 %	0 %	451344821
1242	NC_020272	ATC	2	6	56353	56358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451344821
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1244	NC_020272	TC	3	6	56429	56434	0 %	50 %	0 %	50 %	451344821
1245	NC_020272	CTG	2	6	56456	56461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451344821
1246	NC_020272	CGT	2	6	56481	56486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451344821
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1248	NC_020272	GGCA	2	8	56652	56659	25 %	0 %	50 %	25 %	451344821
1249	NC_020272	ACA	2	6	56697	56702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451344821
1250	NC_020272	CTT	2	6	56760	56765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451344821
1251	NC_020272	GAA	2	6	56775	56780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344821
1252	NC_020272	A	7	7	56832	56838	100 %	0 %	0 %	0 %	451344821
1253	NC_020272	TCTCA	2	10	56893	56902	20 %	40 %	0 %	40 %	451344821
1254	NC_020272	CGGAAG	2	12	56917	56928	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	451344821
1255	NC_020272	TTCG	2	8	57004	57011	0 %	50 %	25 %	25 %	451344822
1256	NC_020272	ACAG	2	8	57059	57066	50 %	0 %	25 %	25 %	451344822
1257	NC_020272	A	6	6	57095	57100	100 %	0 %	0 %	0 %	451344822
1258	NC_020272	A	7	7	57147	57153	100 %	0 %	0 %	0 %	451344822
1259	NC_020272	AT	3	6	57168	57173	50 %	50 %	0 %	0 %	451344822
1260	NC_020272	TGC	2	6	57204	57209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451344822
1261	NC_020272	ATCT	2	8	57215	57222	25 %	50 %	0 %	25 %	451344822
1262	NC_020272	TAT	2	6	57316	57321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451344822
1263	NC_020272	ATT	2	6	57460	57465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451344822
1264	NC_020272	AGG	2	6	57543	57548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451344822
1265	NC_020272	T	6	6	57556	57561	0 %	100 %	0 %	0 %	451344822
1266	NC_020272	CA	3	6	57592	57597	50 %	0 %	0 %	50 %	451344822
1267	NC_020272	ATTCA	2	10	57659	57668	40 %	40 %	0 %	20 %	451344822
1268	NC_020272	GGTTT	2	10	57697	57706	0 %	60 %	40 %	0 %	451344822
1269	NC_020272	AGA	2	6	57766	57771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344822
1270	NC_020272	GAAA	2	8	57802	57809	75 %	0 %	25 %	0 %	451344822
1271	NC_020272	CATT	2	8	57823	57830	25 %	50 %	0 %	25 %	451344822
1272	NC_020272	CCT	2	6	57839	57844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451344822
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1275	NC_020272	AG	3	6	58000	58005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1276	NC_020272	AGA	2	6	58022	58027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344823
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1279	NC_020272	GGA	2	6	58212	58217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451344823
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1285	NC_020272	GAAGGA	2	12	58433	58444	50 %	0 %	50 %	0 %	451344823
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1287	NC_020272	T	7	7	58531	58537	0 %	100 %	0 %	0 %	451344823
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1322	NC_020272	A	6	6	60006	60011	100 %	0 %	0 %	0 %	451344826
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1362	NC_020272	T	7	7	61954	61960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1363	NC_020272	GA	3	6	61974	61979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1364	NC_020272	AAAG	2	8	62005	62012	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1365	NC_020272	TA	3	6	62019	62024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1366	NC_020272	AGGG	2	8	62034	62041	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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1377	NC_020272	GAA	2	6	62472	62477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1378	NC_020272	ATAG	2	8	62528	62535	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1379	NC_020272	AAT	2	6	62586	62591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1380	NC_020272	TTTG	2	8	62649	62656	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1381	NC_020272	AT	3	6	62696	62701	50 %	50 %	0 %	0 %	451344830
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1385	NC_020272	GT	3	6	62894	62899	0 %	50 %	50 %	0 %	451344830
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