MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bordetella bronchiseptica MO149

Total Repeats: 5328

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018829	GGCAA	2	10	1501	1510	40 %	0 %	40 %	20 %	410417817
2	NC_018829	CTGGC	2	10	2703	2712	0 %	20 %	40 %	40 %	410417819
3	NC_018829	CACCC	2	10	3440	3449	20 %	0 %	0 %	80 %	410417820
4	NC_018829	GGGAG	2	10	3457	3466	20 %	0 %	80 %	0 %	410417820
5	NC_018829	TTCGC	2	10	5701	5710	0 %	40 %	20 %	40 %	410417822
6	NC_018829	GGCCG	2	10	5719	5728	0 %	0 %	60 %	40 %	410417822
7	NC_018829	GCTGG	2	10	8561	8570	0 %	20 %	60 %	20 %	410417824
8	NC_018829	TCGCC	2	10	9960	9969	0 %	20 %	20 %	60 %	410417827
9	NC_018829	TACCG	2	10	10103	10112	20 %	20 %	20 %	40 %	410417827
10	NC_018829	GACCA	2	10	13271	13280	40 %	0 %	20 %	40 %	410417830
11	NC_018829	TGCCT	2	10	13794	13803	0 %	40 %	20 %	40 %	410417830
12	NC_018829	CTGGG	2	10	15113	15122	0 %	20 %	60 %	20 %	410417830
13	NC_018829	TCGCC	2	10	15890	15899	0 %	20 %	20 %	60 %	410417831
14	NC_018829	AAGGC	2	10	17147	17156	40 %	0 %	40 %	20 %	410417831
15	NC_018829	CGGCC	2	10	19452	19461	0 %	0 %	40 %	60 %	410417831
16	NC_018829	CTGGC	2	10	19898	19907	0 %	20 %	40 %	40 %	410417831
17	NC_018829	GCGCC	2	10	20864	20873	0 %	0 %	40 %	60 %	410417833
18	NC_018829	CGCCA	2	10	21621	21630	20 %	0 %	20 %	60 %	410417833
19	NC_018829	CGGCC	2	10	22149	22158	0 %	0 %	40 %	60 %	410417834
20	NC_018829	GGCGC	2	10	23007	23016	0 %	0 %	60 %	40 %	410417834
21	NC_018829	GCGTC	2	10	23094	23103	0 %	20 %	40 %	40 %	410417834
22	NC_018829	GCAGC	2	10	23490	23499	20 %	0 %	40 %	40 %	410417834
23	NC_018829	CGGCG	2	10	24830	24839	0 %	0 %	60 %	40 %	410417835
24	NC_018829	GGGCT	2	10	25445	25454	0 %	20 %	60 %	20 %	410417835
25	NC_018829	GGCGC	2	10	26984	26993	0 %	0 %	60 %	40 %	410417837
26	NC_018829	AGCGC	2	10	29945	29954	20 %	0 %	40 %	40 %	410417840
27	NC_018829	CAAGT	2	10	33269	33278	40 %	20 %	20 %	20 %	410417843
28	NC_018829	CGCTG	2	10	34825	34834	0 %	20 %	40 %	40 %	410417846
29	NC_018829	CGCGC	2	10	35050	35059	0 %	0 %	40 %	60 %	410417846
30	NC_018829	CCGCG	2	10	36872	36881	0 %	0 %	40 %	60 %	410417849
31	NC_018829	GCGTG	2	10	37845	37854	0 %	20 %	60 %	20 %	410417852
32	NC_018829	TATCG	2	10	38768	38777	20 %	40 %	20 %	20 %	410417853
33	NC_018829	TTCTC	2	10	40717	40726	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_018829	AAACG	2	10	41029	41038	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_018829	GTTCC	2	10	41977	41986	0 %	40 %	20 %	40 %	410417856
36	NC_018829	GGCGG	2	10	48666	48675	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
37	NC_018829	CCGGC	2	10	50407	50416	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
38	NC_018829	AGGTC	2	10	50539	50548	20 %	20 %	40 %	20 %	410417873
39	NC_018829	GACGT	2	10	50571	50580	20 %	20 %	40 %	20 %	410417873
40	NC_018829	GCCGC	2	10	51407	51416	0 %	0 %	40 %	60 %	410417875
41	NC_018829	GCCGC	2	10	51904	51913	0 %	0 %	40 %	60 %	410417875
42	NC_018829	CTGGC	2	10	52205	52214	0 %	20 %	40 %	40 %	410417875
43	NC_018829	GCCGC	2	10	52423	52432	0 %	0 %	40 %	60 %	410417875
44	NC_018829	GCTGG	2	10	52668	52677	0 %	20 %	60 %	20 %	410417875
45	NC_018829	GCCGA	2	10	54737	54746	20 %	0 %	40 %	40 %	410417877
46	NC_018829	GACCA	2	10	57962	57971	40 %	0 %	20 %	40 %	410417880
47	NC_018829	CTGGC	2	10	59375	59384	0 %	20 %	40 %	40 %	410417881
48	NC_018829	GCGCG	2	10	61484	61493	0 %	0 %	60 %	40 %	410417882
49	NC_018829	AGCGC	2	10	61712	61721	20 %	0 %	40 %	40 %	410417882
50	NC_018829	GCCGG	2	10	62420	62429	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
51	NC_018829	CCCGG	2	10	62441	62450	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
52	NC_018829	CCACG	2	10	62932	62941	20 %	0 %	20 %	60 %	410417884
53	NC_018829	GCCAG	2	10	64756	64765	20 %	0 %	40 %	40 %	410417884
54	NC_018829	CGACG	2	10	65747	65756	20 %	0 %	40 %	40 %	410417886
55	NC_018829	AGGCC	2	10	66662	66671	20 %	0 %	40 %	40 %	410417886
56	NC_018829	GGACG	2	10	66736	66745	20 %	0 %	60 %	20 %	410417887
57	NC_018829	GCGCC	3	15	67466	67480	0 %	0 %	40 %	60 %	410417887
58	NC_018829	GCACG	2	10	69324	69333	20 %	0 %	40 %	40 %	410417889
59	NC_018829	TGCGC	2	10	70235	70244	0 %	20 %	40 %	40 %	410417889
60	NC_018829	GCGCC	2	10	71824	71833	0 %	0 %	40 %	60 %	410417890
61	NC_018829	GGCCT	2	10	72002	72011	0 %	20 %	40 %	40 %	410417890
62	NC_018829	CGCTG	2	10	72960	72969	0 %	20 %	40 %	40 %	410417890
63	NC_018829	GGCAT	2	10	73200	73209	20 %	20 %	40 %	20 %	410417891
64	NC_018829	GGCAT	2	10	76190	76199	20 %	20 %	40 %	20 %	410417893
65	NC_018829	CCGGC	2	10	76461	76470	0 %	0 %	40 %	60 %	410417893
66	NC_018829	GGGCC	2	10	76656	76665	0 %	0 %	60 %	40 %	410417893
67	NC_018829	GCGCG	2	10	77438	77447	0 %	0 %	60 %	40 %	410417894
68	NC_018829	CGGGC	2	10	80388	80397	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
69	NC_018829	GCGCG	2	10	80412	80421	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
70	NC_018829	TGACC	2	10	81689	81698	20 %	20 %	20 %	40 %	410417898
71	NC_018829	AATGA	2	10	82121	82130	60 %	20 %	20 %	0 %	410417899
72	NC_018829	CCAGG	2	10	83400	83409	20 %	0 %	40 %	40 %	410417900
73	NC_018829	ACCGC	2	10	83661	83670	20 %	0 %	20 %	60 %	410417900
74	NC_018829	GCGTG	2	10	83712	83721	0 %	20 %	60 %	20 %	410417900
75	NC_018829	CTGGT	2	10	85782	85791	0 %	40 %	40 %	20 %	410417902
76	NC_018829	CTGGG	2	10	86121	86130	0 %	20 %	60 %	20 %	410417902
77	NC_018829	CCGCG	2	10	87927	87936	0 %	0 %	40 %	60 %	410417904
78	NC_018829	GCGCG	2	10	89483	89492	0 %	0 %	60 %	40 %	410417906
79	NC_018829	GGCGT	2	10	89514	89523	0 %	20 %	60 %	20 %	410417906
80	NC_018829	GCGCG	2	10	90948	90957	0 %	0 %	60 %	40 %	410417907
81	NC_018829	GCGCG	2	10	93465	93474	0 %	0 %	60 %	40 %	410417908
82	NC_018829	CGGCA	2	10	95168	95177	20 %	0 %	40 %	40 %	410417910
83	NC_018829	CAGGT	2	10	95244	95253	20 %	20 %	40 %	20 %	410417910
84	NC_018829	AGCGC	2	10	95257	95266	20 %	0 %	40 %	40 %	410417910
85	NC_018829	GCCAG	2	10	96739	96748	20 %	0 %	40 %	40 %	410417912
86	NC_018829	CCCAG	2	10	96784	96793	20 %	0 %	20 %	60 %	410417912
87	NC_018829	GCGTA	2	10	98189	98198	20 %	20 %	40 %	20 %	410417913
88	NC_018829	GCCGC	2	10	100149	100158	0 %	0 %	40 %	60 %	410417915
89	NC_018829	CGCAC	2	10	100721	100730	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
90	NC_018829	TTCGG	2	10	100833	100842	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_018829	GACGG	2	10	102252	102261	20 %	0 %	60 %	20 %	410417916
92	NC_018829	CGCGC	2	10	102897	102906	0 %	0 %	40 %	60 %	410417916
93	NC_018829	TGCGG	2	10	103295	103304	0 %	20 %	60 %	20 %	410417916
94	NC_018829	GACCG	2	10	104007	104016	20 %	0 %	40 %	40 %	410417916
95	NC_018829	GGACC	2	10	104540	104549	20 %	0 %	40 %	40 %	410417916
96	NC_018829	TGCGG	2	10	104903	104912	0 %	20 %	60 %	20 %	410417916
97	NC_018829	GACCG	2	10	105615	105624	20 %	0 %	40 %	40 %	410417916
98	NC_018829	CTGGG	2	10	107239	107248	0 %	20 %	60 %	20 %	410417917
99	NC_018829	CGATG	2	10	108729	108738	20 %	20 %	40 %	20 %	410417919
100	NC_018829	TGGCG	2	10	109631	109640	0 %	20 %	60 %	20 %	410417919
101	NC_018829	GCCGC	2	10	110789	110798	0 %	0 %	40 %	60 %	410417920
102	NC_018829	GCATC	2	10	110819	110828	20 %	20 %	20 %	40 %	410417920
103	NC_018829	GACCA	2	10	111559	111568	40 %	0 %	20 %	40 %	410417921
104	NC_018829	CGTCC	2	10	111857	111866	0 %	20 %	20 %	60 %	410417921
105	NC_018829	GCTGG	2	10	112332	112341	0 %	20 %	60 %	20 %	410417921
106	NC_018829	ACCCG	2	10	113414	113423	20 %	0 %	20 %	60 %	410417922
107	NC_018829	CGCAT	2	10	113801	113810	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_018829	CAGGG	2	10	117008	117017	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
109	NC_018829	GGCCT	2	10	119232	119241	0 %	20 %	40 %	40 %	410417927
110	NC_018829	CGCGC	2	10	120645	120654	0 %	0 %	40 %	60 %	410417928
111	NC_018829	CGCGC	2	10	121403	121412	0 %	0 %	40 %	60 %	410417929
112	NC_018829	GCGTG	2	10	121742	121751	0 %	20 %	60 %	20 %	410417929
113	NC_018829	CGTTG	2	10	122492	122501	0 %	40 %	40 %	20 %	410417930
114	NC_018829	GCCGT	2	10	123321	123330	0 %	20 %	40 %	40 %	410417931
115	NC_018829	GCCGC	2	10	123966	123975	0 %	0 %	40 %	60 %	410417931
116	NC_018829	GTCGA	2	10	124356	124365	20 %	20 %	40 %	20 %	410417931
117	NC_018829	GCCCC	2	10	125897	125906	0 %	0 %	20 %	80 %	410417933
118	NC_018829	CTCGG	2	10	125964	125973	0 %	20 %	40 %	40 %	410417933
119	NC_018829	ACAGG	2	10	126181	126190	40 %	0 %	40 %	20 %	410417933
120	NC_018829	ACTCC	2	10	127138	127147	20 %	20 %	0 %	60 %	410417933
121	NC_018829	ATGCC	2	10	127866	127875	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_018829	CAGGC	2	10	129798	129807	20 %	0 %	40 %	40 %	410417934
123	NC_018829	GTGTT	2	10	130710	130719	0 %	60 %	40 %	0 %	410417935
124	NC_018829	AGCAG	2	10	136936	136945	40 %	0 %	40 %	20 %	410417939
125	NC_018829	AATCC	2	10	141082	141091	40 %	20 %	0 %	40 %	410417943
126	NC_018829	GCCGC	2	10	145420	145429	0 %	0 %	40 %	60 %	410417946
127	NC_018829	CCCGG	2	10	146819	146828	0 %	0 %	40 %	60 %	410417947
128	NC_018829	GACGG	2	10	148744	148753	20 %	0 %	60 %	20 %	410417948
129	NC_018829	GGACG	2	10	149354	149363	20 %	0 %	60 %	20 %	410417949
130	NC_018829	GCGCG	2	10	152165	152174	0 %	0 %	60 %	40 %	410417951
131	NC_018829	CGATG	2	10	153303	153312	20 %	20 %	40 %	20 %	410417953
132	NC_018829	GGGCA	2	10	154437	154446	20 %	0 %	60 %	20 %	410417953
133	NC_018829	AGGGC	2	10	155242	155251	20 %	0 %	60 %	20 %	410417954
134	NC_018829	CTTCG	2	10	157655	157664	0 %	40 %	20 %	40 %	410417956
135	NC_018829	CAGCG	2	10	158958	158967	20 %	0 %	40 %	40 %	410417958
136	NC_018829	GGCCG	2	10	160278	160287	0 %	0 %	60 %	40 %	410417959
137	NC_018829	CGGCG	2	10	161079	161088	0 %	0 %	60 %	40 %	410417960
138	NC_018829	GGCCT	2	10	161653	161662	0 %	20 %	40 %	40 %	410417960
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264	NC_018829	CTACT	2	10	263860	263869	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
265	NC_018829	ACGGC	2	10	264074	264083	20 %	0 %	40 %	40 %	410418067
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396	NC_018829	GATCA	2	10	385348	385357	40 %	20 %	20 %	20 %	410418177
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