MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC54

Total Repeats: 1293

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018694	A	7	7	22391	22397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_018694	T	6	6	22403	22408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_018694	TATT	2	8	22424	22431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_018694	TAA	2	6	22456	22461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_018694	AGG	2	6	22475	22480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_018694	TGGAT	2	10	22490	22499	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
507	NC_018694	TTC	2	6	22548	22553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_018694	TAC	2	6	22579	22584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_018694	GAA	2	6	22594	22599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_018694	AG	3	6	22651	22656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
511	NC_018694	CT	3	6	22663	22668	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
512	NC_018694	TA	3	6	22696	22701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_018694	A	6	6	22707	22712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_018694	ACA	2	6	22774	22779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_018694	ATG	2	6	22833	22838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_018694	GAC	2	6	22909	22914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407708705
517	NC_018694	GTT	2	6	22973	22978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407708705
518	NC_018694	AGAA	2	8	23006	23013	75 %	0 %	25 %	0 %	407708705
519	NC_018694	AGA	2	6	23061	23066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708705
520	NC_018694	TAT	2	6	23067	23072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708705
521	NC_018694	T	7	7	23120	23126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_018694	AAAT	2	8	23144	23151	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_018694	A	6	6	23183	23188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_018694	TACT	2	8	23229	23236	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
525	NC_018694	G	6	6	23302	23307	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
526	NC_018694	ATTT	2	8	23323	23330	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_018694	T	6	6	23357	23362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_018694	TTTG	2	8	23416	23423	0 %	75 %	25 %	0 %	407708706
529	NC_018694	AGT	2	6	23434	23439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708706
530	NC_018694	TAT	2	6	23440	23445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708706
531	NC_018694	ATT	2	6	23456	23461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708706
532	NC_018694	TAA	2	6	23466	23471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407708706
533	NC_018694	TA	3	6	23478	23483	50 %	50 %	0 %	0 %	407708706
534	NC_018694	AAAG	2	8	23485	23492	75 %	0 %	25 %	0 %	407708706
535	NC_018694	CTTT	2	8	23520	23527	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
536	NC_018694	TA	3	6	23560	23565	50 %	50 %	0 %	0 %	407708707
537	NC_018694	ACT	2	6	23694	23699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708707
538	NC_018694	TTA	2	6	23781	23786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708707
539	NC_018694	CTA	2	6	23808	23813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708707
540	NC_018694	CAT	2	6	23836	23841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708707
541	NC_018694	TAA	2	6	23842	23847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407708707
542	NC_018694	CGTTTT	2	12	23905	23916	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	407708707
543	NC_018694	TAG	2	6	24010	24015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708707
544	NC_018694	ACC	2	6	24080	24085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407708707
545	NC_018694	TAA	2	6	24116	24121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407708707
546	NC_018694	ATA	2	6	24135	24140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407708707
547	NC_018694	CATT	2	8	24148	24155	25 %	50 %	0 %	25 %	407708707
548	NC_018694	A	6	6	24158	24163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_018694	CTT	2	6	24271	24276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_018694	TA	3	6	24311	24316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_018694	AAT	2	6	24317	24322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_018694	AAATT	2	10	24373	24382	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_018694	ATT	2	6	24396	24401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_018694	T	6	6	24412	24417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_018694	TTA	2	6	24423	24428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_018694	TGAT	2	8	24445	24452	25 %	50 %	25 %	0 %	407708708
557	NC_018694	TA	3	6	24455	24460	50 %	50 %	0 %	0 %	407708708
558	NC_018694	TAAA	2	8	24464	24471	75 %	25 %	0 %	0 %	407708708
559	NC_018694	TGATA	2	10	24480	24489	40 %	40 %	20 %	0 %	407708708
560	NC_018694	AAT	2	6	24496	24501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407708708
561	NC_018694	AATG	2	8	24523	24530	50 %	25 %	25 %	0 %	407708708
562	NC_018694	AGA	2	6	24579	24584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708708
563	NC_018694	TGA	2	6	24588	24593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708708
564	NC_018694	CT	3	6	24660	24665	0 %	50 %	0 %	50 %	407708708
565	NC_018694	TAA	2	6	24689	24694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407708708
566	NC_018694	ACA	2	6	24742	24747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407708708
567	NC_018694	TGA	2	6	24756	24761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708708
568	NC_018694	TAC	3	9	24772	24780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708708
569	NC_018694	GAA	2	6	24844	24849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708708
570	NC_018694	CAA	2	6	24934	24939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407708708
571	NC_018694	TTA	2	6	24943	24948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708708
572	NC_018694	TAA	2	6	25004	25009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407708708
573	NC_018694	GAA	2	6	25075	25080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708708
574	NC_018694	A	6	6	25108	25113	100 %	0 %	0 %	0 %	407708708
575	NC_018694	CAT	2	6	25345	25350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708708
576	NC_018694	AAC	2	6	25401	25406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407708708
577	NC_018694	ATT	2	6	25424	25429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708708
578	NC_018694	A	6	6	25483	25488	100 %	0 %	0 %	0 %	407708708
579	NC_018694	AAG	2	6	25496	25501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708708
580	NC_018694	AT	3	6	25532	25537	50 %	50 %	0 %	0 %	407708708
581	NC_018694	ATG	2	6	25541	25546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708708
582	NC_018694	A	6	6	25584	25589	100 %	0 %	0 %	0 %	407708708
583	NC_018694	T	6	6	25602	25607	0 %	100 %	0 %	0 %	407708709
584	NC_018694	TGC	2	6	25613	25618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708709
585	NC_018694	ACC	2	6	25766	25771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407708709
586	NC_018694	A	6	6	25833	25838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_018694	T	6	6	25860	25865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_018694	AGC	2	6	25900	25905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407708710
589	NC_018694	GAA	2	6	25908	25913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708710
590	NC_018694	A	6	6	25912	25917	100 %	0 %	0 %	0 %	407708710
591	NC_018694	TTC	2	6	25963	25968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708710
592	NC_018694	TAG	2	6	26073	26078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708710
593	NC_018694	ATC	2	6	26110	26115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_018694	TTTA	2	8	26181	26188	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_018694	TCT	2	6	26203	26208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708711
596	NC_018694	TCA	2	6	26218	26223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708711
597	NC_018694	T	8	8	26286	26293	0 %	100 %	0 %	0 %	407708711
598	NC_018694	CAA	2	6	26321	26326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407708711
599	NC_018694	TTC	2	6	26335	26340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708711
600	NC_018694	GCT	2	6	26396	26401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708711
601	NC_018694	CAA	2	6	26429	26434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407708711
602	NC_018694	AC	3	6	26543	26548	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
603	NC_018694	T	7	7	26562	26568	0 %	100 %	0 %	0 %	407708712
604	NC_018694	TCA	2	6	26572	26577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708712
605	NC_018694	TAC	2	6	26579	26584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708712
606	NC_018694	AATT	2	8	26603	26610	50 %	50 %	0 %	0 %	407708712
607	NC_018694	TCT	2	6	26641	26646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708712
608	NC_018694	AAT	2	6	26652	26657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407708712
609	NC_018694	AAG	2	6	26665	26670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708712
610	NC_018694	CCA	2	6	26752	26757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407708712
611	NC_018694	ATTC	2	8	26801	26808	25 %	50 %	0 %	25 %	407708712
612	NC_018694	ATTTG	2	10	26857	26866	20 %	60 %	20 %	0 %	407708712
613	NC_018694	TTC	2	6	26877	26882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708712
614	NC_018694	ATT	2	6	26886	26891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708712
615	NC_018694	ATGT	2	8	26905	26912	25 %	50 %	25 %	0 %	407708712
616	NC_018694	TGT	2	6	26918	26923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407708712
617	NC_018694	T	6	6	26926	26931	0 %	100 %	0 %	0 %	407708712
618	NC_018694	TTC	2	6	26994	26999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708712
619	NC_018694	TTG	2	6	27050	27055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407708712
620	NC_018694	ACC	3	9	27096	27104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407708712
621	NC_018694	CTA	2	6	27110	27115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708712
622	NC_018694	ACT	2	6	27118	27123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708712
623	NC_018694	ATC	2	6	27183	27188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708712
624	NC_018694	T	6	6	27189	27194	0 %	100 %	0 %	0 %	407708712
625	NC_018694	ACA	2	6	27304	27309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407708712
626	NC_018694	ATTTT	2	10	27334	27343	20 %	80 %	0 %	0 %	407708712
627	NC_018694	CAT	2	6	27390	27395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708712
628	NC_018694	ATCAAT	2	12	27405	27416	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407708712
629	NC_018694	ATA	2	6	27450	27455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407708712
630	NC_018694	GCT	2	6	27550	27555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708712
631	NC_018694	CTA	2	6	27560	27565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708712
632	NC_018694	TTC	2	6	27576	27581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708712
633	NC_018694	TTC	2	6	27610	27615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708712
634	NC_018694	TTG	2	6	27689	27694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407708712
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