MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii HLJ01 chromosome

Total Repeats: 998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018887	TGAAA	2	10	94	103	60 %	20 %	20 %	0 %	410678749
2	NC_018887	AATCA	2	10	2591	2600	60 %	20 %	0 %	20 %	410678751
3	NC_018887	AATCC	2	10	3568	3577	40 %	20 %	0 %	40 %	410678752
4	NC_018887	AGGTT	2	10	3667	3676	20 %	40 %	40 %	0 %	410678752
5	NC_018887	AAAGA	2	10	4061	4070	80 %	0 %	20 %	0 %	410678752
6	NC_018887	TCAAT	2	10	4123	4132	40 %	40 %	0 %	20 %	410678752
7	NC_018887	ATTCC	2	10	5273	5282	20 %	40 %	0 %	40 %	410678754
8	NC_018887	CCTTG	2	10	5341	5350	0 %	40 %	20 %	40 %	410678754
9	NC_018887	GTATT	2	10	6111	6120	20 %	60 %	20 %	0 %	410678754
10	NC_018887	ACAAT	2	10	7309	7318	60 %	20 %	0 %	20 %	410678755
11	NC_018887	ATTCT	2	10	7328	7337	20 %	60 %	0 %	20 %	410678755
12	NC_018887	TAAAT	2	10	8037	8046	60 %	40 %	0 %	0 %	410678756
13	NC_018887	AATTT	2	10	8310	8319	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018887	TTTCA	2	10	9283	9292	20 %	60 %	0 %	20 %	410678758
15	NC_018887	TTAAA	2	10	10288	10297	60 %	40 %	0 %	0 %	410678759
16	NC_018887	AATTC	2	10	10791	10800	40 %	40 %	0 %	20 %	410678760
17	NC_018887	TTCAT	2	10	11694	11703	20 %	60 %	0 %	20 %	410678761
18	NC_018887	ACTTA	2	10	12499	12508	40 %	40 %	0 %	20 %	410678762
19	NC_018887	CAAAT	2	10	12651	12660	60 %	20 %	0 %	20 %	410678762
20	NC_018887	TAAAA	2	10	12920	12929	80 %	20 %	0 %	0 %	410678763
21	NC_018887	AACAT	2	10	12970	12979	60 %	20 %	0 %	20 %	410678763
22	NC_018887	AATAT	2	10	14590	14599	60 %	40 %	0 %	0 %	410678764
23	NC_018887	AACAA	2	10	14638	14647	80 %	0 %	0 %	20 %	410678764
24	NC_018887	AAAAT	2	10	16223	16232	80 %	20 %	0 %	0 %	410678767
25	NC_018887	TTAAA	2	10	16804	16813	60 %	40 %	0 %	0 %	410678767
26	NC_018887	ATTCA	2	10	16851	16860	40 %	40 %	0 %	20 %	410678768
27	NC_018887	TATCA	2	10	17784	17793	40 %	40 %	0 %	20 %	410678768
28	NC_018887	AAAGA	2	10	18104	18113	80 %	0 %	20 %	0 %	410678769
29	NC_018887	CAATC	2	10	18552	18561	40 %	20 %	0 %	40 %	410678770
30	NC_018887	TAAAC	2	10	19886	19895	60 %	20 %	0 %	20 %	410678770
31	NC_018887	AAACA	2	10	21780	21789	80 %	0 %	0 %	20 %	410678772
32	NC_018887	AATTA	2	10	22771	22780	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018887	ATTTT	2	10	24107	24116	20 %	80 %	0 %	0 %	410678775
34	NC_018887	TCCCC	2	10	24599	24608	0 %	20 %	0 %	80 %	410678775
35	NC_018887	CAAAA	2	10	26728	26737	80 %	0 %	0 %	20 %	410678778
36	NC_018887	AAAAT	2	10	28930	28939	80 %	20 %	0 %	0 %	410678781
37	NC_018887	TAACC	2	10	29492	29501	40 %	20 %	0 %	40 %	410678781
38	NC_018887	TTAAA	2	10	29606	29615	60 %	40 %	0 %	0 %	410678782
39	NC_018887	GAAGT	2	10	31125	31134	40 %	20 %	40 %	0 %	410678783
40	NC_018887	AAATA	2	10	31465	31474	80 %	20 %	0 %	0 %	410678783
41	NC_018887	TTTGA	2	10	32669	32678	20 %	60 %	20 %	0 %	410678785
42	NC_018887	TCACT	2	10	33216	33225	20 %	40 %	0 %	40 %	410678785
43	NC_018887	ATTTC	2	10	35656	35665	20 %	60 %	0 %	20 %	410678786
44	NC_018887	TAAAT	2	10	35863	35872	60 %	40 %	0 %	0 %	410678787
45	NC_018887	ATTTT	2	10	36848	36857	20 %	80 %	0 %	0 %	410678788
46	NC_018887	AATAA	2	10	36928	36937	80 %	20 %	0 %	0 %	410678788
47	NC_018887	GCAAA	2	10	38169	38178	60 %	0 %	20 %	20 %	410678789
48	NC_018887	ATCAA	2	10	39299	39308	60 %	20 %	0 %	20 %	410678789
49	NC_018887	TATCA	2	10	41429	41438	40 %	40 %	0 %	20 %	410678791
50	NC_018887	ATCTT	2	10	41471	41480	20 %	60 %	0 %	20 %	410678792
51	NC_018887	TTAAT	2	10	42187	42196	40 %	60 %	0 %	0 %	410678793
52	NC_018887	AAACT	2	10	42854	42863	60 %	20 %	0 %	20 %	410678794
53	NC_018887	GATTT	2	10	43990	43999	20 %	60 %	20 %	0 %	410678795
54	NC_018887	TCTTT	2	10	44314	44323	0 %	80 %	0 %	20 %	410678795
55	NC_018887	TGCAA	2	10	45681	45690	40 %	20 %	20 %	20 %	410678796
56	NC_018887	AAATT	2	10	45709	45718	60 %	40 %	0 %	0 %	410678796
57	NC_018887	AAGTA	2	10	46514	46523	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018887	ACTAA	2	10	47102	47111	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_018887	TAAAT	2	10	51306	51315	60 %	40 %	0 %	0 %	410678805
60	NC_018887	ATAAA	2	10	56625	56634	80 %	20 %	0 %	0 %	410678809
61	NC_018887	TAAAT	2	10	56760	56769	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018887	TATTT	2	10	56770	56779	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018887	TTAAA	2	10	59347	59356	60 %	40 %	0 %	0 %	410678814
64	NC_018887	ATTTT	2	10	59521	59530	20 %	80 %	0 %	0 %	410678814
65	NC_018887	TTTGT	2	10	60426	60435	0 %	80 %	20 %	0 %	410678815
66	NC_018887	TTATT	2	10	60513	60522	20 %	80 %	0 %	0 %	410678816
67	NC_018887	CATTA	2	10	63284	63293	40 %	40 %	0 %	20 %	410678818
68	NC_018887	AGAGA	2	10	63615	63624	60 %	0 %	40 %	0 %	410678818
69	NC_018887	AAAGG	2	10	63729	63738	60 %	0 %	40 %	0 %	410678818
70	NC_018887	TCTTG	2	10	65269	65278	0 %	60 %	20 %	20 %	410678820
71	NC_018887	ATTTT	2	10	69658	69667	20 %	80 %	0 %	0 %	410678823
72	NC_018887	TTTAT	2	10	70016	70025	20 %	80 %	0 %	0 %	410678823
73	NC_018887	TAAAA	2	10	74992	75001	80 %	20 %	0 %	0 %	410678829
74	NC_018887	TCAAA	2	10	76832	76841	60 %	20 %	0 %	20 %	410678831
75	NC_018887	AATAA	2	10	76907	76916	80 %	20 %	0 %	0 %	410678831
76	NC_018887	TAAAC	2	10	78681	78690	60 %	20 %	0 %	20 %	410678832
77	NC_018887	ATTTT	2	10	80383	80392	20 %	80 %	0 %	0 %	410678834
78	NC_018887	TTTCA	2	10	80783	80792	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_018887	AAAAT	2	10	80911	80920	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018887	AGTAA	2	10	80966	80975	60 %	20 %	20 %	0 %	410678835
81	NC_018887	ATTTA	2	10	81079	81088	40 %	60 %	0 %	0 %	410678835
82	NC_018887	TGATT	2	10	82716	82725	20 %	60 %	20 %	0 %	410678836
83	NC_018887	AATAA	2	10	84633	84642	80 %	20 %	0 %	0 %	410678838
84	NC_018887	TCTTT	2	10	85042	85051	0 %	80 %	0 %	20 %	410678838
85	NC_018887	CTTTT	2	10	88302	88311	0 %	80 %	0 %	20 %	410678841
86	NC_018887	ATCTC	2	10	88505	88514	20 %	40 %	0 %	40 %	410678841
87	NC_018887	AATTT	2	10	89748	89757	40 %	60 %	0 %	0 %	410678842
88	NC_018887	CCCAA	2	10	89856	89865	40 %	0 %	0 %	60 %	410678843
89	NC_018887	TCCCA	2	10	90547	90556	20 %	20 %	0 %	60 %	410678843
90	NC_018887	ATCAA	2	10	90566	90575	60 %	20 %	0 %	20 %	410678843
91	NC_018887	GTCCT	2	10	90690	90699	0 %	40 %	20 %	40 %	410678843
92	NC_018887	TTATC	2	10	94287	94296	20 %	60 %	0 %	20 %	410678847
93	NC_018887	TTAAA	2	10	94561	94570	60 %	40 %	0 %	0 %	410678848
94	NC_018887	TAATA	2	10	94722	94731	60 %	40 %	0 %	0 %	410678848
95	NC_018887	TTCAA	2	10	96454	96463	40 %	40 %	0 %	20 %	410678848
96	NC_018887	ATTTA	2	10	98331	98340	40 %	60 %	0 %	0 %	410678850
97	NC_018887	TACTT	2	10	98514	98523	20 %	60 %	0 %	20 %	410678850
98	NC_018887	CACGC	2	10	99468	99477	20 %	0 %	20 %	60 %	410678851
99	NC_018887	ACCTC	2	10	100938	100947	20 %	20 %	0 %	60 %	410678853
100	NC_018887	ATCAA	2	10	103524	103533	60 %	20 %	0 %	20 %	410678856
101	NC_018887	TTAGT	2	10	103645	103654	20 %	60 %	20 %	0 %	410678857
102	NC_018887	GCATT	2	10	104723	104732	20 %	40 %	20 %	20 %	410678857
103	NC_018887	TTTTA	2	10	105767	105776	20 %	80 %	0 %	0 %	410678859
104	NC_018887	CATAA	2	10	106777	106786	60 %	20 %	0 %	20 %	410678859
105	NC_018887	TGAAT	2	10	107620	107629	40 %	40 %	20 %	0 %	410678860
106	NC_018887	AATCT	2	10	107665	107674	40 %	40 %	0 %	20 %	410678860
107	NC_018887	TACAA	2	10	108091	108100	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_018887	CTATA	2	10	109939	109948	40 %	40 %	0 %	20 %	410678862
109	NC_018887	GCACT	2	10	113287	113296	20 %	20 %	20 %	40 %	410678868
110	NC_018887	AATAA	2	10	114143	114152	80 %	20 %	0 %	0 %	410678868
111	NC_018887	ATTTA	2	10	114591	114600	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018887	CAATA	2	10	115613	115622	60 %	20 %	0 %	20 %	410678870
113	NC_018887	TAATA	2	10	116218	116227	60 %	40 %	0 %	0 %	410678870
114	NC_018887	AAAAG	2	10	116733	116742	80 %	0 %	20 %	0 %	410678871
115	NC_018887	AAAAT	2	10	116941	116950	80 %	20 %	0 %	0 %	410678871
116	NC_018887	AAAAT	2	10	117466	117475	80 %	20 %	0 %	0 %	410678871
117	NC_018887	AAATT	2	10	117976	117985	60 %	40 %	0 %	0 %	410678872
118	NC_018887	TTTAA	2	10	119194	119203	40 %	60 %	0 %	0 %	410678874
119	NC_018887	TATCA	2	10	120075	120084	40 %	40 %	0 %	20 %	410678875
120	NC_018887	ATTTC	2	10	120349	120358	20 %	60 %	0 %	20 %	410678875
121	NC_018887	TCTCT	2	10	122442	122451	0 %	60 %	0 %	40 %	410678879
122	NC_018887	ACCAT	2	10	123443	123452	40 %	20 %	0 %	40 %	410678879
123	NC_018887	ACTCT	2	10	125213	125222	20 %	40 %	0 %	40 %	410678881
124	NC_018887	AAAAT	2	10	125793	125802	80 %	20 %	0 %	0 %	410678882
125	NC_018887	AATAG	2	10	128111	128120	60 %	20 %	20 %	0 %	410678884
126	NC_018887	TTTGC	2	10	128740	128749	0 %	60 %	20 %	20 %	410678884
127	NC_018887	TAAAA	2	10	129487	129496	80 %	20 %	0 %	0 %	410678884
128	NC_018887	ATTAT	2	10	129879	129888	40 %	60 %	0 %	0 %	410678884
129	NC_018887	TTTTA	2	10	129908	129917	20 %	80 %	0 %	0 %	410678884
130	NC_018887	TTATA	2	10	131120	131129	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018887	TATTT	2	10	131666	131675	20 %	80 %	0 %	0 %	410678886
132	NC_018887	ATTTT	2	10	132443	132452	20 %	80 %	0 %	0 %	410678887
133	NC_018887	TAAAA	2	10	133144	133153	80 %	20 %	0 %	0 %	410678887
134	NC_018887	AAATC	2	10	133475	133484	60 %	20 %	0 %	20 %	410678887
135	NC_018887	AAAAG	2	10	134144	134153	80 %	0 %	20 %	0 %	410678888
136	NC_018887	AAATT	2	10	134703	134712	60 %	40 %	0 %	0 %	410678888
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