MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 84908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_019842	AAGC	2	8	98836	98843	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2002	NC_019842	CAC	2	6	98875	98880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2003	NC_019842	GGA	2	6	98960	98965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2004	NC_019842	GCG	2	6	98994	98999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2005	NC_019842	AGG	2	6	99112	99117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_019842	TC	3	6	99144	99149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2007	NC_019842	CGG	2	6	99168	99173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2008	NC_019842	GGA	2	6	99200	99205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_019842	AGT	2	6	99321	99326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2010	NC_019842	AGA	2	6	99402	99407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2011	NC_019842	CACG	2	8	99532	99539	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2012	NC_019842	TC	3	6	99605	99610	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2013	NC_019842	AGC	2	6	99863	99868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2014	NC_019842	TTC	2	6	99961	99966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2015	NC_019842	ACC	2	6	100189	100194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2016	NC_019842	G	6	6	100214	100219	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_019842	AGG	2	6	100224	100229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2018	NC_019842	GCGA	2	8	100320	100327	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2019	NC_019842	TAG	2	6	100332	100337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2020	NC_019842	GAG	2	6	100419	100424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2021	NC_019842	GA	3	6	100442	100447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2022	NC_019842	GA	3	6	100521	100526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2023	NC_019842	CGG	2	6	100679	100684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2024	NC_019842	GA	3	6	100777	100782	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2025	NC_019842	TAGG	2	8	100895	100902	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2026	NC_019842	TAC	2	6	100949	100954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2027	NC_019842	CGC	2	6	100979	100984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2028	NC_019842	CGGG	2	8	100991	100998	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2029	NC_019842	CCT	2	6	101037	101042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2030	NC_019842	GGT	2	6	101173	101178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2031	NC_019842	CGT	2	6	101368	101373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2032	NC_019842	GAG	2	6	101417	101422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2033	NC_019842	GTT	2	6	101471	101476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2034	NC_019842	C	6	6	101544	101549	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2035	NC_019842	GAT	2	6	101595	101600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2036	NC_019842	ATCG	2	8	101656	101663	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2037	NC_019842	GA	3	6	101708	101713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2038	NC_019842	TGG	2	6	101729	101734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2039	NC_019842	CGC	2	6	101832	101837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2040	NC_019842	T	6	6	101878	101883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2041	NC_019842	TA	3	6	101902	101907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2042	NC_019842	ATA	2	6	101970	101975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2043	NC_019842	AGTCAA	2	12	102040	102051	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2044	NC_019842	AGG	2	6	102055	102060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2045	NC_019842	ATA	2	6	102075	102080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429503617
2046	NC_019842	CAT	2	6	102088	102093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503617
2047	NC_019842	TTCC	2	8	102183	102190	0 %	50 %	0 %	50 %	429503617
2048	NC_019842	AAAT	2	8	102192	102199	75 %	25 %	0 %	0 %	429503617
2049	NC_019842	TCA	2	6	102204	102209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503617
2050	NC_019842	AT	3	6	102235	102240	50 %	50 %	0 %	0 %	429503617
2051	NC_019842	GGC	2	6	102260	102265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503617
2052	NC_019842	TAT	2	6	102277	102282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503617
2053	NC_019842	GTC	2	6	102305	102310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503617
2054	NC_019842	TCA	2	6	102312	102317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503617
2055	NC_019842	ATA	2	6	102318	102323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429503617
2056	NC_019842	TGA	2	6	102364	102369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503617
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2058	NC_019842	ATG	2	6	102422	102427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503617
2059	NC_019842	TA	3	6	102453	102458	50 %	50 %	0 %	0 %	429503617
2060	NC_019842	ATG	2	6	102494	102499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503617
2061	NC_019842	GATT	2	8	102544	102551	25 %	50 %	25 %	0 %	429503618
2062	NC_019842	GA	3	6	102567	102572	50 %	0 %	50 %	0 %	429503618
2063	NC_019842	GTT	2	6	102597	102602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429503618
2064	NC_019842	AAG	2	6	102616	102621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503618
2065	NC_019842	TAT	2	6	102703	102708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503618
2066	NC_019842	GCT	2	6	102713	102718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503618
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2068	NC_019842	A	7	7	102980	102986	100 %	0 %	0 %	0 %	429503618
2069	NC_019842	AGC	2	6	103025	103030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503618
2070	NC_019842	AGATC	2	10	103040	103049	40 %	20 %	20 %	20 %	429503618
2071	NC_019842	CAG	2	6	103180	103185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503619
2072	NC_019842	CCCG	2	8	103226	103233	0 %	0 %	25 %	75 %	429503619
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2074	NC_019842	CATC	2	8	103254	103261	25 %	25 %	0 %	50 %	429503619
2075	NC_019842	GGC	2	6	103412	103417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503619
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2082	NC_019842	GGGAC	2	10	103616	103625	20 %	0 %	60 %	20 %	429503619
2083	NC_019842	ATG	2	6	103640	103645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503619
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2089	NC_019842	CGAA	2	8	104103	104110	50 %	0 %	25 %	25 %	429503619
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2098	NC_019842	A	7	7	104442	104448	100 %	0 %	0 %	0 %	429503620
2099	NC_019842	GAACA	2	10	104501	104510	60 %	0 %	20 %	20 %	429503620
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2111	NC_019842	TGA	2	6	105141	105146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503620
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2122	NC_019842	GAAA	2	8	105570	105577	75 %	0 %	25 %	0 %	429503620
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2127	NC_019842	ATG	2	6	105977	105982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503620
2128	NC_019842	GGC	2	6	105985	105990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503620
2129	NC_019842	GAA	2	6	106010	106015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503620
2130	NC_019842	TGA	2	6	106038	106043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503620
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2132	NC_019842	GAGC	3	12	106172	106183	25 %	0 %	50 %	25 %	429503620
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2143	NC_019842	GTAA	2	8	106648	106655	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2144	NC_019842	TA	3	6	106674	106679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2145	NC_019842	ACA	2	6	106708	106713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2235	NC_019842	GCG	2	6	110343	110348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503623
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2242	NC_019842	GCT	2	6	110597	110602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503624
2243	NC_019842	TGAT	2	8	110686	110693	25 %	50 %	25 %	0 %	429503624
2244	NC_019842	GTC	2	6	110703	110708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503624
2245	NC_019842	GC	3	6	110724	110729	0 %	0 %	50 %	50 %	429503624
2246	NC_019842	CA	3	6	110738	110743	50 %	0 %	0 %	50 %	429503624
2247	NC_019842	CAG	2	6	110770	110775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503624
2248	NC_019842	AGG	2	6	110776	110781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429503624
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2250	NC_019842	TCTT	2	8	110903	110910	0 %	75 %	0 %	25 %	429503624
2251	NC_019842	CTT	2	6	110948	110953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503624
2252	NC_019842	TCG	2	6	110974	110979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503624
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2255	NC_019842	GCT	2	6	111192	111197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503625
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2369	NC_019842	G	6	6	117219	117224	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2370	NC_019842	CAA	2	6	117260	117265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429503632
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2372	NC_019842	T	6	6	117389	117394	0 %	100 %	0 %	0 %	429503632
2373	NC_019842	AGA	2	6	117410	117415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503632
2374	NC_019842	GAT	2	6	117431	117436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503632
2375	NC_019842	TA	3	6	117442	117447	50 %	50 %	0 %	0 %	429503632
2376	NC_019842	AG	3	6	117465	117470	50 %	0 %	50 %	0 %	429503632
2377	NC_019842	ATT	2	6	117522	117527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503632
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