MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Brachyspira pilosicoli P43/6/78 chromosome

Total Repeats: 2942

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019908	ATTGT	2	10	1449	1458	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019908	AGGAG	2	10	2325	2334	40 %	0 %	60 %	0 %	431806729
3	NC_019908	TATGG	2	10	3309	3318	20 %	40 %	40 %	0 %	431806731
4	NC_019908	GATTT	2	10	4126	4135	20 %	60 %	20 %	0 %	431806731
5	NC_019908	TTTAA	2	10	5448	5457	40 %	60 %	0 %	0 %	431806732
6	NC_019908	TTAAT	2	10	5911	5920	40 %	60 %	0 %	0 %	431806732
7	NC_019908	GGACA	2	10	6507	6516	40 %	0 %	40 %	20 %	431806734
8	NC_019908	TAAGA	2	10	7511	7520	60 %	20 %	20 %	0 %	431806735
9	NC_019908	ATTTT	2	10	8856	8865	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019908	AAAGC	2	10	10299	10308	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_019908	TTTCT	2	10	10321	10330	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_019908	TATAG	2	10	10767	10776	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019908	TTTAA	2	10	12712	12721	40 %	60 %	0 %	0 %	431806738
14	NC_019908	GAAGA	2	10	13291	13300	60 %	0 %	40 %	0 %	431806738
15	NC_019908	AAAAT	2	10	13884	13893	80 %	20 %	0 %	0 %	431806738
16	NC_019908	AGTTG	2	10	14918	14927	20 %	40 %	40 %	0 %	431806739
17	NC_019908	TAAAA	2	10	16065	16074	80 %	20 %	0 %	0 %	431806741
18	NC_019908	ATTTA	2	10	16191	16200	40 %	60 %	0 %	0 %	431806741
19	NC_019908	TGGAA	2	10	16369	16378	40 %	20 %	40 %	0 %	431806741
20	NC_019908	TTTAA	2	10	17080	17089	40 %	60 %	0 %	0 %	431806741
21	NC_019908	ATTAT	2	10	18478	18487	40 %	60 %	0 %	0 %	431806742
22	NC_019908	TAATA	2	10	19923	19932	60 %	40 %	0 %	0 %	431806742
23	NC_019908	ATTAT	2	10	20660	20669	40 %	60 %	0 %	0 %	431806745
24	NC_019908	TTACT	2	10	21631	21640	20 %	60 %	0 %	20 %	431806746
25	NC_019908	AAAAT	2	10	21947	21956	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019908	TTACT	2	10	22115	22124	20 %	60 %	0 %	20 %	431806747
27	NC_019908	ATTAA	2	10	23025	23034	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019908	TAAAA	2	10	24023	24032	80 %	20 %	0 %	0 %	431806749
29	NC_019908	TGTTT	2	10	25161	25170	0 %	80 %	20 %	0 %	431806750
30	NC_019908	TTTTG	2	10	26665	26674	0 %	80 %	20 %	0 %	431806752
31	NC_019908	AAATA	2	10	27852	27861	80 %	20 %	0 %	0 %	431806753
32	NC_019908	CTTCC	2	10	27877	27886	0 %	40 %	0 %	60 %	431806753
33	NC_019908	GTTTT	2	10	29769	29778	0 %	80 %	20 %	0 %	431806755
34	NC_019908	TATTT	2	10	30166	30175	20 %	80 %	0 %	0 %	431806756
35	NC_019908	TATCT	2	10	30361	30370	20 %	60 %	0 %	20 %	431806756
36	NC_019908	TAATT	2	10	30790	30799	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019908	GATAA	2	10	30958	30967	60 %	20 %	20 %	0 %	431806758
38	NC_019908	TTCTT	2	10	31717	31726	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_019908	TCATC	2	10	32890	32899	20 %	40 %	0 %	40 %	431806760
40	NC_019908	TAATT	2	10	34499	34508	40 %	60 %	0 %	0 %	431806761
41	NC_019908	TAAAA	2	10	36418	36427	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019908	ATAAA	2	10	36437	36446	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019908	AAAGA	2	10	36945	36954	80 %	0 %	20 %	0 %	431806763
44	NC_019908	GTTTG	2	10	38036	38045	0 %	60 %	40 %	0 %	431806763
45	NC_019908	GTTTG	2	10	38132	38141	0 %	60 %	40 %	0 %	431806763
46	NC_019908	TAAAA	2	10	39297	39306	80 %	20 %	0 %	0 %	431806763
47	NC_019908	AATTA	2	10	40363	40372	60 %	40 %	0 %	0 %	431806765
48	NC_019908	TTTTA	2	10	41724	41733	20 %	80 %	0 %	0 %	431806767
49	NC_019908	ACTGT	2	10	41884	41893	20 %	40 %	20 %	20 %	431806767
50	NC_019908	GTATT	2	10	44167	44176	20 %	60 %	20 %	0 %	431806767
51	NC_019908	AAATA	2	10	45472	45481	80 %	20 %	0 %	0 %	431806768
52	NC_019908	AAAAG	2	10	46048	46057	80 %	0 %	20 %	0 %	431806768
53	NC_019908	AAAAT	2	10	46263	46272	80 %	20 %	0 %	0 %	431806769
54	NC_019908	TAGAA	2	10	48205	48214	60 %	20 %	20 %	0 %	431806771
55	NC_019908	TAATA	2	10	48403	48412	60 %	40 %	0 %	0 %	431806771
56	NC_019908	TCTAA	2	10	48533	48542	40 %	40 %	0 %	20 %	431806771
57	NC_019908	TATGA	2	10	49016	49025	40 %	40 %	20 %	0 %	431806771
58	NC_019908	ACTTT	2	10	51312	51321	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_019908	TATTT	2	10	51481	51490	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019908	TTCTA	2	10	56074	56083	20 %	60 %	0 %	20 %	431806775
61	NC_019908	GTATT	2	10	56579	56588	20 %	60 %	20 %	0 %	431806776
62	NC_019908	TAGTT	2	10	56736	56745	20 %	60 %	20 %	0 %	431806776
63	NC_019908	ATCAA	2	10	58387	58396	60 %	20 %	0 %	20 %	431806778
64	NC_019908	AGCAA	2	10	58653	58662	60 %	0 %	20 %	20 %	431806778
65	NC_019908	TTAAA	2	10	58889	58898	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019908	AAAAG	2	10	60158	60167	80 %	0 %	20 %	0 %	431806779
67	NC_019908	ATTTA	2	10	60458	60467	40 %	60 %	0 %	0 %	431806779
68	NC_019908	TATAT	2	10	61275	61284	40 %	60 %	0 %	0 %	431806780
69	NC_019908	ATTTT	2	10	61354	61363	20 %	80 %	0 %	0 %	431806780
70	NC_019908	TATAA	2	10	61501	61510	60 %	40 %	0 %	0 %	431806780
71	NC_019908	ATATT	2	10	61514	61523	40 %	60 %	0 %	0 %	431806780
72	NC_019908	TAAGA	2	10	61755	61764	60 %	20 %	20 %	0 %	431806780
73	NC_019908	GATTT	2	10	61970	61979	20 %	60 %	20 %	0 %	431806780
74	NC_019908	GATAA	2	10	62035	62044	60 %	20 %	20 %	0 %	431806780
75	NC_019908	ATTAT	2	10	62298	62307	40 %	60 %	0 %	0 %	431806781
76	NC_019908	TAGTT	2	10	63203	63212	20 %	60 %	20 %	0 %	431806781
77	NC_019908	AATAT	2	10	63837	63846	60 %	40 %	0 %	0 %	431806782
78	NC_019908	ACAGA	2	10	64548	64557	60 %	0 %	20 %	20 %	431806782
79	NC_019908	TCTAT	2	10	65141	65150	20 %	60 %	0 %	20 %	431806783
80	NC_019908	AATAC	2	10	65953	65962	60 %	20 %	0 %	20 %	431806785
81	NC_019908	GAATT	2	10	66148	66157	40 %	40 %	20 %	0 %	431806785
82	NC_019908	TGTTT	2	10	68304	68313	0 %	80 %	20 %	0 %	431806787
83	NC_019908	TATAC	2	10	70055	70064	40 %	40 %	0 %	20 %	431806788
84	NC_019908	AAAAT	2	10	70414	70423	80 %	20 %	0 %	0 %	431806789
85	NC_019908	AAGAA	2	10	72282	72291	80 %	0 %	20 %	0 %	431806791
86	NC_019908	TCCAT	2	10	73894	73903	20 %	40 %	0 %	40 %	431806792
87	NC_019908	TTTTA	2	10	75016	75025	20 %	80 %	0 %	0 %	431806794
88	NC_019908	TAATA	2	10	76674	76683	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019908	TTTTC	2	10	76827	76836	0 %	80 %	0 %	20 %	431806796
90	NC_019908	ATATT	2	10	79161	79170	40 %	60 %	0 %	0 %	431806799
91	NC_019908	CTATT	2	10	84250	84259	20 %	60 %	0 %	20 %	431806806
92	NC_019908	AATAT	2	10	84723	84732	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019908	GAAAA	2	10	87358	87367	80 %	0 %	20 %	0 %	431806809
94	NC_019908	ATATT	2	10	87555	87564	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019908	GTAAA	2	10	90386	90395	60 %	20 %	20 %	0 %	431806811
96	NC_019908	AGCTA	2	10	91324	91333	40 %	20 %	20 %	20 %	431806813
97	NC_019908	TTATT	2	10	93156	93165	20 %	80 %	0 %	0 %	431806813
98	NC_019908	GAAGA	2	10	94280	94289	60 %	0 %	40 %	0 %	431806814
99	NC_019908	TAAAC	2	10	96298	96307	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_019908	ATTCT	2	10	98835	98844	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_019908	TTATT	2	10	99887	99896	20 %	80 %	0 %	0 %	431806817
102	NC_019908	TAATA	2	10	100991	101000	60 %	40 %	0 %	0 %	431806818
103	NC_019908	TAAGA	2	10	102956	102965	60 %	20 %	20 %	0 %	431806820
104	NC_019908	ATTTT	2	10	103667	103676	20 %	80 %	0 %	0 %	431806820
105	NC_019908	ATTTT	2	10	104640	104649	20 %	80 %	0 %	0 %	431806821
106	NC_019908	ATATT	2	10	105374	105383	40 %	60 %	0 %	0 %	431806821
107	NC_019908	ATTTA	2	10	105577	105586	40 %	60 %	0 %	0 %	431806821
108	NC_019908	CTGGT	2	10	106626	106635	0 %	40 %	40 %	20 %	431806822
109	NC_019908	ACAAG	2	10	107338	107347	60 %	0 %	20 %	20 %	431806822
110	NC_019908	CCTTT	2	10	107951	107960	0 %	60 %	0 %	40 %	431806822
111	NC_019908	GCCAA	2	10	108512	108521	40 %	0 %	20 %	40 %	431806823
112	NC_019908	TTTAA	2	10	109633	109642	40 %	60 %	0 %	0 %	431806824
113	NC_019908	CATTT	2	10	111157	111166	20 %	60 %	0 %	20 %	431806826
114	NC_019908	CAATA	2	10	111542	111551	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_019908	GGGTG	2	10	113189	113198	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019908	TATTT	2	10	113268	113277	20 %	80 %	0 %	0 %	431806828
117	NC_019908	CCAAG	2	10	114266	114275	40 %	0 %	20 %	40 %	431806828
118	NC_019908	TTTTC	2	10	114605	114614	0 %	80 %	0 %	20 %	431806828
119	NC_019908	ATATT	2	10	114782	114791	40 %	60 %	0 %	0 %	431806828
120	NC_019908	ACCGC	2	10	114839	114848	20 %	0 %	20 %	60 %	431806828
121	NC_019908	TTATT	2	10	115911	115920	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019908	TATGT	2	10	116099	116108	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019908	TACAA	2	10	116229	116238	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_019908	ATAAA	2	10	116773	116782	80 %	20 %	0 %	0 %	431806830
125	NC_019908	ATTTT	2	10	117877	117886	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019908	AATGG	2	10	118257	118266	40 %	20 %	40 %	0 %	431806831
127	NC_019908	TTCAT	2	10	118328	118337	20 %	60 %	0 %	20 %	431806831
128	NC_019908	TAAAA	2	10	118896	118905	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019908	AATAT	2	10	119001	119010	60 %	40 %	0 %	0 %	431806832
130	NC_019908	ATTAT	2	10	119220	119229	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019908	TACTA	2	10	119681	119690	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_019908	AGTTT	2	10	120607	120616	20 %	60 %	20 %	0 %	431806833
133	NC_019908	AAATT	2	10	123104	123113	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019908	ATATA	2	10	125298	125307	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019908	AAGTT	2	10	126523	126532	40 %	40 %	20 %	0 %	431806836
136	NC_019908	TTATG	2	10	127974	127983	20 %	60 %	20 %	0 %	431806837
137	NC_019908	ATTAT	2	10	128193	128202	40 %	60 %	0 %	0 %	431806837
138	NC_019908	ATATA	2	10	128625	128634	60 %	40 %	0 %	0 %	431806838
139	NC_019908	TATGA	2	10	128803	128812	40 %	40 %	20 %	0 %	431806838
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