MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pAW63

Total Repeats: 160

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020240	GA	3	6	788	793	50 %	0 %	50 %	0 %	449086378
2	NC_020240	TC	3	6	1006	1011	0 %	50 %	0 %	50 %	449086378
3	NC_020240	TA	3	6	1214	1219	50 %	50 %	0 %	0 %	449086379
4	NC_020240	TA	3	6	1412	1417	50 %	50 %	0 %	0 %	449086379
5	NC_020240	AT	3	6	2140	2145	50 %	50 %	0 %	0 %	449086380
6	NC_020240	TC	3	6	3237	3242	0 %	50 %	0 %	50 %	449086382
7	NC_020240	TA	3	6	5120	5125	50 %	50 %	0 %	0 %	449086383
8	NC_020240	TG	3	6	5712	5717	0 %	50 %	50 %	0 %	449086383
9	NC_020240	CT	3	6	5969	5974	0 %	50 %	0 %	50 %	449086383
10	NC_020240	AT	3	6	6491	6496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020240	TG	3	6	6616	6621	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020240	AT	3	6	6874	6879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020240	CT	3	6	7001	7006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_020240	AT	3	6	8822	8827	50 %	50 %	0 %	0 %	449086384
15	NC_020240	TA	3	6	9137	9142	50 %	50 %	0 %	0 %	449086384
16	NC_020240	TC	3	6	9519	9524	0 %	50 %	0 %	50 %	449086385
17	NC_020240	AC	3	6	9641	9646	50 %	0 %	0 %	50 %	449086385
18	NC_020240	AT	3	6	10090	10095	50 %	50 %	0 %	0 %	449086386
19	NC_020240	TC	3	6	11277	11282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_020240	GA	3	6	11317	11322	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020240	TC	3	6	11707	11712	0 %	50 %	0 %	50 %	449086388
22	NC_020240	TC	3	6	11788	11793	0 %	50 %	0 %	50 %	449086388
23	NC_020240	TC	3	6	11950	11955	0 %	50 %	0 %	50 %	449086388
24	NC_020240	TC	3	6	12112	12117	0 %	50 %	0 %	50 %	449086388
25	NC_020240	TC	3	6	12355	12360	0 %	50 %	0 %	50 %	449086388
26	NC_020240	TC	3	6	12623	12628	0 %	50 %	0 %	50 %	449086388
27	NC_020240	TC	3	6	12803	12808	0 %	50 %	0 %	50 %	449086388
28	NC_020240	TC	3	6	12893	12898	0 %	50 %	0 %	50 %	449086388
29	NC_020240	TC	3	6	12983	12988	0 %	50 %	0 %	50 %	449086388
30	NC_020240	AT	3	6	13696	13701	50 %	50 %	0 %	0 %	449086388
31	NC_020240	AC	3	6	14024	14029	50 %	0 %	0 %	50 %	449086388
32	NC_020240	AT	3	6	15200	15205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020240	GA	3	6	15477	15482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020240	AG	3	6	16730	16735	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020240	AT	3	6	17433	17438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020240	CA	3	6	17700	17705	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020240	AT	3	6	18656	18661	50 %	50 %	0 %	0 %	449086389
38	NC_020240	TC	3	6	19445	19450	0 %	50 %	0 %	50 %	449086389
39	NC_020240	AT	3	6	20336	20341	50 %	50 %	0 %	0 %	449086389
40	NC_020240	CT	3	6	20463	20468	0 %	50 %	0 %	50 %	449086389
41	NC_020240	GA	3	6	21155	21160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020240	TC	3	6	21295	21300	0 %	50 %	0 %	50 %	449086392
43	NC_020240	TC	3	6	21519	21524	0 %	50 %	0 %	50 %	449086392
44	NC_020240	CT	3	6	21691	21696	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_020240	GA	3	6	21707	21712	50 %	0 %	50 %	0 %	449086393
46	NC_020240	AT	3	6	21919	21924	50 %	50 %	0 %	0 %	449086393
47	NC_020240	CT	3	6	22896	22901	0 %	50 %	0 %	50 %	449086394
48	NC_020240	AT	3	6	23108	23113	50 %	50 %	0 %	0 %	449086394
49	NC_020240	AT	3	6	24043	24048	50 %	50 %	0 %	0 %	449086395
50	NC_020240	AC	3	6	24177	24182	50 %	0 %	0 %	50 %	449086395
51	NC_020240	TA	3	6	24253	24258	50 %	50 %	0 %	0 %	449086395
52	NC_020240	AT	3	6	24342	24347	50 %	50 %	0 %	0 %	449086395
53	NC_020240	TC	3	6	24967	24972	0 %	50 %	0 %	50 %	449086396
54	NC_020240	GA	3	6	25077	25082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020240	CT	3	6	25086	25091	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_020240	AT	3	6	25888	25893	50 %	50 %	0 %	0 %	449086399
57	NC_020240	TA	3	6	26423	26428	50 %	50 %	0 %	0 %	449086399
58	NC_020240	TA	3	6	26973	26978	50 %	50 %	0 %	0 %	449086399
59	NC_020240	GA	4	8	30048	30055	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020240	AT	3	6	30159	30164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020240	TA	3	6	30508	30513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020240	AT	3	6	30754	30759	50 %	50 %	0 %	0 %	449086401
63	NC_020240	TA	3	6	30812	30817	50 %	50 %	0 %	0 %	449086401
64	NC_020240	TG	3	6	31350	31355	0 %	50 %	50 %	0 %	449086402
65	NC_020240	AT	4	8	31769	31776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020240	AT	3	6	32184	32189	50 %	50 %	0 %	0 %	449086403
67	NC_020240	GT	4	8	33077	33084	0 %	50 %	50 %	0 %	449086405
68	NC_020240	TC	3	6	33342	33347	0 %	50 %	0 %	50 %	449086406
69	NC_020240	TA	3	6	33429	33434	50 %	50 %	0 %	0 %	449086406
70	NC_020240	TA	3	6	33592	33597	50 %	50 %	0 %	0 %	449086406
71	NC_020240	TA	3	6	34401	34406	50 %	50 %	0 %	0 %	449086409
72	NC_020240	AT	3	6	36108	36113	50 %	50 %	0 %	0 %	449086412
73	NC_020240	CT	3	6	36555	36560	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020240	AT	3	6	36589	36594	50 %	50 %	0 %	0 %	449086414
75	NC_020240	AT	3	6	37099	37104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020240	TG	3	6	37392	37397	0 %	50 %	50 %	0 %	449086415
77	NC_020240	AC	3	6	37754	37759	50 %	0 %	0 %	50 %	449086415
78	NC_020240	AT	3	6	38039	38044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020240	TC	3	6	38371	38376	0 %	50 %	0 %	50 %	449086416
80	NC_020240	TG	3	6	38616	38621	0 %	50 %	50 %	0 %	449086416
81	NC_020240	TC	3	6	38642	38647	0 %	50 %	0 %	50 %	449086416
82	NC_020240	TC	3	6	38656	38661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_020240	CA	3	6	39702	39707	50 %	0 %	0 %	50 %	449086418
84	NC_020240	CA	3	6	39944	39949	50 %	0 %	0 %	50 %	449086418
85	NC_020240	TA	3	6	39951	39956	50 %	50 %	0 %	0 %	449086418
86	NC_020240	CT	3	6	40038	40043	0 %	50 %	0 %	50 %	449086418
87	NC_020240	TA	3	6	40659	40664	50 %	50 %	0 %	0 %	449086418
88	NC_020240	TA	3	6	41630	41635	50 %	50 %	0 %	0 %	449086419
89	NC_020240	TA	3	6	41913	41918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020240	GA	3	6	41952	41957	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020240	CT	4	8	42178	42185	0 %	50 %	0 %	50 %	449086420
92	NC_020240	TG	3	6	42609	42614	0 %	50 %	50 %	0 %	449086420
93	NC_020240	CT	3	6	42838	42843	0 %	50 %	0 %	50 %	449086420
94	NC_020240	GA	3	6	43040	43045	50 %	0 %	50 %	0 %	449086420
95	NC_020240	TA	3	6	43313	43318	50 %	50 %	0 %	0 %	449086420
96	NC_020240	TA	3	6	44008	44013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020240	AG	3	6	44785	44790	50 %	0 %	50 %	0 %	449086421
98	NC_020240	AG	4	8	45361	45368	50 %	0 %	50 %	0 %	449086421
99	NC_020240	AT	3	6	45718	45723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020240	AT	4	8	45804	45811	50 %	50 %	0 %	0 %	449086423
101	NC_020240	AC	3	6	46043	46048	50 %	0 %	0 %	50 %	449086423
102	NC_020240	TA	3	6	48158	48163	50 %	50 %	0 %	0 %	449086424
103	NC_020240	CT	3	6	48315	48320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_020240	TC	3	6	48875	48880	0 %	50 %	0 %	50 %	449086425
105	NC_020240	TA	3	6	49400	49405	50 %	50 %	0 %	0 %	449086425
106	NC_020240	TA	3	6	49846	49851	50 %	50 %	0 %	0 %	449086426
107	NC_020240	TC	3	6	50449	50454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_020240	AT	3	6	50559	50564	50 %	50 %	0 %	0 %	449086428
109	NC_020240	CT	3	6	50630	50635	0 %	50 %	0 %	50 %	449086428
110	NC_020240	AT	3	6	51622	51627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020240	TC	3	6	51849	51854	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_020240	AT	3	6	52259	52264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020240	AC	3	6	53819	53824	50 %	0 %	0 %	50 %	449086432
114	NC_020240	TA	3	6	55414	55419	50 %	50 %	0 %	0 %	449086433
115	NC_020240	AC	3	6	55513	55518	50 %	0 %	0 %	50 %	449086433
116	NC_020240	CA	3	6	55642	55647	50 %	0 %	0 %	50 %	449086433
117	NC_020240	AT	3	6	56273	56278	50 %	50 %	0 %	0 %	449086434
118	NC_020240	AG	3	6	56766	56771	50 %	0 %	50 %	0 %	449086434
119	NC_020240	AG	3	6	56846	56851	50 %	0 %	50 %	0 %	449086434
120	NC_020240	AT	3	6	56955	56960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020240	TA	3	6	57035	57040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020240	TA	3	6	57849	57854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020240	TA	3	6	57860	57865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020240	TA	3	6	57925	57930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020240	TA	3	6	58108	58113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020240	TA	3	6	58561	58566	50 %	50 %	0 %	0 %	449086436
127	NC_020240	AG	3	6	58852	58857	50 %	0 %	50 %	0 %	449086437
128	NC_020240	TA	3	6	59205	59210	50 %	50 %	0 %	0 %	449086437
129	NC_020240	CT	3	6	59455	59460	0 %	50 %	0 %	50 %	449086437
130	NC_020240	TA	3	6	60272	60277	50 %	50 %	0 %	0 %	449086437
131	NC_020240	CT	3	6	60483	60488	0 %	50 %	0 %	50 %	449086437
132	NC_020240	AT	3	6	60950	60955	50 %	50 %	0 %	0 %	449086438
133	NC_020240	TA	3	6	61267	61272	50 %	50 %	0 %	0 %	449086438
134	NC_020240	CT	3	6	61716	61721	0 %	50 %	0 %	50 %	449086439
135	NC_020240	AT	3	6	61893	61898	50 %	50 %	0 %	0 %	449086439
136	NC_020240	AT	3	6	62229	62234	50 %	50 %	0 %	0 %	449086439
137	NC_020240	TA	3	6	62587	62592	50 %	50 %	0 %	0 %	449086439
138	NC_020240	TC	3	6	62659	62664	0 %	50 %	0 %	50 %	449086439
139	NC_020240	TA	3	6	62762	62767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020240	TC	3	6	62802	62807	0 %	50 %	0 %	50 %	449086440
141	NC_020240	AT	3	6	62824	62829	50 %	50 %	0 %	0 %	449086440
142	NC_020240	TA	3	6	62975	62980	50 %	50 %	0 %	0 %	449086440
143	NC_020240	TA	3	6	63333	63338	50 %	50 %	0 %	0 %	449086440
144	NC_020240	CA	3	6	63605	63610	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_020240	TC	4	8	63637	63644	0 %	50 %	0 %	50 %	449086441
146	NC_020240	CT	3	6	65365	65370	0 %	50 %	0 %	50 %	449086443
147	NC_020240	AT	3	6	65612	65617	50 %	50 %	0 %	0 %	449086443
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149	NC_020240	CT	3	6	66246	66251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.