MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 84908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_019842	GCG	2	6	517799	517804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504019
11003	NC_019842	TAT	2	6	517830	517835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504019
11004	NC_019842	AGA	2	6	517911	517916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504019
11005	NC_019842	A	6	6	517930	517935	100 %	0 %	0 %	0 %	429504019
11006	NC_019842	A	6	6	517946	517951	100 %	0 %	0 %	0 %	429504019
11007	NC_019842	GAT	2	6	517962	517967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504019
11008	NC_019842	TGA	2	6	518042	518047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504019
11009	NC_019842	TTGA	2	8	518077	518084	25 %	50 %	25 %	0 %	429504019
11010	NC_019842	TCT	2	6	518136	518141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504019
11011	NC_019842	GAT	2	6	518167	518172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504019
11012	NC_019842	GCT	2	6	518191	518196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504019
11013	NC_019842	GAA	2	6	518212	518217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504019
11014	NC_019842	TTAT	2	8	518230	518237	25 %	75 %	0 %	0 %	429504019
11015	NC_019842	ATTTT	2	10	518319	518328	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_019842	T	6	6	518351	518356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_019842	AAC	2	6	518381	518386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11018	NC_019842	TCA	2	6	518516	518521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504020
11019	NC_019842	AAAGAC	2	12	518529	518540	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	429504020
11020	NC_019842	GAA	2	6	518594	518599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504020
11021	NC_019842	GGT	2	6	518631	518636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429504020
11022	NC_019842	AG	3	6	518660	518665	50 %	0 %	50 %	0 %	429504020
11023	NC_019842	TA	3	6	518682	518687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_019842	TA	3	6	518698	518703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_019842	AGG	2	6	518709	518714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_019842	A	6	6	518715	518720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_019842	AGA	2	6	518787	518792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504021
11028	NC_019842	CGG	2	6	518850	518855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504021
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11030	NC_019842	AGG	2	6	518944	518949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429504021
11031	NC_019842	TCA	2	6	518957	518962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504021
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11033	NC_019842	TGA	2	6	519022	519027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504021
11034	NC_019842	GA	3	6	519051	519056	50 %	0 %	50 %	0 %	429504021
11035	NC_019842	GAA	2	6	519068	519073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504021
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11038	NC_019842	GAA	3	9	519174	519182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504021
11039	NC_019842	A	6	6	519206	519211	100 %	0 %	0 %	0 %	429504021
11040	NC_019842	TTA	2	6	519228	519233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504021
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11042	NC_019842	CA	3	6	519324	519329	50 %	0 %	0 %	50 %	429504022
11043	NC_019842	A	6	6	519329	519334	100 %	0 %	0 %	0 %	429504022
11044	NC_019842	TTTA	2	8	519351	519358	25 %	75 %	0 %	0 %	429504022
11045	NC_019842	ATT	2	6	519410	519415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504022
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11048	NC_019842	AAG	2	6	519515	519520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504022
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11052	NC_019842	A	6	6	519848	519853	100 %	0 %	0 %	0 %	429504022
11053	NC_019842	ACC	2	6	519873	519878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429504022
11054	NC_019842	AGA	2	6	519888	519893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504022
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11056	NC_019842	CTT	2	6	520001	520006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504022
11057	NC_019842	GAT	2	6	520015	520020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504022
11058	NC_019842	TCT	2	6	520026	520031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504022
11059	NC_019842	AGA	2	6	520089	520094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504022
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11062	NC_019842	ATT	2	6	520230	520235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504022
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11065	NC_019842	GA	3	6	520442	520447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_019842	AAAG	2	8	520515	520522	75 %	0 %	25 %	0 %	429504023
11067	NC_019842	ATGA	2	8	520525	520532	50 %	25 %	25 %	0 %	429504023
11068	NC_019842	TGCA	2	8	520559	520566	25 %	25 %	25 %	25 %	429504023
11069	NC_019842	TGA	2	6	520638	520643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504023
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11071	NC_019842	AATG	2	8	520679	520686	50 %	25 %	25 %	0 %	429504023
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11073	NC_019842	TTA	2	6	520825	520830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504024
11074	NC_019842	TTA	2	6	520842	520847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504024
11075	NC_019842	CTT	2	6	520855	520860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504024
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11077	NC_019842	ATTA	2	8	520979	520986	50 %	50 %	0 %	0 %	429504024
11078	NC_019842	AGC	2	6	520998	521003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504024
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11080	NC_019842	TA	3	6	521069	521074	50 %	50 %	0 %	0 %	429504024
11081	NC_019842	A	6	6	521118	521123	100 %	0 %	0 %	0 %	429504024
11082	NC_019842	CGAAGA	2	12	521138	521149	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	429504024
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11084	NC_019842	TGG	2	6	521195	521200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429504024
11085	NC_019842	GGC	2	6	521223	521228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504024
11086	NC_019842	TTTC	2	8	521310	521317	0 %	75 %	0 %	25 %	429504024
11087	NC_019842	TTA	2	6	521469	521474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504024
11088	NC_019842	TCA	2	6	521552	521557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11089	NC_019842	TGA	2	6	521619	521624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11090	NC_019842	TTG	2	6	521689	521694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11091	NC_019842	TA	3	6	521707	521712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11092	NC_019842	AACA	2	8	521770	521777	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11093	NC_019842	CATGT	2	10	521790	521799	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11094	NC_019842	TGA	2	6	521810	521815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11095	NC_019842	A	7	7	521815	521821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11096	NC_019842	AAAC	2	8	521879	521886	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11097	NC_019842	AT	3	6	521891	521896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_019842	T	6	6	522020	522025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_019842	GTC	2	6	522055	522060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11100	NC_019842	AATGA	2	10	522099	522108	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_019842	AGG	2	6	522206	522211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_019842	GTA	2	6	522275	522280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504025
11103	NC_019842	A	6	6	522291	522296	100 %	0 %	0 %	0 %	429504025
11104	NC_019842	ACATG	2	10	522310	522319	40 %	20 %	20 %	20 %	429504025
11105	NC_019842	ATG	2	6	522332	522337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504025
11106	NC_019842	ATT	2	6	522404	522409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504025
11107	NC_019842	A	6	6	522429	522434	100 %	0 %	0 %	0 %	429504025
11108	NC_019842	A	7	7	522493	522499	100 %	0 %	0 %	0 %	429504025
11109	NC_019842	TGAT	2	8	522525	522532	25 %	50 %	25 %	0 %	429504025
11110	NC_019842	A	8	8	522541	522548	100 %	0 %	0 %	0 %	429504025
11111	NC_019842	A	7	7	522562	522568	100 %	0 %	0 %	0 %	429504025
11112	NC_019842	AAG	2	6	522615	522620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504025
11113	NC_019842	T	6	6	522643	522648	0 %	100 %	0 %	0 %	429504025
11114	NC_019842	ATA	2	6	522683	522688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429504025
11115	NC_019842	ATG	2	6	522732	522737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504025
11116	NC_019842	A	6	6	522813	522818	100 %	0 %	0 %	0 %	429504025
11117	NC_019842	TCA	2	6	522842	522847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504025
11118	NC_019842	GTAT	2	8	522877	522884	25 %	50 %	25 %	0 %	429504025
11119	NC_019842	T	7	7	522930	522936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_019842	CTT	2	6	522980	522985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11121	NC_019842	TAA	2	6	523255	523260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429504026
11122	NC_019842	ATC	3	9	523299	523307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504026
11123	NC_019842	TA	3	6	523350	523355	50 %	50 %	0 %	0 %	429504026
11124	NC_019842	TC	3	6	523379	523384	0 %	50 %	0 %	50 %	429504026
11125	NC_019842	ATAA	2	8	523409	523416	75 %	25 %	0 %	0 %	429504026
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11244	NC_019842	CCTG	2	8	529205	529212	0 %	25 %	25 %	50 %	429504034
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11246	NC_019842	A	6	6	529370	529375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11247	NC_019842	TA	3	6	529584	529589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11248	NC_019842	AT	3	6	529593	529598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11249	NC_019842	T	7	7	529622	529628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11251	NC_019842	TAA	2	6	529663	529668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11252	NC_019842	AGG	2	6	529686	529691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11253	NC_019842	TCACAA	2	12	529705	529716	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	429504035
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11498	NC_019842	TGC	2	6	540404	540409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504047
11499	NC_019842	GCG	2	6	540472	540477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504047
11500	NC_019842	GGC	2	6	540537	540542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504047

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