MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC429

Total Repeats: 199

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018689	ATAATT	2	12	727	738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018689	TTGAAG	2	12	3015	3026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702827
3	NC_018689	GAACCA	2	12	8257	8268	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407702831
4	NC_018689	GATAGA	2	12	13000	13011	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018689	TAATTT	2	12	18386	18397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018689	TTTAAT	2	12	24527	24538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018689	TGGGAT	2	12	25350	25361	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407702847
8	NC_018689	TTTTTC	2	12	26286	26297	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407702848
9	NC_018689	TATTTA	2	12	26908	26919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702848
10	NC_018689	AAAGAT	2	12	28727	28738	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407702851
11	NC_018689	AATATC	2	12	29352	29363	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407702851
12	NC_018689	ACAGTT	2	12	40757	40768	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407702861
13	NC_018689	GGAACA	2	12	42232	42243	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018689	ATAAAA	2	12	44709	44720	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407702863
15	NC_018689	TGAAAT	2	12	46317	46328	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407702864
16	NC_018689	ATTTTT	2	12	47015	47026	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407702865
17	NC_018689	AATAGT	2	12	50981	50992	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018689	AATATC	2	12	56382	56393	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407702877
19	NC_018689	TAATTA	2	12	58698	58709	50 %	50 %	0 %	0 %	407702878
20	NC_018689	AAATGT	2	12	61240	61251	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407702880
21	NC_018689	TATATT	2	12	61815	61826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018689	AATTTA	2	12	64214	64225	50 %	50 %	0 %	0 %	407702881
23	NC_018689	AAATAC	2	12	69103	69114	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018689	GTTTTT	2	12	71130	71141	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018689	CCGAAT	2	12	71615	71626	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407702887
26	NC_018689	GCTTTG	2	12	72208	72219	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407702887
27	NC_018689	GTTAAA	2	12	76397	76408	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407702891
28	NC_018689	AAGAGA	2	12	77815	77826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702892
29	NC_018689	GAATTT	2	12	80150	80161	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702894
30	NC_018689	AGAAAA	2	12	81394	81405	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407702895
31	NC_018689	TAGATG	2	12	82303	82314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702897
32	NC_018689	TACAAA	2	12	82938	82949	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018689	ATAAAG	2	12	86097	86108	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407702901
34	NC_018689	TGATAT	2	12	90049	90060	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702905
35	NC_018689	ATACCT	2	12	91221	91232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702906
36	NC_018689	TTTTAA	2	12	96681	96692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018689	TGATAA	2	12	103391	103402	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018689	TATCAT	2	12	103433	103444	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018689	CATTTA	2	12	104441	104452	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407702917
40	NC_018689	TACGTT	2	12	104650	104661	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407702918
41	NC_018689	ACTATT	2	12	106817	106828	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407702920
42	NC_018689	TTTATT	2	12	110015	110026	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407702925
43	NC_018689	CAGGTG	2	12	111795	111806	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407702928
44	NC_018689	AAATAC	2	12	112445	112456	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018689	AGAAAT	2	12	117019	117030	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407702933
46	NC_018689	GCGAAA	2	12	118734	118745	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407702935
47	NC_018689	AAAATC	2	12	119707	119718	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407702937
48	NC_018689	GGGTAT	2	12	119879	119890	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407702937
49	NC_018689	GAATAT	2	12	122389	122400	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018689	GGAAAA	2	12	125019	125030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702941
51	NC_018689	TATTAA	2	12	125596	125607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018689	AGCTAG	2	12	126617	126628	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_018689	TTCAAT	2	12	126786	126797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_018689	ATTTTT	2	12	130152	130163	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018689	GCAAGT	2	12	138780	138791	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407702955
56	NC_018689	ACATTA	2	12	139482	139493	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_018689	TTTACT	2	12	140064	140075	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407702956
58	NC_018689	TTTCAT	2	12	141959	141970	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407702959
59	NC_018689	CCTACT	2	12	142432	142443	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	407702959
60	NC_018689	CTTTTA	2	12	143883	143894	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_018689	CAAGTC	2	12	144518	144529	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407702961
62	NC_018689	ACCAGA	2	12	149448	149459	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018689	TCATAC	2	12	152025	152036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018689	ACTTAA	2	12	156539	156550	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_018689	AAAGTA	2	12	157806	157817	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407702968
66	NC_018689	TCATTT	2	12	158515	158526	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407702968
67	NC_018689	AACAAA	2	12	163336	163347	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	407702972
68	NC_018689	AAAAAT	2	12	163348	163359	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407702972
69	NC_018689	TAAAAA	2	12	164693	164704	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018689	TTTTCA	2	12	168520	168531	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407702976
71	NC_018689	TTTTTA	2	12	173689	173700	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407702980
72	NC_018689	AAAGCA	2	12	175338	175349	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407702981
73	NC_018689	GGAAGA	2	12	175686	175697	50 %	0 %	50 %	0 %	407702981
74	NC_018689	ATCTTC	2	12	181480	181491	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407702986
75	NC_018689	TGTATT	2	12	181702	181713	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018689	ACGTAT	2	12	186338	186349	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407702990
77	NC_018689	CTTATT	2	12	190434	190445	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407702994
78	NC_018689	GAACAA	2	12	191916	191927	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407702995
79	NC_018689	GGTAAT	2	12	194342	194353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018689	TTTGAC	2	12	195584	195595	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407702999
81	NC_018689	TCGAAA	2	12	197774	197785	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407703000
82	NC_018689	ATTTTA	2	12	198821	198832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018689	TACTTG	2	12	202140	202151	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407703003
84	NC_018689	TAATTA	2	12	203746	203757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018689	AAATCC	2	12	206591	206602	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407703006
86	NC_018689	TAACCA	2	12	207051	207062	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407703006
87	NC_018689	ACAAAT	2	12	207399	207410	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407703006
88	NC_018689	ATTTAA	2	12	210341	210352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018689	TATATC	2	12	214056	214067	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_018689	TAAAAG	2	12	214276	214287	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407703012
91	NC_018689	TTAAGT	2	12	214593	214604	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018689	TAATTA	2	12	214788	214799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018689	ATAAAA	2	12	215808	215819	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407703013
94	NC_018689	TATAAA	2	12	216118	216129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407703013
95	NC_018689	CTTGTG	2	12	216848	216859	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_018689	TAAATT	2	12	217436	217447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018689	TTTCAT	2	12	221842	221853	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407703017
98	NC_018689	TCCAAT	2	12	222056	222067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407703017
99	NC_018689	TACAAG	2	12	223498	223509	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407703019
100	NC_018689	TTTATT	2	12	223829	223840	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407703019
101	NC_018689	TAAAAA	2	12	225960	225971	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018689	ACTTAT	2	12	226084	226095	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407703021
103	NC_018689	CCATCA	2	12	227552	227563	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_018689	TGTAGT	2	12	229490	229501	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407703022
105	NC_018689	ATATAA	2	12	231747	231758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018689	TCTCAC	2	12	232973	232984	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_018689	CGAGAC	2	12	233133	233144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018689	TTTAAT	2	12	233201	233212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018689	TTGCTT	2	12	233904	233915	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	407703025
110	NC_018689	ATTATG	2	12	235725	235736	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018689	TTTAAT	2	12	235889	235900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018689	TTTAAT	2	12	237404	237415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018689	CTTCCT	2	12	241181	241192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_018689	CTTCCT	2	12	242269	242280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_018689	TTTAAT	2	12	243842	243853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018689	CAAGGA	2	12	245044	245055	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_018689	TTAGAT	2	12	247380	247391	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407703040
118	NC_018689	TATCTT	3	18	249735	249752	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407703042
119	NC_018689	ACTTTT	2	12	253148	253159	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407703047
120	NC_018689	CTGGAA	2	12	257690	257701	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407703055
121	NC_018689	GGTAAT	2	12	258632	258643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703056
122	NC_018689	GTTACT	2	12	261755	261766	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407703060
123	NC_018689	GTTACT	2	12	261998	262009	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407703060
124	NC_018689	GCTTCT	2	12	263920	263931	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407703061
125	NC_018689	GCTTCT	2	12	264304	264315	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407703061
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.