MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pAW63

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020240	TTTGG	2	10	470	479	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020240	TCCTA	2	10	609	618	20 %	40 %	0 %	40 %	449086378
3	NC_020240	TTTTC	2	10	1763	1772	0 %	80 %	0 %	20 %	449086380
4	NC_020240	TTTCT	2	10	1976	1985	0 %	80 %	0 %	20 %	449086380
5	NC_020240	TTTGT	2	10	3306	3315	0 %	80 %	20 %	0 %	449086382
6	NC_020240	TTTCA	2	10	5055	5064	20 %	60 %	0 %	20 %	449086383
7	NC_020240	TCTCT	2	10	7753	7762	0 %	60 %	0 %	40 %	449086384
8	NC_020240	AGAAA	2	10	11333	11342	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020240	CGCTT	2	10	11670	11679	0 %	40 %	20 %	40 %	449086388
10	NC_020240	TATTT	2	10	13128	13137	20 %	80 %	0 %	0 %	449086388
11	NC_020240	TTTTG	2	10	14243	14252	0 %	80 %	20 %	0 %	449086388
12	NC_020240	ATCAG	2	10	14284	14293	40 %	20 %	20 %	20 %	449086388
13	NC_020240	TTTCT	2	10	15104	15113	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_020240	ATGCA	2	10	15421	15430	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_020240	TTCTT	2	10	18426	18435	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_020240	TTCTT	2	10	18860	18869	0 %	80 %	0 %	20 %	449086389
17	NC_020240	AATTT	2	10	20826	20835	40 %	60 %	0 %	0 %	449086390
18	NC_020240	AAAAG	2	10	23119	23128	80 %	0 %	20 %	0 %	449086394
19	NC_020240	GTTTT	2	10	25141	25150	0 %	80 %	20 %	0 %	449086397
20	NC_020240	CAAAT	2	10	27505	27514	60 %	20 %	0 %	20 %	449086399
21	NC_020240	TTGTT	2	10	28251	28260	0 %	80 %	20 %	0 %	449086399
22	NC_020240	GATTG	2	10	28894	28903	20 %	40 %	40 %	0 %	449086399
23	NC_020240	TAATT	2	10	30199	30208	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020240	GATGT	2	10	36694	36703	20 %	40 %	40 %	0 %	449086414
25	NC_020240	TCTTT	2	10	36796	36805	0 %	80 %	0 %	20 %	449086414
26	NC_020240	CATTT	2	10	37074	37083	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_020240	CTTCT	2	10	38484	38493	0 %	60 %	0 %	40 %	449086416
28	NC_020240	ACATG	2	10	40046	40055	40 %	20 %	20 %	20 %	449086418
29	NC_020240	TAACT	2	10	40708	40717	40 %	40 %	0 %	20 %	449086418
30	NC_020240	CAACA	2	10	41249	41258	60 %	0 %	0 %	40 %	449086419
31	NC_020240	TATGA	2	10	44732	44741	40 %	40 %	20 %	0 %	449086421
32	NC_020240	CTTCA	2	10	46670	46679	20 %	40 %	0 %	40 %	449086424
33	NC_020240	CTGAC	2	10	47501	47510	20 %	20 %	20 %	40 %	449086424
34	NC_020240	TTTCT	2	10	48303	48312	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_020240	TATAA	2	10	49586	49595	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020240	AACAA	2	10	49727	49736	80 %	0 %	0 %	20 %	449086426
37	NC_020240	TAATA	2	10	49947	49956	60 %	40 %	0 %	0 %	449086426
38	NC_020240	TCTAC	2	10	51343	51352	20 %	40 %	0 %	40 %	449086429
39	NC_020240	TTACT	2	10	51877	51886	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_020240	TACAA	2	10	56061	56070	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_020240	ATATA	2	10	56081	56090	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020240	ATACA	2	10	56891	56900	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_020240	ATTTC	2	10	57215	57224	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_020240	GTTAT	2	10	58084	58093	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020240	CTGAC	2	10	63181	63190	20 %	20 %	20 %	40 %	449086440
46	NC_020240	ATGCA	2	10	64225	64234	40 %	20 %	20 %	20 %	449086441
47	NC_020240	AAATA	2	10	65039	65048	80 %	20 %	0 %	0 %	449086442
48	NC_020240	CCGAC	2	10	65490	65499	20 %	0 %	20 %	60 %	449086443
49	NC_020240	TAAAA	2	10	66269	66278	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020240	TCCAT	2	10	66640	66649	20 %	40 %	0 %	40 %	449086444
51	NC_020240	TTCGC	2	10	68408	68417	0 %	40 %	20 %	40 %	449086447
52	NC_020240	CTTTT	2	10	71309	71318	0 %	80 %	0 %	20 %	449086450
53	NC_020240	TTAGA	2	10	71362	71371	40 %	40 %	20 %	0 %	449086450

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.