MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Blattabacterium sp. (Blatta orientalis) str. Tarazona plasmid

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020196	ATT	3	9	187	195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020196	GAA	2	6	332	337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	444335883
3	NC_020196	AAG	2	6	399	404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	444335883
4	NC_020196	AGT	2	6	438	443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	444335883
5	NC_020196	AGA	2	6	484	489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	444335883
6	NC_020196	AGA	2	6	492	497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	444335883
7	NC_020196	CAT	2	6	516	521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444335883
8	NC_020196	TTC	2	6	546	551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	444335883
9	NC_020196	AAC	2	6	565	570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	444335883
10	NC_020196	CAA	2	6	621	626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020196	AAT	2	6	698	703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444335884
12	NC_020196	TAA	2	6	769	774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444335884
13	NC_020196	ATC	2	6	782	787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444335884
14	NC_020196	ATC	2	6	884	889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444335884
15	NC_020196	CAG	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444335885
16	NC_020196	ATA	2	6	1119	1124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444335885
17	NC_020196	GAG	2	6	1273	1278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	444335885
18	NC_020196	ATA	2	6	1350	1355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444335885
19	NC_020196	CTC	2	6	1413	1418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	444335886
20	NC_020196	AAT	2	6	1548	1553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444335886
21	NC_020196	ATA	2	6	1660	1665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444335886
22	NC_020196	TCA	2	6	1697	1702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444335886
23	NC_020196	AAT	2	6	1715	1720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444335886
24	NC_020196	CAA	2	6	1758	1763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	444335886
25	NC_020196	TTC	2	6	1798	1803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	444335886
26	NC_020196	ACA	2	6	1828	1833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	444335886
27	NC_020196	ATA	2	6	1838	1843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444335886
28	NC_020196	TTA	3	9	1893	1901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	444335887
29	NC_020196	TAT	2	6	1927	1932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	444335887
30	NC_020196	TTA	2	6	2022	2027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	444335887
31	NC_020196	TTG	2	6	2066	2071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	444335887
32	NC_020196	TCA	2	6	2113	2118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444335887
33	NC_020196	ATT	2	6	2249	2254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	444335887
34	NC_020196	TCC	2	6	2291	2296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_020196	GAA	2	6	2417	2422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	444335888
36	NC_020196	TTC	2	6	2722	2727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	444335888
37	NC_020196	CTG	2	6	2827	2832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	444335888
38	NC_020196	AGA	2	6	2884	2889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	444335888
39	NC_020196	AAC	2	6	2891	2896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	444335888
40	NC_020196	GCT	3	9	2909	2917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	444335888
41	NC_020196	CTT	2	6	2933	2938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	444335888
42	NC_020196	TCC	2	6	2945	2950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	444335888
43	NC_020196	TTA	2	6	2951	2956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	444335888
44	NC_020196	CAT	2	6	3015	3020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444335888
45	NC_020196	GCT	2	6	3077	3082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	444335888
46	NC_020196	CAT	2	6	3118	3123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444335888
47	NC_020196	AAT	2	6	3168	3173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444335888
48	NC_020196	TTG	2	6	3310	3315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	444335888
49	NC_020196	CAT	2	6	3376	3381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444335888
50	NC_020196	TAA	3	9	3623	3631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444335889
51	NC_020196	TAA	2	6	3637	3642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444335889

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.