MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 chromosome

Total Repeats: 2535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018877	CTATTA	2	12	1548	1559	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018877	TCTTTG	2	12	3355	3366	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	410672381
3	NC_018877	AACAAA	2	12	4289	4300	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	410672382
4	NC_018877	TGGCGG	2	12	4611	4622	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	410672382
5	NC_018877	AAGTTG	2	12	5054	5065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410672382
6	NC_018877	CAAGCG	2	12	7556	7567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410672383
7	NC_018877	TGAAGA	2	12	7783	7794	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410672383
8	NC_018877	ATTTTT	2	12	8978	8989	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018877	TTTCGT	2	12	10607	10618	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_018877	TGGTGT	2	12	16113	16124	0 %	50 %	50 %	0 %	410672385
11	NC_018877	GGCAAT	2	12	17117	17128	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410672386
12	NC_018877	ACTGGA	2	12	17449	17460	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410672386
13	NC_018877	AAAGAT	2	12	17727	17738	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410672386
14	NC_018877	CAGGAA	2	12	18675	18686	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410672387
15	NC_018877	ACAGGA	2	12	20657	20668	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410672389
16	NC_018877	CAAGAT	2	12	24245	24256	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410672394
17	NC_018877	ATTTTT	2	12	28722	28733	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018877	TTTCGT	2	12	30351	30362	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018877	CGTATA	2	12	35387	35398	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410672401
20	NC_018877	AGCTTT	2	12	36891	36902	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410672403
21	NC_018877	AAATGA	2	12	37478	37489	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410672404
22	NC_018877	TGTAGA	2	12	37583	37594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410672404
23	NC_018877	TTGAAA	2	12	39708	39719	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410672408
24	NC_018877	GCACGT	2	12	52040	52051	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	410672421
25	NC_018877	TTTTCC	2	12	54043	54054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018877	AAGCAA	2	12	54516	54527	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	410672425
27	NC_018877	ATTAAC	2	12	56432	56443	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410672425
28	NC_018877	TGCATA	2	12	56906	56917	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410672425
29	NC_018877	TTTAGG	2	12	60179	60190	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	410672428
30	NC_018877	TATTGA	2	12	66034	66045	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410672434
31	NC_018877	CAGGTA	2	12	69800	69811	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410672437
32	NC_018877	TGTCGG	2	12	69894	69905	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	410672437
33	NC_018877	AGCGTT	2	12	72151	72162	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410672439
34	NC_018877	AAAGTA	2	12	72800	72811	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410672439
35	NC_018877	CTGGTG	2	12	73658	73669	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	410672440
36	NC_018877	CTTTTT	2	12	74072	74083	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018877	GCAGAA	2	12	74728	74739	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410672441
38	NC_018877	AAGGTG	2	12	77272	77283	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	410672444
39	NC_018877	CGGTTA	2	12	79411	79422	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410672448
40	NC_018877	ATATCA	2	12	80151	80162	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410672449
41	NC_018877	TTATAT	2	12	81740	81751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018877	ATTTTT	2	12	82003	82014	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018877	ATTTTT	2	12	87713	87724	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018877	AGTCAA	2	12	92709	92720	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018877	GTGAAG	2	12	95349	95360	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	410672453
46	NC_018877	TTTAAT	2	12	100441	100452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410672456
47	NC_018877	GCAGAA	2	12	100628	100639	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410672456
48	NC_018877	CAGATG	2	12	102177	102188	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410672458
49	NC_018877	CAAGAT	2	12	103708	103719	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410672459
50	NC_018877	GTAGAA	2	12	109718	109729	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410672467
51	NC_018877	TCTGGT	2	12	110548	110559	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	410672468
52	NC_018877	GAAGCT	2	12	111147	111158	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410672469
53	NC_018877	CTGTAG	2	12	112491	112502	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410672471
54	NC_018877	ATGCGA	2	12	120581	120592	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410672474
55	NC_018877	GCAAGA	2	12	122660	122671	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410672478
56	NC_018877	AGTAGA	2	12	122765	122776	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410672478
57	NC_018877	AGCGTG	2	12	123538	123549	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410672478
58	NC_018877	AAGTTG	2	12	124312	124323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410672478
59	NC_018877	GCTAAA	2	12	124698	124709	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410672479
60	NC_018877	GAAACT	2	12	124905	124916	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410672479
61	NC_018877	CAAGCT	2	12	125499	125510	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410672479
62	NC_018877	AACTGA	2	12	126745	126756	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410672481
63	NC_018877	TAAAGG	2	12	126967	126978	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410672481
64	NC_018877	GAAATC	2	12	128171	128182	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410672483
65	NC_018877	ACAAGC	2	12	130520	130531	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410672488
66	NC_018877	TTGAAG	2	12	133699	133710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410672496
67	NC_018877	AAAGGT	2	12	133809	133820	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410672496
68	NC_018877	TAGTTG	2	12	134398	134409	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	410672498
69	NC_018877	CTGAAA	2	12	136939	136950	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410672502
70	NC_018877	TAAACA	2	12	138626	138637	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410672505
71	NC_018877	TTAGGT	2	12	140547	140558	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	410672508
72	NC_018877	ATTTTT	2	12	142899	142910	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	410672512
73	NC_018877	ATATCC	2	12	143966	143977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410672513
74	NC_018877	TGCAGT	2	12	147003	147014	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410672518
75	NC_018877	ATTTTT	2	12	150894	150905	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018877	GTGATT	2	12	157868	157879	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018877	TTAGAT	2	12	158709	158720	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410672524
78	NC_018877	AGCAAA	2	12	160253	160264	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	410672526
79	NC_018877	AAGAAA	2	12	161356	161367	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	410672526
80	NC_018877	AAGATA	2	12	161398	161409	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410672526
81	NC_018877	GATGGC	2	12	162196	162207	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410672527
82	NC_018877	CGCATC	2	12	163563	163574	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	410672528
83	NC_018877	ATCGTA	2	12	163943	163954	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410672528
84	NC_018877	AGATAA	2	12	166879	166890	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410672529
85	NC_018877	TGAAAC	2	12	169726	169737	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_018877	GTATGT	2	12	174028	174039	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018877	CAAAAT	2	12	176803	176814	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410672538
88	NC_018877	ATTTTG	2	12	183258	183269	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	410672545
89	NC_018877	AAGTAA	2	12	185997	186008	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410672548
90	NC_018877	CAAATT	2	12	186499	186510	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410672548
91	NC_018877	GAAAAA	2	12	187556	187567	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	410672549
92	NC_018877	GTGGTT	2	12	189643	189654	0 %	50 %	50 %	0 %	410672552
93	NC_018877	AAGTTA	2	12	193354	193365	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410672554
94	NC_018877	TCTGGA	2	12	193366	193377	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410672554
95	NC_018877	TTCTTT	2	12	198333	198344	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	410672559
96	NC_018877	ATTTAT	2	12	201516	201527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410672564
97	NC_018877	TATGAA	2	12	206455	206466	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410672572
98	NC_018877	AAAATA	2	12	206676	206687	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018877	AAGGGG	2	12	206759	206770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018877	AAAAGT	2	12	208177	208188	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018877	CTAATA	2	12	209595	209606	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410672575
102	NC_018877	AGAGGT	2	12	210140	210151	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018877	TATATT	2	12	210193	210204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410672576
104	NC_018877	TTCATA	2	12	211746	211757	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410672578
105	NC_018877	GGAACA	2	12	212765	212776	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410672579
106	NC_018877	GAAAGA	2	12	219202	219213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410672584
107	NC_018877	TAAATG	2	12	219879	219890	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410672584
108	NC_018877	GAGAAT	2	12	220263	220274	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410672585
109	NC_018877	AAAAGA	2	12	222378	222389	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018877	TTATTT	2	12	227183	227194	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	410672593
111	NC_018877	CCATAT	2	12	228889	228900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410672594
112	NC_018877	AAGGTC	2	12	233989	234000	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410672597
113	NC_018877	TAAAGA	2	12	234632	234643	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410672598
114	NC_018877	AAAACA	2	12	236665	236676	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	410672601
115	NC_018877	GTAAGT	2	12	237070	237081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410672601
116	NC_018877	ATTTTT	2	12	243881	243892	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018877	AGCTGA	2	12	250144	250155	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410672608
118	NC_018877	AGCGGT	2	12	250694	250705	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410672610
119	NC_018877	GTAATC	2	12	252487	252498	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410672611
120	NC_018877	GGATAT	2	12	254449	254460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410672612
121	NC_018877	GGCATG	2	12	258176	258187	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410672616
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124	NC_018877	ATTTTT	2	12	274232	274243	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018877	TAGAAA	2	12	281511	281522	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410672627
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134	NC_018877	ATTTTT	2	12	298333	298344	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018877	ATTTTT	2	12	305485	305496	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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231	NC_018877	AATGAA	2	12	500877	500888	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
232	NC_018877	AATGGC	2	12	505164	505175	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410672816
233	NC_018877	TGATCA	2	12	506342	506353	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410672820
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236	NC_018877	AGATGA	2	12	510139	510150	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410672825
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238	NC_018877	CGAAAG	2	12	520487	520498	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410672830
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467	NC_018877	ACAGAG	4	24	984923	984946	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410673271
468	NC_018877	ACATAT	2	12	985247	985258	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410673271
469	NC_018877	ACATTA	2	12	985325	985336	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410673271
470	NC_018877	TTTCTT	2	12	986039	986050	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	410673272
471	NC_018877	TTTTTC	2	12	986056	986067	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	410673272
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