MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pHT73

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020249	ATTAT	2	10	5652	5661	40 %	60 %	0 %	0 %	449086469
2	NC_020249	GAGCC	2	10	6196	6205	20 %	0 %	40 %	40 %	449086469
3	NC_020249	ATTGA	2	10	6644	6653	40 %	40 %	20 %	0 %	449086469
4	NC_020249	TCTCT	2	10	6661	6670	0 %	60 %	0 %	40 %	449086469
5	NC_020249	TGATT	2	10	8492	8501	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020249	ATTTT	2	10	11619	11628	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020249	GAACA	2	10	12403	12412	60 %	0 %	20 %	20 %	449086473
8	NC_020249	TTATT	2	10	13410	13419	20 %	80 %	0 %	0 %	449086474
9	NC_020249	CAATT	2	10	15618	15627	40 %	40 %	0 %	20 %	449086476
10	NC_020249	CAAAT	2	10	16010	16019	60 %	20 %	0 %	20 %	449086476
11	NC_020249	GCAAT	2	10	16710	16719	40 %	20 %	20 %	20 %	449086476
12	NC_020249	TTCAA	2	10	18439	18448	40 %	40 %	0 %	20 %	449086478
13	NC_020249	ATTCA	2	10	21761	21770	40 %	40 %	0 %	20 %	449086479
14	NC_020249	ATTTT	2	10	23055	23064	20 %	80 %	0 %	0 %	449086480
15	NC_020249	CTGTA	2	10	23299	23308	20 %	40 %	20 %	20 %	449086480
16	NC_020249	TAAGA	2	10	23863	23872	60 %	20 %	20 %	0 %	449086480
17	NC_020249	TTGAA	2	10	25688	25697	40 %	40 %	20 %	0 %	449086481
18	NC_020249	ATATT	2	10	25923	25932	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020249	AAATA	2	10	26163	26172	80 %	20 %	0 %	0 %	449086482
20	NC_020249	AACAA	2	10	27138	27147	80 %	0 %	0 %	20 %	449086483
21	NC_020249	ACTCC	2	10	27376	27385	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
22	NC_020249	ACCGA	2	10	28773	28782	40 %	0 %	20 %	40 %	449086485
23	NC_020249	AGCTT	2	10	29868	29877	20 %	40 %	20 %	20 %	449086487
24	NC_020249	ATTTC	2	10	32725	32734	20 %	60 %	0 %	20 %	449086489
25	NC_020249	GAATA	2	10	33131	33140	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020249	ATATA	2	10	33443	33452	60 %	40 %	0 %	0 %	449086490
27	NC_020249	GTTTT	2	10	34116	34125	0 %	80 %	20 %	0 %	449086491
28	NC_020249	TATTG	2	10	35148	35157	20 %	60 %	20 %	0 %	449086492
29	NC_020249	ATCTT	2	10	35272	35281	20 %	60 %	0 %	20 %	449086492
30	NC_020249	AACTT	2	10	35290	35299	40 %	40 %	0 %	20 %	449086492
31	NC_020249	GAACA	2	10	36640	36649	60 %	0 %	20 %	20 %	449086493
32	NC_020249	TTATT	2	10	37647	37656	20 %	80 %	0 %	0 %	449086494
33	NC_020249	TTTTG	2	10	38526	38535	0 %	80 %	20 %	0 %	449086495
34	NC_020249	AAGAT	2	10	39212	39221	60 %	20 %	20 %	0 %	449086495
35	NC_020249	TGCTT	2	10	39398	39407	0 %	60 %	20 %	20 %	449086495
36	NC_020249	TTATG	2	10	41357	41366	20 %	60 %	20 %	0 %	449086497
37	NC_020249	TAATG	2	10	42194	42203	40 %	40 %	20 %	0 %	449086497
38	NC_020249	AAGGT	2	10	42706	42715	40 %	20 %	40 %	0 %	449086498
39	NC_020249	ATATT	2	10	42940	42949	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020249	TAATT	2	10	43031	43040	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020249	AGAGT	2	10	43574	43583	40 %	20 %	40 %	0 %	449086500
42	NC_020249	TACCC	2	10	43597	43606	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
43	NC_020249	TCTTT	2	10	43769	43778	0 %	80 %	0 %	20 %	449086501
44	NC_020249	TCCAA	2	10	43997	44006	40 %	20 %	0 %	40 %	449086501
45	NC_020249	GATAA	2	10	44469	44478	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020249	GAAAA	2	10	48199	48208	80 %	0 %	20 %	0 %	449086506
47	NC_020249	TAGAT	2	10	48654	48663	40 %	40 %	20 %	0 %	449086506
48	NC_020249	GGAAT	2	10	52799	52808	40 %	20 %	40 %	0 %	449086510
49	NC_020249	TAAAT	2	10	54768	54777	60 %	40 %	0 %	0 %	449086512
50	NC_020249	TTTGA	2	10	55809	55818	20 %	60 %	20 %	0 %	449086513
51	NC_020249	CGAAT	2	10	56219	56228	40 %	20 %	20 %	20 %	449086513
52	NC_020249	TTACT	2	10	57213	57222	20 %	60 %	0 %	20 %	449086514
53	NC_020249	TTAAG	2	10	57766	57775	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020249	TAAAT	2	10	57818	57827	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020249	AAAAG	2	10	57973	57982	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020249	TTCTA	2	10	58005	58014	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_020249	CCCTT	2	10	58323	58332	0 %	40 %	0 %	60 %	449086517
58	NC_020249	GTGAT	2	10	58986	58995	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020249	AATTA	2	10	59748	59757	60 %	40 %	0 %	0 %	449086522
60	NC_020249	AGGTA	2	10	59779	59788	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020249	AACTT	2	10	60469	60478	40 %	40 %	0 %	20 %	449086525
62	NC_020249	TGGAA	2	10	61497	61506	40 %	20 %	40 %	0 %	449086527
63	NC_020249	TGTTA	2	10	62205	62214	20 %	60 %	20 %	0 %	449086527
64	NC_020249	ATTTT	2	10	64667	64676	20 %	80 %	0 %	0 %	449086529
65	NC_020249	AAAAT	2	10	65780	65789	80 %	20 %	0 %	0 %	449086531
66	NC_020249	TTTGG	2	10	65818	65827	0 %	60 %	40 %	0 %	449086531
67	NC_020249	ATATT	2	10	66276	66285	40 %	60 %	0 %	0 %	449086532
68	NC_020249	AGAAA	2	10	67040	67049	80 %	0 %	20 %	0 %	449086533
69	NC_020249	CGTTT	2	10	67492	67501	0 %	60 %	20 %	20 %	449086533
70	NC_020249	TATTT	2	10	67792	67801	20 %	80 %	0 %	0 %	449086533
71	NC_020249	TTAAA	2	10	68055	68064	60 %	40 %	0 %	0 %	449086533
72	NC_020249	TGAAA	2	10	68527	68536	60 %	20 %	20 %	0 %	449086533
73	NC_020249	AGTGA	2	10	69366	69375	40 %	20 %	40 %	0 %	449086534
74	NC_020249	TATTT	2	10	69820	69829	20 %	80 %	0 %	0 %	449086535
75	NC_020249	AACAA	2	10	71275	71284	80 %	0 %	0 %	20 %	449086535
76	NC_020249	GAAGC	2	10	73181	73190	40 %	0 %	40 %	20 %	449086535
77	NC_020249	ATAAA	2	10	73221	73230	80 %	20 %	0 %	0 %	449086535

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.