MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica MO149

Total Repeats: 148431

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_018829	GCG	2	6	21002	21007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417833
503	NC_018829	GC	4	8	21045	21052	0 %	0 %	50 %	50 %	410417833
504	NC_018829	CTG	2	6	21055	21060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417833
505	NC_018829	GGC	2	6	21072	21077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417833
506	NC_018829	GGA	2	6	21132	21137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410417833
507	NC_018829	CCTG	2	8	21139	21146	0 %	25 %	25 %	50 %	410417833
508	NC_018829	GCC	3	9	21209	21217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417833
509	NC_018829	GCG	2	6	21223	21228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417833
510	NC_018829	ACG	2	6	21245	21250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417833
511	NC_018829	GC	3	6	21303	21308	0 %	0 %	50 %	50 %	410417833
512	NC_018829	GAGCCG	2	12	21388	21399	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	410417833
513	NC_018829	CCG	2	6	21401	21406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417833
514	NC_018829	CCG	2	6	21433	21438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417833
515	NC_018829	CGA	2	6	21444	21449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417833
516	NC_018829	CGA	2	6	21456	21461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417833
517	NC_018829	CGG	2	6	21482	21487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417833
518	NC_018829	GCA	2	6	21491	21496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417833
519	NC_018829	CTG	2	6	21511	21516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417833
520	NC_018829	TGG	2	6	21547	21552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417833
521	NC_018829	GCG	2	6	21575	21580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417833
522	NC_018829	GAC	2	6	21603	21608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417833
523	NC_018829	CGCCA	2	10	21621	21630	20 %	0 %	20 %	60 %	410417833
524	NC_018829	GCC	2	6	21651	21656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417833
525	NC_018829	GCC	2	6	21658	21663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417833
526	NC_018829	CGC	3	9	21671	21679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417833
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529	NC_018829	CGC	2	6	21750	21755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417833
530	NC_018829	GGA	2	6	21777	21782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410417833
531	NC_018829	GCC	2	6	21814	21819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417833
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533	NC_018829	GCCC	2	8	21914	21921	0 %	0 %	25 %	75 %	410417833
534	NC_018829	GTC	2	6	21958	21963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417833
535	NC_018829	GCC	2	6	21981	21986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417833
536	NC_018829	CACG	2	8	22032	22039	25 %	0 %	25 %	50 %	410417833
537	NC_018829	GCA	2	6	22095	22100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417834
538	NC_018829	CGG	2	6	22113	22118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417834
539	NC_018829	TGA	2	6	22140	22145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410417834
540	NC_018829	CGGCC	2	10	22149	22158	0 %	0 %	40 %	60 %	410417834
541	NC_018829	GCC	2	6	22207	22212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417834
542	NC_018829	TTCG	2	8	22216	22223	0 %	50 %	25 %	25 %	410417834
543	NC_018829	CGG	2	6	22227	22232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417834
544	NC_018829	CG	3	6	22239	22244	0 %	0 %	50 %	50 %	410417834
545	NC_018829	CGT	2	6	22293	22298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417834
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547	NC_018829	CGGA	2	8	22359	22366	25 %	0 %	50 %	25 %	410417834
548	NC_018829	CAG	2	6	22387	22392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417834
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554	NC_018829	GCA	2	6	22518	22523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417834
555	NC_018829	CG	3	6	22567	22572	0 %	0 %	50 %	50 %	410417834
556	NC_018829	TCG	2	6	22589	22594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417834
557	NC_018829	CTG	2	6	22648	22653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417834
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559	NC_018829	GCG	2	6	22707	22712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417834
560	NC_018829	CG	3	6	22711	22716	0 %	0 %	50 %	50 %	410417834
561	NC_018829	TCG	2	6	22820	22825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417834
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563	NC_018829	GCG	2	6	22917	22922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417834
564	NC_018829	TCG	2	6	22961	22966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417834
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572	NC_018829	CG	3	6	23151	23156	0 %	0 %	50 %	50 %	410417834
573	NC_018829	CAG	2	6	23206	23211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417834
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595	NC_018829	CG	4	8	23986	23993	0 %	0 %	50 %	50 %	410417834
596	NC_018829	CAC	2	6	24007	24012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410417834
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599	NC_018829	GAT	2	6	24097	24102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410417834
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601	NC_018829	CAG	2	6	24139	24144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417834
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608	NC_018829	GC	3	6	24355	24360	0 %	0 %	50 %	50 %	410417834
609	NC_018829	GCCA	2	8	24362	24369	25 %	0 %	25 %	50 %	410417834
610	NC_018829	CGGG	2	8	24374	24381	0 %	0 %	75 %	25 %	410417834
611	NC_018829	GCG	4	12	24397	24408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417834
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614	NC_018829	GTA	2	6	24557	24562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410417835
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622	NC_018829	G	6	6	24739	24744	0 %	0 %	100 %	0 %	410417835
623	NC_018829	GCA	2	6	24748	24753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417835
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756	NC_018829	GCGGCC	2	12	30551	30562	0 %	0 %	50 %	50 %	410417840
757	NC_018829	CGT	2	6	30573	30578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417840
758	NC_018829	GCG	2	6	30605	30610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417840
759	NC_018829	GCG	2	6	30638	30643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417840
760	NC_018829	CG	3	6	30650	30655	0 %	0 %	50 %	50 %	410417840
761	NC_018829	CGG	2	6	30665	30670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417840
762	NC_018829	TTC	2	6	30748	30753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410417840
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764	NC_018829	GCT	2	6	30799	30804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417840
765	NC_018829	AAGG	2	8	30817	30824	50 %	0 %	50 %	0 %	410417840
766	NC_018829	CTG	2	6	30847	30852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417840
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769	NC_018829	CCG	2	6	30924	30929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417840
770	NC_018829	GAC	2	6	30949	30954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417840
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772	NC_018829	CCA	2	6	31016	31021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410417840
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774	NC_018829	AAGT	2	8	31126	31133	50 %	25 %	25 %	0 %	410417840
775	NC_018829	CGC	2	6	31140	31145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
776	NC_018829	CAA	2	6	31169	31174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
777	NC_018829	ACG	2	6	31283	31288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417841
778	NC_018829	CGG	2	6	31293	31298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417841
779	NC_018829	ACG	2	6	31304	31309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417841
780	NC_018829	CGG	2	6	31327	31332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417841
781	NC_018829	GAGACG	2	12	31418	31429	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	410417841
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785	NC_018829	CG	3	6	31554	31559	0 %	0 %	50 %	50 %	410417841
786	NC_018829	CTG	2	6	31568	31573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417841
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790	NC_018829	CTG	2	6	31676	31681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417841
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798	NC_018829	CTG	2	6	32045	32050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417841
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805	NC_018829	CGT	2	6	32374	32379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417841
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807	NC_018829	CGC	2	6	32428	32433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
808	NC_018829	GATC	2	8	32512	32519	25 %	25 %	25 %	25 %	410417842
809	NC_018829	CGT	2	6	32600	32605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417842
810	NC_018829	ACG	2	6	32607	32612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417842
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814	NC_018829	CGTCGA	2	12	32746	32757	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	410417842
815	NC_018829	CGG	3	9	32872	32880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
816	NC_018829	TGC	2	6	32926	32931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
817	NC_018829	GA	3	6	32975	32980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
818	NC_018829	GC	4	8	32989	32996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
819	NC_018829	GCC	2	6	33002	33007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
820	NC_018829	GCG	2	6	33038	33043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
821	NC_018829	ACGCCC	2	12	33143	33154	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	410417843
822	NC_018829	GCC	2	6	33155	33160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417843
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827	NC_018829	CGC	2	6	33298	33303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417843
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833	NC_018829	CTG	2	6	33728	33733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417843
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869	NC_018829	CGAT	2	8	35415	35422	25 %	25 %	25 %	25 %	410417846
870	NC_018829	GGT	3	9	35432	35440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417846
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872	NC_018829	GCGCAA	2	12	35548	35559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417846
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878	NC_018829	AAG	2	6	35834	35839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410417847
879	NC_018829	ACT	2	6	35861	35866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410417848
880	NC_018829	GTG	2	6	35877	35882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417848
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