MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 84908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_019842	TAT	2	6	220967	220972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503732
4502	NC_019842	AAC	2	6	221118	221123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429503732
4503	NC_019842	AGC	2	6	221292	221297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503732
4504	NC_019842	GCC	2	6	221332	221337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4505	NC_019842	TC	3	6	221360	221365	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4506	NC_019842	AGGG	2	8	221392	221399	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_019842	ATG	2	6	221405	221410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503733
4508	NC_019842	ATG	2	6	221460	221465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503733
4509	NC_019842	TG	3	6	221464	221469	0 %	50 %	50 %	0 %	429503733
4510	NC_019842	GCT	2	6	221566	221571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503733
4511	NC_019842	TGAA	2	8	221628	221635	50 %	25 %	25 %	0 %	429503733
4512	NC_019842	CGG	2	6	221666	221671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_019842	T	6	6	221681	221686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_019842	ATC	2	6	221711	221716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_019842	GGA	2	6	221756	221761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_019842	A	7	7	221778	221784	100 %	0 %	0 %	0 %	429503734
4517	NC_019842	A	6	6	221813	221818	100 %	0 %	0 %	0 %	429503734
4518	NC_019842	GCC	2	6	221835	221840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503734
4519	NC_019842	ATT	2	6	221841	221846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503734
4520	NC_019842	ATTGG	2	10	221898	221907	20 %	40 %	40 %	0 %	429503734
4521	NC_019842	CTT	2	6	221939	221944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503734
4522	NC_019842	GGCTGC	2	12	221958	221969	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	429503734
4523	NC_019842	CCG	2	6	221972	221977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503734
4524	NC_019842	AT	3	6	222070	222075	50 %	50 %	0 %	0 %	429503734
4525	NC_019842	GAA	2	6	222079	222084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503734
4526	NC_019842	GT	3	6	222113	222118	0 %	50 %	50 %	0 %	429503734
4527	NC_019842	CG	3	6	222217	222222	0 %	0 %	50 %	50 %	429503734
4528	NC_019842	AGA	2	6	222261	222266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503734
4529	NC_019842	GGTG	2	8	222275	222282	0 %	25 %	75 %	0 %	429503734
4530	NC_019842	GA	3	6	222330	222335	50 %	0 %	50 %	0 %	429503734
4531	NC_019842	AGG	2	6	222350	222355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429503734
4532	NC_019842	A	7	7	222464	222470	100 %	0 %	0 %	0 %	429503734
4533	NC_019842	GCC	2	6	222474	222479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4534	NC_019842	ATT	2	6	222510	222515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503735
4535	NC_019842	TCT	2	6	222516	222521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503735
4536	NC_019842	TCA	2	6	222524	222529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503735
4537	NC_019842	TAT	2	6	222570	222575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503735
4538	NC_019842	TTG	2	6	222608	222613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429503735
4539	NC_019842	TCA	2	6	222675	222680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503735
4540	NC_019842	AGT	2	6	222802	222807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_019842	AAT	2	6	222896	222901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_019842	AT	3	6	222909	222914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_019842	ATG	2	6	222996	223001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503736
4544	NC_019842	GAT	2	6	223016	223021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503736
4545	NC_019842	GGCG	2	8	223048	223055	0 %	0 %	75 %	25 %	429503736
4546	NC_019842	ATT	2	6	223080	223085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503736
4547	NC_019842	ATT	2	6	223386	223391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503736
4548	NC_019842	ATT	2	6	223405	223410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503736
4549	NC_019842	ATT	2	6	223464	223469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503736
4550	NC_019842	GCT	2	6	223490	223495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503736
4551	NC_019842	CGG	2	6	223511	223516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503736
4552	NC_019842	CGG	2	6	223570	223575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503736
4553	NC_019842	A	6	6	223643	223648	100 %	0 %	0 %	0 %	429503736
4554	NC_019842	GCT	2	6	223685	223690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503736
4555	NC_019842	ATT	2	6	223836	223841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503736
4556	NC_019842	A	7	7	223924	223930	100 %	0 %	0 %	0 %	429503736
4557	NC_019842	AT	3	6	223934	223939	50 %	50 %	0 %	0 %	429503736
4558	NC_019842	GAT	2	6	223991	223996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503736
4559	NC_019842	ATCGT	2	10	224007	224016	20 %	40 %	20 %	20 %	429503736
4560	NC_019842	TGCT	2	8	224050	224057	0 %	50 %	25 %	25 %	429503736
4561	NC_019842	TGA	2	6	224110	224115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503736
4562	NC_019842	GCG	2	6	224120	224125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503736
4563	NC_019842	CGG	3	9	224128	224136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503736
4564	NC_019842	TC	3	6	224202	224207	0 %	50 %	0 %	50 %	429503736
4565	NC_019842	GC	3	6	224220	224225	0 %	0 %	50 %	50 %	429503736
4566	NC_019842	ATTT	2	8	224274	224281	25 %	75 %	0 %	0 %	429503736
4567	NC_019842	CTA	2	6	224282	224287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503736
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4569	NC_019842	GGC	2	6	224331	224336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503736
4570	NC_019842	ATG	2	6	224364	224369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503736
4571	NC_019842	CGG	2	6	224399	224404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503736
4572	NC_019842	CAT	2	6	224411	224416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503736
4573	NC_019842	TAA	2	6	224581	224586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_019842	T	6	6	224614	224619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_019842	A	8	8	224628	224635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_019842	CAT	2	6	224645	224650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4577	NC_019842	T	6	6	224685	224690	0 %	100 %	0 %	0 %	429503737
4578	NC_019842	AT	3	6	224702	224707	50 %	50 %	0 %	0 %	429503737
4579	NC_019842	AC	3	6	224723	224728	50 %	0 %	0 %	50 %	429503737
4580	NC_019842	CAG	2	6	224745	224750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503737
4581	NC_019842	GTCA	2	8	224895	224902	25 %	25 %	25 %	25 %	429503737
4582	NC_019842	CTG	2	6	224983	224988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503737
4583	NC_019842	T	6	6	225042	225047	0 %	100 %	0 %	0 %	429503737
4584	NC_019842	TTC	2	6	225066	225071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503737
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4586	NC_019842	TCA	2	6	225145	225150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503737
4587	NC_019842	TCA	2	6	225298	225303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503737
4588	NC_019842	T	6	6	225368	225373	0 %	100 %	0 %	0 %	429503737
4589	NC_019842	CGC	2	6	225477	225482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503737
4590	NC_019842	ATGA	2	8	225499	225506	50 %	25 %	25 %	0 %	429503737
4591	NC_019842	TTC	2	6	225561	225566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4592	NC_019842	TGT	2	6	225643	225648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_019842	CCGC	2	8	225664	225671	0 %	0 %	25 %	75 %	429503738
4594	NC_019842	AAG	2	6	225696	225701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503738
4595	NC_019842	GAG	2	6	225720	225725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429503738
4596	NC_019842	GCC	2	6	225740	225745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503738
4597	NC_019842	ATG	2	6	225777	225782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503738
4598	NC_019842	CGC	2	6	225845	225850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503738
4599	NC_019842	T	6	6	225851	225856	0 %	100 %	0 %	0 %	429503738
4600	NC_019842	AAG	2	6	225909	225914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503738
4601	NC_019842	GC	3	6	226021	226026	0 %	0 %	50 %	50 %	429503738
4602	NC_019842	GGC	2	6	226027	226032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503738
4603	NC_019842	GA	3	6	226126	226131	50 %	0 %	50 %	0 %	429503738
4604	NC_019842	TTA	2	6	226230	226235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503738
4605	NC_019842	GTC	2	6	226266	226271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503738
4606	NC_019842	TTC	2	6	226322	226327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503738
4607	NC_019842	CGG	2	6	226331	226336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503738
4608	NC_019842	GCG	2	6	226351	226356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503738
4609	NC_019842	GAA	2	6	226369	226374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503738
4610	NC_019842	AAATG	2	10	226382	226391	60 %	20 %	20 %	0 %	429503738
4611	NC_019842	GAAA	2	8	226411	226418	75 %	0 %	25 %	0 %	429503738
4612	NC_019842	AACA	2	8	226436	226443	75 %	0 %	0 %	25 %	429503738
4613	NC_019842	CGTC	2	8	226556	226563	0 %	25 %	25 %	50 %	429503738
4614	NC_019842	GGC	2	6	226569	226574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503738
4615	NC_019842	TAA	2	6	226600	226605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429503738
4616	NC_019842	ATA	2	6	226740	226745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429503738
4617	NC_019842	CCAAG	2	10	226786	226795	40 %	0 %	20 %	40 %	429503738
4618	NC_019842	ATA	2	6	226862	226867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429503738
4619	NC_019842	ATC	2	6	226940	226945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503738
4620	NC_019842	TC	3	6	226949	226954	0 %	50 %	0 %	50 %	429503738
4621	NC_019842	CAT	2	6	226985	226990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503738
4622	NC_019842	TCC	2	6	226992	226997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4623	NC_019842	ATG	2	6	227017	227022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_019842	TATG	2	8	227023	227030	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_019842	TCCTT	2	10	227033	227042	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
4626	NC_019842	TCCA	2	8	227108	227115	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4627	NC_019842	T	7	7	227199	227205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_019842	AATA	2	8	227207	227214	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_019842	TTGA	2	8	227322	227329	25 %	50 %	25 %	0 %	429503739
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4635	NC_019842	TTTA	2	8	227619	227626	25 %	75 %	0 %	0 %	429503740
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4744	NC_019842	GA	3	6	233500	233505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4745	NC_019842	AAGG	2	8	233559	233566	50 %	0 %	50 %	0 %	429503746
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4751	NC_019842	GCG	2	6	233796	233801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503746
4752	NC_019842	TTCC	2	8	233833	233840	0 %	50 %	0 %	50 %	429503746
4753	NC_019842	AT	3	6	233880	233885	50 %	50 %	0 %	0 %	429503746
4754	NC_019842	TTG	2	6	233944	233949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429503746
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4839	NC_019842	TAG	2	6	238491	238496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4851	NC_019842	GGAC	2	8	239200	239207	25 %	0 %	50 %	25 %	429503752
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4855	NC_019842	A	7	7	239336	239342	100 %	0 %	0 %	0 %	429503752
4856	NC_019842	GAAT	2	8	239359	239366	50 %	25 %	25 %	0 %	429503752
4857	NC_019842	ACGA	2	8	239402	239409	50 %	0 %	25 %	25 %	429503752
4858	NC_019842	ATGT	2	8	239417	239424	25 %	50 %	25 %	0 %	429503752
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4863	NC_019842	GGT	2	6	239526	239531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4864	NC_019842	T	6	6	239533	239538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4865	NC_019842	GGTCT	2	10	239564	239573	0 %	40 %	40 %	20 %	429503753
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4869	NC_019842	GACGG	2	10	239766	239775	20 %	0 %	60 %	20 %	429503753
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4872	NC_019842	GAC	2	6	239939	239944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503753
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4874	NC_019842	ACCATT	2	12	240228	240239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503753
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5000	NC_019842	CAG	2	6	246351	246356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503758

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