MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 84908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019842	TC	3	6	49339	49344	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_019842	T	7	7	49349	49355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_019842	TA	3	6	49436	49441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_019842	TC	3	6	49443	49448	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_019842	GAG	2	6	49450	49455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_019842	AGG	2	6	49457	49462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_019842	TCA	2	6	49469	49474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_019842	CA	3	6	49473	49478	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_019842	A	6	6	49478	49483	100 %	0 %	0 %	0 %	429503573
1010	NC_019842	A	6	6	49486	49491	100 %	0 %	0 %	0 %	429503573
1011	NC_019842	TAT	2	6	49539	49544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503573
1012	NC_019842	CTG	2	6	49546	49551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503573
1013	NC_019842	GTTTCT	2	12	49600	49611	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	429503573
1014	NC_019842	ACA	2	6	49736	49741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429503573
1015	NC_019842	GAA	2	6	49792	49797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503573
1016	NC_019842	GAAC	2	8	49839	49846	50 %	0 %	25 %	25 %	429503573
1017	NC_019842	CAG	3	9	49883	49891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503573
1018	NC_019842	ATG	2	6	49952	49957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503573
1019	NC_019842	GAAA	2	8	49961	49968	75 %	0 %	25 %	0 %	429503573
1020	NC_019842	GAC	2	6	49980	49985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503573
1021	NC_019842	GCA	2	6	50013	50018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503573
1022	NC_019842	A	6	6	50076	50081	100 %	0 %	0 %	0 %	429503573
1023	NC_019842	A	6	6	50135	50140	100 %	0 %	0 %	0 %	429503573
1024	NC_019842	GAAA	2	8	50154	50161	75 %	0 %	25 %	0 %	429503573
1025	NC_019842	AAG	2	6	50162	50167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503573
1026	NC_019842	TC	3	6	50173	50178	0 %	50 %	0 %	50 %	429503573
1027	NC_019842	GAAA	2	8	50187	50194	75 %	0 %	25 %	0 %	429503573
1028	NC_019842	AAG	2	6	50213	50218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503573
1029	NC_019842	TGT	2	6	50241	50246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429503573
1030	NC_019842	AAG	2	6	50261	50266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503573
1031	NC_019842	AGA	2	6	50286	50291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503573
1032	NC_019842	A	6	6	50300	50305	100 %	0 %	0 %	0 %	429503573
1033	NC_019842	AGC	2	6	50357	50362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503573
1034	NC_019842	TCT	2	6	50383	50388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503573
1035	NC_019842	GAAA	2	8	50663	50670	75 %	0 %	25 %	0 %	429503573
1036	NC_019842	AATT	2	8	50692	50699	50 %	50 %	0 %	0 %	429503573
1037	NC_019842	T	7	7	50731	50737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_019842	T	7	7	50815	50821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_019842	GGA	2	6	50822	50827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_019842	ATT	2	6	50847	50852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503574
1041	NC_019842	GC	3	6	50877	50882	0 %	0 %	50 %	50 %	429503574
1042	NC_019842	TCA	2	6	50944	50949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503574
1043	NC_019842	CGG	2	6	51227	51232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503574
1044	NC_019842	CGC	2	6	51249	51254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503574
1045	NC_019842	CTG	2	6	51270	51275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503574
1046	NC_019842	AGC	2	6	51298	51303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503574
1047	NC_019842	TCAAA	2	10	51326	51335	60 %	20 %	0 %	20 %	429503574
1048	NC_019842	AGG	2	6	51373	51378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429503574
1049	NC_019842	AT	3	6	51491	51496	50 %	50 %	0 %	0 %	429503575
1050	NC_019842	GC	3	6	51566	51571	0 %	0 %	50 %	50 %	429503575
1051	NC_019842	AGC	2	6	51578	51583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503575
1052	NC_019842	GTC	2	6	51604	51609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503575
1053	NC_019842	CTG	2	6	51631	51636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503575
1054	NC_019842	TCAT	2	8	51680	51687	25 %	50 %	0 %	25 %	429503575
1055	NC_019842	TGA	2	6	51744	51749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503575
1056	NC_019842	GAC	2	6	51783	51788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503575
1057	NC_019842	ATC	2	6	51793	51798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503575
1058	NC_019842	GAA	2	6	51811	51816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503575
1059	NC_019842	TGC	2	6	51845	51850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503575
1060	NC_019842	TCCT	2	8	51882	51889	0 %	50 %	0 %	50 %	429503575
1061	NC_019842	CGG	2	6	52028	52033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503575
1062	NC_019842	TTC	2	6	52057	52062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503575
1063	NC_019842	AAGC	2	8	52073	52080	50 %	0 %	25 %	25 %	429503575
1064	NC_019842	AAC	2	6	52108	52113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429503575
1065	NC_019842	A	6	6	52144	52149	100 %	0 %	0 %	0 %	429503575
1066	NC_019842	GAA	2	6	52159	52164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503575
1067	NC_019842	TTC	2	6	52166	52171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503575
1068	NC_019842	GCG	2	6	52194	52199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503575
1069	NC_019842	AGA	2	6	52218	52223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503575
1070	NC_019842	CAC	2	6	52287	52292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_019842	ATTC	2	8	52328	52335	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1072	NC_019842	CTT	2	6	52396	52401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_019842	ATG	2	6	52404	52409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_019842	GATT	2	8	52566	52573	25 %	50 %	25 %	0 %	429503576
1075	NC_019842	GAAA	2	8	52629	52636	75 %	0 %	25 %	0 %	429503576
1076	NC_019842	ATGA	2	8	52652	52659	50 %	25 %	25 %	0 %	429503576
1077	NC_019842	TC	3	6	52661	52666	0 %	50 %	0 %	50 %	429503576
1078	NC_019842	GCT	2	6	52669	52674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503576
1079	NC_019842	GCT	2	6	52690	52695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503576
1080	NC_019842	ACT	2	6	52746	52751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503576
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1082	NC_019842	A	7	7	52865	52871	100 %	0 %	0 %	0 %	429503576
1083	NC_019842	GCT	2	6	52891	52896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503576
1084	NC_019842	TCA	2	6	52923	52928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503576
1085	NC_019842	ATG	2	6	52935	52940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503576
1086	NC_019842	TA	3	6	53160	53165	50 %	50 %	0 %	0 %	429503576
1087	NC_019842	GA	4	8	53239	53246	50 %	0 %	50 %	0 %	429503576
1088	NC_019842	GGA	2	6	53255	53260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429503576
1089	NC_019842	TGC	2	6	53277	53282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503576
1090	NC_019842	AT	3	6	53329	53334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_019842	ATT	2	6	53351	53356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_019842	AAT	2	6	53425	53430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_019842	TTG	2	6	53432	53437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_019842	TTA	2	6	53446	53451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_019842	TTG	2	6	53493	53498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_019842	CGG	2	6	53600	53605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503577
1097	NC_019842	CCG	2	6	53606	53611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503577
1098	NC_019842	CTGA	2	8	53727	53734	25 %	25 %	25 %	25 %	429503577
1099	NC_019842	TTTTG	2	10	53814	53823	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_019842	ATT	2	6	53842	53847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_019842	GTT	2	6	53939	53944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_019842	CGT	2	6	53958	53963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503578
1103	NC_019842	GC	3	6	54080	54085	0 %	0 %	50 %	50 %	429503578
1104	NC_019842	CAG	2	6	54102	54107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503578
1105	NC_019842	GGC	2	6	54110	54115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503578
1106	NC_019842	T	6	6	54170	54175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_019842	AATC	2	8	54310	54317	50 %	25 %	0 %	25 %	429503579
1108	NC_019842	GAT	2	6	54367	54372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503579
1109	NC_019842	GAC	2	6	54376	54381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503579
1110	NC_019842	GAT	2	6	54464	54469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503579
1111	NC_019842	A	6	6	54524	54529	100 %	0 %	0 %	0 %	429503579
1112	NC_019842	CGG	2	6	54580	54585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503579
1113	NC_019842	AGC	2	6	54587	54592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503579
1114	NC_019842	CGA	2	6	54792	54797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503579
1115	NC_019842	CCG	2	6	54823	54828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503579
1116	NC_019842	CAG	2	6	54839	54844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503579
1117	NC_019842	GAT	2	6	54868	54873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503579
1118	NC_019842	GAA	2	6	54884	54889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503579
1119	NC_019842	A	6	6	54888	54893	100 %	0 %	0 %	0 %	429503579
1120	NC_019842	GAT	2	6	54967	54972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503579
1121	NC_019842	AGCGGA	2	12	55016	55027	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	429503579
1122	NC_019842	GAT	2	6	55120	55125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503579
1123	NC_019842	TAT	2	6	55168	55173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_019842	ATT	2	6	55180	55185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_019842	TCG	2	6	55214	55219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503580
1126	NC_019842	TGG	2	6	55231	55236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429503580
1127	NC_019842	ATT	2	6	55246	55251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503580
1128	NC_019842	ATCA	2	8	55303	55310	50 %	25 %	0 %	25 %	429503580
1129	NC_019842	TCA	2	6	55317	55322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503580
1130	NC_019842	ATT	2	6	55341	55346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503580
1131	NC_019842	GCT	2	6	55379	55384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503580
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1133	NC_019842	AGGC	2	8	55559	55566	25 %	0 %	50 %	25 %	429503580
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1151	NC_019842	A	7	7	56545	56551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1152	NC_019842	TA	3	6	56609	56614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1153	NC_019842	GGT	2	6	56622	56627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1154	NC_019842	ACT	2	6	56630	56635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1162	NC_019842	T	6	6	56989	56994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1164	NC_019842	TCT	2	6	57052	57057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1165	NC_019842	AT	3	6	57079	57084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1254	NC_019842	TGA	2	6	61798	61803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503588
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