MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 chromosome

Total Repeats: 132174

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018877	GTA	2	6	22996	23001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410672392
502	NC_018877	T	7	7	23019	23025	0 %	100 %	0 %	0 %	410672392
503	NC_018877	TAAA	2	8	23081	23088	75 %	25 %	0 %	0 %	410672392
504	NC_018877	AAATT	2	10	23182	23191	60 %	40 %	0 %	0 %	410672392
505	NC_018877	CTA	2	6	23212	23217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410672392
506	NC_018877	TCT	2	6	23253	23258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410672392
507	NC_018877	TTGT	2	8	23261	23268	0 %	75 %	25 %	0 %	410672392
508	NC_018877	AAAG	2	8	23278	23285	75 %	0 %	25 %	0 %	410672392
509	NC_018877	TCG	2	6	23310	23315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410672392
510	NC_018877	TCA	2	6	23349	23354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410672392
511	NC_018877	TCC	2	6	23471	23476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_018877	ACT	2	6	23499	23504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_018877	ATT	2	6	23521	23526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_018877	AGCG	2	8	23542	23549	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
515	NC_018877	AT	3	6	23581	23586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_018877	ATTA	2	8	23589	23596	50 %	50 %	0 %	0 %	410672393
517	NC_018877	ATTTT	2	10	23598	23607	20 %	80 %	0 %	0 %	410672393
518	NC_018877	ATT	2	6	23645	23650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410672393
519	NC_018877	TAT	2	6	23664	23669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410672393
520	NC_018877	GTT	2	6	23677	23682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410672393
521	NC_018877	TACA	2	8	23704	23711	50 %	25 %	0 %	25 %	410672393
522	NC_018877	CAT	2	6	23733	23738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410672393
523	NC_018877	AT	3	6	23757	23762	50 %	50 %	0 %	0 %	410672393
524	NC_018877	AAT	2	6	23844	23849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410672393
525	NC_018877	TAA	2	6	23856	23861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410672393
526	NC_018877	ATC	2	6	23869	23874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410672393
527	NC_018877	TATT	2	8	23912	23919	25 %	75 %	0 %	0 %	410672393
528	NC_018877	TAA	2	6	23931	23936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410672393
529	NC_018877	T	7	7	24009	24015	0 %	100 %	0 %	0 %	410672393
530	NC_018877	CT	3	6	24140	24145	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
531	NC_018877	T	6	6	24145	24150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_018877	GTA	2	6	24190	24195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_018877	CAAGAT	2	12	24245	24256	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410672394
534	NC_018877	ATTT	2	8	24257	24264	25 %	75 %	0 %	0 %	410672394
535	NC_018877	AGA	2	6	24280	24285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410672394
536	NC_018877	A	6	6	24434	24439	100 %	0 %	0 %	0 %	410672394
537	NC_018877	AGA	2	6	24457	24462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410672394
538	NC_018877	TGTA	2	8	24471	24478	25 %	50 %	25 %	0 %	410672394
539	NC_018877	TG	3	6	24498	24503	0 %	50 %	50 %	0 %	410672394
540	NC_018877	ATC	2	6	24612	24617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410672394
541	NC_018877	AGT	2	6	24625	24630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410672394
542	NC_018877	GAA	2	6	24647	24652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410672394
543	NC_018877	GTT	2	6	24661	24666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410672394
544	NC_018877	T	6	6	24674	24679	0 %	100 %	0 %	0 %	410672394
545	NC_018877	AG	3	6	24680	24685	50 %	0 %	50 %	0 %	410672394
546	NC_018877	A	7	7	24692	24698	100 %	0 %	0 %	0 %	410672394
547	NC_018877	A	7	7	24709	24715	100 %	0 %	0 %	0 %	410672394
548	NC_018877	TAAG	2	8	24915	24922	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
549	NC_018877	GGAA	2	8	24977	24984	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
550	NC_018877	GCA	2	6	24985	24990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_018877	TCT	2	6	25000	25005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_018877	TA	3	6	25088	25093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_018877	T	6	6	25127	25132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_018877	TAA	2	6	25175	25180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_018877	ATA	2	6	25186	25191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_018877	GAGG	2	8	25198	25205	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
557	NC_018877	CTT	2	6	25309	25314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410672395
558	NC_018877	TTAT	2	8	25335	25342	25 %	75 %	0 %	0 %	410672395
559	NC_018877	AATG	2	8	25435	25442	50 %	25 %	25 %	0 %	410672395
560	NC_018877	CTT	2	6	25445	25450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410672395
561	NC_018877	ATT	2	6	25585	25590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410672395
562	NC_018877	AGA	2	6	25644	25649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410672395
563	NC_018877	GCC	2	6	25650	25655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410672395
564	NC_018877	ACA	2	6	25681	25686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410672395
565	NC_018877	ATT	2	6	25711	25716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410672395
566	NC_018877	TTG	2	6	25763	25768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410672395
567	NC_018877	TTG	2	6	25829	25834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410672395
568	NC_018877	TGC	2	6	25839	25844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410672395
569	NC_018877	GGT	2	6	25849	25854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410672395
570	NC_018877	TGA	2	6	25899	25904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410672395
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572	NC_018877	TAG	2	6	25970	25975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410672395
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575	NC_018877	GGA	2	6	26061	26066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410672395
576	NC_018877	TAT	2	6	26077	26082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410672395
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579	NC_018877	ATT	2	6	26200	26205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410672395
580	NC_018877	ACA	2	6	26223	26228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410672395
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584	NC_018877	GCAA	2	8	26328	26335	50 %	0 %	25 %	25 %	410672395
585	NC_018877	GCA	2	6	26349	26354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410672395
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587	NC_018877	AG	3	6	26419	26424	50 %	0 %	50 %	0 %	410672395
588	NC_018877	AAGCG	2	10	26501	26510	40 %	0 %	40 %	20 %	410672395
589	NC_018877	GTT	2	6	26547	26552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410672395
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593	NC_018877	AGA	2	6	26853	26858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410672395
594	NC_018877	TAG	2	6	26870	26875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410672395
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596	NC_018877	AGG	2	6	26913	26918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
597	NC_018877	AATT	2	8	26919	26926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_018877	ATG	2	6	26927	26932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410672396
599	NC_018877	ATG	2	6	26960	26965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410672396
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601	NC_018877	A	6	6	27021	27026	100 %	0 %	0 %	0 %	410672396
602	NC_018877	GGC	2	6	27044	27049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410672396
603	NC_018877	TGAAG	2	10	27091	27100	40 %	20 %	40 %	0 %	410672396
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608	NC_018877	AGG	2	6	27255	27260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410672396
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610	NC_018877	ATCA	2	8	27503	27510	50 %	25 %	0 %	25 %	410672397
611	NC_018877	GTT	2	6	27511	27516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410672397
612	NC_018877	A	6	6	27554	27559	100 %	0 %	0 %	0 %	410672397
613	NC_018877	GTG	2	6	27593	27598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410672397
614	NC_018877	ATG	2	6	27665	27670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410672397
615	NC_018877	AAG	2	6	27680	27685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410672397
616	NC_018877	CAA	2	6	27695	27700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410672397
617	NC_018877	TGG	2	6	27798	27803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410672397
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619	NC_018877	ATG	2	6	27919	27924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410672398
620	NC_018877	GAA	2	6	27953	27958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410672398
621	NC_018877	AGA	2	6	27973	27978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410672398
622	NC_018877	TCT	2	6	28051	28056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410672398
623	NC_018877	AAG	2	6	28063	28068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410672398
624	NC_018877	CGT	2	6	28074	28079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410672398
625	NC_018877	TATTT	2	10	28132	28141	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_018877	GTT	2	6	28157	28162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_018877	TTA	2	6	28163	28168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_018877	T	6	6	28207	28212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_018877	TTGTC	2	10	28214	28223	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
630	NC_018877	TCAT	2	8	28245	28252	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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632	NC_018877	A	6	6	28260	28265	100 %	0 %	0 %	0 %	410672399
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