MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 84908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_019842	TAA	2	6	122394	122399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_019842	T	6	6	122444	122449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_019842	TTA	2	6	122490	122495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_019842	ATA	2	6	122501	122506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_019842	GAC	2	6	122556	122561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503641
2506	NC_019842	CTT	2	6	122634	122639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503641
2507	NC_019842	TGA	2	6	122653	122658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503641
2508	NC_019842	AG	3	6	122666	122671	50 %	0 %	50 %	0 %	429503641
2509	NC_019842	CT	4	8	122714	122721	0 %	50 %	0 %	50 %	429503641
2510	NC_019842	TTAA	2	8	122822	122829	50 %	50 %	0 %	0 %	429503641
2511	NC_019842	TAT	2	6	122881	122886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503641
2512	NC_019842	ATC	2	6	122906	122911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503641
2513	NC_019842	A	6	6	122993	122998	100 %	0 %	0 %	0 %	429503641
2514	NC_019842	TGT	2	6	123064	123069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429503641
2515	NC_019842	ACA	2	6	123201	123206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429503641
2516	NC_019842	CTT	2	6	123227	123232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503641
2517	NC_019842	GCC	2	6	123262	123267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503641
2518	NC_019842	TTC	2	6	123305	123310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503641
2519	NC_019842	TAA	2	6	123355	123360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429503641
2520	NC_019842	TGG	2	6	123411	123416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429503641
2521	NC_019842	AGA	2	6	123464	123469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503641
2522	NC_019842	CGG	2	6	123532	123537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503641
2523	NC_019842	CTG	2	6	123663	123668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503641
2524	NC_019842	ATT	2	6	123671	123676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503641
2525	NC_019842	TCT	2	6	123677	123682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503641
2526	NC_019842	CTT	2	6	123691	123696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503641
2527	NC_019842	CCT	2	6	123700	123705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429503641
2528	NC_019842	TGA	2	6	123724	123729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503641
2529	NC_019842	CCG	2	6	123748	123753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503641
2530	NC_019842	CGC	2	6	123861	123866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503641
2531	NC_019842	AGC	2	6	123867	123872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503641
2532	NC_019842	TTC	2	6	123911	123916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503641
2533	NC_019842	GC	3	6	124021	124026	0 %	0 %	50 %	50 %	429503641
2534	NC_019842	ACT	2	6	124050	124055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503641
2535	NC_019842	TCA	2	6	124124	124129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503641
2536	NC_019842	CCG	2	6	124171	124176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503641
2537	NC_019842	CTG	2	6	124224	124229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503641
2538	NC_019842	TTCT	2	8	124285	124292	0 %	75 %	0 %	25 %	429503641
2539	NC_019842	CTG	2	6	124389	124394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503641
2540	NC_019842	TCG	2	6	124500	124505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503641
2541	NC_019842	GAA	2	6	124616	124621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503641
2542	NC_019842	CCAA	2	8	124683	124690	50 %	0 %	0 %	50 %	429503641
2543	NC_019842	AGT	2	6	124735	124740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503641
2544	NC_019842	CAT	3	9	124852	124860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503641
2545	NC_019842	GAT	2	6	124880	124885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503641
2546	NC_019842	GAA	2	6	124907	124912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503641
2547	NC_019842	TGA	2	6	125002	125007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503641
2548	NC_019842	ACG	2	6	125040	125045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503641
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2550	NC_019842	GAA	2	6	125099	125104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503641
2551	NC_019842	TC	3	6	125156	125161	0 %	50 %	0 %	50 %	429503641
2552	NC_019842	CGG	4	12	125173	125184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503641
2553	NC_019842	ACG	2	6	125193	125198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503641
2554	NC_019842	CGA	2	6	125224	125229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503641
2555	NC_019842	TCC	2	6	125233	125238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429503641
2556	NC_019842	TA	3	6	125262	125267	50 %	50 %	0 %	0 %	429503641
2557	NC_019842	TTC	2	6	125343	125348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503641
2558	NC_019842	GAA	2	6	125351	125356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503641
2559	NC_019842	CGAT	2	8	125385	125392	25 %	25 %	25 %	25 %	429503641
2560	NC_019842	GC	3	6	125511	125516	0 %	0 %	50 %	50 %	429503641
2561	NC_019842	GAA	2	6	125519	125524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503641
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2563	NC_019842	GAA	2	6	125543	125548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503641
2564	NC_019842	TGA	2	6	125662	125667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503641
2565	NC_019842	GCA	2	6	125710	125715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503641
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2569	NC_019842	GA	3	6	125992	125997	50 %	0 %	50 %	0 %	429503641
2570	NC_019842	AGA	2	6	126001	126006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503641
2571	NC_019842	TGA	2	6	126049	126054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503641
2572	NC_019842	GAA	2	6	126062	126067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503641
2573	NC_019842	AGT	2	6	126108	126113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503641
2574	NC_019842	TGAT	2	8	126117	126124	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_019842	GTGAA	2	10	126251	126260	40 %	20 %	40 %	0 %	429503642
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2578	NC_019842	GAA	2	6	126550	126555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503642
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2580	NC_019842	CGT	2	6	126576	126581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503642
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2582	NC_019842	AAG	2	6	126731	126736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503642
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2587	NC_019842	TCA	2	6	126956	126961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503642
2588	NC_019842	TAA	2	6	126966	126971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429503642
2589	NC_019842	GC	3	6	126998	127003	0 %	0 %	50 %	50 %	429503642
2590	NC_019842	CAT	2	6	127008	127013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503642
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2592	NC_019842	ACCGG	2	10	127090	127099	20 %	0 %	40 %	40 %	429503642
2593	NC_019842	ACT	2	6	127184	127189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503642
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2599	NC_019842	GC	3	6	127689	127694	0 %	0 %	50 %	50 %	429503642
2600	NC_019842	CTT	2	6	127741	127746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503642
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2603	NC_019842	ATGA	2	8	127906	127913	50 %	25 %	25 %	0 %	429503642
2604	NC_019842	GAAGA	2	10	127933	127942	60 %	0 %	40 %	0 %	429503642
2605	NC_019842	TCT	2	6	127955	127960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503642
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2608	NC_019842	ATC	2	6	128041	128046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503642
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2611	NC_019842	CAAAG	2	10	128203	128212	60 %	0 %	20 %	20 %	429503642
2612	NC_019842	GAA	3	9	128254	128262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503642
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2619	NC_019842	GAA	2	6	128818	128823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503642
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2621	NC_019842	TAT	2	6	128934	128939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503642
2622	NC_019842	CGC	2	6	128940	128945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503642
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2624	NC_019842	CA	3	6	129021	129026	50 %	0 %	0 %	50 %	429503642
2625	NC_019842	CGA	2	6	129080	129085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503642
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2632	NC_019842	GTCCT	2	10	129524	129533	0 %	40 %	20 %	40 %	429503642
2633	NC_019842	ATTC	2	8	129566	129573	25 %	50 %	0 %	25 %	429503642
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2642	NC_019842	ATT	2	6	129826	129831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2654	NC_019842	T	6	6	130240	130245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2991	NC_019842	GAT	2	6	146986	146991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503671
2992	NC_019842	CAG	2	6	147094	147099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503671
2993	NC_019842	ACG	2	6	147107	147112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503671
2994	NC_019842	CTT	2	6	147133	147138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503671
2995	NC_019842	GGA	2	6	147139	147144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429503671
2996	NC_019842	CAT	2	6	147184	147189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2997	NC_019842	GAA	2	6	147368	147373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503672
2998	NC_019842	TAAAT	2	10	147442	147451	60 %	40 %	0 %	0 %	429503672
2999	NC_019842	TGA	3	9	147499	147507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503672
3000	NC_019842	CTG	2	6	147515	147520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503672

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