MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 84908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019842	GCC	2	6	246360	246365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503758
5002	NC_019842	TCA	2	6	246385	246390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503758
5003	NC_019842	ATGCCG	2	12	246406	246417	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	429503758
5004	NC_019842	TCT	2	6	246441	246446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503758
5005	NC_019842	GCC	2	6	246474	246479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503758
5006	NC_019842	CGA	2	6	246506	246511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503758
5007	NC_019842	TCGGA	2	10	246606	246615	20 %	20 %	40 %	20 %	429503758
5008	NC_019842	TTC	2	6	246708	246713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503758
5009	NC_019842	TAG	2	6	246748	246753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503758
5010	NC_019842	CCT	2	6	246800	246805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429503758
5011	NC_019842	AGC	2	6	246889	246894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503758
5012	NC_019842	ATC	2	6	246922	246927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503758
5013	NC_019842	GAT	2	6	246966	246971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503758
5014	NC_019842	GGC	2	6	247044	247049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503758
5015	NC_019842	TGA	2	6	247058	247063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503758
5016	NC_019842	CATTC	2	10	247094	247103	20 %	40 %	0 %	40 %	429503758
5017	NC_019842	TA	3	6	247182	247187	50 %	50 %	0 %	0 %	429503758
5018	NC_019842	CGGT	2	8	247215	247222	0 %	25 %	50 %	25 %	429503758
5019	NC_019842	CT	3	6	247275	247280	0 %	50 %	0 %	50 %	429503758
5020	NC_019842	TCC	2	6	247301	247306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5021	NC_019842	AGA	2	6	247522	247527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_019842	A	6	6	247563	247568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_019842	T	6	6	247672	247677	0 %	100 %	0 %	0 %	429503759
5024	NC_019842	T	6	6	247679	247684	0 %	100 %	0 %	0 %	429503759
5025	NC_019842	CTG	3	9	247685	247693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503759
5026	NC_019842	GAG	2	6	247776	247781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429503759
5027	NC_019842	T	7	7	247803	247809	0 %	100 %	0 %	0 %	429503759
5028	NC_019842	T	7	7	247829	247835	0 %	100 %	0 %	0 %	429503759
5029	NC_019842	T	6	6	247878	247883	0 %	100 %	0 %	0 %	429503759
5030	NC_019842	TGA	2	6	247896	247901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503759
5031	NC_019842	CGG	2	6	247966	247971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503759
5032	NC_019842	ATG	2	6	247982	247987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503759
5033	NC_019842	CA	3	6	248027	248032	50 %	0 %	0 %	50 %	429503759
5034	NC_019842	T	6	6	248047	248052	0 %	100 %	0 %	0 %	429503759
5035	NC_019842	TGA	2	6	248058	248063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503759
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5037	NC_019842	AGC	2	6	248103	248108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503759
5038	NC_019842	TGA	2	6	248121	248126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503759
5039	NC_019842	GAA	2	6	248144	248149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503759
5040	NC_019842	A	7	7	248162	248168	100 %	0 %	0 %	0 %	429503759
5041	NC_019842	ACG	2	6	248177	248182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503759
5042	NC_019842	TGC	2	6	248256	248261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503759
5043	NC_019842	A	6	6	248288	248293	100 %	0 %	0 %	0 %	429503759
5044	NC_019842	GA	3	6	248339	248344	50 %	0 %	50 %	0 %	429503759
5045	NC_019842	GCC	2	6	248363	248368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503759
5046	NC_019842	A	6	6	248622	248627	100 %	0 %	0 %	0 %	429503759
5047	NC_019842	CTTA	2	8	248702	248709	25 %	50 %	0 %	25 %	429503759
5048	NC_019842	ATA	2	6	248827	248832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429503759
5049	NC_019842	T	7	7	248837	248843	0 %	100 %	0 %	0 %	429503760
5050	NC_019842	TGA	3	9	248849	248857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503760
5051	NC_019842	GAT	2	6	248885	248890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503760
5052	NC_019842	CGAGGA	2	12	248891	248902	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	429503760
5053	NC_019842	GTC	2	6	248913	248918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503760
5054	NC_019842	TTA	2	6	248982	248987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503760
5055	NC_019842	CTG	2	6	248994	248999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503760
5056	NC_019842	CGGGA	2	10	249009	249018	20 %	0 %	60 %	20 %	429503760
5057	NC_019842	TGA	2	6	249064	249069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503760
5058	NC_019842	TGG	2	6	249094	249099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429503760
5059	NC_019842	TC	3	6	249111	249116	0 %	50 %	0 %	50 %	429503760
5060	NC_019842	CAA	2	6	249146	249151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429503760
5061	NC_019842	A	7	7	249261	249267	100 %	0 %	0 %	0 %	429503760
5062	NC_019842	G	7	7	249275	249281	0 %	0 %	100 %	0 %	429503760
5063	NC_019842	ATCA	2	8	249293	249300	50 %	25 %	0 %	25 %	429503760
5064	NC_019842	TATT	2	8	249381	249388	25 %	75 %	0 %	0 %	429503760
5065	NC_019842	GAAA	2	8	249405	249412	75 %	0 %	25 %	0 %	429503760
5066	NC_019842	GCG	2	6	249468	249473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503760
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5068	NC_019842	GAAA	2	8	249644	249651	75 %	0 %	25 %	0 %	429503760
5069	NC_019842	A	6	6	249699	249704	100 %	0 %	0 %	0 %	429503760
5070	NC_019842	TTCA	2	8	249705	249712	25 %	50 %	0 %	25 %	429503760
5071	NC_019842	TCT	2	6	249715	249720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503760
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5073	NC_019842	TAAAA	2	10	250050	250059	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_019842	AGTA	2	8	250085	250092	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_019842	GC	3	6	250100	250105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5076	NC_019842	AG	3	6	250113	250118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_019842	TGC	2	6	250171	250176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5079	NC_019842	TAA	2	6	250282	250287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_019842	T	7	7	250327	250333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_019842	AGG	2	6	250343	250348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5083	NC_019842	A	6	6	250388	250393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_019842	CGA	2	6	250420	250425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503762
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5089	NC_019842	ATAAA	2	10	250646	250655	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_019842	A	6	6	250666	250671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_019842	TCG	2	6	250740	250745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503763
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5094	NC_019842	CAAAA	2	10	250970	250979	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5095	NC_019842	A	6	6	250976	250981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_019842	A	6	6	250990	250995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_019842	GCT	2	6	251013	251018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5099	NC_019842	CTT	2	6	251057	251062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503764
5100	NC_019842	ATTTC	2	10	251086	251095	20 %	60 %	0 %	20 %	429503764
5101	NC_019842	T	6	6	251273	251278	0 %	100 %	0 %	0 %	429503764
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5103	NC_019842	GT	3	6	251390	251395	0 %	50 %	50 %	0 %	429503764
5104	NC_019842	AG	3	6	251434	251439	50 %	0 %	50 %	0 %	429503764
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5106	NC_019842	TCGCT	2	10	251663	251672	0 %	40 %	20 %	40 %	429503764
5107	NC_019842	TTA	2	6	251722	251727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503764
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5109	NC_019842	T	6	6	251883	251888	0 %	100 %	0 %	0 %	429503764
5110	NC_019842	T	6	6	251915	251920	0 %	100 %	0 %	0 %	429503764
5111	NC_019842	CCT	2	6	251921	251926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5112	NC_019842	A	7	7	251939	251945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_019842	T	6	6	252038	252043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_019842	TAA	2	6	252053	252058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_019842	A	7	7	252071	252077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_019842	A	7	7	252123	252129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_019842	TAT	3	9	252159	252167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_019842	T	6	6	252181	252186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_019842	TAATT	2	10	252196	252205	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_019842	CGTTT	2	10	252264	252273	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5121	NC_019842	T	6	6	252271	252276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_019842	T	6	6	252294	252299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_019842	GA	3	6	252337	252342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_019842	TGAA	2	8	252366	252373	50 %	25 %	25 %	0 %	429503765
5125	NC_019842	AGA	2	6	252374	252379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503765
5126	NC_019842	GCAA	2	8	252383	252390	50 %	0 %	25 %	25 %	429503765
5127	NC_019842	TTC	2	6	252393	252398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503765
5128	NC_019842	TTGG	2	8	252443	252450	0 %	50 %	50 %	0 %	429503765
5129	NC_019842	GCA	2	6	252475	252480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503765
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5133	NC_019842	CGTTT	2	10	252688	252697	0 %	60 %	20 %	20 %	429503765
5134	NC_019842	AG	3	6	252723	252728	50 %	0 %	50 %	0 %	429503765
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5242	NC_019842	AAAAC	2	10	257706	257715	80 %	0 %	0 %	20 %	429503771
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5252	NC_019842	AGG	2	6	258267	258272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5253	NC_019842	A	6	6	258287	258292	100 %	0 %	0 %	0 %	429503773
5254	NC_019842	T	6	6	258365	258370	0 %	100 %	0 %	0 %	429503773
5255	NC_019842	CTG	2	6	258379	258384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503773
5256	NC_019842	CGAG	2	8	258450	258457	25 %	0 %	50 %	25 %	429503773
5257	NC_019842	ATG	2	6	258473	258478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503773
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5259	NC_019842	GCTTT	2	10	258578	258587	0 %	60 %	20 %	20 %	429503773
5260	NC_019842	TAT	2	6	258613	258618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503773
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5262	NC_019842	CGG	2	6	258708	258713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503773
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5264	NC_019842	TCG	2	6	258861	258866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503773
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5273	NC_019842	GAT	2	6	259212	259217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503774
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5276	NC_019842	GC	3	6	259378	259383	0 %	0 %	50 %	50 %	429503774
5277	NC_019842	GCC	2	6	259429	259434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503774
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5281	NC_019842	CCG	2	6	259607	259612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503774
5282	NC_019842	T	6	6	259639	259644	0 %	100 %	0 %	0 %	429503774
5283	NC_019842	CTTTT	2	10	259662	259671	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5284	NC_019842	AT	3	6	259692	259697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5285	NC_019842	CA	3	6	259769	259774	50 %	0 %	0 %	50 %	429503775
5286	NC_019842	GCT	2	6	259789	259794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503775
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5289	NC_019842	GCT	2	6	259971	259976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503775
5290	NC_019842	CGT	2	6	259985	259990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503775
5291	NC_019842	GAAA	2	8	260011	260018	75 %	0 %	25 %	0 %	429503775
5292	NC_019842	TG	3	6	260169	260174	0 %	50 %	50 %	0 %	429503775
5293	NC_019842	AAG	2	6	260238	260243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503775
5294	NC_019842	CTT	2	6	260250	260255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503775
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5296	NC_019842	GGT	2	6	260422	260427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429503775
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5299	NC_019842	AT	3	6	260523	260528	50 %	50 %	0 %	0 %	429503775
5300	NC_019842	GGC	2	6	260537	260542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503775
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5309	NC_019842	A	7	7	260848	260854	100 %	0 %	0 %	0 %	429503775
5310	NC_019842	CAG	2	6	260855	260860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5311	NC_019842	CTG	2	6	260874	260879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5344	NC_019842	CT	3	6	262329	262334	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5345	NC_019842	TC	3	6	262350	262355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5346	NC_019842	CAG	2	6	262370	262375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503777
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5349	NC_019842	ATG	2	6	262437	262442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503777
5350	NC_019842	CCG	2	6	262480	262485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503777
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5353	NC_019842	CAGGAT	2	12	262690	262701	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429503777
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5355	NC_019842	TCATT	2	10	262744	262753	20 %	60 %	0 %	20 %	429503777
5356	NC_019842	GCT	2	6	262771	262776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503777
5357	NC_019842	CTTT	2	8	262824	262831	0 %	75 %	0 %	25 %	429503777
5358	NC_019842	AAT	2	6	262832	262837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429503777
5359	NC_019842	T	6	6	262900	262905	0 %	100 %	0 %	0 %	429503777
5360	NC_019842	TAT	2	6	262979	262984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5361	NC_019842	T	6	6	263011	263016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5362	NC_019842	TTC	2	6	263027	263032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5363	NC_019842	ATAA	2	8	263079	263086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5364	NC_019842	GA	3	6	263094	263099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5365	NC_019842	A	6	6	263108	263113	100 %	0 %	0 %	0 %	429503778
5366	NC_019842	GCTCT	2	10	263144	263153	0 %	40 %	20 %	40 %	429503778
5367	NC_019842	CGGC	2	8	263160	263167	0 %	0 %	50 %	50 %	429503778
5368	NC_019842	GAAA	2	8	263188	263195	75 %	0 %	25 %	0 %	429503778
5369	NC_019842	GCAGCC	2	12	263210	263221	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	429503778
5370	NC_019842	A	6	6	263228	263233	100 %	0 %	0 %	0 %	429503778
5371	NC_019842	CGG	2	6	263266	263271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503778
5372	NC_019842	GCT	2	6	263285	263290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503778
5373	NC_019842	CGG	2	6	263319	263324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503778
5374	NC_019842	CTG	2	6	263438	263443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503778
5375	NC_019842	GCT	2	6	263467	263472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503778
5376	NC_019842	TGA	2	6	263479	263484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503778
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5393	NC_019842	TC	3	6	264239	264244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5394	NC_019842	T	7	7	264246	264252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5395	NC_019842	TTG	2	6	264325	264330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5397	NC_019842	T	6	6	264352	264357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5398	NC_019842	TCT	2	6	264363	264368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5399	NC_019842	TAA	2	6	264370	264375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5400	NC_019842	A	6	6	264388	264393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5418	NC_019842	T	6	6	265118	265123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5419	NC_019842	ATA	2	6	265162	265167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5452	NC_019842	T	8	8	266310	266317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5453	NC_019842	CAGG	2	8	266331	266338	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5454	NC_019842	TCTA	2	8	266352	266359	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5455	NC_019842	AAGG	2	8	266379	266386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5471	NC_019842	A	7	7	267335	267341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5472	NC_019842	TTG	2	6	267368	267373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5482	NC_019842	CATCA	2	10	267884	267893	40 %	20 %	0 %	40 %	429503782
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5490	NC_019842	TGT	2	6	268383	268388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5491	NC_019842	ATC	2	6	268460	268465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5497	NC_019842	CAT	2	6	268630	268635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503783
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5499	NC_019842	ATG	2	6	268806	268811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503783
5500	NC_019842	GAT	2	6	268931	268936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503783

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