MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_78p

Total Repeats: 1863

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_018879	AATT	2	8	62329	62336	50 %	50 %	0 %	0 %	410678712
1502	NC_018879	ATTTC	2	10	62373	62382	20 %	60 %	0 %	20 %	410678712
1503	NC_018879	TTC	2	6	62427	62432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678712
1504	NC_018879	AT	3	6	62462	62467	50 %	50 %	0 %	0 %	410678712
1505	NC_018879	TA	3	6	62488	62493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_018879	GAA	2	6	62499	62504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_018879	TAT	2	6	62522	62527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678713
1508	NC_018879	CTT	2	6	62538	62543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678713
1509	NC_018879	CCA	3	9	62678	62686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410678713
1510	NC_018879	TCT	2	6	62747	62752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678713
1511	NC_018879	CATCC	2	10	62764	62773	20 %	20 %	0 %	60 %	410678713
1512	NC_018879	ATC	2	6	62839	62844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678713
1513	NC_018879	TCT	2	6	62891	62896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678713
1514	NC_018879	TCA	2	6	62987	62992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678713
1515	NC_018879	T	6	6	63031	63036	0 %	100 %	0 %	0 %	410678713
1516	NC_018879	AAAG	2	8	63055	63062	75 %	0 %	25 %	0 %	410678713
1517	NC_018879	CATT	2	8	63198	63205	25 %	50 %	0 %	25 %	410678713
1518	NC_018879	CAT	2	6	63210	63215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678713
1519	NC_018879	TTC	2	6	63301	63306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678713
1520	NC_018879	CCA	2	6	63338	63343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410678713
1521	NC_018879	CTT	3	9	63360	63368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678713
1522	NC_018879	GCT	2	6	63380	63385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410678713
1523	NC_018879	CTT	2	6	63424	63429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678713
1524	NC_018879	TCT	2	6	63491	63496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678713
1525	NC_018879	CTT	2	6	63533	63538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678713
1526	NC_018879	TAA	2	6	63577	63582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678713
1527	NC_018879	GGC	2	6	63656	63661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410678713
1528	NC_018879	TTCA	2	8	63709	63716	25 %	50 %	0 %	25 %	410678713
1529	NC_018879	ACC	2	6	63754	63759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410678713
1530	NC_018879	TCC	2	6	63803	63808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_018879	TAGTT	2	10	63822	63831	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_018879	TAAT	2	8	63854	63861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_018879	A	7	7	63865	63871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_018879	ATT	2	6	63942	63947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_018879	GAA	2	6	63962	63967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_018879	TTC	2	6	63984	63989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_018879	CAT	2	6	64029	64034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678714
1538	NC_018879	TAG	2	6	64110	64115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678714
1539	NC_018879	GCT	2	6	64121	64126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410678714
1540	NC_018879	TAC	2	6	64183	64188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678714
1541	NC_018879	TAA	2	6	64221	64226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678714
1542	NC_018879	TTG	2	6	64227	64232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678714
1543	NC_018879	TAT	2	6	64300	64305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678714
1544	NC_018879	AAT	2	6	64322	64327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678714
1545	NC_018879	CT	3	6	64347	64352	0 %	50 %	0 %	50 %	410678714
1546	NC_018879	CTT	2	6	64369	64374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678714
1547	NC_018879	TTC	2	6	64381	64386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678714
1548	NC_018879	GGA	2	6	64462	64467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410678715
1549	NC_018879	TCT	2	6	64475	64480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678715
1550	NC_018879	TTC	2	6	64498	64503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678715
1551	NC_018879	CAA	2	6	64555	64560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678715
1552	NC_018879	T	8	8	64565	64572	0 %	100 %	0 %	0 %	410678715
1553	NC_018879	TA	3	6	64639	64644	50 %	50 %	0 %	0 %	410678715
1554	NC_018879	T	6	6	64736	64741	0 %	100 %	0 %	0 %	410678715
1555	NC_018879	AC	3	6	64753	64758	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1556	NC_018879	CTT	2	6	64762	64767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_018879	TA	3	6	64870	64875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_018879	GTA	2	6	64885	64890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_018879	CTTA	2	8	64906	64913	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1560	NC_018879	TAC	3	9	64920	64928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_018879	AAAT	2	8	64932	64939	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_018879	T	6	6	65104	65109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_018879	TTC	2	6	65165	65170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678716
1564	NC_018879	TA	3	6	65173	65178	50 %	50 %	0 %	0 %	410678716
1565	NC_018879	TTC	2	6	65282	65287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678716
1566	NC_018879	AAT	2	6	65301	65306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678716
1567	NC_018879	GA	3	6	65317	65322	50 %	0 %	50 %	0 %	410678716
1568	NC_018879	TGC	2	6	65387	65392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410678716
1569	NC_018879	TAA	2	6	65435	65440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678716
1570	NC_018879	ATA	2	6	65474	65479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678716
1571	NC_018879	ATATGG	2	12	65674	65685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678717
1572	NC_018879	AAT	2	6	65752	65757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678717
1573	NC_018879	TAA	2	6	65767	65772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678717
1574	NC_018879	TGA	2	6	65796	65801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678717
1575	NC_018879	AGT	2	6	65889	65894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678717
1576	NC_018879	T	8	8	65921	65928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_018879	CA	3	6	65938	65943	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1578	NC_018879	ATT	2	6	65983	65988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678718
1579	NC_018879	T	6	6	66000	66005	0 %	100 %	0 %	0 %	410678718
1580	NC_018879	GCGT	2	8	66029	66036	0 %	25 %	50 %	25 %	410678718
1581	NC_018879	CTT	2	6	66074	66079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678718
1582	NC_018879	ATA	2	6	66133	66138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678718
1583	NC_018879	CT	3	6	66147	66152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1584	NC_018879	GC	3	6	66261	66266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1585	NC_018879	GCC	2	6	66348	66353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1586	NC_018879	CAA	2	6	66434	66439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_018879	AAAC	2	8	66475	66482	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1588	NC_018879	CTA	2	6	66512	66517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_018879	TA	3	6	66552	66557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_018879	ATTT	2	8	66573	66580	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_018879	T	7	7	66578	66584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_018879	CTT	2	6	66758	66763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678719
1593	NC_018879	AT	3	6	66770	66775	50 %	50 %	0 %	0 %	410678719
1594	NC_018879	CTT	2	6	66793	66798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678719
1595	NC_018879	ATT	2	6	66815	66820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678719
1596	NC_018879	T	7	7	66819	66825	0 %	100 %	0 %	0 %	410678719
1597	NC_018879	T	6	6	66894	66899	0 %	100 %	0 %	0 %	410678719
1598	NC_018879	ATAA	2	8	66924	66931	75 %	25 %	0 %	0 %	410678719
1599	NC_018879	TGC	2	6	66950	66955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410678719
1600	NC_018879	AAT	2	6	66990	66995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678719
1601	NC_018879	TTC	2	6	67072	67077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678719
1602	NC_018879	TCAT	2	8	67109	67116	25 %	50 %	0 %	25 %	410678719
1603	NC_018879	AAT	2	6	67195	67200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678719
1604	NC_018879	ATAAA	2	10	67239	67248	80 %	20 %	0 %	0 %	410678719
1605	NC_018879	ATT	2	6	67255	67260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678719
1606	NC_018879	TTAT	2	8	67298	67305	25 %	75 %	0 %	0 %	410678719
1607	NC_018879	GAA	2	6	67361	67366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678719
1608	NC_018879	TAAAG	2	10	67452	67461	60 %	20 %	20 %	0 %	410678719
1609	NC_018879	TCT	2	6	67469	67474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678719
1610	NC_018879	CTT	2	6	67548	67553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678719
1611	NC_018879	TTC	2	6	67597	67602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678719
1612	NC_018879	GTG	2	6	67680	67685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410678719
1613	NC_018879	CTG	3	9	67722	67730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410678719
1614	NC_018879	TTC	2	6	67741	67746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678719
1615	NC_018879	T	7	7	67755	67761	0 %	100 %	0 %	0 %	410678719
1616	NC_018879	ATT	2	6	67819	67824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678719
1617	NC_018879	GT	3	6	67858	67863	0 %	50 %	50 %	0 %	410678719
1618	NC_018879	ACT	2	6	67897	67902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678719
1619	NC_018879	AGT	2	6	67942	67947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678719
1620	NC_018879	AAC	2	6	67954	67959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678719
1621	NC_018879	CT	3	6	67966	67971	0 %	50 %	0 %	50 %	410678719
1622	NC_018879	TC	3	6	67991	67996	0 %	50 %	0 %	50 %	410678719
1623	NC_018879	ATC	2	6	68002	68007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678719
1624	NC_018879	AAC	2	6	68142	68147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_018879	A	6	6	68148	68153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_018879	GTT	2	6	68156	68161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_018879	T	7	7	68168	68174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_018879	CAG	2	6	68176	68181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_018879	ACA	2	6	68185	68190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_018879	A	6	6	68237	68242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1632	NC_018879	ATG	3	9	68295	68303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.