MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica MO149

Total Repeats: 148431

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23122	NC_018829	GCTG	2	8	824224	824231	0 %	25 %	50 %	25 %	410418569
23123	NC_018829	GCGCC	2	10	824248	824257	0 %	0 %	40 %	60 %	410418569
23124	NC_018829	TGC	2	6	824268	824273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418569
23125	NC_018829	CCAT	2	8	824328	824335	25 %	25 %	0 %	50 %	410418569
23126	NC_018829	AGC	2	6	824340	824345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418569
23127	NC_018829	GGCC	2	8	824362	824369	0 %	0 %	50 %	50 %	410418569
23128	NC_018829	CTG	2	6	824401	824406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418569
23129	NC_018829	GCT	2	6	824416	824421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418569
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23131	NC_018829	GGCG	2	8	824440	824447	0 %	0 %	75 %	25 %	410418569
23132	NC_018829	GCGG	2	8	824455	824462	0 %	0 %	75 %	25 %	410418569
23133	NC_018829	TGC	2	6	824466	824471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418569
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23135	NC_018829	GCG	2	6	824489	824494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418569
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23141	NC_018829	GC	3	6	824738	824743	0 %	0 %	50 %	50 %	410418569
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23143	NC_018829	CGGC	2	8	824754	824761	0 %	0 %	50 %	50 %	410418569
23144	NC_018829	GGGCC	2	10	824782	824791	0 %	0 %	60 %	40 %	410418569
23145	NC_018829	GGC	2	6	824799	824804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418569
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23147	NC_018829	GCT	2	6	824872	824877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418569
23148	NC_018829	GC	3	6	824884	824889	0 %	0 %	50 %	50 %	410418569
23149	NC_018829	CGA	2	6	824919	824924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418570
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23151	NC_018829	GCT	2	6	824955	824960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418570
23152	NC_018829	GCG	2	6	825010	825015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418570
23153	NC_018829	ACGC	2	8	825022	825029	25 %	0 %	25 %	50 %	410418570
23154	NC_018829	GC	3	6	825036	825041	0 %	0 %	50 %	50 %	410418570
23155	NC_018829	TGC	2	6	825047	825052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418570
23156	NC_018829	GCTG	2	8	825062	825069	0 %	25 %	50 %	25 %	410418570
23157	NC_018829	TCG	2	6	825091	825096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418570
23158	NC_018829	GC	3	6	825150	825155	0 %	0 %	50 %	50 %	410418570
23159	NC_018829	CGC	2	6	825166	825171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418570
23160	NC_018829	CAC	2	6	825295	825300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410418570
23161	NC_018829	GTGC	2	8	825336	825343	0 %	25 %	50 %	25 %	410418570
23162	NC_018829	CG	3	6	825350	825355	0 %	0 %	50 %	50 %	410418570
23163	NC_018829	CG	3	6	825431	825436	0 %	0 %	50 %	50 %	410418571
23164	NC_018829	ACT	2	6	825445	825450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410418571
23165	NC_018829	CG	3	6	825494	825499	0 %	0 %	50 %	50 %	410418571
23166	NC_018829	GGCGG	2	10	825515	825524	0 %	0 %	80 %	20 %	410418571
23167	NC_018829	CG	3	6	825596	825601	0 %	0 %	50 %	50 %	410418571
23168	NC_018829	GCT	2	6	825647	825652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418571
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23171	NC_018829	CG	3	6	825757	825762	0 %	0 %	50 %	50 %	410418571
23172	NC_018829	TGC	2	6	825769	825774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418571
23173	NC_018829	GCG	2	6	825775	825780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418571
23174	NC_018829	GC	3	6	825874	825879	0 %	0 %	50 %	50 %	410418571
23175	NC_018829	GCCTGG	2	12	825901	825912	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	410418571
23176	NC_018829	GC	3	6	825937	825942	0 %	0 %	50 %	50 %	410418571
23177	NC_018829	GCG	3	9	825964	825972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418571
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23179	NC_018829	AGCG	2	8	826092	826099	25 %	0 %	50 %	25 %	410418571
23180	NC_018829	GCCG	2	8	826124	826131	0 %	0 %	50 %	50 %	410418571
23181	NC_018829	CGA	2	6	826157	826162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418571
23182	NC_018829	GCT	2	6	826169	826174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418571
23183	NC_018829	GCT	2	6	826208	826213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418571
23184	NC_018829	TTCGCG	2	12	826224	826235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418571
23185	NC_018829	CGC	2	6	826236	826241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418571
23186	NC_018829	TTC	2	6	826248	826253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410418571
23187	NC_018829	CGC	2	6	826285	826290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418571
23188	NC_018829	GC	3	6	826289	826294	0 %	0 %	50 %	50 %	410418571
23189	NC_018829	GGC	2	6	826295	826300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418571
23190	NC_018829	CGG	2	6	826303	826308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418571
23191	NC_018829	CCGGC	2	10	826309	826318	0 %	0 %	40 %	60 %	410418571
23192	NC_018829	GCT	3	9	826343	826351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418571
23193	NC_018829	GCC	2	6	826356	826361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418571
23194	NC_018829	GC	3	6	826411	826416	0 %	0 %	50 %	50 %	410418571
23195	NC_018829	CCGCG	2	10	826434	826443	0 %	0 %	40 %	60 %	410418571
23196	NC_018829	CGC	2	6	826462	826467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418571
23197	NC_018829	CCA	2	6	826469	826474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410418571
23198	NC_018829	GTG	2	6	826485	826490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410418571
23199	NC_018829	TCCG	2	8	826579	826586	0 %	25 %	25 %	50 %	410418571
23200	NC_018829	CGA	2	6	826613	826618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418571
23201	NC_018829	CTA	2	6	826628	826633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410418571
23202	NC_018829	GCG	2	6	826640	826645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418571
23203	NC_018829	GC	4	8	826669	826676	0 %	0 %	50 %	50 %	410418571
23204	NC_018829	AGG	2	6	826738	826743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410418571
23205	NC_018829	GCT	3	9	826808	826816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418571
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23207	NC_018829	TGC	2	6	826879	826884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418571
23208	NC_018829	CGGC	2	8	826896	826903	0 %	0 %	50 %	50 %	410418571
23209	NC_018829	GCACG	2	10	826919	826928	20 %	0 %	40 %	40 %	410418571
23210	NC_018829	GACC	2	8	826973	826980	25 %	0 %	25 %	50 %	410418571
23211	NC_018829	CG	3	6	826990	826995	0 %	0 %	50 %	50 %	410418571
23212	NC_018829	GC	3	6	826996	827001	0 %	0 %	50 %	50 %	410418571
23213	NC_018829	GCT	2	6	827015	827020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418571
23214	NC_018829	GC	3	6	827052	827057	0 %	0 %	50 %	50 %	410418571
23215	NC_018829	CAC	2	6	827100	827105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410418571
23216	NC_018829	TGCCCG	2	12	827110	827121	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	410418571
23217	NC_018829	CGA	2	6	827165	827170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418571
23218	NC_018829	TTC	2	6	827223	827228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410418571
23219	NC_018829	GC	3	6	827229	827234	0 %	0 %	50 %	50 %	410418571
23220	NC_018829	ATG	2	6	827250	827255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410418571
23221	NC_018829	CGC	2	6	827275	827280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418571
23222	NC_018829	GCG	2	6	827284	827289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418571
23223	NC_018829	GGC	2	6	827302	827307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418571
23224	NC_018829	GCC	3	9	827317	827325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418571
23225	NC_018829	GGC	2	6	827336	827341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418571
23226	NC_018829	CCG	2	6	827349	827354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23227	NC_018829	CGC	2	6	827440	827445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418572
23228	NC_018829	GAC	2	6	827449	827454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418572
23229	NC_018829	GTG	2	6	827469	827474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410418572
23230	NC_018829	GCC	2	6	827480	827485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418572
23231	NC_018829	GCC	2	6	827503	827508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418572
23232	NC_018829	CTGC	2	8	827511	827518	0 %	25 %	25 %	50 %	410418572
23233	NC_018829	GGT	2	6	827586	827591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410418572
23234	NC_018829	CTGGAA	2	12	827620	827631	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410418572
23235	NC_018829	CCG	2	6	827657	827662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418572
23236	NC_018829	GGC	2	6	827676	827681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418572
23237	NC_018829	GCGCG	2	10	827697	827706	0 %	0 %	60 %	40 %	410418572
23238	NC_018829	CGGC	2	8	827744	827751	0 %	0 %	50 %	50 %	410418572
23239	NC_018829	GGC	2	6	827754	827759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418572
23240	NC_018829	GCC	2	6	827767	827772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418572
23241	NC_018829	GCAT	2	8	827774	827781	25 %	25 %	25 %	25 %	410418572
23242	NC_018829	CGA	2	6	827790	827795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418572
23243	NC_018829	GCA	2	6	827813	827818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418572
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23487	NC_018829	TGC	2	6	835007	835012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418580
23488	NC_018829	GTTCGA	2	12	835026	835037	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410418580
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23490	NC_018829	CGA	2	6	835044	835049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418580
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