MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica MO149

Total Repeats: 148431

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15004	NC_018829	TCG	2	6	544962	544967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418309
15005	NC_018829	CAT	2	6	545023	545028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410418309
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15013	NC_018829	GC	4	8	545396	545403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15014	NC_018829	C	6	6	545411	545416	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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15053	NC_018829	AAT	2	6	546567	546572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15055	NC_018829	AAG	2	6	546583	546588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15104	NC_018829	GGGC	2	8	548567	548574	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15105	NC_018829	GCAT	3	12	548576	548587	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15106	NC_018829	GC	3	6	548614	548619	0 %	0 %	50 %	50 %	410418313
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15124	NC_018829	GCA	2	6	549181	549186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418313
15125	NC_018829	TGGGC	2	10	549256	549265	0 %	20 %	60 %	20 %	410418313
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15127	NC_018829	GC	3	6	549297	549302	0 %	0 %	50 %	50 %	410418313
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15130	NC_018829	CG	3	6	549348	549353	0 %	0 %	50 %	50 %	410418313
15131	NC_018829	GCG	3	9	549351	549359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418313
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15141	NC_018829	GC	3	6	549726	549731	0 %	0 %	50 %	50 %	410418313
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15147	NC_018829	TGC	2	6	549892	549897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418313
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15151	NC_018829	GC	3	6	549998	550003	0 %	0 %	50 %	50 %	410418313
15152	NC_018829	GCCG	2	8	550009	550016	0 %	0 %	50 %	50 %	410418313
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15158	NC_018829	GGA	2	6	550215	550220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15159	NC_018829	GGT	2	6	550260	550265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410418314
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15170	NC_018829	GGT	2	6	550719	550724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410418314
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15191	NC_018829	GAT	2	6	551573	551578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410418315
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15206	NC_018829	GCATG	2	10	551917	551926	20 %	20 %	40 %	20 %	410418315
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15226	NC_018829	CG	4	8	552665	552672	0 %	0 %	50 %	50 %	410418315
15227	NC_018829	GGA	2	6	552698	552703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410418315
15228	NC_018829	GGC	2	6	552734	552739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418315
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15230	NC_018829	CCGG	2	8	552754	552761	0 %	0 %	50 %	50 %	410418315
15231	NC_018829	CCG	2	6	552784	552789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418315
15232	NC_018829	GCGG	2	8	552821	552828	0 %	0 %	75 %	25 %	410418315
15233	NC_018829	AAG	2	6	552837	552842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15234	NC_018829	CG	3	6	553017	553022	0 %	0 %	50 %	50 %	410418316
15235	NC_018829	GGCC	2	8	553039	553046	0 %	0 %	50 %	50 %	410418316
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15239	NC_018829	GCA	2	6	553176	553181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418316
15240	NC_018829	GCA	2	6	553269	553274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418316
15241	NC_018829	GC	4	8	553314	553321	0 %	0 %	50 %	50 %	410418316
15242	NC_018829	CGA	2	6	553360	553365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418316
15243	NC_018829	CGG	2	6	553375	553380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418316
15244	NC_018829	CGG	2	6	553398	553403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418316
15245	NC_018829	CCG	2	6	553440	553445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418316
15246	NC_018829	CAT	2	6	553474	553479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410418316
15247	NC_018829	GCG	2	6	553502	553507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418316
15248	NC_018829	TGG	2	6	553560	553565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410418316
15249	NC_018829	CGG	2	6	553627	553632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418316
15250	NC_018829	CGG	2	6	553698	553703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418316
15251	NC_018829	ATCT	2	8	553706	553713	25 %	50 %	0 %	25 %	410418316
15252	NC_018829	ACG	2	6	553725	553730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418316
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15254	NC_018829	CG	3	6	553820	553825	0 %	0 %	50 %	50 %	410418316
15255	NC_018829	GC	3	6	553911	553916	0 %	0 %	50 %	50 %	410418316
15256	NC_018829	AGG	2	6	553932	553937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410418316
15257	NC_018829	GCTCGA	2	12	553939	553950	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	410418316
15258	NC_018829	CGC	2	6	554028	554033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418316
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15260	NC_018829	GCC	2	6	554101	554106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418316
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15268	NC_018829	CGG	2	6	554319	554324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418317
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15270	NC_018829	GGA	2	6	554448	554453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410418317
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15272	NC_018829	TGC	2	6	554521	554526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418317
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15279	NC_018829	GCCG	2	8	554755	554762	0 %	0 %	50 %	50 %	410418317
15280	NC_018829	AGCA	2	8	554797	554804	50 %	0 %	25 %	25 %	410418317
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15284	NC_018829	GC	6	12	554896	554907	0 %	0 %	50 %	50 %	410418317
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15335	NC_018829	GC	3	6	556799	556804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15354	NC_018829	GCC	2	6	557642	557647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418320
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15359	NC_018829	TCG	2	6	557976	557981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418321
15360	NC_018829	GGCG	2	8	558005	558012	0 %	0 %	75 %	25 %	410418321
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15362	NC_018829	GCA	3	9	558151	558159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418321
15363	NC_018829	GCC	2	6	558164	558169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418321
15364	NC_018829	CGC	2	6	558206	558211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418321
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15419	NC_018829	TGC	2	6	560025	560030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418323
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15441	NC_018829	GC	3	6	560880	560885	0 %	0 %	50 %	50 %	410418323
15442	NC_018829	GCGAT	2	10	560895	560904	20 %	20 %	40 %	20 %	410418323
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15446	NC_018829	GCT	2	6	561076	561081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15448	NC_018829	CGA	2	6	561121	561126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15452	NC_018829	CTGC	2	8	561382	561389	0 %	25 %	25 %	50 %	410418324
15453	NC_018829	TCG	2	6	561411	561416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418324
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15457	NC_018829	TGG	2	6	561510	561515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410418324
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15470	NC_018829	CGC	2	6	561897	561902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418324
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15472	NC_018829	GCT	2	6	561931	561936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418324
15473	NC_018829	CGT	2	6	561952	561957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418324
15474	NC_018829	CG	3	6	561981	561986	0 %	0 %	50 %	50 %	410418324
15475	NC_018829	GGT	2	6	561994	561999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410418324
15476	NC_018829	CCG	2	6	562037	562042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418324
15477	NC_018829	GTG	2	6	562085	562090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410418324
15478	NC_018829	CGC	3	9	562122	562130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418324
15479	NC_018829	GC	3	6	562133	562138	0 %	0 %	50 %	50 %	410418324
15480	NC_018829	GC	3	6	562193	562198	0 %	0 %	50 %	50 %	410418324
15481	NC_018829	GCCG	2	8	562204	562211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15482	NC_018829	TCC	2	6	562287	562292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15483	NC_018829	GCCCG	2	10	562314	562323	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15484	NC_018829	AAC	2	6	562362	562367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15485	NC_018829	CAA	2	6	562377	562382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410418325
15486	NC_018829	GC	3	6	562409	562414	0 %	0 %	50 %	50 %	410418325
15487	NC_018829	GCG	2	6	562435	562440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418325
15488	NC_018829	GCG	2	6	562487	562492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418325
15489	NC_018829	GCT	2	6	562503	562508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418325
15490	NC_018829	GCG	2	6	562538	562543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418325
15491	NC_018829	GCC	2	6	562546	562551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418325
15492	NC_018829	CGA	3	9	562578	562586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418325
15493	NC_018829	GCC	2	6	562598	562603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418325
15494	NC_018829	GACCGC	2	12	562612	562623	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	410418325
15495	NC_018829	CAA	2	6	562674	562679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410418325
15496	NC_018829	GCC	3	9	562721	562729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15497	NC_018829	GCCC	2	8	562739	562746	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15498	NC_018829	GC	3	6	562767	562772	0 %	0 %	50 %	50 %	410418326
15499	NC_018829	GCGCG	2	10	562801	562810	0 %	0 %	60 %	40 %	410418326
15500	NC_018829	CG	4	8	562807	562814	0 %	0 %	50 %	50 %	410418326

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