MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_78p

Total Repeats: 187

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018879	AT	3	6	173	178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018879	AT	3	6	377	382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018879	TG	3	6	556	561	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018879	TC	3	6	1097	1102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018879	AT	3	6	2770	2775	50 %	50 %	0 %	0 %	410678639
6	NC_018879	TA	3	6	2933	2938	50 %	50 %	0 %	0 %	410678639
7	NC_018879	AT	3	6	3843	3848	50 %	50 %	0 %	0 %	410678641
8	NC_018879	TG	3	6	5115	5120	0 %	50 %	50 %	0 %	410678643
9	NC_018879	AT	3	6	5188	5193	50 %	50 %	0 %	0 %	410678643
10	NC_018879	TC	3	6	5217	5222	0 %	50 %	0 %	50 %	410678643
11	NC_018879	AC	3	6	5235	5240	50 %	0 %	0 %	50 %	410678643
12	NC_018879	TA	3	6	5306	5311	50 %	50 %	0 %	0 %	410678643
13	NC_018879	TA	3	6	5532	5537	50 %	50 %	0 %	0 %	410678643
14	NC_018879	AT	4	8	5795	5802	50 %	50 %	0 %	0 %	410678643
15	NC_018879	AT	3	6	5943	5948	50 %	50 %	0 %	0 %	410678643
16	NC_018879	CA	3	6	6245	6250	50 %	0 %	0 %	50 %	410678644
17	NC_018879	AC	3	6	7285	7290	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018879	TA	3	6	7304	7309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018879	AT	3	6	7456	7461	50 %	50 %	0 %	0 %	410678646
20	NC_018879	TA	3	6	7497	7502	50 %	50 %	0 %	0 %	410678646
21	NC_018879	TA	3	6	7798	7803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018879	CT	3	6	7844	7849	0 %	50 %	0 %	50 %	410678647
23	NC_018879	AT	3	6	8591	8596	50 %	50 %	0 %	0 %	410678648
24	NC_018879	AT	4	8	8632	8639	50 %	50 %	0 %	0 %	410678648
25	NC_018879	TA	3	6	8922	8927	50 %	50 %	0 %	0 %	410678649
26	NC_018879	AT	4	8	9272	9279	50 %	50 %	0 %	0 %	410678649
27	NC_018879	CT	3	6	9448	9453	0 %	50 %	0 %	50 %	410678650
28	NC_018879	AT	3	6	9600	9605	50 %	50 %	0 %	0 %	410678650
29	NC_018879	AT	3	6	10023	10028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018879	TA	3	6	10076	10081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018879	AT	3	6	11553	11558	50 %	50 %	0 %	0 %	410678654
32	NC_018879	TA	3	6	12264	12269	50 %	50 %	0 %	0 %	410678654
33	NC_018879	AG	3	6	12475	12480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018879	TC	3	6	12494	12499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018879	AT	4	8	12978	12985	50 %	50 %	0 %	0 %	410678655
36	NC_018879	TA	4	8	13024	13031	50 %	50 %	0 %	0 %	410678655
37	NC_018879	AT	3	6	14727	14732	50 %	50 %	0 %	0 %	410678657
38	NC_018879	AT	3	6	15089	15094	50 %	50 %	0 %	0 %	410678657
39	NC_018879	TA	3	6	15478	15483	50 %	50 %	0 %	0 %	410678657
40	NC_018879	TC	3	6	16464	16469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018879	TC	3	6	16482	16487	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018879	GA	3	6	17136	17141	50 %	0 %	50 %	0 %	410678658
43	NC_018879	TC	3	6	17754	17759	0 %	50 %	0 %	50 %	410678658
44	NC_018879	TA	3	6	17785	17790	50 %	50 %	0 %	0 %	410678658
45	NC_018879	TA	3	6	18345	18350	50 %	50 %	0 %	0 %	410678659
46	NC_018879	TA	3	6	18923	18928	50 %	50 %	0 %	0 %	410678660
47	NC_018879	CT	3	6	19126	19131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018879	TA	3	6	19420	19425	50 %	50 %	0 %	0 %	410678661
49	NC_018879	CT	3	6	19602	19607	0 %	50 %	0 %	50 %	410678662
50	NC_018879	AT	3	6	20153	20158	50 %	50 %	0 %	0 %	410678662
51	NC_018879	TA	3	6	20168	20173	50 %	50 %	0 %	0 %	410678662
52	NC_018879	TA	3	6	21096	21101	50 %	50 %	0 %	0 %	410678664
53	NC_018879	AC	3	6	21208	21213	50 %	0 %	0 %	50 %	410678665
54	NC_018879	TA	4	8	21301	21308	50 %	50 %	0 %	0 %	410678665
55	NC_018879	AT	3	6	21675	21680	50 %	50 %	0 %	0 %	410678666
56	NC_018879	CA	3	6	21684	21689	50 %	0 %	0 %	50 %	410678666
57	NC_018879	CT	3	6	22822	22827	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_018879	GT	3	6	22950	22955	0 %	50 %	50 %	0 %	410678670
59	NC_018879	AT	3	6	22974	22979	50 %	50 %	0 %	0 %	410678670
60	NC_018879	TC	3	6	23124	23129	0 %	50 %	0 %	50 %	410678670
61	NC_018879	TA	3	6	23803	23808	50 %	50 %	0 %	0 %	410678672
62	NC_018879	TC	3	6	24039	24044	0 %	50 %	0 %	50 %	410678672
63	NC_018879	AT	3	6	24293	24298	50 %	50 %	0 %	0 %	410678673
64	NC_018879	CT	3	6	24672	24677	0 %	50 %	0 %	50 %	410678675
65	NC_018879	TC	3	6	24707	24712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_018879	TA	3	6	24735	24740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018879	AT	3	6	24759	24764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018879	TA	3	6	25379	25384	50 %	50 %	0 %	0 %	410678677
69	NC_018879	CA	3	6	25524	25529	50 %	0 %	0 %	50 %	410678677
70	NC_018879	AG	4	8	25739	25746	50 %	0 %	50 %	0 %	410678677
71	NC_018879	AT	3	6	26065	26070	50 %	50 %	0 %	0 %	410678678
72	NC_018879	TA	3	6	28992	28997	50 %	50 %	0 %	0 %	410678683
73	NC_018879	AT	3	6	29286	29291	50 %	50 %	0 %	0 %	410678683
74	NC_018879	TA	3	6	29496	29501	50 %	50 %	0 %	0 %	410678683
75	NC_018879	AT	3	6	29559	29564	50 %	50 %	0 %	0 %	410678683
76	NC_018879	TA	3	6	29868	29873	50 %	50 %	0 %	0 %	410678684
77	NC_018879	TA	3	6	30402	30407	50 %	50 %	0 %	0 %	410678684
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82	NC_018879	TA	3	6	35024	35029	50 %	50 %	0 %	0 %	410678689
83	NC_018879	CT	3	6	35165	35170	0 %	50 %	0 %	50 %	410678689
84	NC_018879	AG	3	6	35489	35494	50 %	0 %	50 %	0 %	410678689
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88	NC_018879	TA	3	6	38573	38578	50 %	50 %	0 %	0 %	410678691
89	NC_018879	TC	3	6	38672	38677	0 %	50 %	0 %	50 %	410678691
90	NC_018879	AC	3	6	38710	38715	50 %	0 %	0 %	50 %	410678691
91	NC_018879	AT	3	6	38836	38841	50 %	50 %	0 %	0 %	410678691
92	NC_018879	TA	3	6	38920	38925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018879	TA	3	6	38943	38948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018879	AT	3	6	39385	39390	50 %	50 %	0 %	0 %	410678692
95	NC_018879	TA	3	6	39481	39486	50 %	50 %	0 %	0 %	410678692
96	NC_018879	TC	3	6	39519	39524	0 %	50 %	0 %	50 %	410678692
97	NC_018879	CT	3	6	40369	40374	0 %	50 %	0 %	50 %	410678692
98	NC_018879	AC	3	6	40436	40441	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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102	NC_018879	AT	3	6	41517	41522	50 %	50 %	0 %	0 %	410678694
103	NC_018879	TA	3	6	41527	41532	50 %	50 %	0 %	0 %	410678694
104	NC_018879	AC	3	6	41801	41806	50 %	0 %	0 %	50 %	410678694
105	NC_018879	TA	3	6	42278	42283	50 %	50 %	0 %	0 %	410678694
106	NC_018879	AT	3	6	42520	42525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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110	NC_018879	CA	3	6	45266	45271	50 %	0 %	0 %	50 %	410678697
111	NC_018879	CT	3	6	45447	45452	0 %	50 %	0 %	50 %	410678697
112	NC_018879	TA	3	6	46012	46017	50 %	50 %	0 %	0 %	410678698
113	NC_018879	TA	3	6	46121	46126	50 %	50 %	0 %	0 %	410678698
114	NC_018879	TA	3	6	46131	46136	50 %	50 %	0 %	0 %	410678698
115	NC_018879	TA	4	8	47467	47474	50 %	50 %	0 %	0 %	410678700
116	NC_018879	AT	3	6	47579	47584	50 %	50 %	0 %	0 %	410678700
117	NC_018879	AC	3	6	47805	47810	50 %	0 %	0 %	50 %	410678700
118	NC_018879	TA	4	8	47851	47858	50 %	50 %	0 %	0 %	410678700
119	NC_018879	AG	3	6	48823	48828	50 %	0 %	50 %	0 %	410678701
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121	NC_018879	GT	3	6	49608	49613	0 %	50 %	50 %	0 %	410678701
122	NC_018879	AT	3	6	50378	50383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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124	NC_018879	TA	3	6	51216	51221	50 %	50 %	0 %	0 %	410678703
125	NC_018879	TA	3	6	51289	51294	50 %	50 %	0 %	0 %	410678703
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128	NC_018879	CT	3	6	51587	51592	0 %	50 %	0 %	50 %	410678704
129	NC_018879	GT	3	6	53189	53194	0 %	50 %	50 %	0 %	410678704
130	NC_018879	AT	3	6	53344	53349	50 %	50 %	0 %	0 %	410678704
131	NC_018879	CT	3	6	53638	53643	0 %	50 %	0 %	50 %	410678704
132	NC_018879	AT	3	6	54020	54025	50 %	50 %	0 %	0 %	410678705
133	NC_018879	TA	3	6	54625	54630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018879	AT	3	6	56193	56198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_018879	AT	3	6	59422	59427	50 %	50 %	0 %	0 %	410678708
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.