MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC429

Total Repeats: 10678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018689	CTT	2	6	20646	20651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702842
502	NC_018689	TTC	2	6	20679	20684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702842
503	NC_018689	TAC	2	6	20793	20798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702842
504	NC_018689	CAT	2	6	20876	20881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702842
505	NC_018689	TTC	2	6	20901	20906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702842
506	NC_018689	GT	3	6	20919	20924	0 %	50 %	50 %	0 %	407702842
507	NC_018689	ATA	3	9	20976	20984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702842
508	NC_018689	AAT	2	6	21101	21106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702842
509	NC_018689	AT	3	6	21162	21167	50 %	50 %	0 %	0 %	407702842
510	NC_018689	CTT	2	6	21176	21181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702842
511	NC_018689	TTC	2	6	21201	21206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702842
512	NC_018689	TAA	2	6	21219	21224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702842
513	NC_018689	TTA	2	6	21238	21243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702842
514	NC_018689	T	6	6	21245	21250	0 %	100 %	0 %	0 %	407702842
515	NC_018689	ATA	2	6	21262	21267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702842
516	NC_018689	ATA	2	6	21298	21303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_018689	T	7	7	21336	21342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_018689	ATG	2	6	21372	21377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_018689	T	7	7	21434	21440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_018689	TGT	2	6	21452	21457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_018689	CTT	2	6	21468	21473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_018689	TAG	2	6	21495	21500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_018689	AG	3	6	21505	21510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
524	NC_018689	AT	3	6	21536	21541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_018689	TTA	2	6	21547	21552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_018689	AAAT	2	8	21573	21580	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_018689	ATT	2	6	21657	21662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_018689	TAA	2	6	21689	21694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_018689	TAAG	2	8	21706	21713	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
530	NC_018689	ATT	2	6	21725	21730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702843
531	NC_018689	AT	4	8	21733	21740	50 %	50 %	0 %	0 %	407702843
532	NC_018689	AT	4	8	21818	21825	50 %	50 %	0 %	0 %	407702843
533	NC_018689	TGC	2	6	21860	21865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_018689	T	6	6	21867	21872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_018689	AAG	2	6	21898	21903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_018689	ATC	2	6	21906	21911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_018689	ATT	2	6	21927	21932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_018689	GTA	2	6	21954	21959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_018689	ATT	2	6	21970	21975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_018689	ATT	2	6	22072	22077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_018689	T	6	6	22103	22108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_018689	TTC	2	6	22206	22211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_018689	GAT	2	6	22224	22229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_018689	TA	3	6	22262	22267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_018689	TAAAG	2	10	22270	22279	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
546	NC_018689	G	6	6	22279	22284	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
547	NC_018689	GAG	2	6	22302	22307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407702844
548	NC_018689	CAAA	2	8	22341	22348	75 %	0 %	0 %	25 %	407702844
549	NC_018689	GATTG	2	10	22386	22395	20 %	40 %	40 %	0 %	407702844
550	NC_018689	GGC	2	6	22422	22427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407702844
551	NC_018689	TAA	2	6	22435	22440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702844
552	NC_018689	T	6	6	22491	22496	0 %	100 %	0 %	0 %	407702844
553	NC_018689	TTCT	2	8	22513	22520	0 %	75 %	0 %	25 %	407702844
554	NC_018689	GTA	2	6	22521	22526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702844
555	NC_018689	ATT	2	6	22538	22543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702844
556	NC_018689	CTT	2	6	22555	22560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702844
557	NC_018689	A	7	7	22584	22590	100 %	0 %	0 %	0 %	407702844
558	NC_018689	TA	3	6	22595	22600	50 %	50 %	0 %	0 %	407702844
559	NC_018689	TAA	2	6	22633	22638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702844
560	NC_018689	ACA	2	6	22662	22667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702844
561	NC_018689	TGG	2	6	22702	22707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407702844
562	NC_018689	TA	3	6	22901	22906	50 %	50 %	0 %	0 %	407702845
563	NC_018689	TGT	2	6	22930	22935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702845
564	NC_018689	AGA	2	6	23041	23046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702845
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566	NC_018689	GGA	2	6	23092	23097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407702845
567	NC_018689	GATT	2	8	23104	23111	25 %	50 %	25 %	0 %	407702845
568	NC_018689	AAG	2	6	23144	23149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702845
569	NC_018689	TA	4	8	23167	23174	50 %	50 %	0 %	0 %	407702845
570	NC_018689	TA	4	8	23183	23190	50 %	50 %	0 %	0 %	407702845
571	NC_018689	GATA	2	8	23202	23209	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
572	NC_018689	CTC	2	6	23211	23216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_018689	GGA	2	6	23259	23264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_018689	T	6	6	23289	23294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_018689	A	6	6	23297	23302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_018689	CA	3	6	23326	23331	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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578	NC_018689	AT	4	8	23401	23408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_018689	GAA	2	6	23528	23533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_018689	TTA	2	6	23557	23562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_018689	T	6	6	23564	23569	0 %	100 %	0 %	0 %	407702846
582	NC_018689	TAA	2	6	23655	23660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702846
583	NC_018689	AAT	2	6	23661	23666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702846
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585	NC_018689	ATT	2	6	23766	23771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702846
586	NC_018689	TTTGA	2	10	23842	23851	20 %	60 %	20 %	0 %	407702846
587	NC_018689	A	6	6	23861	23866	100 %	0 %	0 %	0 %	407702846
588	NC_018689	TA	3	6	23874	23879	50 %	50 %	0 %	0 %	407702846
589	NC_018689	A	6	6	23879	23884	100 %	0 %	0 %	0 %	407702846
590	NC_018689	A	8	8	23895	23902	100 %	0 %	0 %	0 %	407702846
591	NC_018689	ATG	2	6	23908	23913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702846
592	NC_018689	CAT	2	6	23937	23942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702846
593	NC_018689	T	8	8	23952	23959	0 %	100 %	0 %	0 %	407702846
594	NC_018689	CTC	2	6	23981	23986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_018689	TGT	2	6	24067	24072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_018689	T	6	6	24084	24089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_018689	AAT	2	6	24149	24154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_018689	TAT	2	6	24164	24169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_018689	AG	3	6	24254	24259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_018689	CAAA	2	8	24265	24272	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
601	NC_018689	A	6	6	24295	24300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_018689	ATTT	2	8	24343	24350	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_018689	TA	3	6	24506	24511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_018689	TTTAAT	2	12	24527	24538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_018689	GAA	2	6	24596	24601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_018689	AGA	2	6	24630	24635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_018689	AGGA	2	8	24739	24746	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
608	NC_018689	TCT	2	6	24748	24753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_018689	ATAA	2	8	24765	24772	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_018689	GATA	2	8	24873	24880	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
611	NC_018689	TCT	2	6	24909	24914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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613	NC_018689	A	9	9	25026	25034	100 %	0 %	0 %	0 %	407702847
614	NC_018689	TGG	2	6	25079	25084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407702847
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616	NC_018689	AAT	2	6	25122	25127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702847
617	NC_018689	TGC	2	6	25133	25138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407702847
618	NC_018689	CAAC	2	8	25161	25168	50 %	0 %	0 %	50 %	407702847
619	NC_018689	ACTTA	2	10	25175	25184	40 %	40 %	0 %	20 %	407702847
620	NC_018689	TAA	2	6	25228	25233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702847
621	NC_018689	ATG	2	6	25263	25268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702847
622	NC_018689	AGA	2	6	25313	25318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702847
623	NC_018689	TGGGAT	2	12	25350	25361	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407702847
624	NC_018689	A	6	6	25366	25371	100 %	0 %	0 %	0 %	407702847
625	NC_018689	A	6	6	25431	25436	100 %	0 %	0 %	0 %	407702847
626	NC_018689	AAGA	2	8	25600	25607	75 %	0 %	25 %	0 %	407702847
627	NC_018689	TAA	2	6	25659	25664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_018689	TAC	2	6	25679	25684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_018689	ATTTA	2	10	25777	25786	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_018689	A	6	6	25808	25813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_018689	ATT	2	6	25896	25901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702848
632	NC_018689	CAA	2	6	25949	25954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702848
633	NC_018689	TTTC	2	8	26063	26070	0 %	75 %	0 %	25 %	407702848
634	NC_018689	TTTTTC	2	12	26286	26297	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407702848
635	NC_018689	G	6	6	26441	26446	0 %	0 %	100 %	0 %	407702848
636	NC_018689	TTTC	2	8	26454	26461	0 %	75 %	0 %	25 %	407702848
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