MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica MO149

Total Repeats: 148431

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018829	TTGG	2	8	40995	41002	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_018829	AAACG	2	10	41029	41038	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1003	NC_018829	CAGG	2	8	41074	41081	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1004	NC_018829	CAGG	2	8	41091	41098	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1005	NC_018829	CGG	2	6	41157	41162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_018829	TCGT	2	8	41211	41218	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_018829	CAG	2	6	41222	41227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_018829	ACA	2	6	41351	41356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410417855
1009	NC_018829	CAT	2	6	41427	41432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410417855
1010	NC_018829	CG	3	6	41459	41464	0 %	0 %	50 %	50 %	410417855
1011	NC_018829	TGG	2	6	41498	41503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417855
1012	NC_018829	GCC	2	6	41563	41568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417855
1013	NC_018829	AAC	2	6	41699	41704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410417856
1014	NC_018829	CGA	2	6	41716	41721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417856
1015	NC_018829	AAG	2	6	41747	41752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410417856
1016	NC_018829	CGT	2	6	41812	41817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417856
1017	NC_018829	GAA	2	6	41818	41823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410417856
1018	NC_018829	CAA	2	6	41848	41853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410417856
1019	NC_018829	GGC	2	6	41858	41863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417856
1020	NC_018829	TCG	2	6	41865	41870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417856
1021	NC_018829	GTTCC	2	10	41977	41986	0 %	40 %	20 %	40 %	410417856
1022	NC_018829	GACA	2	8	42022	42029	50 %	0 %	25 %	25 %	410417857
1023	NC_018829	AAG	2	6	42167	42172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410417857
1024	NC_018829	GTG	2	6	42224	42229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417857
1025	NC_018829	CG	3	6	42354	42359	0 %	0 %	50 %	50 %	410417857
1026	NC_018829	ACA	2	6	42411	42416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410417857
1027	NC_018829	ATC	2	6	42434	42439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410417857
1028	NC_018829	CAC	3	9	42496	42504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410417857
1029	NC_018829	GAC	2	6	42515	42520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417857
1030	NC_018829	TGA	2	6	42574	42579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_018829	TCA	2	6	42597	42602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410417858
1032	NC_018829	GC	3	6	42616	42621	0 %	0 %	50 %	50 %	410417858
1033	NC_018829	GCTG	2	8	42625	42632	0 %	25 %	50 %	25 %	410417858
1034	NC_018829	GCC	2	6	42641	42646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417858
1035	NC_018829	GC	3	6	42649	42654	0 %	0 %	50 %	50 %	410417858
1036	NC_018829	ATC	2	6	42668	42673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410417858
1037	NC_018829	GAC	2	6	42674	42679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417858
1038	NC_018829	CGA	2	6	42691	42696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417858
1039	NC_018829	GTC	2	6	42783	42788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417858
1040	NC_018829	CG	3	6	42789	42794	0 %	0 %	50 %	50 %	410417858
1041	NC_018829	ATGAGC	2	12	42897	42908	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410417859
1042	NC_018829	GCA	2	6	42947	42952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417859
1043	NC_018829	TAC	2	6	43092	43097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410417859
1044	NC_018829	GCCG	2	8	43098	43105	0 %	0 %	50 %	50 %	410417859
1045	NC_018829	CG	3	6	43219	43224	0 %	0 %	50 %	50 %	410417859
1046	NC_018829	TGA	2	6	43228	43233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410417859
1047	NC_018829	GCG	2	6	43264	43269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417859
1048	NC_018829	GCC	2	6	43475	43480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417860
1049	NC_018829	GC	3	6	43506	43511	0 %	0 %	50 %	50 %	410417860
1050	NC_018829	CCG	2	6	43655	43660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417860
1051	NC_018829	CCCA	2	8	43678	43685	25 %	0 %	0 %	75 %	410417860
1052	NC_018829	TCA	2	6	43697	43702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410417860
1053	NC_018829	CAAG	2	8	43713	43720	50 %	0 %	25 %	25 %	410417860
1054	NC_018829	TCG	2	6	43721	43726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417860
1055	NC_018829	CAAGGG	2	12	43773	43784	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	410417860
1056	NC_018829	CGT	2	6	43806	43811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417860
1057	NC_018829	AAG	2	6	43825	43830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410417860
1058	NC_018829	A	6	6	43864	43869	100 %	0 %	0 %	0 %	410417861
1059	NC_018829	CGT	2	6	43882	43887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417861
1060	NC_018829	CCG	2	6	43899	43904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417861
1061	NC_018829	CAT	2	6	43971	43976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410417861
1062	NC_018829	CG	3	6	44032	44037	0 %	0 %	50 %	50 %	410417861
1063	NC_018829	GCG	2	6	44045	44050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417861
1064	NC_018829	CCG	3	9	44072	44080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417861
1065	NC_018829	TGG	2	6	44084	44089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417861
1066	NC_018829	AAGGCC	2	12	44107	44118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417861
1067	NC_018829	CG	4	8	44193	44200	0 %	0 %	50 %	50 %	410417861
1068	NC_018829	CTA	2	6	44240	44245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410417862
1069	NC_018829	CGC	2	6	44262	44267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417862
1070	NC_018829	ACG	3	9	44279	44287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417862
1071	NC_018829	GAT	2	6	44301	44306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410417862
1072	NC_018829	GGT	2	6	44338	44343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417862
1073	NC_018829	GTG	2	6	44371	44376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417862
1074	NC_018829	GGCGAT	2	12	44377	44388	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410417862
1075	NC_018829	GGGCAA	2	12	44403	44414	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	410417862
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1077	NC_018829	GAA	2	6	44487	44492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410417862
1078	NC_018829	GTG	2	6	44512	44517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417862
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1080	NC_018829	CGG	2	6	44580	44585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417862
1081	NC_018829	GC	3	6	44592	44597	0 %	0 %	50 %	50 %	410417862
1082	NC_018829	GC	3	6	44691	44696	0 %	0 %	50 %	50 %	410417862
1083	NC_018829	CGG	2	6	44708	44713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417862
1084	NC_018829	TGC	2	6	44718	44723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417862
1085	NC_018829	GGCCTG	2	12	44842	44853	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	410417863
1086	NC_018829	CAG	2	6	44865	44870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417863
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1088	NC_018829	CGTCTC	2	12	44928	44939	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	410417863
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1090	NC_018829	GCA	2	6	44999	45004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417864
1091	NC_018829	CCG	2	6	45056	45061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417864
1092	NC_018829	GGC	2	6	45094	45099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417864
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1094	NC_018829	CGC	2	6	45167	45172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417864
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1096	NC_018829	TCA	2	6	45296	45301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410417864
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1098	NC_018829	CGGC	2	8	45350	45357	0 %	0 %	50 %	50 %	410417864
1099	NC_018829	CGC	2	6	45363	45368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417864
1100	NC_018829	GCTT	2	8	45390	45397	0 %	50 %	25 %	25 %	410417864
1101	NC_018829	CGC	2	6	45468	45473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417865
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1103	NC_018829	CATC	2	8	45670	45677	25 %	25 %	0 %	50 %	410417865
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1105	NC_018829	AAGA	2	8	45723	45730	75 %	0 %	25 %	0 %	410417865
1106	NC_018829	GGCC	2	8	45737	45744	0 %	0 %	50 %	50 %	410417865
1107	NC_018829	TGT	2	6	45859	45864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410417865
1108	NC_018829	TCG	2	6	45982	45987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417865
1109	NC_018829	GCT	2	6	46013	46018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417865
1110	NC_018829	GTG	2	6	46098	46103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417865
1111	NC_018829	CAA	2	6	46160	46165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410417865
1112	NC_018829	CCG	2	6	46224	46229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417865
1113	NC_018829	CGT	2	6	46237	46242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417865
1114	NC_018829	GCG	2	6	46285	46290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417865
1115	NC_018829	TGC	2	6	46316	46321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417865
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1121	NC_018829	GCTG	2	8	46520	46527	0 %	25 %	50 %	25 %	410417865
1122	NC_018829	TGCT	2	8	46551	46558	0 %	50 %	25 %	25 %	410417865
1123	NC_018829	GGT	2	6	46602	46607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417865
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1126	NC_018829	ATG	2	6	46668	46673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410417865
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1252	NC_018829	TGC	2	6	52025	52030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417875
1253	NC_018829	GGC	2	6	52087	52092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417875
1254	NC_018829	GCC	3	9	52135	52143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417875
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1259	NC_018829	CTG	2	6	52258	52263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417875
1260	NC_018829	CTGGCG	2	12	52270	52281	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	410417875
1261	NC_018829	CGG	2	6	52310	52315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417875
1262	NC_018829	GAGC	2	8	52332	52339	25 %	0 %	50 %	25 %	410417875
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1264	NC_018829	GCCGC	2	10	52423	52432	0 %	0 %	40 %	60 %	410417875
1265	NC_018829	GGCG	2	8	52434	52441	0 %	0 %	75 %	25 %	410417875
1266	NC_018829	GCG	2	6	52481	52486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417875
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1282	NC_018829	CGGC	2	8	52871	52878	0 %	0 %	50 %	50 %	410417875
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1292	NC_018829	CG	3	6	53229	53234	0 %	0 %	50 %	50 %	410417875
1293	NC_018829	GC	3	6	53276	53281	0 %	0 %	50 %	50 %	410417875
1294	NC_018829	GC	3	6	53329	53334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1295	NC_018829	CGG	2	6	53390	53395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417876
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1365	NC_018829	CGA	2	6	55928	55933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417878
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1367	NC_018829	GGC	2	6	55957	55962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417878
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1369	NC_018829	GGTT	2	8	56034	56041	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1370	NC_018829	CG	4	8	56084	56091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1371	NC_018829	T	6	6	56100	56105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1372	NC_018829	CG	3	6	56179	56184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1373	NC_018829	GGCA	2	8	56185	56192	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1374	NC_018829	TCG	2	6	56228	56233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1375	NC_018829	CGC	2	6	56316	56321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417879
1376	NC_018829	CGC	2	6	56352	56357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417879
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1378	NC_018829	GCA	3	9	56435	56443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417879
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1382	NC_018829	GCA	2	6	56634	56639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417879
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1498	NC_018829	CG	3	6	60767	60772	0 %	0 %	50 %	50 %	410417882
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