MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira pilosicoli P43/6/78 chromosome

Total Repeats: 81891

< Previous12...678910111213141516...163164Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_019908	GAG	2	6	157551	157556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431806869
5003	NC_019908	ATA	2	6	157595	157600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806869
5004	NC_019908	AAT	2	6	157615	157620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806869
5005	NC_019908	CTATAG	2	12	157641	157652	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	431806869
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5007	NC_019908	ATT	2	6	157747	157752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806869
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5009	NC_019908	ATT	2	6	157831	157836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806869
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5011	NC_019908	AT	3	6	157960	157965	50 %	50 %	0 %	0 %	431806869
5012	NC_019908	T	7	7	157995	158001	0 %	100 %	0 %	0 %	431806869
5013	NC_019908	TAT	2	6	158068	158073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806869
5014	NC_019908	TA	5	10	158110	158119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_019908	AT	3	6	158134	158139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_019908	AT	4	8	158145	158152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_019908	T	7	7	158162	158168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_019908	CAAA	2	8	158173	158180	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5019	NC_019908	A	8	8	158178	158185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_019908	TAAA	2	8	158186	158193	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_019908	ATT	2	6	158202	158207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_019908	T	9	9	158221	158229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_019908	A	6	6	158233	158238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_019908	TAA	2	6	158239	158244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_019908	ATA	2	6	158247	158252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_019908	ATT	2	6	158275	158280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_019908	ATA	3	9	158286	158294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_019908	AT	3	6	158304	158309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_019908	AT	3	6	158319	158324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_019908	ATA	2	6	158339	158344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_019908	TA	4	8	158394	158401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_019908	AAAG	2	8	158406	158413	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_019908	AGA	2	6	158525	158530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806870
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5041	NC_019908	TTC	2	6	158866	158871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431806870
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5043	NC_019908	TGA	2	6	158923	158928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806870
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5046	NC_019908	AT	3	6	159010	159015	50 %	50 %	0 %	0 %	431806870
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5052	NC_019908	TAC	2	6	159253	159258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431806870
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5054	NC_019908	A	6	6	159295	159300	100 %	0 %	0 %	0 %	431806870
5055	NC_019908	A	7	7	159351	159357	100 %	0 %	0 %	0 %	431806870
5056	NC_019908	ATA	2	6	159362	159367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_019908	A	7	7	159388	159394	100 %	0 %	0 %	0 %	431806871
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5062	NC_019908	TAA	2	6	159522	159527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806871
5063	NC_019908	ATAGA	2	10	159539	159548	60 %	20 %	20 %	0 %	431806871
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5066	NC_019908	ATT	3	9	159687	159695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806871
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5073	NC_019908	TGA	2	6	159987	159992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806871
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5090	NC_019908	AT	3	6	160623	160628	50 %	50 %	0 %	0 %	431806871
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5099	NC_019908	TGAT	2	8	161054	161061	25 %	50 %	25 %	0 %	431806871
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5106	NC_019908	AACAG	2	10	161317	161326	60 %	0 %	20 %	20 %	431806871
5107	NC_019908	TACT	2	8	161330	161337	25 %	50 %	0 %	25 %	431806871
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5121	NC_019908	T	7	7	161745	161751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_019908	TAA	2	6	161785	161790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_019908	ATTT	2	8	161804	161811	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_019908	ATA	2	6	161833	161838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_019908	AT	3	6	161847	161852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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