MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC189

Total Repeats: 184

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018687	CATAA	2	10	1837	1846	60 %	20 %	0 %	20 %	407702350
2	NC_018687	AGTAA	2	10	1893	1902	60 %	20 %	20 %	0 %	407702350
3	NC_018687	TCCCA	2	10	1994	2003	20 %	20 %	0 %	60 %	407702350
4	NC_018687	ATAAA	2	10	3992	4001	80 %	20 %	0 %	0 %	407702352
5	NC_018687	AATTA	2	10	5044	5053	60 %	40 %	0 %	0 %	407702352
6	NC_018687	TTATC	2	10	5602	5611	20 %	60 %	0 %	20 %	407702353
7	NC_018687	GATAT	2	10	5634	5643	40 %	40 %	20 %	0 %	407702353
8	NC_018687	AATAA	2	10	7283	7292	80 %	20 %	0 %	0 %	407702355
9	NC_018687	TTTCC	2	10	7609	7618	0 %	60 %	0 %	40 %	407702355
10	NC_018687	TTTCA	2	10	8070	8079	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018687	AAAAT	2	10	8214	8223	80 %	20 %	0 %	0 %	407702356
12	NC_018687	TGACT	2	10	9311	9320	20 %	40 %	20 %	20 %	407702359
13	NC_018687	TTTAG	2	10	10458	10467	20 %	60 %	20 %	0 %	407702360
14	NC_018687	TAACA	2	10	11555	11564	60 %	20 %	0 %	20 %	407702361
15	NC_018687	TTTAT	2	10	11797	11806	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018687	AAAAT	2	10	13051	13060	80 %	20 %	0 %	0 %	407702363
17	NC_018687	ATTTC	2	10	13220	13229	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018687	AAATG	2	10	17983	17992	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018687	TATTT	2	10	18851	18860	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018687	TTAAA	2	10	19857	19866	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018687	TATGA	2	10	20654	20663	40 %	40 %	20 %	0 %	407702372
22	NC_018687	ATTTA	2	10	20938	20947	40 %	60 %	0 %	0 %	407702372
23	NC_018687	GTAAT	2	10	21483	21492	40 %	40 %	20 %	0 %	407702373
24	NC_018687	TGTTT	2	10	22931	22940	0 %	80 %	20 %	0 %	407702376
25	NC_018687	ATCTT	2	10	23473	23482	20 %	60 %	0 %	20 %	407702376
26	NC_018687	AATTT	2	10	23781	23790	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018687	TAAAT	2	10	26900	26909	60 %	40 %	0 %	0 %	407702378
28	NC_018687	TAAAT	2	10	26915	26924	60 %	40 %	0 %	0 %	407702378
29	NC_018687	TGGAA	2	10	26943	26952	40 %	20 %	40 %	0 %	407702378
30	NC_018687	AATAT	2	10	27562	27571	60 %	40 %	0 %	0 %	407702378
31	NC_018687	AGTTA	2	10	28042	28051	40 %	40 %	20 %	0 %	407702378
32	NC_018687	GAAGA	2	10	29149	29158	60 %	0 %	40 %	0 %	407702378
33	NC_018687	ATATA	2	10	29342	29351	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018687	AATTT	2	10	30292	30301	40 %	60 %	0 %	0 %	407702380
35	NC_018687	TAACT	2	10	32692	32701	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_018687	TTTAA	2	10	34471	34480	40 %	60 %	0 %	0 %	407702386
37	NC_018687	AAAAT	2	10	36816	36825	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018687	TTTTG	2	10	39500	39509	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018687	GAATT	2	10	41412	41421	40 %	40 %	20 %	0 %	407702393
40	NC_018687	CGAAA	2	10	42579	42588	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_018687	AAAAG	2	10	43707	43716	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018687	TATAA	2	10	45989	45998	60 %	40 %	0 %	0 %	407702399
43	NC_018687	ATAAA	2	10	46904	46913	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018687	AAAAT	2	10	48242	48251	80 %	20 %	0 %	0 %	407702401
45	NC_018687	ACATC	2	10	50060	50069	40 %	20 %	0 %	40 %	407702403
46	NC_018687	AACTT	2	10	50173	50182	40 %	40 %	0 %	20 %	407702403
47	NC_018687	TTCAT	2	10	52423	52432	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_018687	TTGTT	2	10	52519	52528	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018687	AATTA	2	10	53427	53436	60 %	40 %	0 %	0 %	407702405
50	NC_018687	TTTCT	2	10	54915	54924	0 %	80 %	0 %	20 %	407702408
51	NC_018687	AAAAG	2	10	55294	55303	80 %	0 %	20 %	0 %	407702409
52	NC_018687	ATTTA	2	10	60171	60180	40 %	60 %	0 %	0 %	407702411
53	NC_018687	CGAAA	2	10	62191	62200	60 %	0 %	20 %	20 %	407702412
54	NC_018687	TGCAT	2	10	64903	64912	20 %	40 %	20 %	20 %	407702413
55	NC_018687	TAGGA	2	10	65615	65624	40 %	20 %	40 %	0 %	407702413
56	NC_018687	AGTGA	2	10	66394	66403	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018687	CATTC	2	10	67173	67182	20 %	40 %	0 %	40 %	407702416
58	NC_018687	GTACT	2	10	67968	67977	20 %	40 %	20 %	20 %	407702416
59	NC_018687	AAGAT	2	10	68038	68047	60 %	20 %	20 %	0 %	407702416
60	NC_018687	GCAAA	2	10	68428	68437	60 %	0 %	20 %	20 %	407702417
61	NC_018687	AGGTT	2	10	68697	68706	20 %	40 %	40 %	0 %	407702417
62	NC_018687	ATTTG	2	10	73915	73924	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018687	TTATG	2	10	74152	74161	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018687	TTTTA	2	10	77302	77311	20 %	80 %	0 %	0 %	407702422
65	NC_018687	ATCAA	2	10	77420	77429	60 %	20 %	0 %	20 %	407702422
66	NC_018687	ATATG	2	10	78784	78793	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018687	TAAAT	2	10	80451	80460	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018687	TGAAA	2	10	80816	80825	60 %	20 %	20 %	0 %	407702425
69	NC_018687	TTTTA	2	10	81789	81798	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018687	ACAAT	2	10	82357	82366	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_018687	TAGGT	2	10	83661	83670	20 %	40 %	40 %	0 %	407702427
72	NC_018687	CTTAA	2	10	84916	84925	40 %	40 %	0 %	20 %	407702429
73	NC_018687	TTGTA	2	10	85110	85119	20 %	60 %	20 %	0 %	407702429
74	NC_018687	TTGGA	2	10	85254	85263	20 %	40 %	40 %	0 %	407702429
75	NC_018687	ATTTA	2	10	85837	85846	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018687	TCAAT	2	10	86175	86184	40 %	40 %	0 %	20 %	407702432
77	NC_018687	TTGTA	2	10	86943	86952	20 %	60 %	20 %	0 %	407702432
78	NC_018687	TTAAA	2	10	88453	88462	60 %	40 %	0 %	0 %	407702433
79	NC_018687	ATTTT	2	10	90597	90606	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018687	GAGAA	2	10	90937	90946	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018687	TATTT	2	10	91689	91698	20 %	80 %	0 %	0 %	407702434
82	NC_018687	GTTTT	2	10	93348	93357	0 %	80 %	20 %	0 %	407702436
83	NC_018687	AAAGT	2	10	97169	97178	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018687	TTTAC	2	10	97925	97934	20 %	60 %	0 %	20 %	407702439
85	NC_018687	TAATT	2	10	100965	100974	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018687	TTATG	2	10	101459	101468	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018687	TAAAT	2	10	103961	103970	60 %	40 %	0 %	0 %	407702443
88	NC_018687	TGATA	2	10	106295	106304	40 %	40 %	20 %	0 %	407702445
89	NC_018687	AAATT	2	10	107120	107129	60 %	40 %	0 %	0 %	407702446
90	NC_018687	GATTT	2	10	107529	107538	20 %	60 %	20 %	0 %	407702446
91	NC_018687	TATGT	2	10	107698	107707	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018687	TTTAA	2	10	108548	108557	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018687	TCTTT	2	10	109260	109269	0 %	80 %	0 %	20 %	407702450
94	NC_018687	ACAAA	2	10	110678	110687	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_018687	ACAAA	2	10	110742	110751	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_018687	AAAAC	2	10	112039	112048	80 %	0 %	0 %	20 %	407702453
97	NC_018687	AAAGA	2	10	112239	112248	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018687	TTAAT	2	10	113324	113333	40 %	60 %	0 %	0 %	407702455
99	NC_018687	TGTCC	2	10	113821	113830	0 %	40 %	20 %	40 %	407702456
100	NC_018687	AAAGA	2	10	116392	116401	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018687	TATAA	2	10	117075	117084	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018687	TTTAT	2	10	117473	117482	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018687	GAAAA	2	10	117768	117777	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018687	TAGCA	2	10	119290	119299	40 %	20 %	20 %	20 %	407702459
105	NC_018687	TACTG	2	10	120657	120666	20 %	40 %	20 %	20 %	407702460
106	NC_018687	ACAAA	2	10	120968	120977	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_018687	AAAGT	2	10	122688	122697	60 %	20 %	20 %	0 %	407702463
108	NC_018687	TTTTA	2	10	123129	123138	20 %	80 %	0 %	0 %	407702465
109	NC_018687	GAATC	2	10	123139	123148	40 %	20 %	20 %	20 %	407702465
110	NC_018687	CTTCA	2	10	125415	125424	20 %	40 %	0 %	40 %	407702468
111	NC_018687	ATTAT	2	10	125773	125782	40 %	60 %	0 %	0 %	407702468
112	NC_018687	CGTGC	2	10	126873	126882	0 %	20 %	40 %	40 %	407702469
113	NC_018687	AAATC	2	10	128014	128023	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_018687	GATAG	2	10	128999	129008	40 %	20 %	40 %	0 %	407702470
115	NC_018687	TAGTA	2	10	129414	129423	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018687	ATGGA	2	10	129517	129526	40 %	20 %	40 %	0 %	407702471
117	NC_018687	AGAAA	2	10	130413	130422	80 %	0 %	20 %	0 %	407702471
118	NC_018687	TGAAC	2	10	130698	130707	40 %	20 %	20 %	20 %	407702471
119	NC_018687	TTTTC	2	10	131346	131355	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018687	CTGTT	2	10	131422	131431	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_018687	TATCC	2	10	131583	131592	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_018687	AAGAT	2	10	132094	132103	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018687	TAATA	2	10	132252	132261	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018687	TCATT	2	10	133336	133345	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_018687	CAAAT	2	10	136053	136062	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_018687	AATTC	2	10	136434	136443	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_018687	ATAGA	2	10	138740	138749	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018687	ATGAA	2	10	139399	139408	60 %	20 %	20 %	0 %	407702483
129	NC_018687	ATATT	2	10	140044	140053	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018687	ATTTA	2	10	140487	140496	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018687	AATAT	2	10	140617	140626	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018687	GTTTC	2	10	142695	142704	0 %	60 %	20 %	20 %	407702486
133	NC_018687	TAAAT	2	10	144938	144947	60 %	40 %	0 %	0 %	407702487
134	NC_018687	CAATT	2	10	145484	145493	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_018687	ATTAA	2	10	145591	145600	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018687	AACCT	2	10	148095	148104	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_018687	AAATC	2	10	148797	148806	60 %	20 %	0 %	20 %	407702491
138	NC_018687	ATAAA	2	10	148877	148886	80 %	20 %	0 %	0 %	407702491
139	NC_018687	AAAAG	2	10	149511	149520	80 %	0 %	20 %	0 %	407702492
140	NC_018687	TAATA	2	10	151079	151088	60 %	40 %	0 %	0 %	407702493
141	NC_018687	ATGGA	2	10	151139	151148	40 %	20 %	40 %	0 %	407702493
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.