MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 84908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019842	TC	3	6	26544	26549	0 %	50 %	0 %	50 %	429503549
502	NC_019842	CGT	2	6	26557	26562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503549
503	NC_019842	CA	3	6	26576	26581	50 %	0 %	0 %	50 %	429503549
504	NC_019842	TGA	2	6	26602	26607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503549
505	NC_019842	ATC	2	6	26693	26698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503549
506	NC_019842	TGC	2	6	26743	26748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503549
507	NC_019842	TCC	2	6	26751	26756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429503549
508	NC_019842	ATAA	2	8	26804	26811	75 %	25 %	0 %	0 %	429503549
509	NC_019842	CTT	2	6	26837	26842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503549
510	NC_019842	TTTG	2	8	26866	26873	0 %	75 %	25 %	0 %	429503549
511	NC_019842	T	6	6	26875	26880	0 %	100 %	0 %	0 %	429503549
512	NC_019842	TGT	2	6	26944	26949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429503549
513	NC_019842	CTG	2	6	26979	26984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_019842	A	6	6	27017	27022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_019842	AAG	2	6	27026	27031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_019842	AG	3	6	27030	27035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
517	NC_019842	ATGA	2	8	27045	27052	50 %	25 %	25 %	0 %	429503550
518	NC_019842	GA	3	6	27065	27070	50 %	0 %	50 %	0 %	429503550
519	NC_019842	GAA	2	6	27086	27091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503550
520	NC_019842	TG	3	6	27295	27300	0 %	50 %	50 %	0 %	429503550
521	NC_019842	CGT	2	6	27308	27313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503550
522	NC_019842	G	6	6	27359	27364	0 %	0 %	100 %	0 %	429503550
523	NC_019842	TGA	2	6	27379	27384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503550
524	NC_019842	ACC	2	6	27409	27414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429503550
525	NC_019842	GTG	2	6	27423	27428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429503550
526	NC_019842	GCG	2	6	27430	27435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503550
527	NC_019842	T	6	6	27470	27475	0 %	100 %	0 %	0 %	429503550
528	NC_019842	AAAG	2	8	27494	27501	75 %	0 %	25 %	0 %	429503550
529	NC_019842	AGT	2	6	27523	27528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503550
530	NC_019842	TG	3	6	27564	27569	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
531	NC_019842	CAT	2	6	27570	27575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_019842	AT	3	6	27587	27592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_019842	ATTT	2	8	27602	27609	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_019842	TAAG	2	8	27708	27715	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
535	NC_019842	GGAA	2	8	27770	27777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_019842	GCA	2	6	27778	27783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_019842	ATCA	2	8	27880	27887	50 %	25 %	0 %	25 %	429503551
538	NC_019842	T	6	6	27923	27928	0 %	100 %	0 %	0 %	429503551
539	NC_019842	TAA	2	6	27973	27978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429503551
540	NC_019842	ATG	2	6	27981	27986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503551
541	NC_019842	AGG	2	6	27995	28000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_019842	CAG	2	6	28046	28051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503552
543	NC_019842	AGA	2	6	28216	28221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503552
544	NC_019842	AATG	2	8	28229	28236	50 %	25 %	25 %	0 %	429503552
545	NC_019842	GCG	2	6	28238	28243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503552
546	NC_019842	GCG	2	6	28292	28297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503552
547	NC_019842	TA	3	6	28374	28379	50 %	50 %	0 %	0 %	429503552
548	NC_019842	CT	3	6	28400	28405	0 %	50 %	0 %	50 %	429503552
549	NC_019842	GAA	2	6	28439	28444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503552
550	NC_019842	CCG	2	6	28445	28450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503552
551	NC_019842	TCG	2	6	28578	28583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503552
552	NC_019842	AGC	2	6	28590	28595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503552
553	NC_019842	GAA	2	6	28604	28609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503552
554	NC_019842	TGC	2	6	28633	28638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503552
555	NC_019842	GGA	2	6	28643	28648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429503552
556	NC_019842	GCG	2	6	28692	28697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503552
557	NC_019842	GAT	2	6	28712	28717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503552
558	NC_019842	TGAA	2	8	28812	28819	50 %	25 %	25 %	0 %	429503552
559	NC_019842	GAAGGT	2	12	28927	28938	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	429503552
560	NC_019842	GAT	2	6	28993	28998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503552
561	NC_019842	ACC	2	6	29040	29045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429503552
562	NC_019842	T	6	6	29054	29059	0 %	100 %	0 %	0 %	429503552
563	NC_019842	CCG	2	6	29100	29105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503552
564	NC_019842	TGA	2	6	29130	29135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503552
565	NC_019842	CAG	2	6	29144	29149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503552
566	NC_019842	AAG	2	6	29214	29219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503552
567	NC_019842	GAA	2	6	29268	29273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503552
568	NC_019842	GAAG	2	8	29287	29294	50 %	0 %	50 %	0 %	429503552
569	NC_019842	CCA	2	6	29295	29300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429503552
570	NC_019842	AGC	2	6	29324	29329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503552
571	NC_019842	GCT	2	6	29338	29343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503552
572	NC_019842	CAG	2	6	29357	29362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503552
573	NC_019842	GCT	3	9	29408	29416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503552
574	NC_019842	TTAAAT	2	12	29433	29444	50 %	50 %	0 %	0 %	429503552
575	NC_019842	AGA	2	6	29470	29475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503552
576	NC_019842	AGA	2	6	29578	29583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503552
577	NC_019842	CAG	2	6	29600	29605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503552
578	NC_019842	GAA	2	6	29633	29638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503552
579	NC_019842	A	6	6	29660	29665	100 %	0 %	0 %	0 %	429503552
580	NC_019842	TAA	2	6	29699	29704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429503552
581	NC_019842	AG	3	6	29711	29716	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
582	NC_019842	A	6	6	29751	29756	100 %	0 %	0 %	0 %	429503553
583	NC_019842	TGA	2	6	29757	29762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503553
584	NC_019842	A	6	6	29772	29777	100 %	0 %	0 %	0 %	429503553
585	NC_019842	AGG	2	6	29802	29807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429503553
586	NC_019842	CAG	2	6	29835	29840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503553
587	NC_019842	GCG	2	6	29841	29846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503553
588	NC_019842	AAG	2	6	29877	29882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503553
589	NC_019842	AGA	2	6	29902	29907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503553
590	NC_019842	TGC	2	6	29953	29958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503553
591	NC_019842	ACG	2	6	29964	29969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503553
592	NC_019842	A	6	6	29975	29980	100 %	0 %	0 %	0 %	429503553
593	NC_019842	ATGAC	2	10	29985	29994	40 %	20 %	20 %	20 %	429503553
594	NC_019842	ATAA	2	8	30054	30061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_019842	T	7	7	30150	30156	0 %	100 %	0 %	0 %	429503554
596	NC_019842	AGA	2	6	30171	30176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503554
597	NC_019842	TA	3	6	30271	30276	50 %	50 %	0 %	0 %	429503554
598	NC_019842	AAG	2	6	30288	30293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503554
599	NC_019842	TTC	2	6	30380	30385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503554
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601	NC_019842	GCT	2	6	30441	30446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503554
602	NC_019842	GAT	2	6	30460	30465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503554
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604	NC_019842	TA	3	6	30526	30531	50 %	50 %	0 %	0 %	429503554
605	NC_019842	CGG	2	6	30591	30596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503554
606	NC_019842	TGA	2	6	30612	30617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503554
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608	NC_019842	AGGCA	2	10	30670	30679	40 %	0 %	40 %	20 %	429503555
609	NC_019842	TTC	2	6	30686	30691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503555
610	NC_019842	TGA	2	6	30717	30722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503555
611	NC_019842	AGA	2	6	30753	30758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503555
612	NC_019842	ACAG	2	8	30764	30771	50 %	0 %	25 %	25 %	429503555
613	NC_019842	GTT	2	6	30813	30818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429503555
614	NC_019842	T	7	7	30847	30853	0 %	100 %	0 %	0 %	429503555
615	NC_019842	GAAGC	2	10	30862	30871	40 %	0 %	40 %	20 %	429503555
616	NC_019842	TCT	2	6	30922	30927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_019842	T	6	6	30972	30977	0 %	100 %	0 %	0 %	429503556
618	NC_019842	TTGCT	2	10	31004	31013	0 %	60 %	20 %	20 %	429503556
619	NC_019842	T	7	7	31013	31019	0 %	100 %	0 %	0 %	429503556
620	NC_019842	CTG	2	6	31090	31095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503556
621	NC_019842	TCA	2	6	31217	31222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503556
622	NC_019842	ATT	2	6	31235	31240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_019842	GGT	2	6	31260	31265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
624	NC_019842	TGA	2	6	31283	31288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_019842	T	6	6	31297	31302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_019842	GTT	2	6	31322	31327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_019842	GCG	2	6	31374	31379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_019842	TAAA	2	8	31435	31442	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_019842	AGTC	2	8	31461	31468	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
630	NC_019842	ACT	2	6	31471	31476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_019842	GGC	2	6	31514	31519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_019842	GCG	2	6	31574	31579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_019842	CCTG	2	8	31604	31611	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
634	NC_019842	CGA	2	6	31759	31764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_019842	GCA	2	6	31833	31838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_019842	CGC	2	6	31880	31885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
637	NC_019842	GTGA	2	8	31886	31893	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
638	NC_019842	TGT	2	6	31919	31924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_019842	GAA	2	6	31929	31934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_019842	GGC	2	6	31953	31958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_019842	CAG	2	6	32002	32007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_019842	ATT	2	6	32043	32048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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644	NC_019842	GGA	2	6	32193	32198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
645	NC_019842	CT	3	6	32218	32223	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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651	NC_019842	TCGTG	2	10	32554	32563	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
652	NC_019842	GGA	2	6	32657	32662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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655	NC_019842	AC	3	6	32877	32882	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
656	NC_019842	CAC	2	6	32892	32897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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665	NC_019842	GCG	2	6	33353	33358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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674	NC_019842	AGC	2	6	34222	34227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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687	NC_019842	TAGG	2	8	35237	35244	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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700	NC_019842	TGG	2	6	36049	36054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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716	NC_019842	AT	3	6	36697	36702	50 %	50 %	0 %	0 %	429503558
717	NC_019842	GCA	2	6	36720	36725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503558
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734	NC_019842	GAA	2	6	37300	37305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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743	NC_019842	CTGAT	2	10	37557	37566	20 %	40 %	20 %	20 %	429503559
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759	NC_019842	A	6	6	38383	38388	100 %	0 %	0 %	0 %	429503559
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762	NC_019842	ATA	2	6	38471	38476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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