MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC189

Total Repeats: 445

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018687	TC	3	6	390	395	0 %	50 %	0 %	50 %	407702350
2	NC_018687	TA	4	8	1694	1701	50 %	50 %	0 %	0 %	407702350
3	NC_018687	AT	3	6	1738	1743	50 %	50 %	0 %	0 %	407702350
4	NC_018687	AT	3	6	1906	1911	50 %	50 %	0 %	0 %	407702350
5	NC_018687	AT	3	6	2388	2393	50 %	50 %	0 %	0 %	407702350
6	NC_018687	CT	3	6	2703	2708	0 %	50 %	0 %	50 %	407702351
7	NC_018687	AC	3	6	2870	2875	50 %	0 %	0 %	50 %	407702351
8	NC_018687	GA	4	8	3200	3207	50 %	0 %	50 %	0 %	407702352
9	NC_018687	TC	4	8	3367	3374	0 %	50 %	0 %	50 %	407702352
10	NC_018687	AG	3	6	4432	4437	50 %	0 %	50 %	0 %	407702352
11	NC_018687	TA	3	6	5736	5741	50 %	50 %	0 %	0 %	407702353
12	NC_018687	CT	3	6	7925	7930	0 %	50 %	0 %	50 %	407702355
13	NC_018687	CT	3	6	8862	8867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018687	CT	3	6	9019	9024	0 %	50 %	0 %	50 %	407702358
15	NC_018687	AT	4	8	12149	12156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018687	AT	4	8	12204	12211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018687	CT	4	8	12872	12879	0 %	50 %	0 %	50 %	407702363
18	NC_018687	TC	3	6	14699	14704	0 %	50 %	0 %	50 %	407702366
19	NC_018687	AG	3	6	16438	16443	50 %	0 %	50 %	0 %	407702367
20	NC_018687	AT	3	6	16587	16592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018687	AT	3	6	17003	17008	50 %	50 %	0 %	0 %	407702368
22	NC_018687	AG	3	6	17430	17435	50 %	0 %	50 %	0 %	407702369
23	NC_018687	AT	4	8	17458	17465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018687	AT	4	8	17490	17497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018687	AT	3	6	18007	18012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018687	TA	3	6	19137	19142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018687	TA	3	6	19191	19196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018687	AG	3	6	19690	19695	50 %	0 %	50 %	0 %	407702371
29	NC_018687	AT	3	6	22514	22519	50 %	50 %	0 %	0 %	407702376
30	NC_018687	AT	3	6	23212	23217	50 %	50 %	0 %	0 %	407702376
31	NC_018687	AT	3	6	23581	23586	50 %	50 %	0 %	0 %	407702376
32	NC_018687	AT	3	6	23637	23642	50 %	50 %	0 %	0 %	407702376
33	NC_018687	AC	3	6	24539	24544	50 %	0 %	0 %	50 %	407702377
34	NC_018687	AT	3	6	25301	25306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018687	TA	4	8	25477	25484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018687	TA	3	6	25500	25505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018687	AT	3	6	25562	25567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018687	TA	3	6	25600	25605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018687	TA	3	6	25745	25750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018687	TA	3	6	25770	25775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018687	TA	3	6	25814	25819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018687	TA	3	6	26872	26877	50 %	50 %	0 %	0 %	407702378
43	NC_018687	AT	3	6	28445	28450	50 %	50 %	0 %	0 %	407702378
44	NC_018687	TA	3	6	29034	29039	50 %	50 %	0 %	0 %	407702378
45	NC_018687	TA	3	6	30146	30151	50 %	50 %	0 %	0 %	407702380
46	NC_018687	TA	3	6	30745	30750	50 %	50 %	0 %	0 %	407702381
47	NC_018687	CA	3	6	31272	31277	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018687	TA	3	6	31459	31464	50 %	50 %	0 %	0 %	407702383
49	NC_018687	TA	3	6	31568	31573	50 %	50 %	0 %	0 %	407702383
50	NC_018687	AC	3	6	32201	32206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_018687	AT	3	6	32752	32757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018687	AT	5	10	32973	32982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018687	AT	3	6	33602	33607	50 %	50 %	0 %	0 %	407702386
54	NC_018687	TA	3	6	33828	33833	50 %	50 %	0 %	0 %	407702386
55	NC_018687	AT	3	6	33948	33953	50 %	50 %	0 %	0 %	407702386
56	NC_018687	GA	3	6	34639	34644	50 %	0 %	50 %	0 %	407702386
57	NC_018687	AT	3	6	35063	35068	50 %	50 %	0 %	0 %	407702386
58	NC_018687	TA	3	6	35366	35371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018687	AT	4	8	35398	35405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018687	TA	3	6	35607	35612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018687	TA	3	6	35899	35904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018687	TA	3	6	35932	35937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018687	TA	3	6	35951	35956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018687	TG	3	6	36119	36124	0 %	50 %	50 %	0 %	407702387
65	NC_018687	TA	3	6	36783	36788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018687	AT	3	6	37078	37083	50 %	50 %	0 %	0 %	407702389
67	NC_018687	AT	3	6	37093	37098	50 %	50 %	0 %	0 %	407702389
68	NC_018687	AT	3	6	37236	37241	50 %	50 %	0 %	0 %	407702389
69	NC_018687	AT	3	6	37676	37681	50 %	50 %	0 %	0 %	407702390
70	NC_018687	CA	3	6	38358	38363	50 %	0 %	0 %	50 %	407702390
71	NC_018687	AT	3	6	38558	38563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018687	AT	3	6	39207	39212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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74	NC_018687	TA	3	6	39847	39852	50 %	50 %	0 %	0 %	407702391
75	NC_018687	TA	4	8	40204	40211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018687	AT	3	6	40310	40315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018687	AT	3	6	40452	40457	50 %	50 %	0 %	0 %	407702392
78	NC_018687	TA	3	6	40952	40957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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80	NC_018687	AT	3	6	41773	41778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018687	AT	3	6	41815	41820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018687	TA	3	6	41867	41872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018687	TA	3	6	41934	41939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018687	TA	3	6	42209	42214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018687	AT	3	6	42479	42484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018687	TA	3	6	42608	42613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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88	NC_018687	AT	3	6	43450	43455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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90	NC_018687	AT	3	6	43568	43573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018687	AT	3	6	44236	44241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018687	TA	3	6	45563	45568	50 %	50 %	0 %	0 %	407702399
93	NC_018687	TA	3	6	45714	45719	50 %	50 %	0 %	0 %	407702399
94	NC_018687	TA	3	6	46124	46129	50 %	50 %	0 %	0 %	407702399
95	NC_018687	GA	3	6	46279	46284	50 %	0 %	50 %	0 %	407702399
96	NC_018687	TA	4	8	46414	46421	50 %	50 %	0 %	0 %	407702399
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98	NC_018687	TA	3	6	46826	46831	50 %	50 %	0 %	0 %	407702399
99	NC_018687	TA	3	6	47095	47100	50 %	50 %	0 %	0 %	407702400
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102	NC_018687	AT	3	6	47612	47617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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108	NC_018687	TA	3	6	50479	50484	50 %	50 %	0 %	0 %	407702403
109	NC_018687	TG	3	6	51020	51025	0 %	50 %	50 %	0 %	407702404
110	NC_018687	TA	3	6	51128	51133	50 %	50 %	0 %	0 %	407702404
111	NC_018687	CT	3	6	51268	51273	0 %	50 %	0 %	50 %	407702404
112	NC_018687	TA	4	8	51801	51808	50 %	50 %	0 %	0 %	407702404
113	NC_018687	TA	3	6	52272	52277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018687	AG	3	6	52608	52613	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018687	AT	3	6	52811	52816	50 %	50 %	0 %	0 %	407702405
116	NC_018687	TA	3	6	53287	53292	50 %	50 %	0 %	0 %	407702405
117	NC_018687	AT	3	6	53338	53343	50 %	50 %	0 %	0 %	407702405
118	NC_018687	AT	3	6	53450	53455	50 %	50 %	0 %	0 %	407702405
119	NC_018687	AT	3	6	54455	54460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018687	AT	3	6	54968	54973	50 %	50 %	0 %	0 %	407702408
121	NC_018687	AT	3	6	55131	55136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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123	NC_018687	TA	3	6	55515	55520	50 %	50 %	0 %	0 %	407702409
124	NC_018687	TA	4	8	57234	57241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018687	CT	3	6	60200	60205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_018687	AT	3	6	60360	60365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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129	NC_018687	GA	3	6	61049	61054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018687	TA	3	6	61157	61162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018687	TA	3	6	61352	61357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018687	AT	3	6	61368	61373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018687	TA	4	8	62497	62504	50 %	50 %	0 %	0 %	407702412
134	NC_018687	AT	3	6	62887	62892	50 %	50 %	0 %	0 %	407702412
135	NC_018687	TA	3	6	63623	63628	50 %	50 %	0 %	0 %	407702412
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139	NC_018687	CT	3	6	64923	64928	0 %	50 %	0 %	50 %	407702413
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142	NC_018687	AT	3	6	65833	65838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_018687	CA	3	6	188362	188367	50 %	0 %	0 %	50 %	407702532
443	NC_018687	AG	3	6	188493	188498	50 %	0 %	50 %	0 %	407702532
444	NC_018687	AT	3	6	188898	188903	50 %	50 %	0 %	0 %	407702533
445	NC_018687	AT	3	6	188999	189004	50 %	50 %	0 %	0 %	407702533

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.