MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pHT8_1

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020241	T	6	6	114	119	0 %	100 %	0 %	0 %	449092660
2	NC_020241	A	6	6	188	193	100 %	0 %	0 %	0 %	449092660
3	NC_020241	A	6	6	264	269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020241	A	6	6	285	290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020241	A	6	6	298	303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020241	T	6	6	312	317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020241	T	6	6	522	527	0 %	100 %	0 %	0 %	449092661
8	NC_020241	T	7	7	613	619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020241	A	6	6	768	773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020241	T	8	8	1179	1186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020241	T	7	7	1396	1402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020241	A	6	6	1789	1794	100 %	0 %	0 %	0 %	449092664
13	NC_020241	T	6	6	1823	1828	0 %	100 %	0 %	0 %	449092664
14	NC_020241	T	7	7	2039	2045	0 %	100 %	0 %	0 %	449092664
15	NC_020241	A	6	6	2648	2653	100 %	0 %	0 %	0 %	449092665
16	NC_020241	A	7	7	2742	2748	100 %	0 %	0 %	0 %	449092665
17	NC_020241	A	7	7	2911	2917	100 %	0 %	0 %	0 %	449092666
18	NC_020241	A	7	7	2953	2959	100 %	0 %	0 %	0 %	449092666
19	NC_020241	A	6	6	3247	3252	100 %	0 %	0 %	0 %	449092666
20	NC_020241	T	6	6	3313	3318	0 %	100 %	0 %	0 %	449092666
21	NC_020241	A	6	6	3373	3378	100 %	0 %	0 %	0 %	449092666
22	NC_020241	A	8	8	3665	3672	100 %	0 %	0 %	0 %	449092667
23	NC_020241	A	7	7	3788	3794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020241	T	6	6	3820	3825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020241	A	6	6	3933	3938	100 %	0 %	0 %	0 %	449092668
26	NC_020241	T	7	7	3949	3955	0 %	100 %	0 %	0 %	449092668
27	NC_020241	T	7	7	4109	4115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020241	T	7	7	4145	4151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020241	A	8	8	4415	4422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020241	A	7	7	4586	4592	100 %	0 %	0 %	0 %	449092670
31	NC_020241	T	8	8	4923	4930	0 %	100 %	0 %	0 %	449092671
32	NC_020241	A	7	7	5033	5039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020241	T	6	6	5381	5386	0 %	100 %	0 %	0 %	449092672
34	NC_020241	A	6	6	5440	5445	100 %	0 %	0 %	0 %	449092672
35	NC_020241	T	6	6	5508	5513	0 %	100 %	0 %	0 %	449092672
36	NC_020241	T	6	6	6274	6279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020241	T	6	6	6281	6286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020241	T	6	6	6312	6317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020241	A	8	8	6363	6370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020241	A	8	8	6383	6390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020241	T	7	7	6422	6428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020241	T	6	6	6456	6461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020241	A	9	9	6545	6553	100 %	0 %	0 %	0 %	449092673
44	NC_020241	A	7	7	6634	6640	100 %	0 %	0 %	0 %	449092673
45	NC_020241	T	6	6	6655	6660	0 %	100 %	0 %	0 %	449092673
46	NC_020241	T	7	7	7028	7034	0 %	100 %	0 %	0 %	449092674
47	NC_020241	A	6	6	7588	7593	100 %	0 %	0 %	0 %	449092674
48	NC_020241	A	6	6	7838	7843	100 %	0 %	0 %	0 %	449092675
49	NC_020241	A	7	7	7900	7906	100 %	0 %	0 %	0 %	449092675
50	NC_020241	A	6	6	7989	7994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020241	T	7	7	8103	8109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020241	T	7	7	8254	8260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020241	T	6	6	8292	8297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020241	T	7	7	8303	8309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020241	T	6	6	8357	8362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020241	A	6	6	8504	8509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.