MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica 253

Total Repeats: 151443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019382	CGCGG	2	10	118917	118926	0 %	0 %	60 %	40 %	412337469
3002	NC_019382	ACG	2	6	118993	118998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337469
3003	NC_019382	GGC	2	6	119013	119018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337469
3004	NC_019382	GC	3	6	119061	119066	0 %	0 %	50 %	50 %	412337469
3005	NC_019382	GC	3	6	119082	119087	0 %	0 %	50 %	50 %	412337469
3006	NC_019382	CG	3	6	119107	119112	0 %	0 %	50 %	50 %	412337469
3007	NC_019382	GCC	2	6	119162	119167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337469
3008	NC_019382	GCC	2	6	119171	119176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337469
3009	NC_019382	GCA	2	6	119264	119269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_019382	CGA	3	9	119310	119318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337470
3011	NC_019382	GAC	2	6	119320	119325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337470
3012	NC_019382	AGGCGC	2	12	119333	119344	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	412337470
3013	NC_019382	GCCG	2	8	119346	119353	0 %	0 %	50 %	50 %	412337470
3014	NC_019382	CGC	2	6	119372	119377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337470
3015	NC_019382	CG	3	6	119385	119390	0 %	0 %	50 %	50 %	412337470
3016	NC_019382	TGA	2	6	119414	119419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337470
3017	NC_019382	CGT	2	6	119436	119441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337470
3018	NC_019382	GGT	2	6	119445	119450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337470
3019	NC_019382	GCG	2	6	119458	119463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337470
3020	NC_019382	AAG	2	6	119506	119511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412337470
3021	NC_019382	GTG	2	6	119572	119577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337470
3022	NC_019382	CGC	2	6	119583	119588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337470
3023	NC_019382	TCT	2	6	119609	119614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	412337470
3024	NC_019382	GC	5	10	119728	119737	0 %	0 %	50 %	50 %	412337470
3025	NC_019382	GAA	2	6	119791	119796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412337470
3026	NC_019382	GCGG	2	8	119832	119839	0 %	0 %	75 %	25 %	412337470
3027	NC_019382	CGG	2	6	119913	119918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_019382	GTTGG	2	10	119953	119962	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_019382	GGC	2	6	119988	119993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_019382	GCC	2	6	119998	120003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3031	NC_019382	GCT	3	9	120015	120023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337471
3032	NC_019382	CGAT	2	8	120040	120047	25 %	25 %	25 %	25 %	412337471
3033	NC_019382	CTT	2	6	120083	120088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	412337471
3034	NC_019382	TGG	2	6	120109	120114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337471
3035	NC_019382	GCT	2	6	120149	120154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337471
3036	NC_019382	CAG	2	6	120185	120190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337471
3037	NC_019382	CTG	2	6	120233	120238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337471
3038	NC_019382	TAGA	2	8	120396	120403	50 %	25 %	25 %	0 %	412337471
3039	NC_019382	CGC	2	6	120430	120435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337471
3040	NC_019382	GCG	2	6	120514	120519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337471
3041	NC_019382	ACG	2	6	120525	120530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337471
3042	NC_019382	CGGC	2	8	120553	120560	0 %	0 %	50 %	50 %	412337471
3043	NC_019382	CAC	2	6	120623	120628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337471
3044	NC_019382	GGC	2	6	120692	120697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337471
3045	NC_019382	GCT	2	6	120736	120741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337471
3046	NC_019382	GCG	2	6	120748	120753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337471
3047	NC_019382	TTGATG	2	12	120858	120869	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	412337471
3048	NC_019382	GGT	2	6	120932	120937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337471
3049	NC_019382	CAC	2	6	120941	120946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337471
3050	NC_019382	CTGGGC	2	12	120977	120988	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	412337471
3051	NC_019382	GCG	2	6	121011	121016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337471
3052	NC_019382	GCG	2	6	121023	121028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337471
3053	NC_019382	TCGTG	2	10	121063	121072	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3054	NC_019382	GGCG	2	8	121090	121097	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3055	NC_019382	TCA	2	6	121128	121133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337472
3056	NC_019382	CCA	2	6	121187	121192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337472
3057	NC_019382	GCC	2	6	121206	121211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337472
3058	NC_019382	CAG	2	6	121212	121217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337472
3059	NC_019382	ACC	2	6	121222	121227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337472
3060	NC_019382	CG	4	8	121253	121260	0 %	0 %	50 %	50 %	412337472
3061	NC_019382	GCG	2	6	121295	121300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337472
3062	NC_019382	AGC	2	6	121384	121389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337472
3063	NC_019382	TCA	2	6	121439	121444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337472
3064	NC_019382	GCA	2	6	121445	121450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337472
3065	NC_019382	AGC	2	6	121456	121461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337472
3066	NC_019382	GCGT	2	8	121501	121508	0 %	25 %	50 %	25 %	412337472
3067	NC_019382	CAC	2	6	121566	121571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337472
3068	NC_019382	ATG	2	6	121576	121581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337472
3069	NC_019382	CGG	2	6	121595	121600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337472
3070	NC_019382	GATG	2	8	121643	121650	25 %	25 %	50 %	0 %	412337472
3071	NC_019382	GCC	2	6	121725	121730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337472
3072	NC_019382	GCG	2	6	121787	121792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337472
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3074	NC_019382	GC	3	6	121833	121838	0 %	0 %	50 %	50 %	412337472
3075	NC_019382	ATG	2	6	121855	121860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337472
3076	NC_019382	GAT	2	6	121944	121949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337472
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3078	NC_019382	CGG	2	6	121991	121996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337472
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3080	NC_019382	GC	3	6	122032	122037	0 %	0 %	50 %	50 %	412337472
3081	NC_019382	GGC	2	6	122043	122048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337472
3082	NC_019382	ATC	2	6	122050	122055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337472
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3084	NC_019382	CGAT	2	8	122123	122130	25 %	25 %	25 %	25 %	412337472
3085	NC_019382	GCA	2	6	122138	122143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337472
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3087	NC_019382	GCC	2	6	122186	122191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337472
3088	NC_019382	CCA	2	6	122222	122227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337472
3089	NC_019382	CAG	2	6	122247	122252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337472
3090	NC_019382	CAG	2	6	122295	122300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337472
3091	NC_019382	GCC	2	6	122346	122351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337472
3092	NC_019382	CAG	2	6	122412	122417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337472
3093	NC_019382	CGC	2	6	122418	122423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337472
3094	NC_019382	GC	3	6	122459	122464	0 %	0 %	50 %	50 %	412337473
3095	NC_019382	TGA	2	6	122485	122490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337473
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3098	NC_019382	ACC	2	6	122521	122526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337473
3099	NC_019382	GGCG	2	8	122543	122550	0 %	0 %	75 %	25 %	412337473
3100	NC_019382	TCG	2	6	122571	122576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337473
3101	NC_019382	AGC	2	6	122604	122609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337473
3102	NC_019382	GAA	3	9	122612	122620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412337473
3103	NC_019382	TGG	2	6	122703	122708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337473
3104	NC_019382	CAG	2	6	122753	122758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337473
3105	NC_019382	GGTC	2	8	122794	122801	0 %	25 %	50 %	25 %	412337473
3106	NC_019382	TGA	2	6	122830	122835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337473
3107	NC_019382	CAG	2	6	122849	122854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337473
3108	NC_019382	CCAGCG	2	12	122875	122886	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	412337473
3109	NC_019382	CGG	2	6	122896	122901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337473
3110	NC_019382	G	6	6	122913	122918	0 %	0 %	100 %	0 %	412337473
3111	NC_019382	ATG	2	6	122919	122924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337473
3112	NC_019382	TGC	2	6	123070	123075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_019382	TGGA	2	8	123177	123184	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_019382	ATT	2	6	123185	123190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_019382	ACGGC	2	10	123212	123221	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3116	NC_019382	GCG	2	6	123230	123235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_019382	TCC	2	6	123291	123296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3118	NC_019382	TCC	2	6	123347	123352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	412337474
3119	NC_019382	CTG	2	6	123380	123385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337474
3120	NC_019382	GAA	2	6	123394	123399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412337474
3121	NC_019382	GGCC	2	8	123400	123407	0 %	0 %	50 %	50 %	412337474
3122	NC_019382	CG	3	6	123427	123432	0 %	0 %	50 %	50 %	412337474
3123	NC_019382	GCCG	2	8	123466	123473	0 %	0 %	50 %	50 %	412337474
3124	NC_019382	AGC	2	6	123474	123479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337474
3125	NC_019382	CTG	2	6	123497	123502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337474
3126	NC_019382	GCCG	2	8	123514	123521	0 %	0 %	50 %	50 %	412337474
3127	NC_019382	GCT	2	6	123547	123552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337474
3128	NC_019382	GCG	2	6	123648	123653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337474
3129	NC_019382	CTG	2	6	123683	123688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337474
3130	NC_019382	CG	3	6	123722	123727	0 %	0 %	50 %	50 %	412337474
3131	NC_019382	GCCT	2	8	123731	123738	0 %	25 %	25 %	50 %	412337474
3132	NC_019382	GCCGC	2	10	123846	123855	0 %	0 %	40 %	60 %	412337474
3133	NC_019382	CCGA	2	8	123947	123954	25 %	0 %	25 %	50 %	412337474
3134	NC_019382	TGA	2	6	123963	123968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337474
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3137	NC_019382	GCCG	2	8	124090	124097	0 %	0 %	50 %	50 %	412337474
3138	NC_019382	GTG	2	6	124103	124108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337474
3139	NC_019382	CGC	2	6	124123	124128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337474
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3143	NC_019382	CG	3	6	124201	124206	0 %	0 %	50 %	50 %	412337474
3144	NC_019382	ACC	2	6	124223	124228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337474
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3146	NC_019382	ACC	2	6	124260	124265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337474
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3149	NC_019382	GGCC	2	8	124357	124364	0 %	0 %	50 %	50 %	412337474
3150	NC_019382	CGA	2	6	124396	124401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337474
3151	NC_019382	ACC	2	6	124425	124430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337474
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3156	NC_019382	CAA	2	6	124501	124506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	412337474
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3158	NC_019382	CTG	2	6	124526	124531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337474
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3165	NC_019382	GGC	2	6	124679	124684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337474
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3207	NC_019382	TGC	2	6	126297	126302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337474
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3210	NC_019382	CGA	2	6	126355	126360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337474
3211	NC_019382	AGCC	2	8	126395	126402	25 %	0 %	25 %	50 %	412337474
3212	NC_019382	GC	3	6	126403	126408	0 %	0 %	50 %	50 %	412337474
3213	NC_019382	CAT	2	6	126445	126450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337474
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3216	NC_019382	ACG	2	6	126501	126506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337474
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3220	NC_019382	TGGGC	2	10	126639	126648	0 %	20 %	60 %	20 %	412337474
3221	NC_019382	CCG	2	6	126657	126662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337474
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3226	NC_019382	GAT	2	6	126889	126894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337474
3227	NC_019382	GGC	2	6	126895	126900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337474
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3229	NC_019382	TCT	2	6	127011	127016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	412337474
3230	NC_019382	GC	3	6	127032	127037	0 %	0 %	50 %	50 %	412337474
3231	NC_019382	CAG	2	6	127085	127090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337474
3232	NC_019382	GC	3	6	127102	127107	0 %	0 %	50 %	50 %	412337474
3233	NC_019382	GGC	2	6	127114	127119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337474
3234	NC_019382	CGG	2	6	127183	127188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337474
3235	NC_019382	GAC	2	6	127201	127206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337474
3236	NC_019382	ATG	2	6	127229	127234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337474
3237	NC_019382	ATG	2	6	127265	127270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337474
3238	NC_019382	CGG	2	6	127306	127311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337474
3239	NC_019382	CG	4	8	127345	127352	0 %	0 %	50 %	50 %	412337474
3240	NC_019382	CTTCG	2	10	127370	127379	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3241	NC_019382	T	6	6	127413	127418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3242	NC_019382	ATTG	2	8	127458	127465	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3243	NC_019382	GGGT	2	8	127485	127492	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3244	NC_019382	GGGT	2	8	127524	127531	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3245	NC_019382	AGC	2	6	127563	127568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3246	NC_019382	ATGT	2	8	127653	127660	25 %	50 %	25 %	0 %	412337475
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3370	NC_019382	CGG	2	6	131827	131832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337475
3371	NC_019382	CGT	2	6	131833	131838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337475
3372	NC_019382	CGC	2	6	131876	131881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337475
3373	NC_019382	AGG	2	6	131929	131934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	412337475
3374	NC_019382	GCC	2	6	131949	131954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337475
3375	NC_019382	CGGC	2	8	131980	131987	0 %	0 %	50 %	50 %	412337475
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3377	NC_019382	ACG	2	6	132025	132030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337475
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3384	NC_019382	ATC	2	6	132291	132296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337475
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3395	NC_019382	CGG	2	6	132742	132747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337475
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3401	NC_019382	GC	3	6	133029	133034	0 %	0 %	50 %	50 %	412337475
3402	NC_019382	TCT	2	6	133052	133057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	412337475
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3490	NC_019382	CGG	2	6	136553	136558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337475
3491	NC_019382	GGC	2	6	136625	136630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337475
3492	NC_019382	GTG	2	6	136722	136727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337475
3493	NC_019382	GGC	2	6	136752	136757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337475
3494	NC_019382	GGCG	2	8	136775	136782	0 %	0 %	75 %	25 %	412337475
3495	NC_019382	GGCAG	2	10	136822	136831	20 %	0 %	60 %	20 %	412337475
3496	NC_019382	GGC	2	6	136842	136847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337475
3497	NC_019382	GC	3	6	136853	136858	0 %	0 %	50 %	50 %	412337475
3498	NC_019382	CGG	2	6	136889	136894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337475
3499	NC_019382	CGG	2	6	136897	136902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337475
3500	NC_019382	GT	3	6	136903	136908	0 %	50 %	50 %	0 %	412337475

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