MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC319

Total Repeats: 7810

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_018688	TCC	2	6	41577	41582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407702573
1003	NC_018688	A	7	7	41643	41649	100 %	0 %	0 %	0 %	407702573
1004	NC_018688	A	7	7	41659	41665	100 %	0 %	0 %	0 %	407702573
1005	NC_018688	CTTT	2	8	41675	41682	0 %	75 %	0 %	25 %	407702573
1006	NC_018688	AAC	2	6	41721	41726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702573
1007	NC_018688	AGA	2	6	41805	41810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702573
1008	NC_018688	ATT	2	6	41820	41825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702573
1009	NC_018688	CAA	2	6	41857	41862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702573
1010	NC_018688	TC	3	6	41864	41869	0 %	50 %	0 %	50 %	407702573
1011	NC_018688	TTC	2	6	41873	41878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702573
1012	NC_018688	CAA	2	6	41909	41914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702573
1013	NC_018688	AGA	2	6	41958	41963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702573
1014	NC_018688	TG	3	6	42013	42018	0 %	50 %	50 %	0 %	407702573
1015	NC_018688	TGG	2	6	42021	42026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407702573
1016	NC_018688	ATT	2	6	42063	42068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702573
1017	NC_018688	TTCT	2	8	42164	42171	0 %	75 %	0 %	25 %	407702573
1018	NC_018688	A	6	6	42174	42179	100 %	0 %	0 %	0 %	407702573
1019	NC_018688	A	7	7	42200	42206	100 %	0 %	0 %	0 %	407702574
1020	NC_018688	CTT	2	6	42214	42219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702574
1021	NC_018688	AAG	2	6	42230	42235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702574
1022	NC_018688	GAA	2	6	42245	42250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702574
1023	NC_018688	TA	3	6	42294	42299	50 %	50 %	0 %	0 %	407702574
1024	NC_018688	TTG	2	6	42315	42320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702574
1025	NC_018688	CAA	2	6	42362	42367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702574
1026	NC_018688	ATG	2	6	42408	42413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702574
1027	NC_018688	AAT	2	6	42431	42436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702574
1028	NC_018688	GAA	2	6	42473	42478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702574
1029	NC_018688	GCA	2	6	42482	42487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407702574
1030	NC_018688	A	7	7	42516	42522	100 %	0 %	0 %	0 %	407702574
1031	NC_018688	CAA	2	6	42558	42563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702574
1032	NC_018688	ATTT	2	8	42612	42619	25 %	75 %	0 %	0 %	407702574
1033	NC_018688	A	6	6	42646	42651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_018688	T	6	6	42673	42678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_018688	AAT	3	9	42711	42719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702575
1036	NC_018688	ATTTA	2	10	42738	42747	40 %	60 %	0 %	0 %	407702575
1037	NC_018688	GTTTT	2	10	42770	42779	0 %	80 %	20 %	0 %	407702575
1038	NC_018688	TTA	2	6	42781	42786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702575
1039	NC_018688	GAA	2	6	42864	42869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702575
1040	NC_018688	TCA	2	6	42901	42906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702575
1041	NC_018688	CTT	2	6	42944	42949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702575
1042	NC_018688	T	7	7	42965	42971	0 %	100 %	0 %	0 %	407702575
1043	NC_018688	T	6	6	42980	42985	0 %	100 %	0 %	0 %	407702575
1044	NC_018688	CGG	2	6	43008	43013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407702575
1045	NC_018688	ATT	2	6	43018	43023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702575
1046	NC_018688	ATA	2	6	43038	43043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702575
1047	NC_018688	TTTTGA	2	12	43174	43185	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407702575
1048	NC_018688	AATC	2	8	43290	43297	50 %	25 %	0 %	25 %	407702575
1049	NC_018688	TAT	2	6	43322	43327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702575
1050	NC_018688	T	7	7	43338	43344	0 %	100 %	0 %	0 %	407702575
1051	NC_018688	TAC	2	6	43361	43366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702575
1052	NC_018688	ATAA	2	8	43376	43383	75 %	25 %	0 %	0 %	407702575
1053	NC_018688	AAG	2	6	43390	43395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702575
1054	NC_018688	AT	3	6	43429	43434	50 %	50 %	0 %	0 %	407702575
1055	NC_018688	TTA	2	6	43444	43449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702575
1056	NC_018688	TC	3	6	43450	43455	0 %	50 %	0 %	50 %	407702575
1057	NC_018688	TAA	2	6	43490	43495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702575
1058	NC_018688	ATC	2	6	43560	43565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702575
1059	NC_018688	GCA	2	6	43594	43599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407702575
1060	NC_018688	TTTAT	2	10	43615	43624	20 %	80 %	0 %	0 %	407702575
1061	NC_018688	ATA	2	6	43635	43640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702575
1062	NC_018688	TTA	2	6	43648	43653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702575
1063	NC_018688	TCA	2	6	43714	43719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702575
1064	NC_018688	CAG	2	6	43769	43774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407702575
1065	NC_018688	ATC	2	6	43779	43784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702575
1066	NC_018688	CTT	2	6	43829	43834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702575
1067	NC_018688	TTA	2	6	43841	43846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702575
1068	NC_018688	GAA	2	6	43870	43875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702575
1069	NC_018688	ACT	2	6	43890	43895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702575
1070	NC_018688	TCT	2	6	43939	43944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702575
1071	NC_018688	TAA	2	6	43981	43986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702575
1072	NC_018688	ATT	2	6	43995	44000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702575
1073	NC_018688	ATA	2	6	44007	44012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702575
1074	NC_018688	AAT	2	6	44095	44100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702575
1075	NC_018688	TCAATT	2	12	44113	44124	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407702575
1076	NC_018688	T	7	7	44170	44176	0 %	100 %	0 %	0 %	407702575
1077	NC_018688	GCT	2	6	44177	44182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407702575
1078	NC_018688	ATG	2	6	44210	44215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702575
1079	NC_018688	CTA	2	6	44242	44247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702575
1080	NC_018688	TCT	2	6	44251	44256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702575
1081	NC_018688	TAA	2	6	44269	44274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702575
1082	NC_018688	TA	3	6	44420	44425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_018688	ATG	2	6	44431	44436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_018688	A	6	6	44454	44459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_018688	ACC	2	6	44518	44523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1086	NC_018688	TA	3	6	44692	44697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_018688	A	7	7	44772	44778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_018688	ATTT	2	8	44810	44817	25 %	75 %	0 %	0 %	407702576
1089	NC_018688	T	6	6	44815	44820	0 %	100 %	0 %	0 %	407702576
1090	NC_018688	CTAT	2	8	44828	44835	25 %	50 %	0 %	25 %	407702576
1091	NC_018688	TCT	2	6	44854	44859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702576
1092	NC_018688	TA	3	6	44937	44942	50 %	50 %	0 %	0 %	407702576
1093	NC_018688	ACA	2	6	44955	44960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_018688	TCT	2	6	44961	44966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_018688	TTA	2	6	45064	45069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_018688	TTA	2	6	45107	45112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_018688	AAC	2	6	45211	45216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_018688	TTTA	2	8	45248	45255	25 %	75 %	0 %	0 %	407702577
1099	NC_018688	A	8	8	45289	45296	100 %	0 %	0 %	0 %	407702577
1100	NC_018688	TCA	2	6	45380	45385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_018688	AGG	2	6	45455	45460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407702578
1102	NC_018688	CTA	2	6	45518	45523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702578
1103	NC_018688	TTG	2	6	45560	45565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702578
1104	NC_018688	GGAA	2	8	45573	45580	50 %	0 %	50 %	0 %	407702578
1105	NC_018688	ATAC	2	8	45599	45606	50 %	25 %	0 %	25 %	407702578
1106	NC_018688	ATT	2	6	45616	45621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702578
1107	NC_018688	GAA	2	6	45637	45642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702578
1108	NC_018688	GAA	2	6	45719	45724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702578
1109	NC_018688	A	6	6	45781	45786	100 %	0 %	0 %	0 %	407702578
1110	NC_018688	TAT	2	6	45801	45806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702578
1111	NC_018688	AGA	2	6	45855	45860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702578
1112	NC_018688	A	7	7	45900	45906	100 %	0 %	0 %	0 %	407702578
1113	NC_018688	ATT	2	6	45922	45927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702578
1114	NC_018688	ATGA	2	8	45979	45986	50 %	25 %	25 %	0 %	407702578
1115	NC_018688	CTTT	2	8	46043	46050	0 %	75 %	0 %	25 %	407702578
1116	NC_018688	AAG	2	6	46069	46074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702578
1117	NC_018688	CAA	2	6	46096	46101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702578
1118	NC_018688	ACAA	2	8	46133	46140	75 %	0 %	0 %	25 %	407702578
1119	NC_018688	TAA	2	6	46152	46157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702578
1120	NC_018688	TGG	2	6	46167	46172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407702578
1121	NC_018688	A	6	6	46306	46311	100 %	0 %	0 %	0 %	407702578
1122	NC_018688	ATTC	2	8	46333	46340	25 %	50 %	0 %	25 %	407702578
1123	NC_018688	CTT	2	6	46344	46349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702578
1124	NC_018688	CTACA	2	10	46436	46445	40 %	20 %	0 %	40 %	407702578
1125	NC_018688	TGAT	2	8	46553	46560	25 %	50 %	25 %	0 %	407702578
1126	NC_018688	AAGT	2	8	46578	46585	50 %	25 %	25 %	0 %	407702578
1127	NC_018688	TA	3	6	46589	46594	50 %	50 %	0 %	0 %	407702578
1128	NC_018688	A	6	6	46600	46605	100 %	0 %	0 %	0 %	407702578
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