MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus subtilis subsp. subtilis str. BSP1 chromosome

Total Repeats: 3179

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019896	GGTAT	2	10	95	104	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019896	GAAAA	2	10	2200	2209	80 %	0 %	20 %	0 %	430756778
3	NC_019896	GCAAG	2	10	7536	7545	40 %	0 %	40 %	20 %	430756774
4	NC_019896	TTCTT	2	10	7795	7804	0 %	80 %	0 %	20 %	430756773
5	NC_019896	ATGGC	2	10	7882	7891	20 %	20 %	40 %	20 %	430756773
6	NC_019896	ATAGA	2	10	8401	8410	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019896	ATTAT	2	10	8808	8817	40 %	60 %	0 %	0 %	430756772
8	NC_019896	GAGAA	2	10	12405	12414	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019896	AATGG	2	10	14470	14479	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019896	TATAA	2	10	15781	15790	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019896	TTATT	2	10	18986	18995	20 %	80 %	0 %	0 %	430756764
12	NC_019896	CGGTT	2	10	19421	19430	0 %	40 %	40 %	20 %	430756763
13	NC_019896	TTGGA	2	10	19670	19679	20 %	40 %	40 %	0 %	430756763
14	NC_019896	CAATC	2	10	20709	20718	40 %	20 %	0 %	40 %	430756762
15	NC_019896	GCGAT	2	10	20873	20882	20 %	20 %	40 %	20 %	430756762
16	NC_019896	CGTTA	2	10	20988	20997	20 %	40 %	20 %	20 %	430756762
17	NC_019896	TTAAC	2	10	24427	24436	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_019896	AGTTA	2	10	26274	26283	40 %	40 %	20 %	0 %	430756757
19	NC_019896	CCAGT	2	10	26308	26317	20 %	20 %	20 %	40 %	430756757
20	NC_019896	GAGTA	2	10	27186	27195	40 %	20 %	40 %	0 %	430756756
21	NC_019896	AAAAT	2	10	27407	27416	80 %	20 %	0 %	0 %	430756756
22	NC_019896	ATTGA	2	10	27430	27439	40 %	40 %	20 %	0 %	430756756
23	NC_019896	AAAGA	2	10	27613	27622	80 %	0 %	20 %	0 %	430756756
24	NC_019896	TGTGA	2	10	27996	28005	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019896	AAATG	2	10	28343	28352	60 %	20 %	20 %	0 %	430756755
26	NC_019896	TTTTC	2	10	28926	28935	0 %	80 %	0 %	20 %	430756755
27	NC_019896	GAAGG	2	10	31776	31785	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019896	CGTTT	2	10	32152	32161	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_019896	ATCAA	2	10	34509	34518	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_019896	CTATT	2	10	34772	34781	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_019896	ATAAG	2	10	34896	34905	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019896	AATAA	2	10	36098	36107	80 %	20 %	0 %	0 %	430756753
33	NC_019896	ATTGA	2	10	38070	38079	40 %	40 %	20 %	0 %	430756752
34	NC_019896	AAGGC	2	10	38858	38867	40 %	0 %	40 %	20 %	430756751
35	NC_019896	AAACG	2	10	40048	40057	60 %	0 %	20 %	20 %	430756749
36	NC_019896	TTCAT	2	10	40641	40650	20 %	60 %	0 %	20 %	430756748
37	NC_019896	TTTTC	2	10	40846	40855	0 %	80 %	0 %	20 %	430756748
38	NC_019896	AAAGA	2	10	41245	41254	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019896	TAGTT	2	10	41949	41958	20 %	60 %	20 %	0 %	430756747
40	NC_019896	GCAAA	2	10	43416	43425	60 %	0 %	20 %	20 %	430756745
41	NC_019896	ATGTA	2	10	44593	44602	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019896	CTGAG	2	10	45402	45411	20 %	20 %	40 %	20 %	430756742
43	NC_019896	GCCAA	2	10	45499	45508	40 %	0 %	20 %	40 %	430756742
44	NC_019896	GTGAA	2	10	46967	46976	40 %	20 %	40 %	0 %	430756741
45	NC_019896	TTTTA	2	10	47096	47105	20 %	80 %	0 %	0 %	430756740
46	NC_019896	CCAAA	2	10	48137	48146	60 %	0 %	0 %	40 %	430756740
47	NC_019896	CAAGC	2	10	50314	50323	40 %	0 %	20 %	40 %	430756738
48	NC_019896	CAGCG	2	10	51837	51846	20 %	0 %	40 %	40 %	430756737
49	NC_019896	TAAAA	2	10	52168	52177	80 %	20 %	0 %	0 %	430756737
50	NC_019896	TACTT	2	10	57742	57751	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_019896	ATGAA	2	10	58192	58201	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019896	AAGAA	2	10	58295	58304	80 %	0 %	20 %	0 %	430755616
53	NC_019896	AGTGG	2	10	62123	62132	20 %	20 %	60 %	0 %	430755618
54	NC_019896	CATGA	2	10	62256	62265	40 %	20 %	20 %	20 %	430755619
55	NC_019896	TCAAT	2	10	64633	64642	40 %	40 %	0 %	20 %	430755621
56	NC_019896	TTATT	2	10	65869	65878	20 %	80 %	0 %	0 %	430755623
57	NC_019896	TTTTG	2	10	66426	66435	0 %	80 %	20 %	0 %	430755623
58	NC_019896	TGAAG	2	10	67076	67085	40 %	20 %	40 %	0 %	430755624
59	NC_019896	GAGAA	2	10	67554	67563	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019896	TCAAC	2	10	67817	67826	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_019896	TCACG	2	10	70968	70977	20 %	20 %	20 %	40 %	430755627
62	NC_019896	TGAAG	2	10	71113	71122	40 %	20 %	40 %	0 %	430755627
63	NC_019896	AAAAC	2	10	74469	74478	80 %	0 %	0 %	20 %	430755629
64	NC_019896	ATCGG	2	10	75611	75620	20 %	20 %	40 %	20 %	430757872
65	NC_019896	GGACG	2	10	77669	77678	20 %	0 %	60 %	20 %	430757875
66	NC_019896	ACAGT	2	10	78498	78507	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_019896	CCGAA	2	10	79176	79185	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_019896	GTCCA	2	10	80552	80561	20 %	20 %	20 %	40 %	430757878
69	NC_019896	GAGAA	2	10	81026	81035	60 %	0 %	40 %	0 %	430757879
70	NC_019896	TCAGG	2	10	82371	82380	20 %	20 %	40 %	20 %	430757881
71	NC_019896	GGAAA	2	10	82497	82506	60 %	0 %	40 %	0 %	430757881
72	NC_019896	AATTG	2	10	85979	85988	40 %	40 %	20 %	0 %	430757885
73	NC_019896	GTATT	2	10	86559	86568	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019896	ATATT	2	10	88195	88204	40 %	60 %	0 %	0 %	430757886
75	NC_019896	TATGT	2	10	90869	90878	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019896	TCTTT	2	10	91519	91528	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_019896	TGATC	2	10	92506	92515	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_019896	GTGCT	2	10	96815	96824	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_019896	TGCCC	2	10	101328	101337	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
80	NC_019896	AAATA	2	10	102816	102825	80 %	20 %	0 %	0 %	430757889
81	NC_019896	TCATG	2	10	103246	103255	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_019896	CAAGC	2	10	104234	104243	40 %	0 %	20 %	40 %	430757890
83	NC_019896	ACAGC	2	10	104742	104751	40 %	0 %	20 %	40 %	430757890
84	NC_019896	TGAAA	2	10	105105	105114	60 %	20 %	20 %	0 %	430757891
85	NC_019896	GGAGC	2	10	106091	106100	20 %	0 %	60 %	20 %	430757892
86	NC_019896	AGAAC	2	10	106384	106393	60 %	0 %	20 %	20 %	430757892
87	NC_019896	GAAAA	2	10	107371	107380	80 %	0 %	20 %	0 %	430757893
88	NC_019896	CCTTG	2	10	107788	107797	0 %	40 %	20 %	40 %	430757893
89	NC_019896	AATGC	2	10	108176	108185	40 %	20 %	20 %	20 %	430757894
90	NC_019896	CGGAG	2	10	111737	111746	20 %	0 %	60 %	20 %	430757898
91	NC_019896	AAAGC	2	10	113230	113239	60 %	0 %	20 %	20 %	430757899
92	NC_019896	TCCAT	2	10	113488	113497	20 %	40 %	0 %	40 %	430757899
93	NC_019896	ACACG	2	10	114050	114059	40 %	0 %	20 %	40 %	430757900
94	NC_019896	AGATA	2	10	114138	114147	60 %	20 %	20 %	0 %	430757900
95	NC_019896	AATAA	2	10	114450	114459	80 %	20 %	0 %	0 %	430757900
96	NC_019896	ATGGT	2	10	114562	114571	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019896	CTTGT	2	10	114908	114917	0 %	60 %	20 %	20 %	430757901
98	NC_019896	TTGAT	2	10	120451	120460	20 %	60 %	20 %	0 %	430757450
99	NC_019896	GACAT	2	10	121550	121559	40 %	20 %	20 %	20 %	430757452
100	NC_019896	TTTAT	2	10	125876	125885	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019896	CAATG	2	10	127050	127059	40 %	20 %	20 %	20 %	430757457
102	NC_019896	TAATA	2	10	127883	127892	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019896	TGATG	2	10	131151	131160	20 %	40 %	40 %	0 %	430757460
104	NC_019896	TGATT	2	10	132425	132434	20 %	60 %	20 %	0 %	430757461
105	NC_019896	GATTC	2	10	136575	136584	20 %	40 %	20 %	20 %	430757464
106	NC_019896	TTGAA	2	10	136690	136699	40 %	40 %	20 %	0 %	430757464
107	NC_019896	GATCA	2	10	139222	139231	40 %	20 %	20 %	20 %	430757467
108	NC_019896	TTAAT	2	10	140632	140641	40 %	60 %	0 %	0 %	430757469
109	NC_019896	ACAAT	2	10	143781	143790	60 %	20 %	0 %	20 %	430757471
110	NC_019896	TTCTT	2	10	143797	143806	0 %	80 %	0 %	20 %	430757471
111	NC_019896	GAAAG	2	10	144264	144273	60 %	0 %	40 %	0 %	430757472
112	NC_019896	GTTTT	2	10	145701	145710	0 %	80 %	20 %	0 %	430757474
113	NC_019896	GAATC	2	10	147405	147414	40 %	20 %	20 %	20 %	430757477
114	NC_019896	AAAAG	2	10	149356	149365	80 %	0 %	20 %	0 %	430757480
115	NC_019896	CAAAT	2	10	150407	150416	60 %	20 %	0 %	20 %	430757482
116	NC_019896	AGCGG	2	10	150526	150535	20 %	0 %	60 %	20 %	430757482
117	NC_019896	ACTGG	2	10	152465	152474	20 %	20 %	40 %	20 %	430757484
118	NC_019896	TATTG	2	10	155638	155647	20 %	60 %	20 %	0 %	430757487
119	NC_019896	GAAGA	2	10	155786	155795	60 %	0 %	40 %	0 %	430757488
120	NC_019896	GAGCG	2	10	158412	158421	20 %	0 %	60 %	20 %	430757490
121	NC_019896	CGACA	2	10	162483	162492	40 %	0 %	20 %	40 %	430757493
122	NC_019896	ATTCC	2	10	162743	162752	20 %	40 %	0 %	40 %	430757493
123	NC_019896	CATCC	2	10	163532	163541	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
124	NC_019896	TAACT	2	10	164545	164554	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_019896	AGGGT	2	10	165151	165160	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019896	AACGG	2	10	167880	167889	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_019896	TGCTT	2	10	168060	168069	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_019896	GGAAT	2	10	169264	169273	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019896	TCAGC	2	10	170126	170135	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_019896	CAATC	2	10	170673	170682	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_019896	TCCGA	2	10	171007	171016	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_019896	TTTTA	2	10	171615	171624	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019896	ATTAT	2	10	171999	172008	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019896	ATCTC	2	10	173331	173340	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_019896	GTGAG	2	10	175254	175263	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019896	AACAG	2	10	175998	176007	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_019896	GTAAC	2	10	176375	176384	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_019896	TGGAG	2	10	177508	177517	20 %	20 %	60 %	0 %	430757495
139	NC_019896	TTATT	2	10	177534	177543	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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264	NC_019896	AGCAA	2	10	325064	325073	60 %	0 %	20 %	20 %	430755690
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