MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bordetella bronchiseptica 253

Total Repeats: 16002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019382	GATT	2	8	165	172	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019382	AGCA	2	8	239	246	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019382	CAAG	2	8	472	479	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019382	CAGA	2	8	527	534	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_019382	GAAT	2	8	1134	1141	50 %	25 %	25 %	0 %	412337339
6	NC_019382	GCCG	2	8	1594	1601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_019382	GTCC	2	8	2172	2179	0 %	25 %	25 %	50 %	412337341
8	NC_019382	GCCA	2	8	2333	2340	25 %	0 %	25 %	50 %	412337341
9	NC_019382	GGCC	2	8	2570	2577	0 %	0 %	50 %	50 %	412337341
10	NC_019382	CGTT	2	8	2667	2674	0 %	50 %	25 %	25 %	412337341
11	NC_019382	CTGG	2	8	3064	3071	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_019382	CGCA	2	8	3350	3357	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_019382	CTGA	2	8	3454	3461	25 %	25 %	25 %	25 %	412337344
14	NC_019382	CTTT	2	8	3522	3529	0 %	75 %	0 %	25 %	412337344
15	NC_019382	CGGA	2	8	3757	3764	25 %	0 %	50 %	25 %	412337345
16	NC_019382	CTCG	2	8	4555	4562	0 %	25 %	25 %	50 %	412337347
17	NC_019382	GCCC	2	8	4752	4759	0 %	0 %	25 %	75 %	412337347
18	NC_019382	GGTG	2	8	4901	4908	0 %	25 %	75 %	0 %	412337347
19	NC_019382	TCGA	2	8	5130	5137	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_019382	GGCA	2	8	6467	6474	25 %	0 %	50 %	25 %	412337349
21	NC_019382	CGGC	2	8	6527	6534	0 %	0 %	50 %	50 %	412337349
22	NC_019382	GGCC	2	8	6693	6700	0 %	0 %	50 %	50 %	412337349
23	NC_019382	CTGG	2	8	7001	7008	0 %	25 %	50 %	25 %	412337350
24	NC_019382	CTGG	2	8	7217	7224	0 %	25 %	50 %	25 %	412337350
25	NC_019382	GCTG	2	8	8275	8282	0 %	25 %	50 %	25 %	412337352
26	NC_019382	GCCG	2	8	8426	8433	0 %	0 %	50 %	50 %	412337353
27	NC_019382	GCCG	2	8	8476	8483	0 %	0 %	50 %	50 %	412337353
28	NC_019382	GCGT	2	8	8566	8573	0 %	25 %	50 %	25 %	412337353
29	NC_019382	GCGG	2	8	8747	8754	0 %	0 %	75 %	25 %	412337353
30	NC_019382	AGAC	2	8	8813	8820	50 %	0 %	25 %	25 %	412337353
31	NC_019382	GGCG	2	8	8855	8862	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_019382	CGTC	2	8	8868	8875	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_019382	GCTC	2	8	9054	9061	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_019382	ACGA	2	8	9444	9451	50 %	0 %	25 %	25 %	412337354
35	NC_019382	GCTG	2	8	10598	10605	0 %	25 %	50 %	25 %	412337355
36	NC_019382	ACCG	2	8	10612	10619	25 %	0 %	25 %	50 %	412337355
37	NC_019382	GCCA	2	8	10824	10831	25 %	0 %	25 %	50 %	412337356
38	NC_019382	CGGC	2	8	10885	10892	0 %	0 %	50 %	50 %	412337356
39	NC_019382	CCGC	2	8	10975	10982	0 %	0 %	25 %	75 %	412337356
40	NC_019382	GTCG	2	8	11902	11909	0 %	25 %	50 %	25 %	412337356
41	NC_019382	GCCA	2	8	12336	12343	25 %	0 %	25 %	50 %	412337357
42	NC_019382	ATGG	2	8	12588	12595	25 %	25 %	50 %	0 %	412337357
43	NC_019382	CGAC	2	8	12735	12742	25 %	0 %	25 %	50 %	412337357
44	NC_019382	CGGC	2	8	12782	12789	0 %	0 %	50 %	50 %	412337357
45	NC_019382	CCAG	2	8	12869	12876	25 %	0 %	25 %	50 %	412337357
46	NC_019382	GCAG	2	8	13118	13125	25 %	0 %	50 %	25 %	412337357
47	NC_019382	CGGC	2	8	14409	14416	0 %	0 %	50 %	50 %	412337360
48	NC_019382	CCGA	2	8	15158	15165	25 %	0 %	25 %	50 %	412337360
49	NC_019382	AGGC	2	8	15348	15355	25 %	0 %	50 %	25 %	412337361
50	NC_019382	CGGC	2	8	15965	15972	0 %	0 %	50 %	50 %	412337362
51	NC_019382	GCTG	2	8	16025	16032	0 %	25 %	50 %	25 %	412337362
52	NC_019382	AGGC	2	8	16657	16664	25 %	0 %	50 %	25 %	412337364
53	NC_019382	AGGC	2	8	18225	18232	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_019382	AACG	2	8	18269	18276	50 %	0 %	25 %	25 %	412337368
55	NC_019382	AGGT	3	12	18339	18350	25 %	25 %	50 %	0 %	412337368
56	NC_019382	GAAG	2	8	18574	18581	50 %	0 %	50 %	0 %	412337368
57	NC_019382	GGGA	2	8	18766	18773	25 %	0 %	75 %	0 %	412337369
58	NC_019382	AGCC	2	8	18849	18856	25 %	0 %	25 %	50 %	412337369
59	NC_019382	GGTG	2	8	19807	19814	0 %	25 %	75 %	0 %	412337371
60	NC_019382	CGGC	2	8	19944	19951	0 %	0 %	50 %	50 %	412337371
61	NC_019382	GCTG	2	8	20215	20222	0 %	25 %	50 %	25 %	412337371
62	NC_019382	GCGT	2	8	20353	20360	0 %	25 %	50 %	25 %	412337371
63	NC_019382	TCGC	2	8	20607	20614	0 %	25 %	25 %	50 %	412337371
64	NC_019382	CGGG	2	8	21528	21535	0 %	0 %	75 %	25 %	412337371
65	NC_019382	ACCT	2	8	21605	21612	25 %	25 %	0 %	50 %	412337371
66	NC_019382	GAAG	2	8	22327	22334	50 %	0 %	50 %	0 %	412337373
67	NC_019382	CAGG	2	8	22511	22518	25 %	0 %	50 %	25 %	412337373
68	NC_019382	CGTG	2	8	22807	22814	0 %	25 %	50 %	25 %	412337373
69	NC_019382	TGGG	2	8	22883	22890	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019382	AGCA	2	8	22982	22989	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_019382	CGGC	2	8	23406	23413	0 %	0 %	50 %	50 %	412337374
72	NC_019382	CGCC	2	8	23455	23462	0 %	0 %	25 %	75 %	412337374
73	NC_019382	CAGC	2	8	23475	23482	25 %	0 %	25 %	50 %	412337374
74	NC_019382	ATTT	2	8	24205	24212	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019382	GGCG	2	8	24285	24292	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_019382	ATCG	2	8	24642	24649	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_019382	AGGC	2	8	26519	26526	25 %	0 %	50 %	25 %	412337376
78	NC_019382	CGAA	2	8	26871	26878	50 %	0 %	25 %	25 %	412337376
79	NC_019382	ATCT	2	8	27086	27093	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_019382	GATG	2	8	27340	27347	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019382	CGGC	2	8	28342	28349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_019382	CCTC	2	8	28799	28806	0 %	25 %	0 %	75 %	412337379
83	NC_019382	GATG	2	8	29062	29069	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019382	CATG	2	8	29671	29678	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_019382	GTTG	2	8	29956	29963	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019382	TGGT	2	8	29964	29971	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019382	CTTG	2	8	30430	30437	0 %	50 %	25 %	25 %	412337381
88	NC_019382	GCAC	2	8	30872	30879	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_019382	TTGC	2	8	31134	31141	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_019382	CTGG	2	8	31733	31740	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_019382	GGCT	2	8	31777	31784	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_019382	CTGC	2	8	32029	32036	0 %	25 %	25 %	50 %	412337382
93	NC_019382	TCCG	2	8	32351	32358	0 %	25 %	25 %	50 %	412337383
94	NC_019382	GCAT	2	8	32768	32775	25 %	25 %	25 %	25 %	412337383
95	NC_019382	GGGA	2	8	33014	33021	25 %	0 %	75 %	0 %	412337383
96	NC_019382	GCTG	2	8	33415	33422	0 %	25 %	50 %	25 %	412337384
97	NC_019382	TTCC	2	8	33431	33438	0 %	50 %	0 %	50 %	412337384
98	NC_019382	AGGA	2	8	33758	33765	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019382	GCGG	2	8	33817	33824	0 %	0 %	75 %	25 %	412337385
100	NC_019382	GCGG	2	8	34645	34652	0 %	0 %	75 %	25 %	412337387
101	NC_019382	CGCC	2	8	34719	34726	0 %	0 %	25 %	75 %	412337387
102	NC_019382	CTTA	2	8	34813	34820	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_019382	GACC	2	8	34967	34974	25 %	0 %	25 %	50 %	412337388
104	NC_019382	GGCC	2	8	35144	35151	0 %	0 %	50 %	50 %	412337388
105	NC_019382	GGTG	2	8	35335	35342	0 %	25 %	75 %	0 %	412337388
106	NC_019382	CTCG	2	8	35841	35848	0 %	25 %	25 %	50 %	412337388
107	NC_019382	ACCG	2	8	36402	36409	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_019382	TGCT	2	8	36643	36650	0 %	50 %	25 %	25 %	412337389
109	NC_019382	GCCG	2	8	36935	36942	0 %	0 %	50 %	50 %	412337390
110	NC_019382	CCGG	2	8	37056	37063	0 %	0 %	50 %	50 %	412337390
111	NC_019382	CGGT	2	8	37254	37261	0 %	25 %	50 %	25 %	412337390
112	NC_019382	CGGT	2	8	37393	37400	0 %	25 %	50 %	25 %	412337391
113	NC_019382	GCGT	2	8	37610	37617	0 %	25 %	50 %	25 %	412337391
114	NC_019382	CGAA	2	8	37740	37747	50 %	0 %	25 %	25 %	412337392
115	NC_019382	GGAA	2	8	37817	37824	50 %	0 %	50 %	0 %	412337392
116	NC_019382	TGGC	2	8	38041	38048	0 %	25 %	50 %	25 %	412337392
117	NC_019382	GTTT	2	8	38129	38136	0 %	75 %	25 %	0 %	412337392
118	NC_019382	GTTT	2	8	39051	39058	0 %	75 %	25 %	0 %	412337392
119	NC_019382	GCCG	2	8	39910	39917	0 %	0 %	50 %	50 %	412337394
120	NC_019382	GGCC	2	8	40339	40346	0 %	0 %	50 %	50 %	412337394
121	NC_019382	TGGC	2	8	40371	40378	0 %	25 %	50 %	25 %	412337394
122	NC_019382	CAGG	2	8	40396	40403	25 %	0 %	50 %	25 %	412337394
123	NC_019382	CATC	2	8	40972	40979	25 %	25 %	0 %	50 %	412337395
124	NC_019382	GGCC	2	8	41036	41043	0 %	0 %	50 %	50 %	412337395
125	NC_019382	CCCG	2	8	42277	42284	0 %	0 %	25 %	75 %	412337398
126	NC_019382	TGTC	2	8	43634	43641	0 %	50 %	25 %	25 %	412337399
127	NC_019382	GGTC	2	8	45133	45140	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_019382	GGTC	2	8	45383	45390	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_019382	GCCG	2	8	47212	47219	0 %	0 %	50 %	50 %	412337401
130	NC_019382	CTGG	2	8	47446	47453	0 %	25 %	50 %	25 %	412337401
131	NC_019382	GGTC	2	8	48025	48032	0 %	25 %	50 %	25 %	412337401
132	NC_019382	GTCT	2	8	48667	48674	0 %	50 %	25 %	25 %	412337401
133	NC_019382	GATT	2	8	48958	48965	25 %	50 %	25 %	0 %	412337401
134	NC_019382	TGGC	2	8	49335	49342	0 %	25 %	50 %	25 %	412337401
135	NC_019382	TTCG	2	8	49390	49397	0 %	50 %	25 %	25 %	412337401
136	NC_019382	ACGC	2	8	49399	49406	25 %	0 %	25 %	50 %	412337401
137	NC_019382	TGCG	2	8	49431	49438	0 %	25 %	50 %	25 %	412337401
138	NC_019382	GCGA	2	8	50461	50468	25 %	0 %	50 %	25 %	412337401
139	NC_019382	GTAG	2	8	50499	50506	25 %	25 %	50 %	0 %	412337401
140	NC_019382	ACCA	2	8	50953	50960	50 %	0 %	0 %	50 %	412337402
141	NC_019382	GCGT	2	8	51110	51117	0 %	25 %	50 %	25 %	412337402
142	NC_019382	CAGG	2	8	51375	51382	25 %	0 %	50 %	25 %	412337402
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144	NC_019382	CGCA	2	8	51716	51723	25 %	0 %	25 %	50 %	412337402
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