MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_78p

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018879	GAACA	2	10	2330	2339	60 %	0 %	20 %	20 %	410678639
2	NC_018879	TTATT	2	10	3337	3346	20 %	80 %	0 %	0 %	410678640
3	NC_018879	ATATT	2	10	4213	4222	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018879	AAATA	2	10	4453	4462	80 %	20 %	0 %	0 %	410678642
5	NC_018879	AACAA	2	10	5428	5437	80 %	0 %	0 %	20 %	410678643
6	NC_018879	GTTGA	2	10	6626	6635	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018879	ATAGC	2	10	6842	6851	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018879	TTTTA	2	10	8275	8284	20 %	80 %	0 %	0 %	410678648
9	NC_018879	TGAAA	2	10	10214	10223	60 %	20 %	20 %	0 %	410678652
10	NC_018879	AGTTG	2	10	10611	10620	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018879	GTTTT	2	10	10841	10850	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018879	TATAA	2	10	11339	11348	60 %	40 %	0 %	0 %	410678654
13	NC_018879	AAATT	2	10	11432	11441	60 %	40 %	0 %	0 %	410678654
14	NC_018879	ATTTA	2	10	11523	11532	40 %	60 %	0 %	0 %	410678654
15	NC_018879	TAAAT	2	10	12425	12434	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018879	TTTAA	2	10	14094	14103	40 %	60 %	0 %	0 %	410678657
17	NC_018879	AGGAA	2	10	14105	14114	60 %	0 %	40 %	0 %	410678657
18	NC_018879	TAGTT	2	10	15755	15764	20 %	60 %	20 %	0 %	410678657
19	NC_018879	AATTA	2	10	16488	16497	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018879	ACTGT	2	10	17963	17972	20 %	40 %	20 %	20 %	410678659
21	NC_018879	TTGTA	2	10	18049	18058	20 %	60 %	20 %	0 %	410678659
22	NC_018879	CCTTT	2	10	18498	18507	0 %	60 %	0 %	40 %	410678660
23	NC_018879	TTTTA	2	10	19113	19122	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018879	CTGTT	2	10	19198	19207	0 %	60 %	20 %	20 %	410678661
25	NC_018879	AAAAG	2	10	20679	20688	80 %	0 %	20 %	0 %	410678663
26	NC_018879	TTCGT	2	10	21604	21613	0 %	60 %	20 %	20 %	410678666
27	NC_018879	TTGTT	2	10	21960	21969	0 %	80 %	20 %	0 %	410678667
28	NC_018879	TCATT	3	15	24299	24313	20 %	60 %	0 %	20 %	410678673
29	NC_018879	CAATT	2	10	25105	25114	40 %	40 %	0 %	20 %	410678676
30	NC_018879	CTTTG	2	10	27511	27520	0 %	60 %	20 %	20 %	410678680
31	NC_018879	TCTTT	2	10	27591	27600	0 %	80 %	0 %	20 %	410678680
32	NC_018879	CCATA	2	10	27774	27783	40 %	20 %	0 %	40 %	410678680
33	NC_018879	TTATT	2	10	29631	29640	20 %	80 %	0 %	0 %	410678684
34	NC_018879	TGTAC	2	10	30790	30799	20 %	40 %	20 %	20 %	410678685
35	NC_018879	TTGTA	2	10	32270	32279	20 %	60 %	20 %	0 %	410678686
36	NC_018879	CACTT	2	10	33327	33336	20 %	40 %	0 %	40 %	410678687
37	NC_018879	CCCTA	2	10	35197	35206	20 %	20 %	0 %	60 %	410678689
38	NC_018879	GATTT	2	10	36066	36075	20 %	60 %	20 %	0 %	410678689
39	NC_018879	TAAGT	2	10	36919	36928	40 %	40 %	20 %	0 %	410678690
40	NC_018879	ATTAA	2	10	39099	39108	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018879	ATTTT	2	10	41691	41700	20 %	80 %	0 %	0 %	410678694
42	NC_018879	AAAAG	2	10	42330	42339	80 %	0 %	20 %	0 %	410678694
43	NC_018879	CTTTT	2	10	42940	42949	0 %	80 %	0 %	20 %	410678695
44	NC_018879	CTTTT	2	10	43468	43477	0 %	80 %	0 %	20 %	410678695
45	NC_018879	CTTTT	2	10	44419	44428	0 %	80 %	0 %	20 %	410678695
46	NC_018879	TTTTC	2	10	47532	47541	0 %	80 %	0 %	20 %	410678700
47	NC_018879	CTAAT	2	10	49919	49928	40 %	40 %	0 %	20 %	410678701
48	NC_018879	TTAGT	2	10	50039	50048	20 %	60 %	20 %	0 %	410678701
49	NC_018879	CATAC	2	10	50495	50504	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_018879	CAGTT	2	10	50641	50650	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_018879	AAATC	2	10	53924	53933	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_018879	TATTG	2	10	55399	55408	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018879	AATTA	2	10	55637	55646	60 %	40 %	0 %	0 %	410678706
54	NC_018879	CTAAT	2	10	55657	55666	40 %	40 %	0 %	20 %	410678706
55	NC_018879	TATCA	2	10	55898	55907	40 %	40 %	0 %	20 %	410678706
56	NC_018879	ATCCC	2	10	56113	56122	20 %	20 %	0 %	60 %	410678706
57	NC_018879	AAGAG	2	10	58243	58252	60 %	0 %	40 %	0 %	410678708
58	NC_018879	AAATG	2	10	59383	59392	60 %	20 %	20 %	0 %	410678708
59	NC_018879	TCTTT	2	10	60363	60372	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_018879	TCTTT	2	10	61169	61178	0 %	80 %	0 %	20 %	410678711
61	NC_018879	AAACT	2	10	61817	61826	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_018879	ATTTC	2	10	62373	62382	20 %	60 %	0 %	20 %	410678712
63	NC_018879	CATCC	2	10	62764	62773	20 %	20 %	0 %	60 %	410678713
64	NC_018879	TAGTT	2	10	63822	63831	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018879	ATAAA	2	10	67239	67248	80 %	20 %	0 %	0 %	410678719
66	NC_018879	TAAAG	2	10	67452	67461	60 %	20 %	20 %	0 %	410678719
67	NC_018879	GAATA	2	10	68758	68767	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018879	TTATT	2	10	68865	68874	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018879	GGGCT	2	10	68974	68983	0 %	20 %	60 %	20 %	410678720
70	NC_018879	TGACT	2	10	70765	70774	20 %	40 %	20 %	20 %	410678723
71	NC_018879	TTACA	2	10	71362	71371	40 %	40 %	0 %	20 %	410678724
72	NC_018879	TTCAA	2	10	72200	72209	40 %	40 %	0 %	20 %	410678726
73	NC_018879	TACAG	2	10	74589	74598	40 %	20 %	20 %	20 %	410678727
74	NC_018879	AAGCA	2	10	75379	75388	60 %	0 %	20 %	20 %	410678728
75	NC_018879	GTATA	2	10	75407	75416	40 %	40 %	20 %	0 %	410678728
76	NC_018879	TGAAT	2	10	76127	76136	40 %	40 %	20 %	0 %	410678728

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.