MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC54

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018694	TA	3	6	3848	3853	50 %	50 %	0 %	0 %	407708687
2	NC_018694	GA	3	6	3979	3984	50 %	0 %	50 %	0 %	407708687
3	NC_018694	AT	3	6	4024	4029	50 %	50 %	0 %	0 %	407708687
4	NC_018694	TG	3	6	4253	4258	0 %	50 %	50 %	0 %	407708688
5	NC_018694	AT	3	6	8334	8339	50 %	50 %	0 %	0 %	407708693
6	NC_018694	AT	3	6	8510	8515	50 %	50 %	0 %	0 %	407708693
7	NC_018694	TA	3	6	8873	8878	50 %	50 %	0 %	0 %	407708693
8	NC_018694	GA	3	6	9762	9767	50 %	0 %	50 %	0 %	407708694
9	NC_018694	GA	3	6	9800	9805	50 %	0 %	50 %	0 %	407708694
10	NC_018694	AT	3	6	9875	9880	50 %	50 %	0 %	0 %	407708694
11	NC_018694	AT	3	6	10089	10094	50 %	50 %	0 %	0 %	407708694
12	NC_018694	GA	3	6	10243	10248	50 %	0 %	50 %	0 %	407708694
13	NC_018694	TA	3	6	10589	10594	50 %	50 %	0 %	0 %	407708695
14	NC_018694	CG	3	6	11772	11777	0 %	0 %	50 %	50 %	407708695
15	NC_018694	AT	3	6	11862	11867	50 %	50 %	0 %	0 %	407708696
16	NC_018694	TC	3	6	12040	12045	0 %	50 %	0 %	50 %	407708696
17	NC_018694	AT	3	6	14362	14367	50 %	50 %	0 %	0 %	407708700
18	NC_018694	TA	4	8	14694	14701	50 %	50 %	0 %	0 %	407708700
19	NC_018694	TA	3	6	15396	15401	50 %	50 %	0 %	0 %	407708700
20	NC_018694	AG	3	6	16582	16587	50 %	0 %	50 %	0 %	407708701
21	NC_018694	AT	3	6	16911	16916	50 %	50 %	0 %	0 %	407708701
22	NC_018694	CA	3	6	17131	17136	50 %	0 %	0 %	50 %	407708701
23	NC_018694	AT	3	6	17571	17576	50 %	50 %	0 %	0 %	407708701
24	NC_018694	AG	3	6	17608	17613	50 %	0 %	50 %	0 %	407708701
25	NC_018694	AT	3	6	18138	18143	50 %	50 %	0 %	0 %	407708701
26	NC_018694	GA	3	6	18506	18511	50 %	0 %	50 %	0 %	407708701
27	NC_018694	CT	3	6	18994	18999	0 %	50 %	0 %	50 %	407708702
28	NC_018694	TA	3	6	19205	19210	50 %	50 %	0 %	0 %	407708702
29	NC_018694	AT	3	6	20228	20233	50 %	50 %	0 %	0 %	407708702
30	NC_018694	AG	3	6	22651	22656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018694	CT	3	6	22663	22668	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018694	TA	3	6	22696	22701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018694	TA	3	6	23478	23483	50 %	50 %	0 %	0 %	407708706
34	NC_018694	TA	3	6	23560	23565	50 %	50 %	0 %	0 %	407708707
35	NC_018694	TA	3	6	24311	24316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018694	TA	3	6	24455	24460	50 %	50 %	0 %	0 %	407708708
37	NC_018694	CT	3	6	24660	24665	0 %	50 %	0 %	50 %	407708708
38	NC_018694	AT	3	6	25532	25537	50 %	50 %	0 %	0 %	407708708
39	NC_018694	AC	3	6	26543	26548	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018694	AT	3	6	28440	28445	50 %	50 %	0 %	0 %	407708713
41	NC_018694	TG	4	8	29442	29449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018694	TA	3	6	29528	29533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018694	AT	3	6	29539	29544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018694	AT	4	8	30056	30063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018694	CT	3	6	30261	30266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_018694	AG	4	8	30560	30567	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018694	TG	3	6	31157	31162	0 %	50 %	50 %	0 %	407708716
48	NC_018694	TA	3	6	31558	31563	50 %	50 %	0 %	0 %	407708718
49	NC_018694	AT	3	6	31763	31768	50 %	50 %	0 %	0 %	407708718
50	NC_018694	TC	3	6	31837	31842	0 %	50 %	0 %	50 %	407708718
51	NC_018694	AT	3	6	31982	31987	50 %	50 %	0 %	0 %	407708718
52	NC_018694	TA	3	6	32509	32514	50 %	50 %	0 %	0 %	407708719
53	NC_018694	GT	3	6	33181	33186	0 %	50 %	50 %	0 %	407708720
54	NC_018694	CT	3	6	34062	34067	0 %	50 %	0 %	50 %	407708721
55	NC_018694	CT	3	6	34208	34213	0 %	50 %	0 %	50 %	407708721
56	NC_018694	TA	3	6	34570	34575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018694	CT	4	8	34856	34863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_018694	AT	4	8	35548	35555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018694	TA	4	8	35573	35580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018694	TA	3	6	37001	37006	50 %	50 %	0 %	0 %	407708723
61	NC_018694	AG	3	6	37231	37236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018694	GA	3	6	38090	38095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018694	CG	3	6	38156	38161	0 %	0 %	50 %	50 %	407708727
64	NC_018694	GA	3	6	41760	41765	50 %	0 %	50 %	0 %	407708734
65	NC_018694	AG	3	6	43100	43105	50 %	0 %	50 %	0 %	407708737
66	NC_018694	GA	3	6	43341	43346	50 %	0 %	50 %	0 %	407708737
67	NC_018694	TA	3	6	45617	45622	50 %	50 %	0 %	0 %	407708742
68	NC_018694	TA	3	6	45777	45782	50 %	50 %	0 %	0 %	407708742
69	NC_018694	GA	3	6	46076	46081	50 %	0 %	50 %	0 %	407708743
70	NC_018694	TG	3	6	46183	46188	0 %	50 %	50 %	0 %	407708743
71	NC_018694	TA	4	8	46402	46409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018694	TA	3	6	46427	46432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018694	AT	3	6	46800	46805	50 %	50 %	0 %	0 %	407708744
74	NC_018694	GA	3	6	46914	46919	50 %	0 %	50 %	0 %	407708744
75	NC_018694	TA	3	6	47132	47137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018694	AT	3	6	47147	47152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018694	TA	3	6	48165	48170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018694	GA	3	6	48673	48678	50 %	0 %	50 %	0 %	407708746
79	NC_018694	AG	4	8	48953	48960	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018694	CT	3	6	48978	48983	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_018694	AT	3	6	49013	49018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018694	AG	3	6	49406	49411	50 %	0 %	50 %	0 %	407708747
83	NC_018694	AG	3	6	49626	49631	50 %	0 %	50 %	0 %	407708747
84	NC_018694	TA	3	6	50365	50370	50 %	50 %	0 %	0 %	407708748
85	NC_018694	AT	3	6	50737	50742	50 %	50 %	0 %	0 %	407708750
86	NC_018694	AT	3	6	50769	50774	50 %	50 %	0 %	0 %	407708750
87	NC_018694	AT	3	6	50879	50884	50 %	50 %	0 %	0 %	407708751
88	NC_018694	AT	3	6	51781	51786	50 %	50 %	0 %	0 %	407708752
89	NC_018694	TA	3	6	52515	52520	50 %	50 %	0 %	0 %	407708752
90	NC_018694	AT	3	6	52530	52535	50 %	50 %	0 %	0 %	407708752
91	NC_018694	AT	3	6	53120	53125	50 %	50 %	0 %	0 %	407708753
92	NC_018694	TA	3	6	53949	53954	50 %	50 %	0 %	0 %	407708753
93	NC_018694	TG	3	6	53978	53983	0 %	50 %	50 %	0 %	407708753

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.