MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC429

Total Repeats: 487

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018689	CTTTT	2	10	237	246	0 %	80 %	0 %	20 %	407702825
2	NC_018689	GGAAA	2	10	2297	2306	60 %	0 %	40 %	0 %	407702827
3	NC_018689	GAGAA	2	10	3027	3036	60 %	0 %	40 %	0 %	407702827
4	NC_018689	ATGAA	2	10	3117	3126	60 %	20 %	20 %	0 %	407702827
5	NC_018689	GCTAA	2	10	4443	4452	40 %	20 %	20 %	20 %	407702828
6	NC_018689	AAATC	2	10	4994	5003	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_018689	TGTTT	2	10	8689	8698	0 %	80 %	20 %	0 %	407702831
8	NC_018689	AATAA	2	10	8860	8869	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018689	GAAAA	2	10	9051	9060	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018689	GCGAT	2	10	11215	11224	20 %	20 %	40 %	20 %	407702833
11	NC_018689	TACAT	2	10	11384	11393	40 %	40 %	0 %	20 %	407702834
12	NC_018689	TCAGG	2	10	14193	14202	20 %	20 %	40 %	20 %	407702835
13	NC_018689	AGTAA	2	10	14922	14931	60 %	20 %	20 %	0 %	407702835
14	NC_018689	GAAGT	2	10	15213	15222	40 %	20 %	40 %	0 %	407702836
15	NC_018689	ATGGA	2	10	17246	17255	40 %	20 %	40 %	0 %	407702838
16	NC_018689	CAGCG	2	10	17459	17468	20 %	0 %	40 %	40 %	407702838
17	NC_018689	TTTAG	2	10	18142	18151	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018689	ATAAA	2	10	18217	18226	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018689	TATTT	2	10	18894	18903	20 %	80 %	0 %	0 %	407702840
20	NC_018689	ATTTT	2	10	19190	19199	20 %	80 %	0 %	0 %	407702840
21	NC_018689	GGTAT	2	10	20530	20539	20 %	40 %	40 %	0 %	407702842
22	NC_018689	TAAAG	2	10	22270	22279	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018689	GATTG	2	10	22386	22395	20 %	40 %	40 %	0 %	407702844
24	NC_018689	ATAGA	2	10	23052	23061	60 %	20 %	20 %	0 %	407702845
25	NC_018689	TTTGA	2	10	23842	23851	20 %	60 %	20 %	0 %	407702846
26	NC_018689	ACTTA	2	10	25175	25184	40 %	40 %	0 %	20 %	407702847
27	NC_018689	ATTTA	2	10	25777	25786	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018689	CTTTT	2	10	26496	26505	0 %	80 %	0 %	20 %	407702848
29	NC_018689	CTTTT	2	10	26511	26520	0 %	80 %	0 %	20 %	407702848
30	NC_018689	TTACT	2	10	27245	27254	20 %	60 %	0 %	20 %	407702849
31	NC_018689	AACAA	2	10	28444	28453	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_018689	TATGT	2	10	28457	28466	20 %	60 %	20 %	0 %	407702851
33	NC_018689	AAAAT	2	10	29642	29651	80 %	20 %	0 %	0 %	407702851
34	NC_018689	GAAAA	2	10	30928	30937	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018689	AATGA	2	10	31035	31044	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018689	TGAAT	2	10	31098	31107	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018689	AAGGA	2	10	31304	31313	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018689	ATTTT	2	10	31453	31462	20 %	80 %	0 %	0 %	407702852
39	NC_018689	AATGA	2	10	32957	32966	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018689	GCAAA	2	10	34832	34841	60 %	0 %	20 %	20 %	407702856
41	NC_018689	CAAAA	2	10	35628	35637	80 %	0 %	0 %	20 %	407702856
42	NC_018689	ACAAA	2	10	36026	36035	80 %	0 %	0 %	20 %	407702856
43	NC_018689	ATGGT	2	10	36084	36093	20 %	40 %	40 %	0 %	407702856
44	NC_018689	ATTTT	2	10	41122	41131	20 %	80 %	0 %	0 %	407702861
45	NC_018689	CAACC	2	10	41470	41479	40 %	0 %	0 %	60 %	407702861
46	NC_018689	AAGTG	2	10	42906	42915	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018689	TGCAT	2	10	44398	44407	20 %	40 %	20 %	20 %	407702863
48	NC_018689	AACAA	2	10	44579	44588	80 %	0 %	0 %	20 %	407702863
49	NC_018689	TTTTA	2	10	46094	46103	20 %	80 %	0 %	0 %	407702864
50	NC_018689	AGTAC	2	10	46640	46649	40 %	20 %	20 %	20 %	407702865
51	NC_018689	AGAAA	2	10	47558	47567	80 %	0 %	20 %	0 %	407702866
52	NC_018689	CGTAT	2	10	49513	49522	20 %	40 %	20 %	20 %	407702869
53	NC_018689	TAAAA	2	10	49667	49676	80 %	20 %	0 %	0 %	407702869
54	NC_018689	GTAGC	2	10	51563	51572	20 %	20 %	40 %	20 %	407702871
55	NC_018689	TAATT	2	10	52599	52608	40 %	60 %	0 %	0 %	407702872
56	NC_018689	TTAAA	2	10	53200	53209	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018689	AGATT	2	10	53261	53270	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018689	TCGTT	2	10	54016	54025	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_018689	AAGTA	2	10	55423	55432	60 %	20 %	20 %	0 %	407702876
60	NC_018689	TTATT	2	10	57714	57723	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018689	TATTT	2	10	57951	57960	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018689	GAAAA	2	10	58026	58035	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018689	TAACA	2	10	59624	59633	60 %	20 %	0 %	20 %	407702879
64	NC_018689	TTTTC	2	10	60875	60884	0 %	80 %	0 %	20 %	407702880
65	NC_018689	AAAAT	2	10	61734	61743	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018689	ATATA	2	10	62327	62336	60 %	40 %	0 %	0 %	407702881
67	NC_018689	TAATT	2	10	65209	65218	40 %	60 %	0 %	0 %	407702882
68	NC_018689	AGAGA	2	10	66970	66979	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018689	AAGTA	2	10	66988	66997	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018689	AAAAT	2	10	67209	67218	80 %	20 %	0 %	0 %	407702884
71	NC_018689	TGAAC	2	10	67521	67530	40 %	20 %	20 %	20 %	407702885
72	NC_018689	TAAAT	2	10	68199	68208	60 %	40 %	0 %	0 %	407702885
73	NC_018689	TAAGC	2	10	68367	68376	40 %	20 %	20 %	20 %	407702885
74	NC_018689	AAAAC	2	10	70017	70026	80 %	0 %	0 %	20 %	407702886
75	NC_018689	GAAAA	2	10	70215	70224	80 %	0 %	20 %	0 %	407702886
76	NC_018689	CTATC	2	10	71314	71323	20 %	40 %	0 %	40 %	407702887
77	NC_018689	TTTTG	2	10	72494	72503	0 %	80 %	20 %	0 %	407702887
78	NC_018689	CATGG	2	10	73359	73368	20 %	20 %	40 %	20 %	407702888
79	NC_018689	TCCTT	2	10	73963	73972	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_018689	CTTCT	2	10	74577	74586	0 %	60 %	0 %	40 %	407702889
81	NC_018689	TTGTT	2	10	74917	74926	0 %	80 %	20 %	0 %	407702889
82	NC_018689	CTAAT	2	10	75896	75905	40 %	40 %	0 %	20 %	407702890
83	NC_018689	TGAAA	2	10	78440	78449	60 %	20 %	20 %	0 %	407702893
84	NC_018689	ATTGG	2	10	78549	78558	20 %	40 %	40 %	0 %	407702893
85	NC_018689	CAAAT	2	10	78802	78811	60 %	20 %	0 %	20 %	407702893
86	NC_018689	TCAAT	2	10	81055	81064	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_018689	AAGAA	2	10	81613	81622	80 %	0 %	20 %	0 %	407702895
88	NC_018689	TCATT	2	10	82081	82090	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_018689	CTTTT	2	10	84304	84313	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_018689	TTAGA	2	10	85065	85074	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018689	TTTTA	2	10	85441	85450	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018689	TAATT	2	10	85579	85588	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018689	AAATG	2	10	85735	85744	60 %	20 %	20 %	0 %	407702901
94	NC_018689	TACCT	2	10	86021	86030	20 %	40 %	0 %	40 %	407702901
95	NC_018689	ATTTA	2	10	88789	88798	40 %	60 %	0 %	0 %	407702903
96	NC_018689	AATAG	2	10	89944	89953	60 %	20 %	20 %	0 %	407702904
97	NC_018689	TTCAA	2	10	90193	90202	40 %	40 %	0 %	20 %	407702905
98	NC_018689	TATTG	2	10	91250	91259	20 %	60 %	20 %	0 %	407702906
99	NC_018689	TTAAT	2	10	92033	92042	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018689	TTAAT	2	10	92134	92143	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018689	TTATG	2	10	92374	92383	20 %	60 %	20 %	0 %	407702907
102	NC_018689	AGAAA	2	10	92595	92604	80 %	0 %	20 %	0 %	407702907
103	NC_018689	ATGGG	2	10	93130	93139	20 %	20 %	60 %	0 %	407702907
104	NC_018689	TTTTA	2	10	93544	93553	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018689	CTTTT	2	10	93893	93902	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_018689	TCCCT	2	10	94206	94215	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
107	NC_018689	AAAGT	2	10	97539	97548	60 %	20 %	20 %	0 %	407702910
108	NC_018689	TAATA	2	10	97885	97894	60 %	40 %	0 %	0 %	407702911
109	NC_018689	CCCTT	2	10	101051	101060	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
110	NC_018689	AAAAT	2	10	102698	102707	80 %	20 %	0 %	0 %	407702914
111	NC_018689	CTTTT	3	15	104763	104777	0 %	80 %	0 %	20 %	407702918
112	NC_018689	TTTTC	2	10	105006	105015	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_018689	TCCAA	2	10	105641	105650	40 %	20 %	0 %	40 %	407702919
114	NC_018689	ACGAT	2	10	106205	106214	40 %	20 %	20 %	20 %	407702920
115	NC_018689	AAGAT	2	10	107146	107155	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018689	GAATT	2	10	107969	107978	40 %	40 %	20 %	0 %	407702921
117	NC_018689	ACTAT	2	10	108484	108493	40 %	40 %	0 %	20 %	407702922
118	NC_018689	TACTG	2	10	108983	108992	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_018689	GTAAG	2	10	109231	109240	40 %	20 %	40 %	0 %	407702923
120	NC_018689	AGAAT	2	10	109466	109475	60 %	20 %	20 %	0 %	407702923
121	NC_018689	ATAAA	3	15	110427	110441	80 %	20 %	0 %	0 %	407702926
122	NC_018689	AAATA	2	10	110972	110981	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018689	CTTTT	2	10	112627	112636	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_018689	TGAAG	2	10	112704	112713	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018689	TCACA	2	10	113788	113797	40 %	20 %	0 %	40 %	407702930
126	NC_018689	ATTAT	2	10	114498	114507	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018689	TCGTT	2	10	114856	114865	0 %	60 %	20 %	20 %	407702932
128	NC_018689	TAGAC	2	10	114971	114980	40 %	20 %	20 %	20 %	407702932
129	NC_018689	AGTGA	2	10	115521	115530	40 %	20 %	40 %	0 %	407702932
130	NC_018689	ATCGT	2	10	115883	115892	20 %	40 %	20 %	20 %	407702932
131	NC_018689	GGACC	2	10	116132	116141	20 %	0 %	40 %	40 %	407702932
132	NC_018689	AAGAA	2	10	118154	118163	80 %	0 %	20 %	0 %	407702935
133	NC_018689	AAAGA	2	10	119897	119906	80 %	0 %	20 %	0 %	407702937
134	NC_018689	CCTTA	2	10	120070	120079	20 %	40 %	0 %	40 %	407702937
135	NC_018689	AAACA	2	10	122090	122099	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_018689	TGATA	2	10	124288	124297	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018689	GCATG	2	10	124441	124450	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_018689	TGAAT	2	10	125432	125441	40 %	40 %	20 %	0 %	407702941
139	NC_018689	TTTTA	2	10	128482	128491	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018689	TGATA	2	10	128761	128770	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018689	ATAGA	2	10	130136	130145	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018689	AACAA	2	10	131375	131384	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_018689	ATAGA	2	10	131495	131504	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018689	AAAGA	2	10	131967	131976	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018689	AAAAT	2	10	133496	133505	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_018689	TAAAT	2	10	136189	136198	60 %	40 %	0 %	0 %	407702952
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185	NC_018689	ATTTT	2	10	173535	173544	20 %	80 %	0 %	0 %	407702980
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253	NC_018689	AAAGA	2	10	242246	242255	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
254	NC_018689	ATATA	2	10	242363	242372	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_018689	ATTAA	2	10	250984	250993	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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264	NC_018689	TTCTT	2	10	252128	252137	0 %	80 %	0 %	20 %	407703045
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272	NC_018689	TCTTT	2	10	257409	257418	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
273	NC_018689	GAAGA	2	10	258079	258088	60 %	0 %	40 %	0 %	407703055
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