MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica MO149

Total Repeats: 148431

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_018829	CCA	2	6	225954	225959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410418028
6003	NC_018829	GCC	2	6	226028	226033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418028
6004	NC_018829	TGG	2	6	226034	226039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410418028
6005	NC_018829	TCG	2	6	226040	226045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418028
6006	NC_018829	CG	3	6	226051	226056	0 %	0 %	50 %	50 %	410418028
6007	NC_018829	GAA	2	6	226084	226089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410418028
6008	NC_018829	CAGCGC	2	12	226090	226101	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	410418028
6009	NC_018829	CCA	2	6	226104	226109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410418028
6010	NC_018829	GCC	2	6	226115	226120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418028
6011	NC_018829	CGG	3	9	226125	226133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418028
6012	NC_018829	CAG	2	6	226153	226158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418028
6013	NC_018829	GCC	2	6	226159	226164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418028
6014	NC_018829	GAT	2	6	226183	226188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410418028
6015	NC_018829	CAG	2	6	226291	226296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418028
6016	NC_018829	GTG	2	6	226298	226303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410418028
6017	NC_018829	GCA	2	6	226326	226331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418028
6018	NC_018829	CGACCG	2	12	226341	226352	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	410418028
6019	NC_018829	GC	3	6	226371	226376	0 %	0 %	50 %	50 %	410418028
6020	NC_018829	CAG	2	6	226402	226407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418028
6021	NC_018829	CCA	2	6	226470	226475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410418028
6022	NC_018829	TCA	2	6	226566	226571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410418028
6023	NC_018829	GCC	2	6	226573	226578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418028
6024	NC_018829	GAA	2	6	226594	226599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410418028
6025	NC_018829	TGTC	2	8	226605	226612	0 %	50 %	25 %	25 %	410418028
6026	NC_018829	TCG	2	6	226668	226673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418029
6027	NC_018829	TCT	2	6	226690	226695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410418029
6028	NC_018829	GAC	3	9	226709	226717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418029
6029	NC_018829	TGG	2	6	226768	226773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410418029
6030	NC_018829	TCG	2	6	226782	226787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418029
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6033	NC_018829	GAT	2	6	226973	226978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410418029
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6035	NC_018829	CAG	2	6	227045	227050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418029
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6038	NC_018829	CGC	2	6	227188	227193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418029
6039	NC_018829	GCA	2	6	227194	227199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418029
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6041	NC_018829	TGA	2	6	227233	227238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410418029
6042	NC_018829	GAT	2	6	227276	227281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410418029
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6044	NC_018829	TGCGC	2	10	227386	227395	0 %	20 %	40 %	40 %	410418029
6045	NC_018829	GC	3	6	227450	227455	0 %	0 %	50 %	50 %	410418030
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6048	NC_018829	TGCGGG	2	12	227602	227613	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	410418030
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6052	NC_018829	CGCC	2	8	227692	227699	0 %	0 %	25 %	75 %	410418030
6053	NC_018829	GCA	2	6	227731	227736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418030
6054	NC_018829	TGA	2	6	227833	227838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410418030
6055	NC_018829	CGT	2	6	227848	227853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418030
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6061	NC_018829	CGG	2	6	228052	228057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418030
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6063	NC_018829	CGG	2	6	228152	228157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418030
6064	NC_018829	GTC	2	6	228167	228172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418030
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6066	NC_018829	GCT	2	6	228232	228237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418030
6067	NC_018829	CGCC	2	8	228292	228299	0 %	0 %	25 %	75 %	410418030
6068	NC_018829	CAG	2	6	228512	228517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418030
6069	NC_018829	CG	3	6	228529	228534	0 %	0 %	50 %	50 %	410418030
6070	NC_018829	ATA	2	6	228545	228550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410418030
6071	NC_018829	TCGA	2	8	228573	228580	25 %	25 %	25 %	25 %	410418030
6072	NC_018829	CGG	2	6	228668	228673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418030
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6074	NC_018829	GGTC	2	8	228697	228704	0 %	25 %	50 %	25 %	410418030
6075	NC_018829	GC	5	10	228726	228735	0 %	0 %	50 %	50 %	410418030
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6079	NC_018829	CGT	2	6	228814	228819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418030
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6081	NC_018829	TGGC	2	8	228861	228868	0 %	25 %	50 %	25 %	410418030
6082	NC_018829	GC	3	6	228874	228879	0 %	0 %	50 %	50 %	410418030
6083	NC_018829	GCT	2	6	228895	228900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418030
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6086	NC_018829	TCG	2	6	228948	228953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418030
6087	NC_018829	CGACCA	2	12	229024	229035	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	410418030
6088	NC_018829	GCA	2	6	229054	229059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418030
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6090	NC_018829	GGC	2	6	229235	229240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418030
6091	NC_018829	AGC	3	9	229326	229334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418030
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6093	NC_018829	TCC	2	6	229400	229405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6094	NC_018829	GAT	2	6	229421	229426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_018829	GGC	2	6	229427	229432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6096	NC_018829	GGTTG	2	10	229500	229509	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_018829	CCA	2	6	229510	229515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6098	NC_018829	CGC	2	6	229613	229618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418031
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6100	NC_018829	GTCGC	2	10	229764	229773	0 %	20 %	40 %	40 %	410418031
6101	NC_018829	CGG	2	6	229790	229795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418031
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6103	NC_018829	ACG	2	6	229840	229845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418031
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6106	NC_018829	GC	3	6	229872	229877	0 %	0 %	50 %	50 %	410418031
6107	NC_018829	CGG	2	6	229882	229887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418031
6108	NC_018829	GCT	2	6	229901	229906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418031
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6110	NC_018829	CTG	2	6	229995	230000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418031
6111	NC_018829	GC	3	6	230010	230015	0 %	0 %	50 %	50 %	410418031
6112	NC_018829	GCT	2	6	230048	230053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418031
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6115	NC_018829	GC	3	6	230126	230131	0 %	0 %	50 %	50 %	410418031
6116	NC_018829	GCT	2	6	230165	230170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418031
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6119	NC_018829	GCCC	2	8	230288	230295	0 %	0 %	25 %	75 %	410418032
6120	NC_018829	GCC	2	6	230308	230313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418032
6121	NC_018829	CGG	2	6	230327	230332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418032
6122	NC_018829	GC	3	6	230359	230364	0 %	0 %	50 %	50 %	410418032
6123	NC_018829	GCG	2	6	230378	230383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418032
6124	NC_018829	GCCA	2	8	230413	230420	25 %	0 %	25 %	50 %	410418032
6125	NC_018829	GC	3	6	230438	230443	0 %	0 %	50 %	50 %	410418032
6126	NC_018829	CGG	2	6	230444	230449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418032
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6128	NC_018829	CAT	2	6	230499	230504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410418032
6129	NC_018829	CCAG	2	8	230507	230514	25 %	0 %	25 %	50 %	410418032
6130	NC_018829	CAG	2	6	230550	230555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418032
6131	NC_018829	CG	3	6	230564	230569	0 %	0 %	50 %	50 %	410418032
6132	NC_018829	GGCG	2	8	230582	230589	0 %	0 %	75 %	25 %	410418032
6133	NC_018829	CCG	2	6	230599	230604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418032
6134	NC_018829	GC	3	6	230615	230620	0 %	0 %	50 %	50 %	410418032
6135	NC_018829	GC	3	6	230622	230627	0 %	0 %	50 %	50 %	410418032
6136	NC_018829	CCAGG	2	10	230643	230652	20 %	0 %	40 %	40 %	410418032
6137	NC_018829	CAG	2	6	230778	230783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418032
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6139	NC_018829	GC	3	6	230825	230830	0 %	0 %	50 %	50 %	410418032
6140	NC_018829	CGA	2	6	230831	230836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418032
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6142	NC_018829	GGC	2	6	230913	230918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6143	NC_018829	CGG	2	6	230946	230951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6144	NC_018829	GCC	2	6	230962	230967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6145	NC_018829	TGA	3	9	230989	230997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6146	NC_018829	GC	4	8	231065	231072	0 %	0 %	50 %	50 %	410418033
6147	NC_018829	GGC	2	6	231074	231079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418033
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6150	NC_018829	GGA	2	6	231164	231169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410418033
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6152	NC_018829	CGA	2	6	231218	231223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418033
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6154	NC_018829	TCG	2	6	231364	231369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418033
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6163	NC_018829	GC	3	6	231651	231656	0 %	0 %	50 %	50 %	410418033
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6176	NC_018829	CGG	2	6	231956	231961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6177	NC_018829	CGC	2	6	231999	232004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6178	NC_018829	GCG	2	6	232008	232013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6179	NC_018829	AGG	2	6	232024	232029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6184	NC_018829	GGCCA	2	10	232163	232172	20 %	0 %	40 %	40 %	410418034
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6188	NC_018829	GCCG	2	8	232324	232331	0 %	0 %	50 %	50 %	410418034
6189	NC_018829	GGC	2	6	232355	232360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418034
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6193	NC_018829	CTT	2	6	232596	232601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410418035
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6219	NC_018829	GAT	2	6	233322	233327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410418035
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6223	NC_018829	CAGCG	2	10	233446	233455	20 %	0 %	40 %	40 %	410418035
6224	NC_018829	GCTG	2	8	233456	233463	0 %	25 %	50 %	25 %	410418035
6225	NC_018829	CGG	2	6	233486	233491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418035
6226	NC_018829	GCCAGC	2	12	233506	233517	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	410418035
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6228	NC_018829	CTC	2	6	233546	233551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6229	NC_018829	GC	3	6	233573	233578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6230	NC_018829	GC	3	6	233585	233590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6231	NC_018829	TAT	2	6	233606	233611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6232	NC_018829	GCG	2	6	233628	233633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6233	NC_018829	CCG	2	6	233680	233685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6234	NC_018829	GC	3	6	233703	233708	0 %	0 %	50 %	50 %	410418036
6235	NC_018829	GC	4	8	233716	233723	0 %	0 %	50 %	50 %	410418036
6236	NC_018829	CGC	2	6	233784	233789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418036
6237	NC_018829	CG	5	10	233835	233844	0 %	0 %	50 %	50 %	410418036
6238	NC_018829	GC	3	6	233876	233881	0 %	0 %	50 %	50 %	410418036
6239	NC_018829	TCG	2	6	233897	233902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418036
6240	NC_018829	TCA	2	6	233916	233921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410418036
6241	NC_018829	GCA	2	6	233976	233981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418036
6242	NC_018829	CGAG	2	8	234042	234049	25 %	0 %	50 %	25 %	410418036
6243	NC_018829	GGC	2	6	234066	234071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418036
6244	NC_018829	CG	3	6	234126	234131	0 %	0 %	50 %	50 %	410418036
6245	NC_018829	TTG	2	6	234146	234151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410418036
6246	NC_018829	CAGGTC	2	12	234181	234192	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	410418036
6247	NC_018829	CGC	2	6	234245	234250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418036
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6249	NC_018829	GGC	2	6	234349	234354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418036
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6252	NC_018829	GCGG	2	8	234503	234510	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6253	NC_018829	GCC	2	6	234538	234543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6257	NC_018829	TCCGCC	2	12	234657	234668	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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6261	NC_018829	GCCT	2	8	234865	234872	0 %	25 %	25 %	50 %	410418037
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6296	NC_018829	CGCAA	2	10	236004	236013	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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6366	NC_018829	CG	3	6	238635	238640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6492	NC_018829	GGC	2	6	242419	242424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418044
6493	NC_018829	GC	3	6	242423	242428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6494	NC_018829	GC	5	10	242447	242456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6495	NC_018829	GCT	2	6	242538	242543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418045
6496	NC_018829	GCC	2	6	242545	242550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418045
6497	NC_018829	ACG	2	6	242555	242560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418045
6498	NC_018829	CCGG	2	8	242586	242593	0 %	0 %	50 %	50 %	410418045
6499	NC_018829	GGC	2	6	242634	242639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418045
6500	NC_018829	GCC	2	6	242644	242649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418045

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