MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_78p

Total Repeats: 267

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018879	TAAA	2	8	198	205	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018879	AATA	2	8	207	214	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018879	GGGA	2	8	642	649	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018879	GCCT	2	8	715	722	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018879	ATTT	2	8	1121	1128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018879	TAAT	2	8	1152	1159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018879	AAAT	2	8	1385	1392	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018879	ATTT	2	8	1400	1407	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018879	AATA	2	8	1602	1609	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018879	GTAT	2	8	1655	1662	25 %	50 %	25 %	0 %	410678639
11	NC_018879	ATAA	2	8	1753	1760	75 %	25 %	0 %	0 %	410678639
12	NC_018879	GAAA	2	8	2112	2119	75 %	0 %	25 %	0 %	410678639
13	NC_018879	ATTC	2	8	3113	3120	25 %	50 %	0 %	25 %	410678640
14	NC_018879	TGAT	2	8	3688	3695	25 %	50 %	25 %	0 %	410678640
15	NC_018879	GATT	2	8	3924	3931	25 %	50 %	25 %	0 %	410678641
16	NC_018879	ATTT	2	8	4051	4058	25 %	75 %	0 %	0 %	410678641
17	NC_018879	ATTA	2	8	4175	4182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018879	TTCT	2	8	4533	4540	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_018879	AGTA	2	8	4679	4686	50 %	25 %	25 %	0 %	410678643
20	NC_018879	GTAT	2	8	5241	5248	25 %	50 %	25 %	0 %	410678643
21	NC_018879	AGAT	2	8	5313	5320	50 %	25 %	25 %	0 %	410678643
22	NC_018879	GAAT	2	8	5385	5392	50 %	25 %	25 %	0 %	410678643
23	NC_018879	TTTA	2	8	5614	5621	25 %	75 %	0 %	0 %	410678643
24	NC_018879	ATTG	2	8	5701	5708	25 %	50 %	25 %	0 %	410678643
25	NC_018879	CCTT	2	8	6419	6426	0 %	50 %	0 %	50 %	410678644
26	NC_018879	TAAA	2	8	6823	6830	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018879	GGTG	2	8	6948	6955	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018879	AAAT	2	8	7146	7153	75 %	25 %	0 %	0 %	410678645
29	NC_018879	ATAA	2	8	7323	7330	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018879	AAAC	2	8	7618	7625	75 %	0 %	0 %	25 %	410678646
31	NC_018879	CAAC	2	8	7690	7697	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018879	ATTG	2	8	8068	8075	25 %	50 %	25 %	0 %	410678647
33	NC_018879	TGTT	2	8	8872	8879	0 %	75 %	25 %	0 %	410678649
34	NC_018879	TGTT	2	8	9311	9318	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018879	CCTT	2	8	9553	9560	0 %	50 %	0 %	50 %	410678650
36	NC_018879	ATTA	2	8	9746	9753	50 %	50 %	0 %	0 %	410678651
37	NC_018879	ATTC	2	8	9976	9983	25 %	50 %	0 %	25 %	410678651
38	NC_018879	ATAA	2	8	10088	10095	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018879	TTTA	2	8	10171	10178	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018879	GTTT	2	8	10430	10437	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018879	TAAT	2	8	11193	11200	50 %	50 %	0 %	0 %	410678653
42	NC_018879	CTTT	2	8	11234	11241	0 %	75 %	0 %	25 %	410678654
43	NC_018879	TACT	2	8	11266	11273	25 %	50 %	0 %	25 %	410678654
44	NC_018879	ATTT	2	8	11793	11800	25 %	75 %	0 %	0 %	410678654
45	NC_018879	AATT	2	8	12065	12072	50 %	50 %	0 %	0 %	410678654
46	NC_018879	TAAG	2	8	12371	12378	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018879	GACT	2	8	13203	13210	25 %	25 %	25 %	25 %	410678655
48	NC_018879	TATC	2	8	13417	13424	25 %	50 %	0 %	25 %	410678656
49	NC_018879	CTTC	2	8	14241	14248	0 %	50 %	0 %	50 %	410678657
50	NC_018879	TTAA	2	8	14298	14305	50 %	50 %	0 %	0 %	410678657
51	NC_018879	CTAT	2	8	14514	14521	25 %	50 %	0 %	25 %	410678657
52	NC_018879	TTTG	2	8	14559	14566	0 %	75 %	25 %	0 %	410678657
53	NC_018879	TTTC	2	8	14828	14835	0 %	75 %	0 %	25 %	410678657
54	NC_018879	ATCA	2	8	15266	15273	50 %	25 %	0 %	25 %	410678657
55	NC_018879	AAAT	2	8	15379	15386	75 %	25 %	0 %	0 %	410678657
56	NC_018879	TAAG	2	8	15703	15710	50 %	25 %	25 %	0 %	410678657
57	NC_018879	TCCT	2	8	15971	15978	0 %	50 %	0 %	50 %	410678657
58	NC_018879	TACT	2	8	16125	16132	25 %	50 %	0 %	25 %	410678657
59	NC_018879	AATA	2	8	16301	16308	75 %	25 %	0 %	0 %	410678657
60	NC_018879	ATTA	3	12	16596	16607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018879	ATTT	2	8	16805	16812	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018879	TTAA	2	8	17396	17403	50 %	50 %	0 %	0 %	410678658
63	NC_018879	ATTA	2	8	18316	18323	50 %	50 %	0 %	0 %	410678659
64	NC_018879	TTCT	2	8	18438	18445	0 %	75 %	0 %	25 %	410678659
65	NC_018879	CGTT	2	8	18600	18607	0 %	50 %	25 %	25 %	410678660
66	NC_018879	TTCT	2	8	18775	18782	0 %	75 %	0 %	25 %	410678660
67	NC_018879	AATA	2	8	18917	18924	75 %	25 %	0 %	0 %	410678660
68	NC_018879	ATTT	2	8	19591	19598	25 %	75 %	0 %	0 %	410678662
69	NC_018879	ATAC	2	8	19685	19692	50 %	25 %	0 %	25 %	410678662
70	NC_018879	AATT	2	8	19863	19870	50 %	50 %	0 %	0 %	410678662
71	NC_018879	TTCT	2	8	19892	19899	0 %	75 %	0 %	25 %	410678662
72	NC_018879	ACTT	2	8	20141	20148	25 %	50 %	0 %	25 %	410678662
73	NC_018879	TAGA	2	8	20181	20188	50 %	25 %	25 %	0 %	410678662
74	NC_018879	AGAA	2	8	20221	20228	75 %	0 %	25 %	0 %	410678662
75	NC_018879	TTTA	2	8	20265	20272	25 %	75 %	0 %	0 %	410678662
76	NC_018879	CATC	2	8	20429	20436	25 %	25 %	0 %	50 %	410678663
77	NC_018879	ATTT	2	8	20550	20557	25 %	75 %	0 %	0 %	410678663
78	NC_018879	ATTT	2	8	20924	20931	25 %	75 %	0 %	0 %	410678663
79	NC_018879	TAAT	2	8	21006	21013	50 %	50 %	0 %	0 %	410678664
80	NC_018879	TTTA	2	8	21261	21268	25 %	75 %	0 %	0 %	410678665
81	NC_018879	CAAA	2	8	21703	21710	75 %	0 %	0 %	25 %	410678666
82	NC_018879	TGTT	2	8	21975	21982	0 %	75 %	25 %	0 %	410678667
83	NC_018879	AAAT	2	8	22643	22650	75 %	25 %	0 %	0 %	410678669
84	NC_018879	TCCA	2	8	22721	22728	25 %	25 %	0 %	50 %	410678669
85	NC_018879	TATC	2	8	23186	23193	25 %	50 %	0 %	25 %	410678670
86	NC_018879	TAAA	2	8	23421	23428	75 %	25 %	0 %	0 %	410678671
87	NC_018879	TTAT	2	8	24851	24858	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018879	TTAT	2	8	24885	24892	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018879	ATAA	2	8	24923	24930	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018879	AATA	2	8	25000	25007	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018879	AAAT	2	8	25607	25614	75 %	25 %	0 %	0 %	410678677
92	NC_018879	GTAA	2	8	25773	25780	50 %	25 %	25 %	0 %	410678678
93	NC_018879	TAGT	2	8	25801	25808	25 %	50 %	25 %	0 %	410678678
94	NC_018879	ACTA	2	8	26019	26026	50 %	25 %	0 %	25 %	410678678
95	NC_018879	AGTA	2	8	26031	26038	50 %	25 %	25 %	0 %	410678678
96	NC_018879	AAAC	2	8	26375	26382	75 %	0 %	0 %	25 %	410678679
97	NC_018879	ATTC	2	8	26478	26485	25 %	50 %	0 %	25 %	410678679
98	NC_018879	TCAT	2	8	27428	27435	25 %	50 %	0 %	25 %	410678680
99	NC_018879	ATAA	2	8	27469	27476	75 %	25 %	0 %	0 %	410678680
100	NC_018879	ATCT	2	8	27570	27577	25 %	50 %	0 %	25 %	410678680
101	NC_018879	CTTT	2	8	27952	27959	0 %	75 %	0 %	25 %	410678681
102	NC_018879	GGTT	2	8	28029	28036	0 %	50 %	50 %	0 %	410678681
103	NC_018879	CTCA	2	8	28280	28287	25 %	25 %	0 %	50 %	410678681
104	NC_018879	AAAG	2	8	28313	28320	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018879	TAAT	2	8	28642	28649	50 %	50 %	0 %	0 %	410678682
106	NC_018879	TAAC	2	8	28835	28842	50 %	25 %	0 %	25 %	410678683
107	NC_018879	CATC	2	8	28916	28923	25 %	25 %	0 %	50 %	410678683
108	NC_018879	GAAT	2	8	29662	29669	50 %	25 %	25 %	0 %	410678684
109	NC_018879	TAGG	2	8	30592	30599	25 %	25 %	50 %	0 %	410678685
110	NC_018879	CATC	2	8	30708	30715	25 %	25 %	0 %	50 %	410678685
111	NC_018879	TCCA	2	8	30851	30858	25 %	25 %	0 %	50 %	410678685
112	NC_018879	ATAA	2	8	31184	31191	75 %	25 %	0 %	0 %	410678685
113	NC_018879	TGCT	2	8	31364	31371	0 %	50 %	25 %	25 %	410678685
114	NC_018879	TCCT	2	8	31607	31614	0 %	50 %	0 %	50 %	410678685
115	NC_018879	ACAA	2	8	31649	31656	75 %	0 %	0 %	25 %	410678685
116	NC_018879	CTTT	2	8	31807	31814	0 %	75 %	0 %	25 %	410678685
117	NC_018879	GATA	2	8	32321	32328	50 %	25 %	25 %	0 %	410678686
118	NC_018879	ATTA	2	8	33704	33711	50 %	50 %	0 %	0 %	410678688
119	NC_018879	AGCA	2	8	33831	33838	50 %	0 %	25 %	25 %	410678688
120	NC_018879	CAAA	2	8	34052	34059	75 %	0 %	0 %	25 %	410678688
121	NC_018879	ATTT	2	8	34491	34498	25 %	75 %	0 %	0 %	410678689
122	NC_018879	ATTA	2	8	34891	34898	50 %	50 %	0 %	0 %	410678689
123	NC_018879	CCTT	2	8	35171	35178	0 %	50 %	0 %	50 %	410678689
124	NC_018879	ATTT	2	8	35280	35287	25 %	75 %	0 %	0 %	410678689
125	NC_018879	TTCT	2	8	35839	35846	0 %	75 %	0 %	25 %	410678689
126	NC_018879	TTTC	2	8	35951	35958	0 %	75 %	0 %	25 %	410678689
127	NC_018879	TTTA	2	8	36259	36266	25 %	75 %	0 %	0 %	410678689
128	NC_018879	AAAT	2	8	36296	36303	75 %	25 %	0 %	0 %	410678689
129	NC_018879	CATT	2	8	36321	36328	25 %	50 %	0 %	25 %	410678689
130	NC_018879	ATGT	2	8	36487	36494	25 %	50 %	25 %	0 %	410678689
131	NC_018879	AGTT	2	8	36583	36590	25 %	50 %	25 %	0 %	410678689
132	NC_018879	ATTT	2	8	36752	36759	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018879	TTTA	2	8	37012	37019	25 %	75 %	0 %	0 %	410678690
134	NC_018879	TTTC	2	8	37920	37927	0 %	75 %	0 %	25 %	410678690
135	NC_018879	GTAT	2	8	37996	38003	25 %	50 %	25 %	0 %	410678690
136	NC_018879	ATTT	2	8	38252	38259	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018879	CAGA	2	8	38751	38758	50 %	0 %	25 %	25 %	410678691
138	NC_018879	ATTA	2	8	38897	38904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018879	AATA	2	8	39475	39482	75 %	25 %	0 %	0 %	410678692
140	NC_018879	AATA	2	8	39630	39637	75 %	25 %	0 %	0 %	410678692
141	NC_018879	TATC	2	8	40179	40186	25 %	50 %	0 %	25 %	410678692
142	NC_018879	GCTT	2	8	40319	40326	0 %	50 %	25 %	25 %	410678692
143	NC_018879	CCAT	2	8	40424	40431	25 %	25 %	0 %	50 %	410678692
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.