MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira pilosicoli P43/6/78 chromosome

Total Repeats: 81891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019908	TTA	2	6	15324	15329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_019908	A	6	6	15355	15360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_019908	ATTA	2	8	15365	15372	50 %	50 %	0 %	0 %	431806740
504	NC_019908	TACC	2	8	15413	15420	25 %	25 %	0 %	50 %	431806740
505	NC_019908	TAG	2	6	15464	15469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806740
506	NC_019908	CAT	2	6	15471	15476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431806740
507	NC_019908	CTA	2	6	15491	15496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431806740
508	NC_019908	T	7	7	15525	15531	0 %	100 %	0 %	0 %	431806740
509	NC_019908	TCA	2	6	15547	15552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431806740
510	NC_019908	TTTG	2	8	15578	15585	0 %	75 %	25 %	0 %	431806740
511	NC_019908	ATA	2	6	15596	15601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806740
512	NC_019908	TTTTTC	2	12	15603	15614	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	431806740
513	NC_019908	A	6	6	15666	15671	100 %	0 %	0 %	0 %	431806740
514	NC_019908	GTA	2	6	15697	15702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806740
515	NC_019908	AGC	2	6	15726	15731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431806740
516	NC_019908	ATAC	2	8	15767	15774	50 %	25 %	0 %	25 %	431806740
517	NC_019908	T	6	6	15819	15824	0 %	100 %	0 %	0 %	431806740
518	NC_019908	T	8	8	15845	15852	0 %	100 %	0 %	0 %	431806740
519	NC_019908	CTT	2	6	15890	15895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431806740
520	NC_019908	A	7	7	15952	15958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_019908	TAT	2	6	15959	15964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_019908	AAT	2	6	15975	15980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_019908	T	6	6	15990	15995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_019908	ATG	2	6	15997	16002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_019908	ACA	2	6	16012	16017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_019908	TAT	2	6	16041	16046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_019908	TAAAA	2	10	16065	16074	80 %	20 %	0 %	0 %	431806741
528	NC_019908	A	6	6	16071	16076	100 %	0 %	0 %	0 %	431806741
529	NC_019908	TAT	2	6	16078	16083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806741
530	NC_019908	T	6	6	16088	16093	0 %	100 %	0 %	0 %	431806741
531	NC_019908	ATT	2	6	16094	16099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806741
532	NC_019908	TTA	3	9	16114	16122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806741
533	NC_019908	ATT	2	6	16137	16142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806741
534	NC_019908	TAT	2	6	16184	16189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806741
535	NC_019908	ATTTA	2	10	16191	16200	40 %	60 %	0 %	0 %	431806741
536	NC_019908	AAG	3	9	16211	16219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806741
537	NC_019908	TCC	2	6	16227	16232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431806741
538	NC_019908	AAAGTA	2	12	16336	16347	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	431806741
539	NC_019908	AAGA	2	8	16359	16366	75 %	0 %	25 %	0 %	431806741
540	NC_019908	TGGAA	2	10	16369	16378	40 %	20 %	40 %	0 %	431806741
541	NC_019908	TA	3	6	16455	16460	50 %	50 %	0 %	0 %	431806741
542	NC_019908	ATT	2	6	16502	16507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806741
543	NC_019908	AGA	2	6	16539	16544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806741
544	NC_019908	TA	3	6	16556	16561	50 %	50 %	0 %	0 %	431806741
545	NC_019908	GGA	2	6	16594	16599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431806741
546	NC_019908	TTC	2	6	16659	16664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431806741
547	NC_019908	TGA	3	9	16818	16826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806741
548	NC_019908	CTT	3	9	16922	16930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431806741
549	NC_019908	TGC	2	6	16941	16946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431806741
550	NC_019908	ATT	2	6	16955	16960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806741
551	NC_019908	TTTAA	2	10	17080	17089	40 %	60 %	0 %	0 %	431806741
552	NC_019908	CTT	2	6	17122	17127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431806741
553	NC_019908	TA	3	6	17136	17141	50 %	50 %	0 %	0 %	431806741
554	NC_019908	ATT	2	6	17213	17218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806741
555	NC_019908	TGA	2	6	17220	17225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806741
556	NC_019908	AGA	2	6	17238	17243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806741
557	NC_019908	GA	3	6	17242	17247	50 %	0 %	50 %	0 %	431806741
558	NC_019908	TTC	2	6	17259	17264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431806741
559	NC_019908	AG	3	6	17278	17283	50 %	0 %	50 %	0 %	431806741
560	NC_019908	TA	3	6	17319	17324	50 %	50 %	0 %	0 %	431806741
561	NC_019908	AAG	2	6	17373	17378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806741
562	NC_019908	TTA	2	6	17396	17401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806741
563	NC_019908	ATT	2	6	17412	17417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806741
564	NC_019908	GA	3	6	17438	17443	50 %	0 %	50 %	0 %	431806741
565	NC_019908	A	6	6	17483	17488	100 %	0 %	0 %	0 %	431806741
566	NC_019908	TA	3	6	17544	17549	50 %	50 %	0 %	0 %	431806741
567	NC_019908	TGC	2	6	17550	17555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431806741
568	NC_019908	AT	5	10	17562	17571	50 %	50 %	0 %	0 %	431806741
569	NC_019908	GAT	2	6	17623	17628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806741
570	NC_019908	ATG	2	6	17654	17659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806741
571	NC_019908	TCA	2	6	17686	17691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431806741
572	NC_019908	GAG	2	6	17696	17701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431806741
573	NC_019908	GGC	2	6	17781	17786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431806741
574	NC_019908	TTA	2	6	17789	17794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806741
575	NC_019908	ATA	2	6	17854	17859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806741
576	NC_019908	A	6	6	17872	17877	100 %	0 %	0 %	0 %	431806741
577	NC_019908	ATC	2	6	17926	17931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431806742
578	NC_019908	TGT	2	6	17947	17952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431806742
579	NC_019908	AAG	2	6	17956	17961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806742
580	NC_019908	A	7	7	17974	17980	100 %	0 %	0 %	0 %	431806742
581	NC_019908	AAT	2	6	18010	18015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806742
582	NC_019908	CTC	2	6	18045	18050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431806742
583	NC_019908	AGAA	2	8	18057	18064	75 %	0 %	25 %	0 %	431806742
584	NC_019908	AT	4	8	18082	18089	50 %	50 %	0 %	0 %	431806742
585	NC_019908	GTAT	2	8	18117	18124	25 %	50 %	25 %	0 %	431806742
586	NC_019908	GCT	2	6	18125	18130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431806742
587	NC_019908	TA	3	6	18153	18158	50 %	50 %	0 %	0 %	431806742
588	NC_019908	A	7	7	18158	18164	100 %	0 %	0 %	0 %	431806742
589	NC_019908	CTG	2	6	18222	18227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431806742
590	NC_019908	GAT	2	6	18236	18241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806742
591	NC_019908	TGA	2	6	18328	18333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806742
592	NC_019908	TA	3	6	18338	18343	50 %	50 %	0 %	0 %	431806742
593	NC_019908	AGA	2	6	18457	18462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806742
594	NC_019908	ATTAT	2	10	18478	18487	40 %	60 %	0 %	0 %	431806742
595	NC_019908	CTG	2	6	18519	18524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431806742
596	NC_019908	TAT	2	6	18537	18542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806742
597	NC_019908	AT	3	6	18541	18546	50 %	50 %	0 %	0 %	431806742
598	NC_019908	ATA	2	6	18630	18635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806742
599	NC_019908	AG	3	6	18665	18670	50 %	0 %	50 %	0 %	431806742
600	NC_019908	CTTC	2	8	18686	18693	0 %	50 %	0 %	50 %	431806742
601	NC_019908	ATA	2	6	18695	18700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806742
602	NC_019908	AGA	2	6	18718	18723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806742
603	NC_019908	CT	3	6	18745	18750	0 %	50 %	0 %	50 %	431806742
604	NC_019908	TCT	2	6	18789	18794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431806742
605	NC_019908	AGC	2	6	18821	18826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431806742
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608	NC_019908	AT	4	8	18840	18847	50 %	50 %	0 %	0 %	431806742
609	NC_019908	CTG	2	6	18864	18869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431806742
610	NC_019908	TAT	2	6	18900	18905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806742
611	NC_019908	AT	3	6	18907	18912	50 %	50 %	0 %	0 %	431806742
612	NC_019908	GGC	2	6	18914	18919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431806742
613	NC_019908	TGC	2	6	18946	18951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431806742
614	NC_019908	AT	3	6	18995	19000	50 %	50 %	0 %	0 %	431806742
615	NC_019908	ACT	2	6	19094	19099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431806742
616	NC_019908	TGA	2	6	19156	19161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806742
617	NC_019908	AAT	2	6	19190	19195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806742
618	NC_019908	AAT	2	6	19307	19312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806742
619	NC_019908	TTA	2	6	19326	19331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806742
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627	NC_019908	TA	4	8	19788	19795	50 %	50 %	0 %	0 %	431806742
628	NC_019908	GAT	2	6	19802	19807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806742
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