MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 chromosome

Total Repeats: 4946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018693	ATATT	2	10	704	713	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018693	AAGGG	2	10	2371	2380	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018693	ATTTA	2	10	4709	4718	40 %	60 %	0 %	0 %	407703240
4	NC_018693	ATATA	2	10	5335	5344	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018693	ATTTT	2	10	5433	5442	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018693	GAAAT	2	10	5910	5919	60 %	20 %	20 %	0 %	407703241
7	NC_018693	TCGAA	2	10	7165	7174	40 %	20 %	20 %	20 %	407703242
8	NC_018693	ATTGT	2	10	7989	7998	20 %	60 %	20 %	0 %	407703243
9	NC_018693	AGAAA	2	10	8042	8051	80 %	0 %	20 %	0 %	407703243
10	NC_018693	AAACA	2	10	8993	9002	80 %	0 %	0 %	20 %	407703244
11	NC_018693	CTTTT	2	10	14221	14230	0 %	80 %	0 %	20 %	407703251
12	NC_018693	TGTTA	2	10	15102	15111	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018693	AATGG	2	10	16222	16231	40 %	20 %	40 %	0 %	407703254
14	NC_018693	ATTTC	2	10	18297	18306	20 %	60 %	0 %	20 %	407703255
15	NC_018693	CGTTC	2	10	19024	19033	0 %	40 %	20 %	40 %	407703255
16	NC_018693	ATTTT	2	10	20259	20268	20 %	80 %	0 %	0 %	407703257
17	NC_018693	GAAAT	2	10	22551	22560	60 %	20 %	20 %	0 %	407703259
18	NC_018693	GGTTG	2	10	23416	23425	0 %	40 %	60 %	0 %	407703260
19	NC_018693	TCTTT	2	10	24099	24108	0 %	80 %	0 %	20 %	407703262
20	NC_018693	AAGGA	2	10	26751	26760	60 %	0 %	40 %	0 %	407703264
21	NC_018693	TGGAA	2	10	37866	37875	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018693	ATATT	2	10	38234	38243	40 %	60 %	0 %	0 %	407703277
23	NC_018693	GAAAA	2	10	40096	40105	80 %	0 %	20 %	0 %	407703279
24	NC_018693	GGGCT	2	10	40335	40344	0 %	20 %	60 %	20 %	407703279
25	NC_018693	ATGAA	2	10	41207	41216	60 %	20 %	20 %	0 %	407703280
26	NC_018693	TAAAA	2	10	43768	43777	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018693	AAATT	2	10	44561	44570	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018693	TTACG	2	10	45058	45067	20 %	40 %	20 %	20 %	407703284
29	NC_018693	AAGGA	2	10	49294	49303	60 %	0 %	40 %	0 %	407703289
30	NC_018693	AGGGA	2	10	49402	49411	40 %	0 %	60 %	0 %	407703290
31	NC_018693	TTAGG	2	10	49433	49442	20 %	40 %	40 %	0 %	407703290
32	NC_018693	TGATA	2	10	50941	50950	40 %	40 %	20 %	0 %	407703292
33	NC_018693	ATGTT	2	10	51457	51466	20 %	60 %	20 %	0 %	407703293
34	NC_018693	AGAAT	2	10	52845	52854	60 %	20 %	20 %	0 %	407703294
35	NC_018693	GAGAA	2	10	54098	54107	60 %	0 %	40 %	0 %	407703295
36	NC_018693	CATTT	2	10	54573	54582	20 %	60 %	0 %	20 %	407703296
37	NC_018693	CGTTA	2	10	55059	55068	20 %	40 %	20 %	20 %	407703296
38	NC_018693	ATTCC	2	10	57205	57214	20 %	40 %	0 %	40 %	407703299
39	NC_018693	TGTAA	2	10	57670	57679	40 %	40 %	20 %	0 %	407703300
40	NC_018693	CGGTG	2	10	57827	57836	0 %	20 %	60 %	20 %	407703300
41	NC_018693	AATAA	2	10	57944	57953	80 %	20 %	0 %	0 %	407703300
42	NC_018693	TCTTT	2	10	58999	59008	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018693	TCATT	2	10	59767	59776	20 %	60 %	0 %	20 %	407703301
44	NC_018693	AATCG	2	10	60620	60629	40 %	20 %	20 %	20 %	407703302
45	NC_018693	AAAAG	2	10	61684	61693	80 %	0 %	20 %	0 %	407703302
46	NC_018693	ATTCC	2	10	63409	63418	20 %	40 %	0 %	40 %	407703305
47	NC_018693	AGGAG	2	10	64473	64482	40 %	0 %	60 %	0 %	407703305
48	NC_018693	CGAAA	2	10	67634	67643	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_018693	ATTTT	2	10	68726	68735	20 %	80 %	0 %	0 %	407703309
50	NC_018693	TTTCA	2	10	70414	70423	20 %	60 %	0 %	20 %	407703311
51	NC_018693	ATTAT	2	10	71165	71174	40 %	60 %	0 %	0 %	407703312
52	NC_018693	GTAAT	2	10	74141	74150	40 %	40 %	20 %	0 %	407703315
53	NC_018693	ATAAA	2	10	75636	75645	80 %	20 %	0 %	0 %	407703316
54	NC_018693	TATGG	2	10	76414	76423	20 %	40 %	40 %	0 %	407703318
55	NC_018693	GTATT	2	10	76481	76490	20 %	60 %	20 %	0 %	407703319
56	NC_018693	TAAAT	2	10	77160	77169	60 %	40 %	0 %	0 %	407703320
57	NC_018693	CAGCT	2	10	78288	78297	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_018693	AAGAA	2	10	81176	81185	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018693	GAAGA	2	10	81567	81576	60 %	0 %	40 %	0 %	407703327
60	NC_018693	GGAAT	2	10	81897	81906	40 %	20 %	40 %	0 %	407703327
61	NC_018693	AAATT	2	10	82411	82420	60 %	40 %	0 %	0 %	407703327
62	NC_018693	ACAGC	2	10	84657	84666	40 %	0 %	20 %	40 %	407703330
63	NC_018693	ATGCA	2	10	84953	84962	40 %	20 %	20 %	20 %	407703330
64	NC_018693	GAATG	2	10	85187	85196	40 %	20 %	40 %	0 %	407703330
65	NC_018693	TTATT	2	10	86202	86211	20 %	80 %	0 %	0 %	407703331
66	NC_018693	TTATT	2	10	86671	86680	20 %	80 %	0 %	0 %	407703331
67	NC_018693	AGATG	2	10	88962	88971	40 %	20 %	40 %	0 %	407703334
68	NC_018693	AAAGT	2	10	89944	89953	60 %	20 %	20 %	0 %	407703335
69	NC_018693	GGGCG	2	10	90468	90477	0 %	0 %	80 %	20 %	407703335
70	NC_018693	CGTAA	2	10	90888	90897	40 %	20 %	20 %	20 %	407703335
71	NC_018693	AAATG	2	10	91418	91427	60 %	20 %	20 %	0 %	407703336
72	NC_018693	AACAA	2	10	92446	92455	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_018693	AATGA	2	10	92944	92953	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018693	TTTTC	2	10	94780	94789	0 %	80 %	0 %	20 %	407703341
75	NC_018693	CCATA	2	10	94796	94805	40 %	20 %	0 %	40 %	407703341
76	NC_018693	TTTCG	2	10	95058	95067	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018693	TATTT	2	10	96778	96787	20 %	80 %	0 %	0 %	407703344
78	NC_018693	AAAAT	2	10	97537	97546	80 %	20 %	0 %	0 %	407703345
79	NC_018693	GCTCA	2	10	101459	101468	20 %	20 %	20 %	40 %	407703351
80	NC_018693	GCAGC	2	10	103229	103238	20 %	0 %	40 %	40 %	407703353
81	NC_018693	ATGTA	2	10	104621	104630	40 %	40 %	20 %	0 %	407703355
82	NC_018693	ATTTT	2	10	104943	104952	20 %	80 %	0 %	0 %	407703356
83	NC_018693	GGTCT	2	10	106953	106962	0 %	40 %	40 %	20 %	407703357
84	NC_018693	GAAGG	2	10	107852	107861	40 %	0 %	60 %	0 %	407703357
85	NC_018693	TTATA	2	10	108935	108944	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018693	TTAAT	2	10	109036	109045	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018693	CATTT	2	10	110641	110650	20 %	60 %	0 %	20 %	407703361
88	NC_018693	GGAAG	2	10	110863	110872	40 %	0 %	60 %	0 %	407703361
89	NC_018693	TAACG	2	10	111304	111313	40 %	20 %	20 %	20 %	407703361
90	NC_018693	TAATA	2	10	111394	111403	60 %	40 %	0 %	0 %	407703361
91	NC_018693	CATAC	2	10	111587	111596	40 %	20 %	0 %	40 %	407703361
92	NC_018693	AGAGA	2	10	111933	111942	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018693	AAACG	2	10	112036	112045	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_018693	ATTAA	2	10	112221	112230	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018693	AAATG	2	10	114780	114789	60 %	20 %	20 %	0 %	407703364
96	NC_018693	TGGAT	2	10	116588	116597	20 %	40 %	40 %	0 %	407703365
97	NC_018693	AAAAT	2	10	118082	118091	80 %	20 %	0 %	0 %	407703366
98	NC_018693	CGAAG	2	10	123218	123227	40 %	0 %	40 %	20 %	407703372
99	NC_018693	TGTAT	2	10	124692	124701	20 %	60 %	20 %	0 %	407703373
100	NC_018693	TTTTA	2	10	125847	125856	20 %	80 %	0 %	0 %	407703374
101	NC_018693	GAATT	2	10	125864	125873	40 %	40 %	20 %	0 %	407703374
102	NC_018693	ACTTA	2	10	125946	125955	40 %	40 %	0 %	20 %	407703374
103	NC_018693	ATATG	2	10	128668	128677	40 %	40 %	20 %	0 %	407703376
104	NC_018693	ACCAA	2	10	128902	128911	60 %	0 %	0 %	40 %	407703376
105	NC_018693	TAAAT	2	10	130711	130720	60 %	40 %	0 %	0 %	407703378
106	NC_018693	GAAAA	2	10	131173	131182	80 %	0 %	20 %	0 %	407703379
107	NC_018693	GAAGA	2	10	131333	131342	60 %	0 %	40 %	0 %	407703379
108	NC_018693	AAATG	2	10	131725	131734	60 %	20 %	20 %	0 %	407703379
109	NC_018693	AGTTC	2	10	133850	133859	20 %	40 %	20 %	20 %	407703380
110	NC_018693	TTAAA	2	10	135348	135357	60 %	40 %	0 %	0 %	407703380
111	NC_018693	AAACG	2	10	135867	135876	60 %	0 %	20 %	20 %	407703380
112	NC_018693	AACAA	2	10	136030	136039	80 %	0 %	0 %	20 %	407703380
113	NC_018693	TTAAA	2	10	136437	136446	60 %	40 %	0 %	0 %	407703380
114	NC_018693	TTAAA	2	10	136977	136986	60 %	40 %	0 %	0 %	407703380
115	NC_018693	AAATA	2	10	137782	137791	80 %	20 %	0 %	0 %	407703380
116	NC_018693	ACAAA	2	10	139489	139498	80 %	0 %	0 %	20 %	407703381
117	NC_018693	TAGTT	2	10	143115	143124	20 %	60 %	20 %	0 %	407703384
118	NC_018693	GCGAA	2	10	148308	148317	40 %	0 %	40 %	20 %	407703390
119	NC_018693	TAATT	2	10	148945	148954	40 %	60 %	0 %	0 %	407703390
120	NC_018693	AAAAT	2	10	150279	150288	80 %	20 %	0 %	0 %	407703392
121	NC_018693	TTATT	2	10	151941	151950	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018693	AAAAG	2	10	153628	153637	80 %	0 %	20 %	0 %	407703396
123	NC_018693	ATTTA	2	10	154242	154251	40 %	60 %	0 %	0 %	407703396
124	NC_018693	TTGGC	2	10	157156	157165	0 %	40 %	40 %	20 %	407703398
125	NC_018693	TCGAT	2	10	158090	158099	20 %	40 %	20 %	20 %	407703399
126	NC_018693	CTTAT	2	10	158288	158297	20 %	60 %	0 %	20 %	407703399
127	NC_018693	ACATT	2	10	158689	158698	40 %	40 %	0 %	20 %	407703399
128	NC_018693	AAAAC	2	10	158832	158841	80 %	0 %	0 %	20 %	407703399
129	NC_018693	ATTAC	2	10	160051	160060	40 %	40 %	0 %	20 %	407703400
130	NC_018693	GCAGA	2	10	161415	161424	40 %	0 %	40 %	20 %	407703402
131	NC_018693	AACGA	2	10	161637	161646	60 %	0 %	20 %	20 %	407703402
132	NC_018693	AGAAA	2	10	162409	162418	80 %	0 %	20 %	0 %	407703403
133	NC_018693	TCATT	2	10	164646	164655	20 %	60 %	0 %	20 %	407703406
134	NC_018693	AATTC	2	10	164729	164738	40 %	40 %	0 %	20 %	407703406
135	NC_018693	CACTC	2	10	166707	166716	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
136	NC_018693	GAAGT	2	10	168030	168039	40 %	20 %	40 %	0 %	407703411
137	NC_018693	TGTGC	2	10	168814	168823	0 %	40 %	40 %	20 %	407703412
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