MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Brachyspira pilosicoli P43/6/78 chromosome

Total Repeats: 8096

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019908	AGAT	2	8	14	21	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019908	AGTT	2	8	436	443	25 %	50 %	25 %	0 %	431806728
3	NC_019908	GAAA	2	8	891	898	75 %	0 %	25 %	0 %	431806728
4	NC_019908	TAAA	2	8	1677	1684	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019908	GTGA	2	8	2305	2312	25 %	25 %	50 %	0 %	431806729
6	NC_019908	AAAG	2	8	2475	2482	75 %	0 %	25 %	0 %	431806729
7	NC_019908	AAAG	3	12	2564	2575	75 %	0 %	25 %	0 %	431806730
8	NC_019908	TAAT	2	8	2757	2764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019908	AACA	2	8	2864	2871	75 %	0 %	0 %	25 %	431806731
10	NC_019908	TAAC	2	8	2959	2966	50 %	25 %	0 %	25 %	431806731
11	NC_019908	AAAC	2	8	3144	3151	75 %	0 %	0 %	25 %	431806731
12	NC_019908	AAAG	2	8	3323	3330	75 %	0 %	25 %	0 %	431806731
13	NC_019908	AAGA	2	8	3492	3499	75 %	0 %	25 %	0 %	431806731
14	NC_019908	TTAA	2	8	3990	3997	50 %	50 %	0 %	0 %	431806731
15	NC_019908	ACAA	2	8	4017	4024	75 %	0 %	0 %	25 %	431806731
16	NC_019908	CAAT	2	8	4052	4059	50 %	25 %	0 %	25 %	431806731
17	NC_019908	GAAA	2	8	4089	4096	75 %	0 %	25 %	0 %	431806731
18	NC_019908	ACAG	2	8	4500	4507	50 %	0 %	25 %	25 %	431806731
19	NC_019908	ACAA	2	8	4567	4574	75 %	0 %	0 %	25 %	431806731
20	NC_019908	AATA	2	8	4695	4702	75 %	25 %	0 %	0 %	431806731
21	NC_019908	TACT	2	8	5176	5183	25 %	50 %	0 %	25 %	431806732
22	NC_019908	TAAT	2	8	5218	5225	50 %	50 %	0 %	0 %	431806732
23	NC_019908	AAAT	2	8	5609	5616	75 %	25 %	0 %	0 %	431806732
24	NC_019908	TAAA	2	8	5653	5660	75 %	25 %	0 %	0 %	431806732
25	NC_019908	ATTT	2	8	5986	5993	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019908	TGAG	2	8	6816	6823	25 %	25 %	50 %	0 %	431806734
27	NC_019908	AATG	2	8	6931	6938	50 %	25 %	25 %	0 %	431806734
28	NC_019908	AAGA	2	8	7529	7536	75 %	0 %	25 %	0 %	431806735
29	NC_019908	ATGC	2	8	7898	7905	25 %	25 %	25 %	25 %	431806735
30	NC_019908	AAAT	2	8	7937	7944	75 %	25 %	0 %	0 %	431806735
31	NC_019908	ATTT	2	8	8002	8009	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019908	TTAT	2	8	8042	8049	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019908	TTTA	2	8	8736	8743	25 %	75 %	0 %	0 %	431806736
34	NC_019908	CTTC	2	8	8936	8943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_019908	ATTT	2	8	9000	9007	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019908	TATT	2	8	9071	9078	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019908	ATTA	2	8	9083	9090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019908	TTTC	2	8	9835	9842	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_019908	TAAA	2	8	9882	9889	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019908	GCAT	2	8	10927	10934	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_019908	TCTT	2	8	10978	10985	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_019908	ATGA	2	8	11200	11207	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019908	AAAT	2	8	11395	11402	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019908	GTAT	2	8	11669	11676	25 %	50 %	25 %	0 %	431806737
45	NC_019908	CAGC	2	8	11890	11897	25 %	0 %	25 %	50 %	431806737
46	NC_019908	CATA	2	8	12325	12332	50 %	25 %	0 %	25 %	431806738
47	NC_019908	TACA	2	8	13032	13039	50 %	25 %	0 %	25 %	431806738
48	NC_019908	GGAG	2	8	13280	13287	25 %	0 %	75 %	0 %	431806738
49	NC_019908	TGTA	2	8	15123	15130	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019908	GAAG	2	8	15239	15246	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019908	ATTA	2	8	15365	15372	50 %	50 %	0 %	0 %	431806740
52	NC_019908	TACC	2	8	15413	15420	25 %	25 %	0 %	50 %	431806740
53	NC_019908	TTTG	2	8	15578	15585	0 %	75 %	25 %	0 %	431806740
54	NC_019908	ATAC	2	8	15767	15774	50 %	25 %	0 %	25 %	431806740
55	NC_019908	AAGA	2	8	16359	16366	75 %	0 %	25 %	0 %	431806741
56	NC_019908	AGAA	2	8	18057	18064	75 %	0 %	25 %	0 %	431806742
57	NC_019908	GTAT	2	8	18117	18124	25 %	50 %	25 %	0 %	431806742
58	NC_019908	CTTC	2	8	18686	18693	0 %	50 %	0 %	50 %	431806742
59	NC_019908	ACAG	2	8	19353	19360	50 %	0 %	25 %	25 %	431806742
60	NC_019908	CTTC	2	8	19550	19557	0 %	50 %	0 %	50 %	431806742
61	NC_019908	AATG	2	8	19778	19785	50 %	25 %	25 %	0 %	431806742
62	NC_019908	ATGA	2	8	19823	19830	50 %	25 %	25 %	0 %	431806742
63	NC_019908	TTTA	2	8	21051	21058	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019908	AAAT	2	8	21111	21118	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019908	AAAC	2	8	21233	21240	75 %	0 %	0 %	25 %	431806746
66	NC_019908	TGCT	2	8	21450	21457	0 %	50 %	25 %	25 %	431806746
67	NC_019908	AATG	2	8	21463	21470	50 %	25 %	25 %	0 %	431806746
68	NC_019908	ACAG	2	8	21641	21648	50 %	0 %	25 %	25 %	431806746
69	NC_019908	ATTT	2	8	21977	21984	25 %	75 %	0 %	0 %	431806747
70	NC_019908	TGTT	2	8	22007	22014	0 %	75 %	25 %	0 %	431806747
71	NC_019908	AACA	2	8	22455	22462	75 %	0 %	0 %	25 %	431806747
72	NC_019908	ATTT	2	8	22971	22978	25 %	75 %	0 %	0 %	431806747
73	NC_019908	ATTA	2	8	23301	23308	50 %	50 %	0 %	0 %	431806748
74	NC_019908	GAAA	2	8	23712	23719	75 %	0 %	25 %	0 %	431806749
75	NC_019908	ATTT	2	8	23724	23731	25 %	75 %	0 %	0 %	431806749
76	NC_019908	GTAT	2	8	23899	23906	25 %	50 %	25 %	0 %	431806749
77	NC_019908	ATAA	2	8	24351	24358	75 %	25 %	0 %	0 %	431806749
78	NC_019908	CTTC	2	8	24483	24490	0 %	50 %	0 %	50 %	431806749
79	NC_019908	ACAA	2	8	24639	24646	75 %	0 %	0 %	25 %	431806749
80	NC_019908	TAAT	3	12	24673	24684	50 %	50 %	0 %	0 %	431806749
81	NC_019908	AATC	2	8	24927	24934	50 %	25 %	0 %	25 %	431806750
82	NC_019908	CATG	2	8	25077	25084	25 %	25 %	25 %	25 %	431806750
83	NC_019908	TTAT	2	8	25587	25594	25 %	75 %	0 %	0 %	431806751
84	NC_019908	AAAT	2	8	25631	25638	75 %	25 %	0 %	0 %	431806751
85	NC_019908	CAAT	2	8	25716	25723	50 %	25 %	0 %	25 %	431806751
86	NC_019908	TTTA	2	8	26081	26088	25 %	75 %	0 %	0 %	431806751
87	NC_019908	ATTT	2	8	26108	26115	25 %	75 %	0 %	0 %	431806751
88	NC_019908	TAAT	2	8	26341	26348	50 %	50 %	0 %	0 %	431806751
89	NC_019908	TTTG	2	8	26913	26920	0 %	75 %	25 %	0 %	431806752
90	NC_019908	ATTT	2	8	27113	27120	25 %	75 %	0 %	0 %	431806752
91	NC_019908	TAAT	2	8	27167	27174	50 %	50 %	0 %	0 %	431806752
92	NC_019908	AAAC	2	8	27683	27690	75 %	0 %	0 %	25 %	431806753
93	NC_019908	CATA	2	8	27979	27986	50 %	25 %	0 %	25 %	431806753
94	NC_019908	TGAT	2	8	28176	28183	25 %	50 %	25 %	0 %	431806753
95	NC_019908	GCCT	2	8	28311	28318	0 %	25 %	25 %	50 %	431806753
96	NC_019908	CTTC	2	8	28476	28483	0 %	50 %	0 %	50 %	431806753
97	NC_019908	TAAA	2	8	29036	29043	75 %	25 %	0 %	0 %	431806754
98	NC_019908	AAAG	2	8	29154	29161	75 %	0 %	25 %	0 %	431806754
99	NC_019908	AATA	2	8	29192	29199	75 %	25 %	0 %	0 %	431806754
100	NC_019908	ATCT	2	8	29223	29230	25 %	50 %	0 %	25 %	431806754
101	NC_019908	TAAA	2	8	30549	30556	75 %	25 %	0 %	0 %	431806757
102	NC_019908	TAAT	2	8	30802	30809	50 %	50 %	0 %	0 %	431806758
103	NC_019908	AATA	2	8	31165	31172	75 %	25 %	0 %	0 %	431806758
104	NC_019908	TAAA	2	8	31758	31765	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019908	GCAA	2	8	32783	32790	50 %	0 %	25 %	25 %	431806760
106	NC_019908	ATCT	2	8	33227	33234	25 %	50 %	0 %	25 %	431806760
107	NC_019908	TAGA	2	8	33385	33392	50 %	25 %	25 %	0 %	431806760
108	NC_019908	CATA	2	8	33628	33635	50 %	25 %	0 %	25 %	431806760
109	NC_019908	TCAT	2	8	33702	33709	25 %	50 %	0 %	25 %	431806760
110	NC_019908	CTTA	2	8	35123	35130	25 %	50 %	0 %	25 %	431806761
111	NC_019908	ACAT	2	8	36264	36271	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_019908	TAAA	2	8	36744	36751	75 %	25 %	0 %	0 %	431806763
113	NC_019908	TAAA	2	8	37188	37195	75 %	25 %	0 %	0 %	431806763
114	NC_019908	AAGA	2	8	37367	37374	75 %	0 %	25 %	0 %	431806763
115	NC_019908	TACT	2	8	37977	37984	25 %	50 %	0 %	25 %	431806763
116	NC_019908	GGTT	2	8	38240	38247	0 %	50 %	50 %	0 %	431806763
117	NC_019908	TCAC	2	8	38439	38446	25 %	25 %	0 %	50 %	431806763
118	NC_019908	TACT	2	8	38713	38720	25 %	50 %	0 %	25 %	431806763
119	NC_019908	AGAT	2	8	38734	38741	50 %	25 %	25 %	0 %	431806763
120	NC_019908	CTTG	2	8	39085	39092	0 %	50 %	25 %	25 %	431806763
121	NC_019908	GTAA	2	8	39128	39135	50 %	25 %	25 %	0 %	431806763
122	NC_019908	TAAT	2	8	39310	39317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019908	TAAA	2	8	39427	39434	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019908	TAGT	2	8	39876	39883	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019908	GCTA	2	8	39888	39895	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_019908	AGTG	2	8	40230	40237	25 %	25 %	50 %	0 %	431806765
127	NC_019908	ATTT	2	8	40803	40810	25 %	75 %	0 %	0 %	431806766
128	NC_019908	AAAT	2	8	40896	40903	75 %	25 %	0 %	0 %	431806766
129	NC_019908	TTTA	2	8	40947	40954	25 %	75 %	0 %	0 %	431806766
130	NC_019908	ATTT	2	8	41003	41010	25 %	75 %	0 %	0 %	431806766
131	NC_019908	ATTT	2	8	41036	41043	25 %	75 %	0 %	0 %	431806766
132	NC_019908	TATT	2	8	41201	41208	25 %	75 %	0 %	0 %	431806766
133	NC_019908	GCAA	2	8	41227	41234	50 %	0 %	25 %	25 %	431806766
134	NC_019908	TAAA	2	8	41369	41376	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019908	TAGT	2	8	41398	41405	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019908	GAAA	2	8	41900	41907	75 %	0 %	25 %	0 %	431806767
137	NC_019908	ATTT	2	8	41989	41996	25 %	75 %	0 %	0 %	431806767
138	NC_019908	TAAG	2	8	42130	42137	50 %	25 %	25 %	0 %	431806767
139	NC_019908	TAAT	2	8	42874	42881	50 %	50 %	0 %	0 %	431806767
140	NC_019908	AAAC	2	8	43245	43252	75 %	0 %	0 %	25 %	431806767
141	NC_019908	ATTT	2	8	43284	43291	25 %	75 %	0 %	0 %	431806767
142	NC_019908	ATTG	2	8	43559	43566	25 %	50 %	25 %	0 %	431806767
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