MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 84908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_019842	CCG	2	6	197741	197746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503710
4003	NC_019842	ATC	2	6	197765	197770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503710
4004	NC_019842	TCA	2	6	197802	197807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_019842	AG	3	6	197819	197824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_019842	A	6	6	197845	197850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_019842	A	6	6	197856	197861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_019842	A	8	8	197872	197879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_019842	TA	3	6	197913	197918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_019842	CGG	2	6	197987	197992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_019842	GGA	2	6	198025	198030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_019842	CGG	2	6	198072	198077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_019842	TCC	2	6	198091	198096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4014	NC_019842	A	7	7	198188	198194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_019842	CGG	2	6	198223	198228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_019842	C	6	6	198270	198275	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4017	NC_019842	CCA	2	6	198277	198282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4018	NC_019842	T	9	9	198387	198395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_019842	TCA	2	6	198425	198430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_019842	GCT	2	6	198447	198452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_019842	CCTG	2	8	198488	198495	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4022	NC_019842	TAA	2	6	198515	198520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_019842	A	8	8	198519	198526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_019842	A	7	7	198606	198612	100 %	0 %	0 %	0 %	429503711
4025	NC_019842	CAAG	2	8	198617	198624	50 %	0 %	25 %	25 %	429503711
4026	NC_019842	A	6	6	198627	198632	100 %	0 %	0 %	0 %	429503711
4027	NC_019842	AAGAT	2	10	198673	198682	60 %	20 %	20 %	0 %	429503711
4028	NC_019842	CGC	2	6	198920	198925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503711
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4030	NC_019842	AG	3	6	199119	199124	50 %	0 %	50 %	0 %	429503711
4031	NC_019842	TGA	2	6	199161	199166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_019842	TCCT	2	8	199223	199230	0 %	50 %	0 %	50 %	429503712
4033	NC_019842	ACA	2	6	199251	199256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429503712
4034	NC_019842	CTG	2	6	199346	199351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503712
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4036	NC_019842	GAT	2	6	199431	199436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503712
4037	NC_019842	GCG	2	6	199469	199474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503712
4038	NC_019842	T	6	6	199476	199481	0 %	100 %	0 %	0 %	429503712
4039	NC_019842	GT	3	6	199511	199516	0 %	50 %	50 %	0 %	429503712
4040	NC_019842	A	6	6	199596	199601	100 %	0 %	0 %	0 %	429503712
4041	NC_019842	CGT	2	6	199644	199649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503712
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4043	NC_019842	CGT	2	6	199758	199763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503712
4044	NC_019842	T	6	6	199815	199820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_019842	CGC	2	6	199827	199832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4046	NC_019842	ATG	2	6	199884	199889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_019842	GCA	2	6	199904	199909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_019842	GGA	2	6	199946	199951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_019842	AT	3	6	200031	200036	50 %	50 %	0 %	0 %	429503713
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4057	NC_019842	GCG	2	6	200502	200507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503713
4058	NC_019842	AGTGA	2	10	200589	200598	40 %	20 %	40 %	0 %	429503713
4059	NC_019842	ATT	2	6	200613	200618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503713
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4061	NC_019842	GAAA	2	8	200693	200700	75 %	0 %	25 %	0 %	429503713
4062	NC_019842	CTT	2	6	200737	200742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503713
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4064	NC_019842	CATTG	2	10	200811	200820	20 %	40 %	20 %	20 %	429503714
4065	NC_019842	GCT	3	9	200829	200837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503714
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4068	NC_019842	ATG	2	6	200954	200959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503714
4069	NC_019842	GTC	2	6	200971	200976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503714
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4071	NC_019842	CGGA	2	8	201128	201135	25 %	0 %	50 %	25 %	429503714
4072	NC_019842	GTCA	2	8	201156	201163	25 %	25 %	25 %	25 %	429503714
4073	NC_019842	A	6	6	201182	201187	100 %	0 %	0 %	0 %	429503714
4074	NC_019842	TAC	2	6	201217	201222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503714
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4077	NC_019842	TGTTGA	2	12	201420	201431	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	429503714
4078	NC_019842	GTCA	2	8	201435	201442	25 %	25 %	25 %	25 %	429503714
4079	NC_019842	AAGG	2	8	201498	201505	50 %	0 %	50 %	0 %	429503714
4080	NC_019842	A	6	6	201701	201706	100 %	0 %	0 %	0 %	429503714
4081	NC_019842	CAG	2	6	201790	201795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503714
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4083	NC_019842	AGACAA	2	12	202086	202097	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	429503714
4084	NC_019842	GAC	2	6	202114	202119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503714
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4087	NC_019842	GGAG	2	8	202397	202404	25 %	0 %	75 %	0 %	429503715
4088	NC_019842	ATCG	2	8	202424	202431	25 %	25 %	25 %	25 %	429503715
4089	NC_019842	GGCG	2	8	202505	202512	0 %	0 %	75 %	25 %	429503715
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4093	NC_019842	CGG	2	6	202726	202731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503715
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4095	NC_019842	ATG	2	6	202867	202872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503715
4096	NC_019842	AC	3	6	202884	202889	50 %	0 %	0 %	50 %	429503715
4097	NC_019842	A	7	7	202918	202924	100 %	0 %	0 %	0 %	429503715
4098	NC_019842	TGA	2	6	202976	202981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503715
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4105	NC_019842	CGG	2	6	203195	203200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503715
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4107	NC_019842	ATGAA	2	10	203320	203329	60 %	20 %	20 %	0 %	429503715
4108	NC_019842	A	6	6	203328	203333	100 %	0 %	0 %	0 %	429503715
4109	NC_019842	AGA	2	6	203381	203386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503715
4110	NC_019842	AG	3	6	203591	203596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_019842	ACAAG	2	10	203600	203609	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4112	NC_019842	ATA	2	6	203620	203625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_019842	ATG	2	6	203637	203642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_019842	A	6	6	203653	203658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_019842	CGG	2	6	203820	203825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_019842	TTC	2	6	203867	203872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_019842	A	7	7	203921	203927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_019842	TTC	2	6	203970	203975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_019842	AGG	2	6	203994	203999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4122	NC_019842	GTG	2	6	204176	204181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429503716
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4126	NC_019842	ATT	2	6	204484	204489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503716
4127	NC_019842	A	6	6	204523	204528	100 %	0 %	0 %	0 %	429503716
4128	NC_019842	CGT	2	6	204568	204573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503716
4129	NC_019842	GAAT	2	8	204607	204614	50 %	25 %	25 %	0 %	429503716
4130	NC_019842	AGC	2	6	204780	204785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503716
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4133	NC_019842	AT	3	6	204937	204942	50 %	50 %	0 %	0 %	429503716
4134	NC_019842	ACA	2	6	204996	205001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429503716
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4140	NC_019842	TTC	2	6	205397	205402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503716
4141	NC_019842	ACT	2	6	205419	205424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503716
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4152	NC_019842	TTA	2	6	205829	205834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4153	NC_019842	T	6	6	205845	205850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4154	NC_019842	ATAC	2	8	205867	205874	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4155	NC_019842	TA	3	6	205903	205908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4156	NC_019842	ATGC	2	8	205992	205999	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4157	NC_019842	TCA	2	6	206001	206006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4158	NC_019842	TCA	2	6	206031	206036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4159	NC_019842	TA	3	6	206048	206053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4160	NC_019842	AATC	2	8	206059	206066	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4161	NC_019842	A	6	6	206090	206095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4162	NC_019842	AAC	2	6	206165	206170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4163	NC_019842	T	6	6	206172	206177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4164	NC_019842	AAT	2	6	206179	206184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4165	NC_019842	A	7	7	206199	206205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4166	NC_019842	ACA	2	6	206212	206217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4167	NC_019842	ATG	2	6	206232	206237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503717
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4173	NC_019842	GGTT	2	8	206578	206585	0 %	50 %	50 %	0 %	429503717
4174	NC_019842	TTCT	2	8	206588	206595	0 %	75 %	0 %	25 %	429503717
4175	NC_019842	A	6	6	206610	206615	100 %	0 %	0 %	0 %	429503717
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4197	NC_019842	TCATT	2	10	207689	207698	20 %	60 %	0 %	20 %	429503718
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4202	NC_019842	GCAG	2	8	207813	207820	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4203	NC_019842	CCGC	2	8	207821	207828	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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4210	NC_019842	ATG	2	6	208051	208056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4211	NC_019842	CTTGG	2	10	208073	208082	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4212	NC_019842	GGT	2	6	208095	208100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4215	NC_019842	TTTATT	2	12	208419	208430	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4216	NC_019842	CTT	2	6	208462	208467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4217	NC_019842	GTGAAA	2	12	208507	208518	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4219	NC_019842	TGA	2	6	208632	208637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4222	NC_019842	AT	3	6	208718	208723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4223	NC_019842	TCC	2	6	208741	208746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4224	NC_019842	CAT	2	6	208757	208762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4226	NC_019842	CAT	2	6	208842	208847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4227	NC_019842	TA	3	6	208886	208891	50 %	50 %	0 %	0 %	429503719
4228	NC_019842	A	6	6	208891	208896	100 %	0 %	0 %	0 %	429503719
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4237	NC_019842	GA	3	6	209397	209402	50 %	0 %	50 %	0 %	429503719
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4240	NC_019842	CAG	2	6	209573	209578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503719
4241	NC_019842	CAT	2	6	209629	209634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503719
4242	NC_019842	TGA	2	6	209647	209652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503719
4243	NC_019842	CGG	2	6	209667	209672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503719
4244	NC_019842	ATC	2	6	209724	209729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503719
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4246	NC_019842	GCA	2	6	209809	209814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503719
4247	NC_019842	CGG	2	6	209835	209840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503719
4248	NC_019842	GCC	2	6	209849	209854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503719
4249	NC_019842	ATG	2	6	209895	209900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503719
4250	NC_019842	TA	3	6	210028	210033	50 %	50 %	0 %	0 %	429503719
4251	NC_019842	A	6	6	210041	210046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4252	NC_019842	ATG	2	6	210055	210060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4253	NC_019842	CTC	2	6	210093	210098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429503720
4254	NC_019842	CCG	2	6	210104	210109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503720
4255	NC_019842	CGTC	2	8	210127	210134	0 %	25 %	25 %	50 %	429503720
4256	NC_019842	TCA	2	6	210172	210177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503720
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4258	NC_019842	TTC	2	6	210387	210392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503720
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4275	NC_019842	GAT	2	6	211001	211006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4370	NC_019842	TGA	2	6	215298	215303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503725
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4375	NC_019842	G	6	6	215448	215453	0 %	0 %	100 %	0 %	429503726
4376	NC_019842	T	7	7	215463	215469	0 %	100 %	0 %	0 %	429503726
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4383	NC_019842	TCA	2	6	215760	215765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503726
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4493	NC_019842	GCT	2	6	220562	220567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4496	NC_019842	AGG	2	6	220838	220843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4497	NC_019842	GCC	2	6	220884	220889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503732
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4500	NC_019842	GCG	2	6	220935	220940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503732

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