MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 84908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_019842	T	7	7	291499	291505	0 %	100 %	0 %	0 %	429503802
6002	NC_019842	GGC	2	6	291519	291524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503802
6003	NC_019842	TCA	2	6	291577	291582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503802
6004	NC_019842	GCT	2	6	291602	291607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503802
6005	NC_019842	TCG	2	6	291658	291663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503802
6006	NC_019842	TCG	2	6	291700	291705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503802
6007	NC_019842	CGCT	2	8	291708	291715	0 %	25 %	25 %	50 %	429503802
6008	NC_019842	GCT	2	6	291757	291762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503802
6009	NC_019842	CGA	2	6	291778	291783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503802
6010	NC_019842	ATC	2	6	291884	291889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503802
6011	NC_019842	TA	3	6	291895	291900	50 %	50 %	0 %	0 %	429503802
6012	NC_019842	CTG	2	6	291945	291950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503802
6013	NC_019842	GGA	2	6	292001	292006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429503802
6014	NC_019842	GC	3	6	292084	292089	0 %	0 %	50 %	50 %	429503802
6015	NC_019842	GCC	2	6	292119	292124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503802
6016	NC_019842	GGC	2	6	292169	292174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503802
6017	NC_019842	TTA	2	6	292195	292200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503802
6018	NC_019842	TCG	2	6	292234	292239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503802
6019	NC_019842	GCT	2	6	292280	292285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503802
6020	NC_019842	CTG	2	6	292314	292319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503802
6021	NC_019842	TATT	2	8	292414	292421	25 %	75 %	0 %	0 %	429503802
6022	NC_019842	CGT	2	6	292499	292504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503802
6023	NC_019842	CGTA	2	8	292564	292571	25 %	25 %	25 %	25 %	429503802
6024	NC_019842	GCTTC	2	10	292577	292586	0 %	40 %	20 %	40 %	429503802
6025	NC_019842	TTA	2	6	292664	292669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503802
6026	NC_019842	GGA	2	6	292752	292757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_019842	AGAGTG	2	12	292802	292813	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	429503803
6028	NC_019842	GAAAGA	2	12	292815	292826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503803
6029	NC_019842	CAT	2	6	292881	292886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503803
6030	NC_019842	TTC	2	6	292945	292950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503803
6031	NC_019842	TAT	2	6	292963	292968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503803
6032	NC_019842	AGA	2	6	293019	293024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503803
6033	NC_019842	AGC	3	9	293042	293050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503803
6034	NC_019842	GCG	2	6	293083	293088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503803
6035	NC_019842	TCTT	2	8	293144	293151	0 %	75 %	0 %	25 %	429503803
6036	NC_019842	AGA	2	6	293212	293217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503803
6037	NC_019842	A	6	6	293232	293237	100 %	0 %	0 %	0 %	429503803
6038	NC_019842	ATC	2	6	293241	293246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503803
6039	NC_019842	GGT	2	6	293253	293258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_019842	T	7	7	293262	293268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_019842	AG	3	6	293340	293345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_019842	TG	3	6	293346	293351	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_019842	GAA	2	6	293412	293417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_019842	CAGT	2	8	293443	293450	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6045	NC_019842	GCT	2	6	293564	293569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503804
6046	NC_019842	CAAA	2	8	293586	293593	75 %	0 %	0 %	25 %	429503804
6047	NC_019842	AAGG	2	8	293738	293745	50 %	0 %	50 %	0 %	429503804
6048	NC_019842	TG	3	6	293850	293855	0 %	50 %	50 %	0 %	429503804
6049	NC_019842	ATCA	2	8	293900	293907	50 %	25 %	0 %	25 %	429503804
6050	NC_019842	TAC	2	6	293908	293913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503804
6051	NC_019842	AC	3	6	293973	293978	50 %	0 %	0 %	50 %	429503804
6052	NC_019842	ATG	2	6	294126	294131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503804
6053	NC_019842	GT	3	6	294336	294341	0 %	50 %	50 %	0 %	429503804
6054	NC_019842	ATG	3	9	294420	294428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503804
6055	NC_019842	TGAG	2	8	294444	294451	25 %	25 %	50 %	0 %	429503804
6056	NC_019842	CTTTT	2	10	294506	294515	0 %	80 %	0 %	20 %	429503804
6057	NC_019842	GGA	2	6	294530	294535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429503804
6058	NC_019842	AAC	2	6	294674	294679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429503804
6059	NC_019842	TCT	2	6	294737	294742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503804
6060	NC_019842	ATA	2	6	294786	294791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429503804
6061	NC_019842	CGG	2	6	294855	294860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503804
6062	NC_019842	TGA	2	6	294874	294879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503804
6063	NC_019842	TCTT	2	8	294900	294907	0 %	75 %	0 %	25 %	429503804
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6066	NC_019842	GCA	2	6	295012	295017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503804
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6069	NC_019842	A	6	6	295145	295150	100 %	0 %	0 %	0 %	429503804
6070	NC_019842	CAT	2	6	295168	295173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503804
6071	NC_019842	ATG	2	6	295227	295232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503804
6072	NC_019842	ACGCTG	2	12	295304	295315	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	429503804
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6074	NC_019842	CAT	2	6	295470	295475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_019842	CAT	2	6	295478	295483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6076	NC_019842	TGT	2	6	295577	295582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_019842	CAA	2	6	295583	295588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_019842	T	7	7	295609	295615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6080	NC_019842	AT	3	6	295726	295731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_019842	GAAC	2	8	295735	295742	50 %	0 %	25 %	25 %	429503805
6082	NC_019842	TTG	2	6	295776	295781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429503805
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6089	NC_019842	ACG	2	6	296535	296540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503805
6090	NC_019842	CGT	2	6	296560	296565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503805
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6092	NC_019842	A	6	6	296686	296691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_019842	T	7	7	296720	296726	0 %	100 %	0 %	0 %	429503806
6094	NC_019842	T	6	6	296734	296739	0 %	100 %	0 %	0 %	429503806
6095	NC_019842	AAT	2	6	296860	296865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429503806
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6108	NC_019842	A	6	6	297520	297525	100 %	0 %	0 %	0 %	429503806
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6116	NC_019842	CGG	2	6	297865	297870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503806
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6119	NC_019842	CCG	2	6	297917	297922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503806
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6122	NC_019842	AAG	2	6	298019	298024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503806
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6124	NC_019842	ATG	2	6	298092	298097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503806
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6129	NC_019842	TCC	2	6	298264	298269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6130	NC_019842	TACT	2	8	298272	298279	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6131	NC_019842	CAA	2	6	298375	298380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429503807
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6234	NC_019842	T	6	6	303389	303394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6235	NC_019842	TTTA	2	8	303407	303414	25 %	75 %	0 %	0 %	429503813
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6239	NC_019842	T	6	6	303678	303683	0 %	100 %	0 %	0 %	429503813
6240	NC_019842	ATTTC	2	10	303686	303695	20 %	60 %	0 %	20 %	429503813
6241	NC_019842	AAATG	2	10	303711	303720	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6242	NC_019842	TAA	2	6	303732	303737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6243	NC_019842	GAT	2	6	303741	303746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6244	NC_019842	T	7	7	303778	303784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6245	NC_019842	A	6	6	303794	303799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6246	NC_019842	T	6	6	303819	303824	0 %	100 %	0 %	0 %	429503814
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6371	NC_019842	GA	3	6	309888	309893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6372	NC_019842	GAA	2	6	309956	309961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503820
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6374	NC_019842	TCAA	2	8	310058	310065	50 %	25 %	0 %	25 %	429503820
6375	NC_019842	AGA	2	6	310078	310083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503820
6376	NC_019842	GTC	2	6	310085	310090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503820
6377	NC_019842	GCT	2	6	310139	310144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503820
6378	NC_019842	GAA	2	6	310181	310186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503820
6379	NC_019842	CCG	2	6	310222	310227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503820
6380	NC_019842	CGG	2	6	310299	310304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503820
6381	NC_019842	TAC	2	6	310325	310330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503820
6382	NC_019842	GC	3	6	310331	310336	0 %	0 %	50 %	50 %	429503820
6383	NC_019842	AC	3	6	310404	310409	50 %	0 %	0 %	50 %	429503820
6384	NC_019842	GTC	2	6	310424	310429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503820
6385	NC_019842	ACG	2	6	310469	310474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503820
6386	NC_019842	AGCGG	2	10	310607	310616	20 %	0 %	60 %	20 %	429503820
6387	NC_019842	TCG	2	6	310632	310637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503820
6388	NC_019842	CAT	2	6	310654	310659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503820
6389	NC_019842	CG	3	6	310703	310708	0 %	0 %	50 %	50 %	429503820
6390	NC_019842	CAG	2	6	310727	310732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503820
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6393	NC_019842	GCG	2	6	311055	311060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503820
6394	NC_019842	GAT	2	6	311069	311074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503820
6395	NC_019842	CGA	2	6	311097	311102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503820
6396	NC_019842	GAA	2	6	311141	311146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503820
6397	NC_019842	TGA	2	6	311188	311193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503820
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6399	NC_019842	GCGG	2	8	311384	311391	0 %	0 %	75 %	25 %	429503820
6400	NC_019842	ATT	2	6	311397	311402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503820
6401	NC_019842	TCC	2	6	311464	311469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6402	NC_019842	G	6	6	311474	311479	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6403	NC_019842	GGA	3	9	311508	311516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6404	NC_019842	ATT	2	6	311541	311546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503821
6405	NC_019842	GACG	2	8	311599	311606	25 %	0 %	50 %	25 %	429503821
6406	NC_019842	G	7	7	311630	311636	0 %	0 %	100 %	0 %	429503821
6407	NC_019842	GCG	2	6	311676	311681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503821
6408	NC_019842	GCG	2	6	311740	311745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503821
6409	NC_019842	ATC	2	6	311942	311947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503821
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6428	NC_019842	GTC	2	6	312912	312917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503821
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6430	NC_019842	T	7	7	313082	313088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6431	NC_019842	GATAAA	2	12	313117	313128	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6432	NC_019842	AG	4	8	313164	313171	50 %	0 %	50 %	0 %	429503822
6433	NC_019842	T	6	6	313172	313177	0 %	100 %	0 %	0 %	429503822
6434	NC_019842	AATT	2	8	313196	313203	50 %	50 %	0 %	0 %	429503822
6435	NC_019842	TCA	2	6	313208	313213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503822
6436	NC_019842	TTGC	2	8	313261	313268	0 %	50 %	25 %	25 %	429503822
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6440	NC_019842	A	6	6	313415	313420	100 %	0 %	0 %	0 %	429503822
6441	NC_019842	AG	3	6	313442	313447	50 %	0 %	50 %	0 %	429503822
6442	NC_019842	GACG	2	8	313518	313525	25 %	0 %	50 %	25 %	429503822
6443	NC_019842	T	6	6	313536	313541	0 %	100 %	0 %	0 %	429503822
6444	NC_019842	ATC	2	6	313570	313575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503822
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6447	NC_019842	TGC	2	6	313700	313705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503822
6448	NC_019842	T	6	6	313712	313717	0 %	100 %	0 %	0 %	429503822
6449	NC_019842	AGT	2	6	313719	313724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503822
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6453	NC_019842	TCG	3	9	313847	313855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503822
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6456	NC_019842	CTG	2	6	313912	313917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503822
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6462	NC_019842	A	7	7	314117	314123	100 %	0 %	0 %	0 %	429503822
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6465	NC_019842	CTG	2	6	314194	314199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503822
6466	NC_019842	ATCT	2	8	314212	314219	25 %	50 %	0 %	25 %	429503822
6467	NC_019842	CAAAA	2	10	314232	314241	80 %	0 %	0 %	20 %	429503822
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6469	NC_019842	TGACA	2	10	314304	314313	40 %	20 %	20 %	20 %	429503822
6470	NC_019842	AATT	2	8	314316	314323	50 %	50 %	0 %	0 %	429503822
6471	NC_019842	TGA	2	6	314369	314374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503822
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6473	NC_019842	AG	3	6	314477	314482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6474	NC_019842	CTG	2	6	314496	314501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6475	NC_019842	TG	3	6	314507	314512	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6476	NC_019842	TATTGA	2	12	314522	314533	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6477	NC_019842	G	6	6	314708	314713	0 %	0 %	100 %	0 %	429503823
6478	NC_019842	A	6	6	314736	314741	100 %	0 %	0 %	0 %	429503823
6479	NC_019842	CGG	2	6	314755	314760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503823
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6485	NC_019842	CGG	2	6	315151	315156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503823
6486	NC_019842	AGC	2	6	315164	315169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503823
6487	NC_019842	TCA	2	6	315294	315299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503823
6488	NC_019842	TGA	2	6	315304	315309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503823
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6491	NC_019842	CGC	2	6	315442	315447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503823
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6493	NC_019842	CCG	2	6	315501	315506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503823
6494	NC_019842	A	6	6	315572	315577	100 %	0 %	0 %	0 %	429503823
6495	NC_019842	A	6	6	315591	315596	100 %	0 %	0 %	0 %	429503823
6496	NC_019842	TTTCA	2	10	315664	315673	20 %	60 %	0 %	20 %	429503824
6497	NC_019842	CGG	2	6	315711	315716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503824
6498	NC_019842	CGG	2	6	315729	315734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503824
6499	NC_019842	CTG	2	6	315966	315971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503824
6500	NC_019842	CGG	2	6	316094	316099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503824

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